/[PAMELA software]/PamelaLevel2/src/PamLevel2.cpp
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revision 1.6 by pam-fi, Tue Oct 24 10:24:27 2006 UTC revision 1.16 by pam-fi, Tue Jan 16 13:19:58 2007 UTC
# Line 7  Line 7 
7   * Default constructor   * Default constructor
8   */   */
9  PamTrack::PamTrack(){  PamTrack::PamTrack(){
10      trk_track  = this->TrkTrack::GetTrkTrack();      trk_track  = 0;
11      calo_track = this->CaloTrkVar::GetCaloTrkVar();      calo_track = 0;
12      tof_track  = this->ToFTrkVar::GetToFTrkVar();      tof_track  = 0;
13        candeleteobj = 0;
14  };  };
15  //--------------------------------------  //--------------------------------------
16  //  //
# Line 19  PamTrack::PamTrack(){ Line 20  PamTrack::PamTrack(){
20   * Constructor   * Constructor
21   */   */
22  PamTrack::PamTrack(TrkTrack* t, CaloTrkVar* c, ToFTrkVar* o){  PamTrack::PamTrack(TrkTrack* t, CaloTrkVar* c, ToFTrkVar* o){
23      trk_track  = this->TrkTrack::GetTrkTrack();  
24      calo_track = this->CaloTrkVar::GetCaloTrkVar();      trk_track  = 0;
25      tof_track  = this->ToFTrkVar::GetToFTrkVar();      calo_track = 0;
26      if(t) *trk_track  = *t;      tof_track  = 0;
27      if(c) *calo_track = *c;  //     if(t)trk_track  = new TrkTrack(*t);
28      if(o) *tof_track  = *o;      //     if(c)calo_track = new CaloTrkVar(*c);
29    //     if(o)tof_track  = new ToFTrkVar(*o);
30        if(t)trk_track  = t;
31        if(c)calo_track = c;
32        if(o)tof_track  = o;
33        candeleteobj = 0;
34    
35  };  };
36    PamTrack::PamTrack(const PamTrack& track){
37    
38        TrkTrack   *t = track.trk_track;
39        CaloTrkVar *c = track.calo_track;
40        ToFTrkVar  *o = track.tof_track;
41    
42        trk_track  = 0;
43        calo_track = 0;
44        tof_track  = 0;
45        if(t)trk_track  = new TrkTrack(*t);
46        if(c)calo_track = new CaloTrkVar(*c);
47        if(o)tof_track  = new ToFTrkVar(*o);
48        candeleteobj = 1;
49        
50    }
51    void PamTrack::Clear(){
52    
53    //    cout << "PamTrack::Clear() "<<candeleteobj<<endl;
54        if(candeleteobj){
55            if(trk_track)  trk_track->TrkTrack::Clear();
56            if(calo_track) calo_track->CaloTrkVar::Clear();//???
57            if(tof_track)  tof_track->ToFTrkVar::Clear();//???
58        }else{
59            trk_track  = 0;
60            calo_track = 0;
61            tof_track  = 0;
62        }
63    }
64    void PamTrack::Delete(){
65    //    cout << "PamTrack::Delete() "<<candeleteobj<<endl;
66        if(candeleteobj){
67            if(trk_track)  {
68                trk_track->TrkTrack::Clear();
69                delete trk_track;
70            }
71            if(calo_track){
72                calo_track->CaloTrkVar::Clear();//???
73                delete calo_track;
74            }
75            if(tof_track){
76                tof_track->ToFTrkVar::Clear();//???
77                delete tof_track;
78            }
79        }else{
80            Clear();
81        }
82    }
83  //--------------------------------------  //--------------------------------------
84  //  //
85  //  //
# Line 36  PamTrack::PamTrack(TrkTrack* t, CaloTrkV Line 89  PamTrack::PamTrack(TrkTrack* t, CaloTrkV
89   */   */
90  PamLevel2::PamLevel2(){  PamLevel2::PamLevel2(){
91                    
92      trk_l1_obj  = this->TrkLevel1::GetTrkLevel1();        //     trk2_obj  = TrkLevel2::GetTrkLevel2();
93      trk_obj     = this->TrkLevel2::GetTrkLevel2();  //     trk1_obj  = TrkLevel1::GetTrkLevel1();
94      calo_obj    = this->CaloLevel2::GetCaloLevel2();  //     trkh_obj  = TrkHough::GetTrkHough();
95      tof_obj     = this->ToFLevel2::GetToFLevel2();  //     calo1_obj = CaloLevel1::GetCaloLevel1();
96      trig_obj    = this->TrigLevel2::GetTrigLevel2();  //     calo2_obj = CaloLevel2::GetCaloLevel2();
97      s4_obj      = this->S4Level2::GetS4Level2();  //     tof_obj   = ToFLevel2::GetToFLevel2();
98      nd_obj      = this->NDLevel2::GetNDLevel2();  //     trig_obj  = TrigLevel2::GetTrigLevel2();
99      ac_obj      = this->AcLevel2::GetAcLevel2();  //     s4_obj    = S4Level2::GetS4Level2();
100      orb_obj     = this->OrbitalInfo::GetOrbitalInfo();  //     nd_obj    = NDLevel2::GetNDLevel2();
101    //     ac_obj    = AcLevel2::GetAcLevel2();
102      run_obj     = new GL_RUN();  //     orb_obj   = OrbitalInfo::GetOrbitalInfo();
103            trk2_obj  = 0;
104      sorted_tracks = new TRefArray();      trk1_obj  = 0;
105            trkh_obj  = 0;
106      CAL = true;      calo1_obj = 0;
107      TRK = true;      calo2_obj = 0;
108        tof_obj   = 0;
109        trig_obj  = 0;
110        s4_obj    = 0;
111        nd_obj    = 0;
112        ac_obj    = 0;
113        orb_obj   = 0;
114    
115        run_obj   = 0;//new GL_RUN();
116        soft_obj   = 0;// Emiliano
117        
118    
119        for(Int_t i=0; i<8; i++ )tree_clone[i]=NULL;
120    
121    //    sorted_tracks = 0;//new TRefArray();
122        
123        CAL1 = true;
124        CAL2 = true;
125        TRK2 = true;
126        TRK1 = false;
127        TRKh = false;
128      TRG = true;      TRG = true;
129      TOF = true;      TOF = true;
130      S4  = true;      S4  = true;
# Line 59  PamLevel2::PamLevel2(){ Line 132  PamLevel2::PamLevel2(){
132      AC  = true;      AC  = true;
133      ORB = true;      ORB = true;
134            
135      TRK_L1 = false;      RUN = true;
136        
137      Tout  = NULL;      tsorted=0;
138        timage=0;
139    
140  };  };
141  /**  /**
142   * Destructor   * Delete the event (act as Dtor)
143   */   */
144  PamLevel2::~PamLevel2(){  void PamLevel2::Delete(){
                   
     TrkLevel1::Clear();  
       
     TrkLevel2::Clear();  
     CaloLevel2::Clear();  
     ToFLevel2::Clear();  
     TrigLevel2::Clear();  
     S4Level2::Clear();  
     NDLevel2::Clear();  
     AcLevel2::Clear();  
     OrbitalInfo::Clear();  
       
     delete run_obj;  
       
 //      delete sorted_tracks;  
     sorted_tracks->Delete(); // clean the reference array  
           
     if(Tout)Tout->Delete(); // delete loaded tree from memory  
145                    
146        if(run_obj)delete run_obj;
147        if(soft_obj)delete soft_obj; //Emiliano
148    
149    //    cout << "void PamLevel2::Clear()"<<endl;
150        if(trk1_obj) delete trk1_obj;      
151        if(trk2_obj) delete trk2_obj;
152        if(trkh_obj) delete trkh_obj;
153        if(calo1_obj)delete calo1_obj;
154        if(calo2_obj)delete calo2_obj;
155        if(tof_obj)  delete tof_obj;
156        if(trig_obj) delete trig_obj;
157        if(s4_obj)   delete s4_obj;
158        if(nd_obj)   delete nd_obj;
159        if(ac_obj)   delete ac_obj;
160        if(orb_obj)  delete orb_obj;
161        
162        if(tsorted){
163            tsorted->Delete();
164            delete tsorted;
165        }
166        if(timage){
167            timage->Delete();
168            delete timage;
169        }
170  };  };
171    
172  /**  /**
173   * Clear the event   * Clear the event (NB! does not deallocate objects)
174   */   */
175  void PamLevel2::Clear(){  void PamLevel2::Clear(){
176                    
177      TrkLevel1::Clear();  //    cout << "void PamLevel2::Clear()"<<endl;
178            
179      TrkLevel2::Clear();  //
180      CaloLevel2::Clear();  //    if(run_obj)delete run_obj;
181      ToFLevel2::Clear();      if(run_obj) run_obj->Clear();  // Emiliano: Do not deallocate run_obj here, it will give segmentation fault! call clear instead
182      TrigLevel2::Clear();      if(soft_obj) soft_obj->Clear();
183      S4Level2::Clear();  
184      NDLevel2::Clear();      if(trk1_obj) trk1_obj->Clear();    
185      AcLevel2::Clear();      if(trk2_obj) trk2_obj->Clear();
186      OrbitalInfo::Clear();      if(trkh_obj) trkh_obj->Clear();
187        if(calo1_obj)calo1_obj->Clear();
188        if(calo2_obj)calo2_obj->Clear();
189        if(tof_obj)  tof_obj->Clear();
190        if(trig_obj) trig_obj->Clear();
191        if(s4_obj)   s4_obj->Clear();
192        if(nd_obj)   nd_obj->Clear();
193        if(ac_obj)   ac_obj->Clear();
194        if(orb_obj)  orb_obj->Clear();
195            
196      sorted_tracks->Delete(); // clean the reference array  //    if(sorted_tracks)sorted_tracks->Clear();
197    //    sorted_tracks.Clear();
198    
199        if(tsorted){
200            tsorted->Delete();
201        }
202        if(timage){
203            timage->Delete();
204        }
205            
206  };  };
207    
# Line 112  void PamLevel2::Clear(){ Line 210  void PamLevel2::Clear(){
210  //  //
211  //  //
212  //--------------------------------------  //--------------------------------------
213    void *PamLevel2::GetPointerTo(const char* c ){
214    
215        TString objname = c;
216    
217        if(!objname.CompareTo("TrkLevel1"))  {
218            if(!trk1_obj){
219                trk1_obj  = new TrkLevel1();
220                trk1_obj->Set();
221            }
222            return &trk1_obj;
223        };
224        if(!objname.CompareTo("TrkLevel2"))  {
225            if(!trk2_obj){  
226                trk2_obj  = new TrkLevel2();
227                trk2_obj->Set();
228            }
229            return &trk2_obj;
230        };
231        if(!objname.CompareTo("TrkHough"))   {
232            if(!trkh_obj)  trkh_obj  = new TrkHough();
233            return &trkh_obj;
234        };
235        if(!objname.CompareTo("CaloLevel1")) {
236            if(!calo1_obj) calo1_obj = new CaloLevel1();
237            return &calo1_obj;
238        };
239        if(!objname.CompareTo("CaloLevel2")) {
240            if(!calo2_obj){
241                calo2_obj = new CaloLevel2();
242                calo2_obj->Set();
243            };
244            return &calo2_obj;
245        };
246        if(!objname.CompareTo("ToFLevel2"))  {
247            if(!tof_obj){
248                tof_obj   = new ToFLevel2();
249                tof_obj->Set();
250            }
251            return &tof_obj;
252        };
253        if(!objname.CompareTo("TrigLevel2")) {
254            if(!trig_obj)  trig_obj  = new TrigLevel2();
255            return &trig_obj;
256        };
257        if(!objname.CompareTo("S4Level2"))   {
258            if(!s4_obj)    s4_obj    = new S4Level2();
259            return &s4_obj;
260        };
261        if(!objname.CompareTo("NDLevel2"))   {
262            if(!nd_obj)    nd_obj    = new NDLevel2();
263            return &nd_obj;
264        };
265        if(!objname.CompareTo("AcLevel2"))   {
266            if(!ac_obj)    ac_obj    = new AcLevel2();
267            return &ac_obj;
268        };
269        if(!objname.CompareTo("OrbitalInfo")){
270            if(!orb_obj)   orb_obj   = new OrbitalInfo();
271            return &orb_obj;
272        };
273        
274        if(!objname.CompareTo("RunInfo"))return &run_obj;
275    
276        if(!objname.CompareTo("SoftInfo"))return &soft_obj; // Emiliano
277    
278        return NULL;
279    };
280    //--------------------------------------
281    //
282    //
283    //--------------------------------------
284  /**  /**
285   * Retrieves the calorimeter track matching the seqno-th tracker stored track.   * Retrieves the calorimeter track matching the seqno-th tracker stored track.
286   * (If seqno = -1 retrieves the self-trigger calorimeter track)   * (If seqno = -1 retrieves the self-trigger calorimeter track)
287   */   */
288   CaloTrkVar *PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int seqno){   CaloTrkVar *PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int seqno){
289                
290       if( CaloLevel2::ntrk()==0 ){       if( !calo2_obj )return 0;
291    
292         if( calo2_obj->CaloLevel2::ntrk()==0 ){
293           cout << "PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" but no Calorimeter tracks are stored"<<endl;           cout << "PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" but no Calorimeter tracks are stored"<<endl;
294           return NULL;           return NULL;
295       };       };
# Line 127  void PamLevel2::Clear(){ Line 298  void PamLevel2::Clear(){
298       Int_t it_calo=0;       Int_t it_calo=0;
299            
300       do{       do{
301           c = CaloLevel2::GetCaloTrkVar(it_calo);           c = calo2_obj->CaloLevel2::GetCaloTrkVar(it_calo);
302           it_calo++;           it_calo++;
303       } while( c && seqno != c->trkseqno && it_calo < CaloLevel2::ntrk());             } while( c && seqno != c->trkseqno && it_calo < calo2_obj->CaloLevel2::ntrk());    
304            
305       if(!c || seqno != c->trkseqno){       if(!c || seqno != c->trkseqno){
306           c = 0;           c = 0;
# Line 148  void PamLevel2::Clear(){ Line 319  void PamLevel2::Clear(){
319   */   */
320   ToFTrkVar *PamLevel2::GetToFStoredTrack(int seqno){   ToFTrkVar *PamLevel2::GetToFStoredTrack(int seqno){
321                    
322       if( ToFLevel2::ntrk()==0 ){       if( !tof_obj )return 0;
323    
324         if( tof_obj->ToFLevel2::ntrk()==0 ){
325           cout << "PamLevel2::GetToFStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" but no ToF tracks are stored"<<endl;           cout << "PamLevel2::GetToFStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" but no ToF tracks are stored"<<endl;
326           return NULL;           return NULL;
327       };       };
# Line 157  void PamLevel2::Clear(){ Line 330  void PamLevel2::Clear(){
330       Int_t it_tof=0;       Int_t it_tof=0;
331            
332       do{       do{
333           c = ToFLevel2::GetToFTrkVar(it_tof);           c = tof_obj->ToFLevel2::GetToFTrkVar(it_tof);
334           it_tof++;           it_tof++;
335       } while( c && seqno != c->trkseqno && it_tof < ToFLevel2::ntrk());       } while( c && seqno != c->trkseqno && it_tof < tof_obj->ToFLevel2::ntrk());        
336            
337       if(!c || seqno != c->trkseqno){       if(!c || seqno != c->trkseqno){
338           c = 0;           c = 0;
# Line 177  void PamLevel2::Clear(){ Line 350  void PamLevel2::Clear(){
350   * Give the pamela track associated to a tracker track, retrieving related calorimeter and tof track information.   * Give the pamela track associated to a tracker track, retrieving related calorimeter and tof track information.
351   */   */
352   PamTrack* PamLevel2::GetPamTrackAlong(TrkTrack* t){   PamTrack* PamLevel2::GetPamTrackAlong(TrkTrack* t){
353                
354         cout <<"PamLevel2::GetPamTrackAlong(TrkTrack* t) **obsolete** "<<endl;
355         cout <<"(if you use it, remember to delete the PamTrack object)"<<endl;
356    
357       CaloTrkVar *c = 0;       CaloTrkVar *c = 0;
358       ToFTrkVar  *o = 0;       ToFTrkVar  *o = 0;
359            
360       if(CAL) c = GetCaloStoredTrack(t->GetSeqNo());       if(CAL2) c = GetCaloStoredTrack(t->GetSeqNo());
361       if(TOF) o = GetToFStoredTrack(t->GetSeqNo());       if(TOF) o = GetToFStoredTrack(t->GetSeqNo());
362            
363  //    if(t && c && o)track = new PamTrack(t,c,o);  //    if(t && c && o)track = new PamTrack(t,c,o);
# Line 202  void PamLevel2::Clear(){ Line 378  void PamLevel2::Clear(){
378    
379  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_t itrk){  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_t itrk){
380            
381        cout <<"PamLevel2::GetStoredTrack(Int_t itrk) **to-be-updated** "<<endl;
382        cout <<"for the moment, better use separately the methods: TrkLevel2::GetStoredTrack(seqno) CaloLevel2::GetCaloTrkVar(Int_t notrack) ToFLevel2::GetToFTrkVar(Int_t notrack)"<<endl;
383        cout <<"(if you use it, remember to delete the PamTrack object)"<<endl;
384      PamTrack *track = 0;      PamTrack *track = 0;
385            
386      if( itrk >=0 && itrk < TrkLevel2::ntrk() ){      if( itrk >=0 && itrk < trk2_obj->TrkLevel2::ntrk() ){
387                    
388          TrkTrack *t = TrkLevel2::GetStoredTrack(itrk);          TrkTrack *t = trk2_obj->TrkLevel2::GetStoredTrack(itrk);
389          track = GetPamTrackAlong(t);          track = GetPamTrackAlong(t);
390                    
391            
392    
393      }else{      }else{
394          cout << "PamLevel2::GetStoredTrack(int) : tracker track SeqNo "<< itrk <<" does not exist (GetNTracks() = "<<TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;          cout << "PamLevel2::GetStoredTrack(int) : tracker track SeqNo "<< itrk <<" does not exist (GetNTracks() = "<<trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
395      };      };
396            
397      return track;      return track;
# Line 224  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_ Line 405  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_
405   * Sort physical (tracker) tracks and stores them in the TRefArray (of TrkTrack objects) which pointer is  PamLevel2::sorted_tracks.   * Sort physical (tracker) tracks and stores them in the TRefArray (of TrkTrack objects) which pointer is  PamLevel2::sorted_tracks.
406   * @param how String to set the sorting cryterium (es: "CAL" or "TRK+CAL+TOF" ecc...).   * @param how String to set the sorting cryterium (es: "CAL" or "TRK+CAL+TOF" ecc...).
407   * Sorting cryteria:   * Sorting cryteria:
408   * TRK: lower chi**2   * TRK: lower chi**2
409   * CAL: lower Y spatial residual on the first calorimeter plane   * CAL: lower Y spatial residual on the first calorimeter plane
410   * TOF: bigger numebr of hit PMTs along the track, on S12 S21 S32 (where paddles are along the Y axis).   * TOF: bigger numebr of hit PMTs along the track, on S12 S21 S32 (where paddles are along the Y axis).
411   * The default sorting cryterium is "TOF+CAL".   * The default sorting cryterium is "TOF+CAL".
# Line 233  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_ Line 414  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_
414   */   */
415  void PamLevel2::SortTracks(TString how){  void PamLevel2::SortTracks(TString how){
416    
417    //    cout <<" PamLevel2::SortTracks(TString how) "<<endl;
418        if( !trk2_obj ){
419            cout << "void PamLevel2::SortTracks(TString how):  TrkLevel2 not loaded !!!";
420            return;
421        };
422    //    cout << "call SortTracs() "<<endl;
423    //Save current Object count    //Save current Object count
424      Int_t ObjectNumber = TProcessID::GetObjectCount();      Int_t ObjectNumber = TProcessID::GetObjectCount();
425        
426      sorted_tracks->Delete(); //temporaneo???  //    cout << "ObjectNumber  "<<ObjectNumber <<endl;
427            
428    //     if(!sorted_tracks)sorted_tracks = new TRefArray();
429    //     sorted_tracks->Clear();
430    //    sorted_tracks.Clear();
431    
432        if(!tsorted)tsorted = new TClonesArray("PamTrack",trk2_obj->GetNTracks());
433        tsorted->Delete();
434        TClonesArray &ttsorted = *tsorted;
435        if(!timage)timage = new TClonesArray("PamTrack",trk2_obj->GetNTracks());
436        timage->Delete();
437        TClonesArray &ttimage = *timage;
438    
439    
440      // loop over the tracks sorted by the tracker      // loop over the tracks sorted by the tracker
441      Bool_t use_TRK = how.Contains("TRK", TString::kIgnoreCase);      Bool_t use_TRK = how.Contains("TRK", TString::kIgnoreCase);
442      Bool_t use_CAL = how.Contains("CAL", TString::kIgnoreCase);      Bool_t use_CAL = how.Contains("CAL", TString::kIgnoreCase);
443      Bool_t use_TOF = how.Contains("TOF", TString::kIgnoreCase);      Bool_t use_TOF = how.Contains("TOF", TString::kIgnoreCase);
444            
445      if( !CAL &&  use_CAL) use_CAL = false;      if( !CAL2 &&  use_CAL) use_CAL = false;
446      if( !TOF &&  use_TOF) use_TOF = false;      if( !TOF &&  use_TOF) use_TOF = false;
447            
448      if( !TRK ){      if( !TRK2 ){
449          cout << "SortTracks() : without tracker does not work!!! (not yet)" << endl;  //      cout << "SortTracks() : without tracker does not work!!! (not yet)" << endl;
450          return;          return;
451      };      };
452    
453        //   cout << "use_CAL "<<use_CAL<<" use_TOF "<<use_TOF<<" use_TRK "<<use_TRK <<endl;
454            
455      for(Int_t i=0; i < TrkLevel2::GetNTracks(); i++){      for(Int_t i=0; i < trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks(); i++){
456                    
457          TrkTrack *ts = 0;          TrkTrack   *ts = 0;
458            CaloTrkVar *cs = 0;
459            ToFTrkVar  *os = 0;
460                    
461          // get tracker tracks          // get tracker tracks
462          TrkTrack   *tp = TrkLevel2::GetTrack(i);                    //tracker          TrkTrack   *tp = trk2_obj->TrkLevel2::GetTrack(i);                    //tracker
463  //              CaloTrkVar *cp = GetCaloStoredTrack(tp->GetSeqNo());          CaloTrkVar *cp = GetCaloStoredTrack(tp->GetSeqNo());
464  //              ToFTrkVar  *op = GetToFStoredTrack(tp->GetSeqNo());          ToFTrkVar  *op = GetToFStoredTrack(tp->GetSeqNo());
465          CaloTrkVar *cp = 0;  
466          ToFTrkVar  *op = 0;          TrkTrack   *ti = 0;              //tracker (image)
467                    CaloTrkVar *ci = 0;
468            ToFTrkVar  *oi = 0;
469    //      cout << "trk track n. "<<i << " "<<hex<< tp <<dec<< endl;
470          // if track has an image, check image selection          // if track has an image, check image selection
471          if(tp->HasImage()){          if(tp->HasImage()){
472                            
473              TrkTrack   *ti = TrkLevel2::GetTrackImage(i);              //tracker (image)              ti = trk2_obj->TrkLevel2::GetTrackImage(i);              //tracker (image)
474  //                      CaloTrkVar *ci = GetCaloStoredTrack(ti->GetSeqNo());              ci = GetCaloStoredTrack(ti->GetSeqNo());
475  //                      ToFTrkVar  *oi = GetToFStoredTrack(ti->GetSeqNo());              oi = GetToFStoredTrack(ti->GetSeqNo());
             CaloTrkVar *ci = 0;  
             ToFTrkVar  *oi = 0;  
476                            
477    //          cout << "its image "<<i << " "<<hex<< ti <<dec<< endl;
478    
479              //assign starting scores              //assign starting scores
480              Int_t tp_score = 0;  //main track sorted by the tracker              Int_t tp_score = 0;  //main track sorted by the tracker
481              Int_t ti_score = 0;  //image track              Int_t ti_score = 0;  //image track
# Line 280  void PamLevel2::SortTracks(TString how){ Line 485  void PamLevel2::SortTracks(TString how){
485              // ------------------------              // ------------------------
486              // check the Y spatial residual on the first calorimeter plane              // check the Y spatial residual on the first calorimeter plane
487              // (cut on calorimeter variables from Emiliano)              // (cut on calorimeter variables from Emiliano)
488                if( use_CAL && !calo2_obj ){
489                    cout << "void PamLevel2::SortTracks(TString how): how= "<<how<<" but CaloLevel2 not loaded !!!";
490                    return;
491                };
492              if(              if(
493                  use_CAL            &&                  use_CAL            &&
494                  npcfit[1] > 15     &&   //no. of fit planes on Y view                  calo2_obj->npcfit[1] > 15     &&   //no. of fit planes on Y view
495                  varcfit[1] < 1000. &&  //fit variance on Y view                  calo2_obj->varcfit[1] < 1000. &&  //fit variance on Y view
496                  true){                  true){
497    
498                                    
499                  cp = GetCaloStoredTrack(tp->GetSeqNo());                  Float_t resy_p = cp->tbar[0][1] - calo2_obj->cbar[0][1]; if(resy_p < 0)resy_p= - resy_p;
500                  ci = GetCaloStoredTrack(ti->GetSeqNo());                  Float_t resy_i = ci->tbar[0][1] - calo2_obj->cbar[0][1]; if(resy_i < 0)resy_i= - resy_i;
                   
                 Float_t resy_p = cp->tbar[0][1] - cbar[0][1]; if(resy_p < 0)resy_p= - resy_p;  
                 Float_t resy_i = ci->tbar[0][1] - cbar[0][1]; if(resy_i < 0)resy_i= - resy_i;  
501                                    
502                  if(resy_p <= resy_i) tp_score++;                  if(resy_p <= resy_i) tp_score++;
503                  else                 ti_score++;                  else                 ti_score++;
504    
505    //              cout << "CALO "<<tp_score<<ti_score<<endl;
506    
507              };              };
508              // ------------------------              // ------------------------
509              // TOF check              // TOF check
510              // ------------------------                  // ------------------------    
511              // check the number of hit pmts along the track              // check the number of hit pmts along the track
512              // on S12 S21 and S32, where paddles are parallel to Y axis              // on S12 S21 and S32, where paddles are parallel to Y axis
513                if( use_TOF && !tof_obj ){
514                    cout << "void PamLevel2::SortTracks(TString how): how= "<<how<<" but ToFLevel2 not loaded !!!";
515                    return;
516                };
517              if( use_TOF ){              if( use_TOF ){
518                                    
519                  Int_t nphit_p =0;                  Int_t nphit_p =0;
520                  Int_t nphit_i =0;                  Int_t nphit_i =0;
521                                    
                 op = GetToFStoredTrack(tp->GetSeqNo());  
                 oi = GetToFStoredTrack(ti->GetSeqNo());  
522                                    
523  /*                              cout << "track: npmtadc "<< op->npmtadc << endl;  /*                              cout << "track: npmtadc "<< op->npmtadc << endl;
524                                  cout << "track: npmttdc "<< op->npmttdc << endl;                                  cout << "track: npmttdc "<< op->npmttdc << endl;
# Line 314  void PamLevel2::SortTracks(TString how){ Line 526  void PamLevel2::SortTracks(TString how){
526                                  cout << "image: npmttdc "<< oi->npmttdc << endl;*/                                  cout << "image: npmttdc "<< oi->npmttdc << endl;*/
527                                    
528                  for (Int_t ih=0; ih < op->npmtadc; ih++){                  for (Int_t ih=0; ih < op->npmtadc; ih++){
529                      Int_t pl = GetPlaneIndex( (op->pmtadc).At(ih) );                      Int_t pl = tof_obj->GetPlaneIndex( (op->pmtadc).At(ih) );
530                      if(pl == 1 || pl == 2 || pl == 5)nphit_p++;                      if(pl == 1 || pl == 2 || pl == 5)nphit_p++;
531                  };                  };
532                                    
533                  for (Int_t ih=0; ih < oi->npmtadc; ih++){                  for (Int_t ih=0; ih < oi->npmtadc; ih++){
534                      Int_t pl = GetPlaneIndex( (oi->pmtadc).At(ih) );                      Int_t pl = tof_obj->GetPlaneIndex( (oi->pmtadc).At(ih) );
535                      if(pl == 1 || pl == 2 || pl == 5)nphit_i++;                      if(pl == 1 || pl == 2 || pl == 5)nphit_i++;
536                  };                  };
537                                    
# Line 331  void PamLevel2::SortTracks(TString how){ Line 543  void PamLevel2::SortTracks(TString how){
543                      if( nphit_p >= nphit_i) tp_score++;                      if( nphit_p >= nphit_i) tp_score++;
544                      else ti_score++;                      else ti_score++;
545                  };                  };
546    //              cout << "TOF "<<tp_score<<ti_score<<endl;
547              };              };
548              if(tp_score == ti_score) use_TRK = true;              if(tp_score == ti_score) use_TRK = true;
549              // ------------------------              // ------------------------
# Line 342  void PamLevel2::SortTracks(TString how){ Line 555  void PamLevel2::SortTracks(TString how){
555              if(use_TRK){              if(use_TRK){
556                  if(      tp->chi2 > 0 && tp->chi2 < ti->chi2 ) tp_score++ ;                  if(      tp->chi2 > 0 && tp->chi2 < ti->chi2 ) tp_score++ ;
557                  else if( ti->chi2 > 0 && ti->chi2 < tp->chi2 ) ti_score++ ;                  else if( ti->chi2 > 0 && ti->chi2 < tp->chi2 ) ti_score++ ;
558    //              cout << "TRK "<<tp_score<<ti_score<<endl;
559              };              };
560                            
561              // ------------------------              // ------------------------
562              // the winner is....              // the winner is....
563              // ------------------------                  // ------------------------    
564              if      (tp_score > ti_score) ts = tp;//the track sorted by the tracker!!              if      (tp_score > ti_score) {
565              else if (tp_score < ti_score) ts = ti;//its image!!  //              ts = tp;//the track sorted by the tracker!!
566              else {  //              cs = cp;
567                  ts = tp;  //              os = op;
568                }else if (tp_score < ti_score) {
569                    ts = ti;//its image!!
570                    cs = ci;
571                    os = oi;
572    
573                    ti = tp;//its image!!
574                    ci = cp;
575                    oi = op;
576    
577                    tp = ts;//its image!!
578                    cp = cs;
579                    op = os;
580    
581                    
582                }else {
583    //              ts = tp;
584    //              cs = cp;
585    //              os = op;
586  //                              cout << "Warning - track image ambiguity not solved" << endl;  //                              cout << "Warning - track image ambiguity not solved" << endl;
587  //                              cout << ts->GetNtot() << " "<< ts->chi2 << " " << npcfit[1] << " "<< nphit_p << endl;  //                              cout << ts->GetNtot() << " "<< ts->chi2 << " " << npcfit[1] << " "<< nphit_p << endl;
588              };              };
589                            
590          }else{          }else{
591              ts = tp;  //          ts = tp;
592    //          cs = cp;
593    //          os = op;
594          };          };
595                    
596  //              cout <<" SortTracks() "<<i<<" -- "<<ts<<endl;  //      cout <<" SortTracks() "<<i<<" -- "<<ts<<endl;
597          sorted_tracks->Add(ts);//save the track in the sorted array  //      sorted_tracks->Add(ts);//save the track in the sorted array
598  //              cout << "SortTracks:: sorted_tracks->Add(it) "<<i<<" "<<ts<<endl;  //      sorted_tracks.Add(ts);//save the track in the sorted array
599            //      sorted_tracks.Add(tp);//save the track in the sorted array
600      };  //      cout << "SortTracks:: sorted_tracks->Add(it) "<<i<<" "<<ts<<endl;
601    //      cout<<"o "<<tp<<endl;
602    //      cout<<"o "<<cp<<endl;
603    //      cout<<"o "<<op<<endl;
604            new(ttsorted[i]) PamTrack(tp,cp,op);
605            new(ttimage[i])  PamTrack(ti,ci,oi);
606        };
607    
608        if( tsorted->GetEntries() != trk2_obj->GetNTracks() ){
609            cout << "void PamLevel2::SortTracks(TString how): tsorted->GetEntries() "<<tsorted->GetEntries()<<" != trk2_obj->GetNTracks() = "<<trk2_obj->GetNTracks() <<endl;
610            tsorted->Delete(); tsorted=0;
611            timage->Delete(); timage=0;    
612        }
613    
614      //Restore Object count      //Restore Object count
615      //To save space in the table keeping track of all referenced objects      //To save space in the table keeping track of all referenced objects
616      //we assume that our events do not address each other. We reset the      //We reset the object count to what it was at the beginning of the event.
     //object count to what it was at the beginning of the event.  
617      TProcessID::SetObjectCount(ObjectNumber);      TProcessID::SetObjectCount(ObjectNumber);
618            
619  };  };
# Line 379  void PamLevel2::SortTracks(TString how){ Line 625  void PamLevel2::SortTracks(TString how){
625   * This method overrides TrkLevel2::GetTracks(), where sorting is done by decreasing number of fit points and increasing chi^2.   * This method overrides TrkLevel2::GetTracks(), where sorting is done by decreasing number of fit points and increasing chi^2.
626   * PamLevel2::GetTracks() keeps the same track order given by TrkLevel2::GetTracks(), but checks image selection by using calorimeter and ToF tracking information.   * PamLevel2::GetTracks() keeps the same track order given by TrkLevel2::GetTracks(), but checks image selection by using calorimeter and ToF tracking information.
627   */   */
628   TRefArray *PamLevel2::GetTracks(){  // TRefArray *PamLevel2::GetTracks(){
629           //  
630  //      SortTracks("+CAL+TOF");  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
631           SortTracks("+CAL+TRK");//TEMP!!!!!!!!!!!!!  //     SortTracks("+CAL+TOF");
632          //  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
633          return sorted_tracks;  
634    // //   return  sorted_tracks;
635    //     return &sorted_tracks;
636        
637    //  };
638    TClonesArray *PamLevel2::GetTracks(){
639    
640    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
641        SortTracks("+CAL+TOF");
642    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
643    
644        return tsorted;
645        
646   };   };
647  //--------------------------------------  //--------------------------------------
648   //   //
# Line 396  void PamLevel2::SortTracks(TString how){ Line 654  void PamLevel2::SortTracks(TString how){
654   * @param it Track number, ranging from 0 to GetNTracks().   * @param it Track number, ranging from 0 to GetNTracks().
655   */   */
656  PamTrack *PamLevel2::GetTrack(int it){  PamTrack *PamLevel2::GetTrack(int it){
657    
658    //    if(!trk2_obj) return 0;
659                    
660  //  *-*-*-*-*-*-*  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
661  //      SortTracks("+CAL+TOF");  //     SortTracks("+CAL+TOF");
662      SortTracks("+CAL+TRK");//TEMP!!!!!!!!!!!!!  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
663  //  *-*-*-*-*-*-*  // //    if(!sorted_tracks)return 0;
664    //     if(sorted_tracks.IsEmpty())return 0;
665    
666    //     PamTrack *track = 0;
667        
668    //     if( it >=0 && it < trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks() && it<sorted_tracks.GetEntriesFast() ){    
669    //      TrkTrack   *t = (TrkTrack*)sorted_tracks.At(it);
670    //      track = GetPamTrackAlong(t);
671    //     }else{
672    //      cout << "PamLevel2::GetTrack(int) : tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
673    //     };
674        
675    //     return track;
676    
677    //    cout << "PamLevel2::GetTrack(int it) "<<endl;
678    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
679        SortTracks("+CAL+TOF");
680    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
681        if(!tsorted)return 0;
682        if(!tsorted->GetEntries())return 0;
683    
684      PamTrack *track = 0;      PamTrack *track = 0;
685            
686      if( it >=0 && it < TrkLevel2::GetNTracks() && it<sorted_tracks->GetEntriesFast() ){      if( it >=0 && it < trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()){
687          TrkTrack   *t = (TrkTrack*)sorted_tracks->At(it);  //      TrkTrack   *t = (TrkTrack*)sorted_tracks.At(it);
688          track = GetPamTrackAlong(t);  //      track = GetPamTrackAlong(t);
689            TClonesArray &t = *(tsorted);
690            track = (PamTrack*)t[it];
691            
692      }else{      }else{
693          cout << "PamLevel2::GetTrack(int) : tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;          cout << "PamLevel2::GetTrack(int) : tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
694      };      };
695            
696      return track;      return track;
# Line 425  PamTrack *PamLevel2::GetTrack(int it){ Line 707  PamTrack *PamLevel2::GetTrack(int it){
707   */   */
708  PamTrack *PamLevel2::GetTrackImage(int it){  PamTrack *PamLevel2::GetTrackImage(int it){
709    
710  //      SortTracks("+CAL+TOF");  //     if(!trk2_obj) return 0;
         SortTracks("+CAL+TRK");//TEMP!!!!!!!!!!!!!  
           
         PamTrack *image = 0;  
711    
712          if( it >=0 && it < TrkLevel2::GetNTracks() ){  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
713                  TrkTrack *temp = (TrkTrack*)sorted_tracks->At(it);  //     SortTracks("+CAL+TOF");
714                  if( temp->HasImage() ){  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
715                          TrkTrack   *t = TrkLevel2::GetStoredTrack(temp->GetImageSeqNo());  // //    if(!sorted_tracks)return 0;
716                          image = GetPamTrackAlong(t);  //     if(sorted_tracks.IsEmpty())return 0;
717                  }else{      
718                          cout <<"PamLevel2::GetTrackImage(int) : Track SeqNo "<<it<<" does not have image"<<endl;  //     PamTrack *image = 0;
719                  };      
720    //     if( it >=0 && it < trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks() ){
721    //      TrkTrack *temp = (TrkTrack*)sorted_tracks.At(it);
722    //      if( temp->HasImage() ){
723    //          TrkTrack   *t = trk2_obj->TrkLevel2::GetStoredTrack(temp->GetImageSeqNo());
724    //          image = GetPamTrackAlong(t);
725    //      }else{
726    //          cout <<"PamLevel2::GetTrackImage(int) : Track SeqNo "<<it<<" does not have image"<<endl;
727    //      };
728    //     }else{
729    //      cout << "PamLevel2::GetTrackImage(int) : Tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
730    //     };
731        
732    //     return image;
733    
734    
735    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
736        SortTracks("+CAL+TOF");
737    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
738        if(!timage)return 0;
739        if(!timage->GetEntries())return 0;
740        
741        PamTrack *image = 0;
742        
743        if( it >=0 && it < trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks() ){
744            TClonesArray &t = *(tsorted);
745            PamTrack *temp = (PamTrack*)t[it];
746            if( temp->GetTrkTrack()->HasImage() ){
747                TClonesArray &t = *(timage);
748                image = (PamTrack*)t[it];
749          }else{          }else{
750                  cout << "PamLevel2::GetTrackImage(int) : Tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;  //          cout <<"PamLevel2::GetTrackImage(int) : Track SeqNo "<<it<<" does not have image"<<endl;
751          };          };
752        }else{
753            cout << "PamLevel2::GetTrackImage(int) : Tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
754        };
755            
756          return image;      return image;
757  }  }
758    
759  //--------------------------------------  //--------------------------------------
# Line 455  PamTrack *PamLevel2::GetTrackImage(int i Line 766  PamTrack *PamLevel2::GetTrackImage(int i
766   * @param detlist String to select trees to be included   * @param detlist String to select trees to be included
767   * @return Pointer to a TTree   * @return Pointer to a TTree
768   */   */
769  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, TString detlist="+ALL"){  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, TString detlist ){
770    
771  //      cout << "WARNING!!! -- obsolete method -- \n";  //     if( !detlist.IsNull() ) SetWhichTrees(detlist);
772  //      cout << "better use TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList*, TString) \n";  //     else                    GetWhichTrees(f);
           
     TTree *Trout =0;  
       
773      SetWhichTrees(detlist);      SetWhichTrees(detlist);
774    
775        TTree *Trout =0;
776    
777        TString fname = f->GetName();
778        if(!CheckLevel2File(fname))return NULL;
779    
780        UInt_t *found=0;    
781    
782        cout<< "GetPamTree(TFile*,TString): detector list --> ";
783        if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
784        if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
785        if(TRKh)cout<<"TRKH ";
786        if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
787        if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
788        if(TOF)cout<<"TOF ";
789        if(TRG)cout<<"TRG ";
790        if(AC)cout<<"AC ";
791        if(ND)cout<<"ND ";
792        if(S4)cout<<"S4 ";
793        if(ORB)cout<<"ORB ";
794        cout << endl;
795    
796        f->cd();
797    
798  // Tracker  // Tracker
799      TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");      TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");
800      if(T && TRK) {      if(T && (TRK2||TRK1||TRKh)) {
801          if(TRK_L1){          if(TRK2)T->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerTo("TrkLevel2"));
802              T->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerToTrk(1));          else    T->SetBranchStatus("TrkLevel2",0,found);
803              cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;          if(TRK2)cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;
804          };          if(TRK1)T->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel1"));
805          T->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerToTrk(2));          else    T->SetBranchStatus("TrkLevel1",0,found);
806          cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;          if(TRK1)cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;
807          Trout=T;          if(TRKh)T->SetBranchAddress("TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
808            else    T->SetBranchStatus("TrkHough",0,found);
809            if(TRKh)cout << "Tracker      : set branch address TrkHough"<<endl;
810            if(!Trout)Trout=T;
811            else Trout->AddFriend(T);
812      }else{      }else{
813          cout << "Tracker      : missing tree"<<endl;          cout << "Tracker      : missing tree"<<endl;
814      };      };
815      // Calorimeter      // Calorimeter
816      TTree *C = (TTree*)f->Get("Calorimeter");      TTree *C = (TTree*)f->Get("Calorimeter");
817      if(C && CAL) {      if(C && (CAL2||CAL1)) {
818          C->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerToCalo());          if(CAL2)C->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
819          cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;          else    C->SetBranchStatus("CaloLevel2",0,found);
820            if(CAL2)cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;
821            if(CAL1)C->SetBranchAddress("CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
822            else    C->SetBranchStatus("CaloLevel1",0,found);
823            if(CAL1)cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel1"<<endl;
824          if(!Trout)Trout=C;          if(!Trout)Trout=C;
825          else Trout->AddFriend(C);          else Trout->AddFriend(C);
826      }else{      }else{
827          cout << "Calorimeter  : missing tree"<<endl;          cout << "Calorimeter  : missing tree"<<endl;
828      };      };
829    
830      // ToF          // ToF    
831      TTree *O = (TTree*)f->Get("ToF");      TTree *O = (TTree*)f->Get("ToF");
832      if(O && TOF) {      if(O && TOF) {
833          O->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerToToF());          O->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
834          cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;          cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;
835          if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
836          else Trout->AddFriend(O);          else Trout->AddFriend(O);
# Line 499  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 840  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
840      // Trigger      // Trigger
841      TTree *R = (TTree*)f->Get("Trigger");      TTree *R = (TTree*)f->Get("Trigger");
842      if(R && TRG) {      if(R && TRG) {
843          R->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerToTrig());          R->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
844          cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;          cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;
845          if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
846          else Trout->AddFriend(R);          else Trout->AddFriend(R);
# Line 509  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 850  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
850      // S4      // S4
851      TTree *S = (TTree*)f->Get("S4");      TTree *S = (TTree*)f->Get("S4");
852      if(S && S4) {      if(S && S4) {
853          S->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerToS4());          S->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
854          cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;          cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;
855          if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
856          else Trout->AddFriend(S);          else Trout->AddFriend(S);
# Line 519  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 860  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
860      // Neutron Detector      // Neutron Detector
861      TTree *N = (TTree*)f->Get("NeutronD");      TTree *N = (TTree*)f->Get("NeutronD");
862      if(N && ND) {      if(N && ND) {
863          N->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerToND());          N->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
864          cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;          cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;
865          if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
866          else Trout->AddFriend(N);          else Trout->AddFriend(N);
# Line 529  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 870  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
870      // Anticounters      // Anticounters
871      TTree *A = (TTree*)f->Get("Anticounter");      TTree *A = (TTree*)f->Get("Anticounter");
872      if(A && AC) {      if(A && AC) {
873          A->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerToAc());          A->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
874          cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;          cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;
875          if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
876          else Trout->AddFriend(A);          else Trout->AddFriend(A);
# Line 537  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 878  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
878          cout << "Anticounter  : missing tree"<<endl;          cout << "Anticounter  : missing tree"<<endl;
879      };      };
880      // Orbital Info      // Orbital Info
881          TTree *B = (TTree*)f->Get("OrbitalInfo");      TTree *B = (TTree*)f->Get("OrbitalInfo");
882          if(B && ORB) {      if(B && ORB) {
883                  B->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerToOrb());          B->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
884                  cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;          cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;
885                  if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
886                  else Trout->AddFriend(B);          else Trout->AddFriend(B);
887          }else{      }else{
888                  cout << "OrbitalInfo  : missing tree"<<endl;          cout << "OrbitalInfo  : missing tree"<<endl;
889          };      };
890            
891          cout<<endl<<" Number of entries: "<<Trout->GetEntries()<<endl<<endl;      cout<<endl<<" Number of entries: "<<Trout->GetEntries()<<endl<<endl;
892                
893          return Trout;      return Trout;
894            
895  }  }
896  //--------------------------------------  //--------------------------------------
# Line 574  TList*  PamLevel2::GetListOfLevel2Files( Line 915  TList*  PamLevel2::GetListOfLevel2Files(
915      TList *contents  = new TList; // create output list      TList *contents  = new TList; // create output list
916      contents->SetOwner();      contents->SetOwner();
917            
918      char *fullpath;  //    char *fullpath;
919        const char *fullpath;
920            
921      // if no input file list is given:        // if no input file list is given:  
922      if ( flisttxt != "" ){      if ( flisttxt != "" ){
923                    
924          if( !gSystem->IsFileInIncludePath(flisttxt,&fullpath) )return 0;  //      if( !gSystem->IsFileInIncludePath(flisttxt,&fullpath) ){        
925                    if( !(fullpath = gSystem->FindFile("./",flisttxt)) ){
926                cout <<"File "<<flisttxt<<" not found"<<endl;
927                return 0;
928            }      
929  //              flisttxt = gSystem->ConcatFileName(gSystem->DirName(flisttxt),gSystem->BaseName(flisttxt));  //              flisttxt = gSystem->ConcatFileName(gSystem->DirName(flisttxt),gSystem->BaseName(flisttxt));
930          flisttxt = fullpath;          flisttxt = fullpath;
931            
932          if( !gSystem->ChangeDirectory(ddir) )return 0;          if( !gSystem->ChangeDirectory(ddir) ){
933                cout << "Cannot change directory : "<<ddir<<endl;
934                return 0;
935            }
936                    
937          cout <<"Input file list : " << flisttxt <<endl;          cout <<"Input file list : " << flisttxt <<endl;
938          ifstream in;          ifstream in;
939          in.open(flisttxt, ios::in); //open input file list          in.open(flisttxt, ios::in); //open input file list
940            int line=0;
941          while (1) {          while (1) {
942              TString file;              TString file;
943              in >> file;              in >> file;
944              if (!in.good()) break;              if (!in.good()) break;
945              if( gSystem->IsFileInIncludePath(file,&fullpath) ){              line++;
946  //                              contents->Add(new TSystemDirectory(fullpath,ddir)); // add file to the list  //          cout <<"(1) " << file << endl;
947  //                              contents->Add(new TSystemFile(fullpath,ddir)); // add file to the list              if(file.IsNull()){
948                    cout << "-- list interrupted at line "<<line <<endl;
949                    break;
950                }
951                if(file.Contains("#"))file = file(0,file.First("#"));
952    //          cout <<"(2) " << file << endl;
953    //          if( gSystem->IsFileInIncludePath(file,&fullpath) ){
954                if( (fullpath = gSystem->FindFile(ddir,file)) ){
955    
956                  contents->Add(new TSystemFile(fullpath,gSystem->DirName(fullpath)));// add file to the list                  contents->Add(new TSystemFile(fullpath,gSystem->DirName(fullpath)));// add file to the list
957    
958              }else{              }else{
959                  cout << "warning! --- File "<<file<<" does not exists"<< endl;  //              if(file.Data()!="")cout << "File: "<<file<<" ---> missing "<< endl;
960              };              };
961          };          };
962          in.close();          in.close();
# Line 621  TList*  PamLevel2::GetListOfLevel2Files( Line 979  TList*  PamLevel2::GetListOfLevel2Files(
979          while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {          while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {
980              TString name =  questo-> GetName();              TString name =  questo-> GetName();
981              if( name.EndsWith(".root") ){              if( name.EndsWith(".root") ){
982                  char *fullpath;                  const char *fullpath = gSystem->FindFile(ddir,name);
983                  gSystem->IsFileInIncludePath(name,&fullpath);  //              char *fullpath;
984    //              gSystem->IsFileInIncludePath(name,&fullpath);
985                  contents->Add(new TSystemFile(fullpath,gSystem->DirName(fullpath)));                  contents->Add(new TSystemFile(fullpath,gSystem->DirName(fullpath)));
986              };              };
987          }          }
# Line 648  TList*  PamLevel2::GetListOfLevel2Files( Line 1007  TList*  PamLevel2::GetListOfLevel2Files(
1007   * @param detlist String to select trees to be included   * @param detlist String to select trees to be included
1008   * @return Pointer to a TChain   * @return Pointer to a TChain
1009   */   */
1010  TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList *fl, TString detlist="+ALL"){  TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList *fl, TString detlist ){
   
 //      TChain *Tout=0;  
     if(Tout)Tout->Delete();  
     Tout = NULL;  
1011            
1012        TChain *Trout =0;
1013    
1014    //    if( !detlist.IsNull() )SetWhichTrees(detlist);
1015      SetWhichTrees(detlist);      SetWhichTrees(detlist);
1016            
1017        cout<< "GetPamTree(TList*,TString): input detector list --> ";
1018        if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
1019        if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
1020        if(TRKh)cout<<"TRKH ";
1021        if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
1022        if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
1023        if(TOF)cout<<"TOF ";
1024        if(TRG)cout<<"TRG ";
1025        if(AC)cout<<"AC ";
1026        if(ND)cout<<"ND ";
1027        if(S4)cout<<"S4 ";
1028        if(ORB)cout<<"ORB ";
1029        cout << endl;
1030    
1031      TChain *T = 0;            TChain *T = 0;      
1032      TChain *C = 0;      TChain *C = 0;
1033      TChain *O = 0;      TChain *O = 0;
# Line 665  TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList *fl, Line 1037  TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList *fl,
1037      TChain *A = 0;      TChain *A = 0;
1038      TChain *B = 0;      TChain *B = 0;
1039            
1040      if(TRK) T = new TChain("Tracker");        if(TRK2||TRK1||TRKh) T = new TChain("Tracker");    
1041      if(CAL) C = new TChain("Calorimeter");      if(CAL2||CAL1)       C = new TChain("Calorimeter");
1042      if(TOF) O = new TChain("ToF");      if(TOF)              O = new TChain("ToF");
1043      if(TRG) R = new TChain("Trigger");      if(TRG)              R = new TChain("Trigger");
1044      if(S4)  S = new TChain("S4");      if(S4)               S = new TChain("S4");
1045      if(ND)  N = new TChain("NeutronD");      if(ND)               N = new TChain("NeutronD");
1046      if(AC)  A = new TChain("Anticounter");      if(AC)               A = new TChain("Anticounter");
1047      if(ORB) B = new TChain("OrbitalInfo");      if(ORB)              B = new TChain("OrbitalInfo");
1048            
1049      // loop over files and create chains              // loop over files and create chains        
1050      TIter next(fl);      TIter next(fl);
1051      TSystemFile *questo = 0;      TSystemFile *questo = 0;
1052      while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {      while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {
1053          TString name =  questo->GetName();          TString name =  questo->GetName();
1054  //              cout << "File: "<< name << endl;          cout << "File: "<< name << endl;
1055          if( CheckLevel2File(name) ){          if( CheckLevel2File(name) ){
1056              if(TRK) T->Add(name);              if(TRK2||TRK1||TRKh) T->Add(name);
1057              if(CAL) C->Add(name);              if(CAL1||CAL2)       C->Add(name);
1058              if(TOF) O->Add(name);              if(TOF)              O->Add(name);
1059              if(TRG) R->Add(name);              if(TRG)              R->Add(name);
1060              if(S4)  S->Add(name);              if(S4)               S->Add(name);
1061              if(ND)  N->Add(name);              if(ND)               N->Add(name);
1062              if(AC)  A->Add(name);              if(AC)               A->Add(name);
1063              if(ORB) B->Add(name);              if(ORB)              B->Add(name);
1064          };          };
1065      }      }
1066            
1067      cout << "done chain \n";      cout << "done chain \n";
1068    
1069      // Tracker      UInt_t *found=0;
1070      if(TRK) if(!Tout)Tout=T;  // Tracker
1071        if(T && (TRK2||TRK1||TRKh)) {
1072            if(TRK2)T->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerTo("TrkLevel2"));
1073            else    T->SetBranchStatus("TrkLevel2",0,found);
1074            if(TRK2)cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;
1075            if(TRK1)T->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel1"));
1076            else    T->SetBranchStatus("TrkLevel1",0,found);
1077            if(TRK1)cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;
1078            if(TRKh)T->SetBranchAddress("TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
1079            else    T->SetBranchStatus("TrkHough",0,found);
1080            if(TRKh)cout << "Tracker      : set branch address TrkHough"<<endl;
1081            if(!Trout)Trout=T;
1082            else Trout->AddFriend("Tracker");
1083        }else{
1084            cout << "Tracker      : missing tree"<<endl;
1085        };
1086      // Calorimeter      // Calorimeter
1087      if(CAL) {                if(C && (CAL2||CAL1)) {
1088          if(!Tout)Tout=C;          if(CAL2)C->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
1089          else Tout->AddFriend("Calorimeter");          else    C->SetBranchStatus("CaloLevel2",0,found);
1090            if(CAL2)cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;
1091            if(CAL1)C->SetBranchAddress("CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
1092            else    C->SetBranchStatus("CaloLevel1",0,found);
1093            if(CAL1)cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel1"<<endl;
1094            if(!Trout)Trout=C;
1095            else Trout->AddFriend("Calorimeter");
1096        }else{
1097            cout << "Calorimeter  : missing tree"<<endl;
1098      };      };
1099      // ToF          // ToF    
1100      if(TOF) {      if(O && TOF) {
1101          if(!Tout)Tout=O;          O->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
1102          else Tout->AddFriend("ToF");          cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;
1103            if(!Trout)Trout=O;
1104            else Trout->AddFriend("ToF");
1105        }else{
1106            cout << "ToF         : missing tree"<<endl;
1107      };      };
1108      // Trigger      // Trigger
1109      if(TRG) {      if(R && TRG) {
1110          if(!Tout)Tout=O;          R->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
1111          else Tout->AddFriend("Trigger");          cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;
1112            if(!Trout)Trout=O;
1113            else Trout->AddFriend("Trigger");
1114        }else{
1115            cout << "Trigger      : missing tree"<<endl;
1116      };      };
1117      // S4      // S4
1118      if(S4) {      if(S && S4) {
1119          if(!Tout)Tout=O;          S->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
1120          else Tout->AddFriend("S4");          cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;
1121            if(!Trout)Trout=O;
1122            else Trout->AddFriend("S4");
1123        }else{
1124            cout << "S4           : missing tree"<<endl;
1125      };      };
1126      // Neutron Detector      // Neutron Detector
1127      if(ND) {      if(N && ND) {
1128          if(!Tout)Tout=O;          N->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
1129          else Tout->AddFriend("NeutronD");          cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;
1130            if(!Trout)Trout=O;
1131            else Trout->AddFriend("NeutronD");
1132        }else{
1133            cout << "NeutronD     : missing tree"<<endl;
1134      };      };
1135      // Anticounters      // Anticounters
1136      if(AC) {      if(A && AC) {
1137          if(!Tout)Tout=O;          A->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
1138          else Tout->AddFriend("Anticounter");          cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;
1139            if(!Trout)Trout=O;
1140            else Trout->AddFriend("Anticounter");
1141        }else{
1142            cout << "Anticounter  : missing tree"<<endl;
1143      };      };
1144      // OrbitalInfo      // Orbital Info
1145      if(ORB) {      if(B && ORB) {
1146          if(!Tout)Tout=O;          B->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
1147          else Tout->AddFriend("OrbitalInfo");          cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;
1148            if(!Trout)Trout=O;
1149            else Trout->AddFriend("OrbitalInfo");
1150        }else{
1151            cout << "OrbitalInfo  : missing tree"<<endl;
1152      };      };
1153            
1154    //    cout<<endl<<" Number of entries: "<<Trout->GetEntries()<<endl<<endl;
1155    
1156        
1157    //     // Tracker
1158    //     if(TRK2||TRK1||TRKh){
1159    //      if(!Tout)Tout=T;
1160    //      else Tout->AddFriend("Tracker");
1161    //     }
1162    //     // Calorimeter
1163    //     if(CAL2||CAL1) {        
1164    //      if(!Tout)Tout=C;
1165    //      else Tout->AddFriend("Calorimeter");
1166    //     };
1167    //     // ToF    
1168    //     if(TOF) {
1169    //      if(!Tout)Tout=O;
1170    //      else Tout->AddFriend("ToF");
1171    //     };
1172    //     // Trigger
1173    //     if(TRG) {
1174    //      if(!Tout)Tout=R;
1175    //      else Tout->AddFriend("Trigger");
1176    //     };
1177    //     // S4
1178    //     if(S4) {
1179    //      if(!Tout)Tout=S;
1180    //      else Tout->AddFriend("S4");
1181    //     };
1182    //     // Neutron Detector
1183    //     if(ND) {
1184    //      if(!Tout)Tout=N;
1185    //      else Tout->AddFriend("NeutronD");
1186    //     };
1187    //     // Anticounters
1188    //     if(AC) {
1189    //      if(!Tout)Tout=A;
1190    //      else Tout->AddFriend("Anticounter");
1191    //     };
1192    //     // OrbitalInfo
1193    //     if(ORB) {
1194    //      if(!Tout)Tout=B;
1195    //      else Tout->AddFriend("OrbitalInfo");
1196    //     };
1197        
1198  //    cout<<endl<<" Number of entries: "<<Tout->GetEntries()<<endl<<endl;  //    cout<<endl<<" Number of entries: "<<Tout->GetEntries()<<endl<<endl;
1199            
1200      if( Tout->GetEntries() )PamLevel2::SetBranchAddress();  //    if( Tout->GetEntries() )PamLevel2::SetBranchAddress( Tout );
1201            
1202      return Tout;      return Trout;
1203  }  }
1204    
1205    
1206    
1207  //--------------------------------------  //--------------------------------------
1208  //  //
1209  //  //
# Line 745  TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList *fl, Line 1211  TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList *fl,
1211  /**  /**
1212   * Set branch addresses for Pamela friend trees   * Set branch addresses for Pamela friend trees
1213   */   */
1214  void PamLevel2::SetBranchAddress(){  void PamLevel2::SetBranchAddress(TTree *t){
1215    
1216        TRK2    = TRK2 & t->GetBranchStatus("TrkLevel2");
1217        TRK1    = TRK1 & t->GetBranchStatus("TrkLevel1");
1218        TRKh    = TRKh & t->GetBranchStatus("TrkHough");
1219        CAL2    = CAL2 & t->GetBranchStatus("CaloLevel2");
1220        CAL1    = CAL1 & t->GetBranchStatus("CaloLevel1");
1221        TOF    = TOF & t->GetBranchStatus("ToFLevel2");
1222        TRG    = TRG & t->GetBranchStatus("TrigLevel2");
1223        S4     = S4  & t->GetBranchStatus("S4Level2");
1224        ND     = ND  & t->GetBranchStatus("NDLevel2");
1225        AC     = AC  & t->GetBranchStatus("AcLevel2");
1226        ORB    = ORB & t->GetBranchStatus("OrbitalInfo");
1227    
1228    
1229      // Tracker      // Tracker
1230      if(TRK) {      if(TRK1) {
1231          if(TRK_L1){          t->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel2"));
1232              Tout->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerToTrk(1));          cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;
1233              cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;      };
1234          };      if(TRK2) {
1235          Tout->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerToTrk(2));          t->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerTo("TrkLevel1"));
1236          cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;          cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;
1237      };      };
1238        if(TRKh) {
1239            t->SetBranchAddress("TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
1240            cout << "Tracker      : set branch address TrkHough"<<endl;
1241        };
1242            
1243      // Calorimeter      // Calorimeter
1244      if(CAL) {      if(CAL1) {
1245          Tout->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerToCalo());          t->SetBranchAddress("CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
1246            cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel1"<<endl;
1247        };
1248        if(CAL2) {
1249            t->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
1250          cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;          cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;
1251      };      };
1252            
1253      // ToF          // ToF    
1254      if(TOF) {      if(TOF) {
1255          Tout->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerToToF());          t->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
1256          cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;          cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;
1257      };      };
1258      // Trigger      // Trigger
1259      if(TRG) {      if(TRG) {
1260          Tout->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerToTrig());          t->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
1261          cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;          cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;
1262      };      };
1263      // S4      // S4
1264      if(S4) {      if(S4) {
1265          Tout->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerToS4());          t->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
1266          cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;          cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;
1267      };      };
1268      // Neutron Detector      // Neutron Detector
1269      if(ND) {      if(ND) {
1270          Tout->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerToND());          t->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
1271          cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;          cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;
1272      };      };
1273      // Anticounters      // Anticounters
1274      if(AC) {      if(AC) {
1275          Tout->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerToAc());          t->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
1276          cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;          cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;
1277      };      };
1278      // OrbitalInfo      // OrbitalInfo
1279      if(ORB) {      if(ORB) {
1280          Tout->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerToOrb());          t->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
1281          cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;          cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;
1282      };      };
1283            
1284  }  }
1285    /**
1286     * Set branch addresses for Pamela friend trees
1287     */
1288    void PamLevel2::SetBranchAddress(TChain *t){
1289    
1290  //--------------------------------------      TRK2    = TRK2 & t->GetBranchStatus("TrkLevel2");
1291  //      TRK1    = TRK1 & t->GetBranchStatus("TrkLevel1");
1292  //      TRKh    = TRKh & t->GetBranchStatus("TrkHough");
1293  //--------------------------------------      CAL1    = CAL1 & t->GetBranchStatus("CaloLevel1");
1294  void *PamLevel2::GetPointerTo(const char* c ){      CAL2    = CAL2 & t->GetBranchStatus("CaloLevel2");
1295  //      cout << "objname "<< objname << endl;      TOF    = TOF & t->GetBranchStatus("ToFLevel2");
1296      TString objname = c;      TRG    = TRG & t->GetBranchStatus("TrigLevel2");
1297      if(!objname.CompareTo("TrkLevel1"))return &trk_l1_obj;      S4     = S4  & t->GetBranchStatus("S4Level2");
1298      if(!objname.CompareTo("TrkLevel2"))return &trk_obj;      ND     = ND  & t->GetBranchStatus("NDLevel2");
1299        AC     = AC  & t->GetBranchStatus("AcLevel2");
1300        ORB    = ORB & t->GetBranchStatus("OrbitalInfo");
1301    
1302        // Tracker
1303         if(TRK2) {
1304            t->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerTo("TrkLevel2"));
1305            cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;
1306        };
1307        if(TRK1) {
1308            t->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel1"));
1309            cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;
1310        };
1311         if(TRKh) {
1312            t->SetBranchAddress("TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
1313            cout << "Tracker      : set branch address TrkHough"<<endl;
1314         };
1315            
1316      return NULL;      // Calorimeter
1317  };      if(CAL2) {
1318            t->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
1319            cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;
1320        };  
1321        if(CAL1) {
1322            t->SetBranchAddress("CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
1323            cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel1"<<endl;
1324        };
1325        
1326        // ToF    
1327        if(TOF) {
1328            t->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
1329            cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;
1330        };
1331        // Trigger
1332        if(TRG) {
1333            t->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
1334            cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;
1335        };
1336        // S4
1337        if(S4) {
1338            t->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
1339            cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;
1340        };
1341        // Neutron Detector
1342        if(ND) {
1343            t->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
1344            cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;
1345        };
1346        // Anticounters
1347        if(AC) {
1348            t->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
1349            cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;
1350        };
1351        // OrbitalInfo
1352        if(ORB) {
1353            t->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
1354            cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;
1355        };
1356        
1357    }
1358    
1359    
1360  //--------------------------------------  //--------------------------------------
1361  //  //
1362  //  //
# Line 831  TChain *PamLevel2::GetRunTree(TList *fl) Line 1381  TChain *PamLevel2::GetRunTree(TList *fl)
1381          };          };
1382      }      }
1383            
1384      R->SetBranchAddress("RunInfo", GetPointerToRun());      R->SetBranchAddress("RunInfo", GetPointerTo("RunInfo"));
1385      cout << "Run         : set branch address RunInfo"<<endl;      cout << "Run         : set branch address RunInfo"<<endl;
1386        R->SetBranchAddress("SoftInfo", GetPointerTo("SoftInfo")); // Emiliano
1387        cout << "Software    : set branch address SoftInfo"<<endl; // Emiliano
1388            
1389      return R;      return R;
1390            
# Line 851  TTree *PamLevel2::GetRunTree(TFile *f){ Line 1403  TTree *PamLevel2::GetRunTree(TFile *f){
1403    
1404      TTree *R = (TTree*)f->Get("Run");      TTree *R = (TTree*)f->Get("Run");
1405            
1406      R->SetBranchAddress("RunInfo", GetPointerToRun());      R->SetBranchAddress("RunInfo", GetPointerTo("RunInfo"));
1407      cout << "Run         : set branch address RunInfo"<<endl;      cout << "Run         : set branch address RunInfo"<<endl;
1408        R->SetBranchAddress("SoftInfo", GetPointerTo("SoftInfo")); // Emiliano
1409        cout << "Software    : set branch address SoftInfo"<<endl; // Emiliano
1410            
1411      return R;      return R;
1412            
# Line 862  TTree *PamLevel2::GetRunTree(TFile *f){ Line 1416  TTree *PamLevel2::GetRunTree(TFile *f){
1416  //  //
1417  //--------------------------------------  //--------------------------------------
1418  /**  /**
1419   * Set which trees should be analysed   * Set which trees shoul be analysed
1420   * @param detlist TString containing the sequence of trees required   * @param detlist TString containing the sequence of trees required
1421  */  */
1422  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString detlist){  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString detlist){
1423                    
1424      if(detlist.Contains("+ALL", TString::kIgnoreCase)){      if(detlist.IsNull() || detlist.Contains("+ALL", TString::kIgnoreCase)){
1425          CAL = true;          CAL1 = true;
1426          TRK = true;          CAL2 = true;
1427          TRK_L1 = false;          TRK2 = true;
1428            TRK1 = false;
1429            TRKh = false;
1430          TRG = true;          TRG = true;
1431          TOF = true;          TOF = true;
1432          S4  = true;          S4  = true;
# Line 878  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString de Line 1434  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString de
1434          AC  = true;          AC  = true;
1435          ORB = true;          ORB = true;
1436      }else if( detlist.Contains("-ALL", TString::kIgnoreCase) ){      }else if( detlist.Contains("-ALL", TString::kIgnoreCase) ){
1437          CAL = false;          CAL1 = false;
1438          TRK = false;          CAL2 = false;
1439          TRK_L1 = false;          TRK2 = false;
1440            TRK1 = false;
1441            TRKh = false;
1442          TRG = false;          TRG = false;
1443          TOF = false;          TOF = false;
1444          S4  = false;          S4  = false;
# Line 889  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString de Line 1447  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString de
1447          ORB = false;          ORB = false;
1448      };      };
1449            
1450      if( detlist.Contains("-CAL", TString::kIgnoreCase) )CAL = false;  //  -------------------------------------------------------------------------
1451      else if( detlist.Contains("+CAL", TString::kIgnoreCase) )CAL = true;      if( detlist.Contains("CAL1", TString::kIgnoreCase) ){
1452                if ( detlist.Contains("-CAL1", TString::kIgnoreCase) )CAL1=false;
1453      if( detlist.Contains("-TRK", TString::kIgnoreCase) )TRK = false;          if ( detlist.Contains("+CAL1", TString::kIgnoreCase) )CAL1=true;
1454      else if( detlist.Contains("+TRK", TString::kIgnoreCase) )TRK = true;      };
1455                
1456      if( detlist.Contains("-TRK1", TString::kIgnoreCase) )TRK_L1 = false;      if( detlist.Contains("CAL2", TString::kIgnoreCase)){
1457      else if( detlist.Contains("+TRK1", TString::kIgnoreCase) )TRK_L1 = true;          if ( detlist.Contains("-CAL2", TString::kIgnoreCase) )CAL2=false;
1458            if ( detlist.Contains("+CAL2", TString::kIgnoreCase) )CAL2=true;
1459        };
1460            
1461        if( detlist.Contains("+CAL", TString::kIgnoreCase) && !CAL1 && !CAL2 )CAL2=true;
1462        if( detlist.Contains("-CAL", TString::kIgnoreCase) && CAL1 && CAL2 ){
1463            CAL2=false;
1464            CAL1=false;
1465        }
1466    //  -------------------------------------------------------------------------
1467        if( detlist.Contains("TRK1", TString::kIgnoreCase) ){
1468            if ( detlist.Contains("-TRK1", TString::kIgnoreCase) )TRK1=false;
1469            if ( detlist.Contains("+TRK1", TString::kIgnoreCase) )TRK1=true;
1470        };
1471            
1472        if( detlist.Contains("TRK2", TString::kIgnoreCase)){
1473            if ( detlist.Contains("-TRK2", TString::kIgnoreCase) )TRK2=false;
1474            if ( detlist.Contains("+TRK2", TString::kIgnoreCase) )TRK2=true;
1475        };
1476    
1477        if( detlist.Contains("TRKh", TString::kIgnoreCase)){
1478            if ( detlist.Contains("-TRKh", TString::kIgnoreCase) )TRKh=false;
1479            if ( detlist.Contains("+TRKh", TString::kIgnoreCase) )TRKh=true;
1480        };
1481            
1482        if( detlist.Contains("+TRK", TString::kIgnoreCase) && !TRK1 && !TRK2 && !TRKh )TRK2=true;
1483        if( detlist.Contains("-TRK", TString::kIgnoreCase) && TRK1 && TRK2 && TRKh){
1484            TRK2=false;
1485            TRK1=false;
1486            TRKh=false;
1487        }
1488    //  -------------------------------------------------------------------------
1489            
1490      if( detlist.Contains("-TRG", TString::kIgnoreCase) )TRG = false;      if( detlist.Contains("-TRG", TString::kIgnoreCase) )TRG = false;
1491      else if( detlist.Contains("+TRG", TString::kIgnoreCase) )TRG = true;      else if( detlist.Contains("+TRG", TString::kIgnoreCase) )TRG = true;
# Line 915  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString de Line 1504  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString de
1504            
1505      if( detlist.Contains("-ORB", TString::kIgnoreCase) )ORB = false;      if( detlist.Contains("-ORB", TString::kIgnoreCase) )ORB = false;
1506      else if( detlist.Contains("+ORB", TString::kIgnoreCase) )ORB = true;      else if( detlist.Contains("+ORB", TString::kIgnoreCase) )ORB = true;
1507    
1508    //     cout<< "Set detector list --> ";
1509    //     if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
1510    //     if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
1511    //     if(TRKh)cout<<"TRKH ";
1512    //     if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
1513    //     if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
1514    //     if(TOF)cout<<"TOF ";
1515    //     if(TRG)cout<<"TRG ";
1516    //     if(AC)cout<<"AC ";
1517    //     if(ND)cout<<"ND ";
1518    //     if(S4)cout<<"S4 ";
1519    //     if(ORB)cout<<"ORB ";
1520    //     cout << endl;
1521        
1522    };
1523    
1524    
1525    /**
1526     * Set tree/branch detector flags from the content of a tree
1527     */
1528    void  PamLevel2::GetWhichTrees(TFile* f){
1529            
1530        // -----------
1531        // reset flags
1532        // -----------
1533        CAL1   = false;    
1534        CAL2   = false;    
1535        TRK2   = false;    
1536        TRK1   = false;    
1537        TRKh   = false;    
1538        TRG    = false;    
1539        TOF    = false;    
1540        S4     = false;    
1541        ND     = false;    
1542        AC     = false;    
1543        ORB    = false;    
1544        
1545        RUN    = false;
1546            
1547        cout << "Checking file: "<<f->GetName()<<endl;
1548        if( !f || f->IsZombie() ){
1549            cout << "File: "<< f->GetName() <<" Non valid root file"<< endl;
1550            return;
1551        }
1552    
1553        TList *lk = f->GetListOfKeys();
1554        TIter next(lk);
1555        TKey *key =0;
1556    
1557        Int_t nev = 0;
1558    
1559        while( (key = (TKey*)next()) ){
1560            
1561            if( !strcmp(key->GetName(),"Run"        ) )RUN = true;
1562    
1563            //=========================================================    
1564            if( !strcmp(key->GetName(),"Trigger"    ) ){
1565                TRG = true;
1566                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("Trigger"))->GetEntries();
1567                if( nev && nevt!=nev){
1568                    cout << "File: "<< f->GetName() <<" Trigger tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1569                    TRG = false;
1570                }else nev=nevt;
1571            }
1572            //=========================================================    
1573            if( !strcmp(key->GetName(),"ToF"        ) ){
1574                TOF = true;
1575                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("ToF"))->GetEntries();
1576                if( nev && nevt!=nev){
1577                    cout << "File: "<< f->GetName() <<"     ToF tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1578                    TOF = false;
1579                }else nev=nevt;
1580            }
1581            //=========================================================  
1582            if( !strcmp(key->GetName(),"S4"         ) ){
1583                S4 = true;
1584                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("S4"))->GetEntries();
1585                if( nev && nevt!=nev){
1586                    cout << "File: "<< f->GetName() <<"      S4 tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1587                    S4 = false;
1588                }else nev=nevt;
1589            }
1590            //=========================================================  
1591    
1592            if( !strcmp(key->GetName(),"NeutronD"   ) ){
1593                ND = true;
1594                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("NeutronD"))->GetEntries();
1595                if( nev && nevt!=nev){
1596                    cout << "File: "<< f->GetName() <<"NeutronD tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1597                    ND =false;
1598                }else nev=nevt;
1599            }      
1600            //=========================================================  
1601            if( !strcmp(key->GetName(),"Anticounter") ){
1602                AC = true;
1603                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("Anticounter"))->GetEntries();
1604                if( nev && nevt!=nev){
1605                    cout << "File: "<< f->GetName() <<" Anticounter tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1606                    AC =false;
1607                }else nev=nevt;
1608            }
1609            //=========================================================  
1610            if( !strcmp(key->GetName(),"OrbitalInfo") ){
1611                ORB = true;
1612                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("OrbitalInfo"))->GetEntries();
1613                if( nev && nevt!=nev){
1614                    cout << "File: "<< f->GetName() <<" OrbitalInfo tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1615                    ORB = false;
1616                }else nev=nevt;
1617            }
1618            //=========================================================  
1619            if( !strcmp(key->GetName(),"Tracker"    ) ){
1620                TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");
1621                for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){
1622                    TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();
1623                    if( !name.CompareTo("TrkLevel1") )TRK1=true;
1624                    if( !name.CompareTo("TrkLevel2") )TRK2=true;
1625                    if( !name.CompareTo("TrkHough") )TRKh=true;
1626                };      
1627                Int_t nevt = T->GetEntries();
1628                if( nev && nevt!=nev){
1629                    cout << "File: "<< f->GetName() <<" Tracker tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1630                    TRK1 = false;
1631                    TRK2 = false;
1632                    TRKh = false;
1633                }else nev=nevt;
1634                T->Delete();
1635            };
1636            //=========================================================  
1637            if( !strcmp(key->GetName(),"Calorimeter"    ) ){
1638                TTree *T = (TTree*)f->Get("Calorimeter");
1639                for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){
1640                    TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();
1641                    if( !name.CompareTo("CaloLevel1") )CAL1=true;
1642                    if( !name.CompareTo("CaloLevel2") )CAL2=true;
1643                };    
1644                Int_t nevt = T->GetEntries();
1645                if( nev && nevt!=nev){
1646                    cout << "File: "<< f->GetName() <<"  Calorimeter tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1647                    CAL1 = false;
1648                    CAL2 = false;
1649                }else nev=nevt;
1650                T->Delete();
1651            };      
1652    
1653        };
1654            
1655        delete lk;
1656    
1657    //     cout<< "Get detector list from input file --> ";
1658    //     if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
1659    //     if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
1660    //     if(TRKh)cout<<"TRKH ";
1661    //     if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
1662    //     if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
1663    //     if(TOF)cout<<"TOF ";
1664    //     if(TRG)cout<<"TRG ";
1665    //     if(AC)cout<<"AC ";
1666    //     if(ND)cout<<"ND ";
1667    //     if(S4)cout<<"S4 ";
1668    //     if(ORB)cout<<"ORB ";
1669    //     cout << endl;
1670          
1671        return ;
1672            
1673  };  };
1674    
1675    
1676  //--------------------------------------  //--------------------------------------
1677  //  //
1678  //  //
# Line 928  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString de Line 1684  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString de
1684   */   */
1685  Bool_t  PamLevel2::CheckLevel2File(TString name){  Bool_t  PamLevel2::CheckLevel2File(TString name){
1686                    
1687      Bool_t CAL__ok = false;          Bool_t CAL1__ok   = false;    
1688      Bool_t TRK__ok = false;          Bool_t CAL2__ok   = false;    
1689      Bool_t TRK_L1__ok = false;          Bool_t TRK2__ok   = false;    
1690      Bool_t TRG__ok = false;          Bool_t TRK1__ok   = false;    
1691      Bool_t TOF__ok = false;          Bool_t TRKh__ok   = false;    
1692      Bool_t S4__ok  = false;          Bool_t TRG__ok    = false;    
1693      Bool_t ND__ok  = false;          Bool_t TOF__ok    = false;    
1694      Bool_t AC__ok  = false;          Bool_t S4__ok     = false;    
1695      Bool_t ORB__ok = false;          Bool_t ND__ok     = false;    
1696        Bool_t AC__ok     = false;    
1697        Bool_t ORB__ok    = false;    
1698        
1699        Bool_t RUN__ok    = false;
1700            
     Bool_t RUN__ok = false;  
1701            
1702  //    cout << "Checking file: "<<name<<endl;  
1703        cout << "Checking file: "<<name<<endl;
1704      TFile *f = new TFile(name.Data());      TFile *f = new TFile(name.Data());
1705      if( !f || f->IsZombie() ){      if( !f || f->IsZombie() ){
1706          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Non valid root file"<< endl; return false;          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Non valid root file"<< endl; return false;
1707      }      }
1708      //   cout << "Get list of keys: "<<f<<endl;  //    cout << "Get list of keys: "<<f<<endl;
1709      TList *lk = f->GetListOfKeys();      TList *lk = f->GetListOfKeys();
1710  //      lk->Print();  //    lk->Print();
1711      TIter next(lk);      TIter next(lk);
1712      TKey *key =0;      TKey *key =0;
1713      Int_t nev =0;  
1714      Int_t nev_previous =0;      Int_t nev = 0;
1715    
1716      while( (key = (TKey*)next()) ){      while( (key = (TKey*)next()) ){
1717                    
1718          nev_previous = nev;  //      cout << key->GetName() << ""<<key->GetClassName()<<endl;
1719          nev = ((TTree*)f->Get(key->GetName()))->GetEntries();  //              cout << " Get tree: " << f->Get(key->GetName())<<endl;
1720          if( key->GetClassName()=="TTree" && nev_previous && nev != nev_previous ){  //      nev_previous = nev;
1721              cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- "<< key->GetName() << " tree: n.entries does not match "<<nev<<" "<<nev_previous<< endl;  //      cout << " n.entries  "<< nev <<endl;
1722              return false;  //      if( key->GetClassName()=="TTree" && nev_previous && nev != nev_previous ){
1723          };  //          nev = ((TTree*)f->Get(key->GetName()))->GetEntries();
1724    //          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- "<< key->GetName() << " tree: n.entries does not match "<<nev<<" "<<nev_previous<< endl;
1725    //          return false;
1726    //      };
1727    
         if( !strcmp(key->GetName(),"Calorimeter") )CAL__ok = true;  
         if( !strcmp(key->GetName(),"Trigger"    ) )TRG__ok = true;  
         if( !strcmp(key->GetName(),"ToF"        ) )TOF__ok = true;  
         if( !strcmp(key->GetName(),"S4"         ) )S4__ok = true;  
         if( !strcmp(key->GetName(),"NeutronD"   ) )ND__ok = true;  
         if( !strcmp(key->GetName(),"Anticounter") )AC__ok = true;  
         if( !strcmp(key->GetName(),"OrbitalInfo") )ORB__ok = true;  
1728          if( !strcmp(key->GetName(),"Run"        ) )RUN__ok = true;                if( !strcmp(key->GetName(),"Run"        ) )RUN__ok = true;      
1729    
1730            //=========================================================    
1731            if( !strcmp(key->GetName(),"Trigger"    ) ){
1732                TRG__ok = true;
1733                if(TRG){
1734                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("Trigger"))->GetEntries();
1735                    if( nev && nevt!=nev){
1736                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Trigger tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1737                        return false;
1738                    }
1739                    nev=nevt;
1740                }
1741            }
1742            //=========================================================    
1743            if( !strcmp(key->GetName(),"ToF"        ) ){
1744                TOF__ok = true;
1745                if(TOF){
1746                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("ToF"))->GetEntries();
1747                    if( nev && nevt!=nev){
1748                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- ToF tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1749                        return false;
1750                    }
1751                    nev=nevt;
1752                }
1753            }
1754            //=========================================================  
1755            if( !strcmp(key->GetName(),"S4"         ) ){
1756                S4__ok = true;
1757                if(S4){
1758                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("S4"))->GetEntries();
1759                    if( nev && nevt!=nev){
1760                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- S4 tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1761                        return false;
1762                    }
1763                    nev=nevt;
1764                }
1765            }
1766            //=========================================================  
1767    
1768            if( !strcmp(key->GetName(),"NeutronD"   ) ){
1769                ND__ok = true;
1770                if(ND){
1771                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("NeutronD"))->GetEntries();
1772                    if( nev && nevt!=nev){
1773                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- NeutronD tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1774                        return false;
1775                    }
1776                    nev=nevt;
1777                }
1778            }      
1779            //=========================================================  
1780            if( !strcmp(key->GetName(),"Anticounter") ){
1781                AC__ok = true;
1782                if(AC){
1783                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("Anticounter"))->GetEntries();
1784                    if( nev && nevt!=nev){
1785                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Anticounter tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1786                        return false;
1787                    }
1788                    nev=nevt;
1789                }
1790            }
1791            //=========================================================  
1792            if( !strcmp(key->GetName(),"OrbitalInfo") ){
1793                ORB__ok = true;
1794                if(ORB){
1795                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("OrbitalInfo"))->GetEntries();
1796                    if( nev && nevt!=nev){
1797                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- OrbitalInfo tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1798                        return false;
1799                    }
1800                    nev=nevt;
1801                }
1802            }
1803            //=========================================================  
1804          if( !strcmp(key->GetName(),"Tracker"    ) ){          if( !strcmp(key->GetName(),"Tracker"    ) ){
             TRK__ok = true;  
1805              TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");              TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");
1806                if(TRK1||TRK2||TRKh){
1807                    Int_t nevt = T->GetEntries();
1808                    if( nev && nevt!=nev){
1809                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Tracker tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1810                        return false;
1811                    }
1812                    nev=nevt;
1813                }
1814              for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){              for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){
1815                  TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();                  TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();
1816                  if( !name.CompareTo("TrkLevel1") )TRK_L1__ok=true;                  if( !name.CompareTo("TrkLevel1") )TRK1__ok=true;
1817              };                  if( !name.CompareTo("TrkLevel2") )TRK2__ok=true;
1818                    if( !name.CompareTo("TrkHough") )TRKh__ok=true;
1819                };      
1820                T->Delete();
1821          };          };
1822                    //=========================================================  
1823            if( !strcmp(key->GetName(),"Calorimeter"    ) ){
1824                TTree *T = (TTree*)f->Get("Calorimeter");
1825                if(CAL1||CAL2){
1826                    Int_t nevt = T->GetEntries();
1827                    if( nev && nevt!=nev){
1828                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Calorimeter tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1829                        return false;
1830                    }
1831                    nev=nevt;
1832                }
1833                for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){
1834                    TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();
1835                    if( !name.CompareTo("CaloLevel1") )CAL1__ok=true;
1836                    if( !name.CompareTo("CaloLevel2") )CAL2__ok=true;
1837                };    
1838                T->Delete();
1839            };      
1840    
1841      };      };
1842            
1843      lk->Delete();  //     cout<< "CheckLevel2File(TString): detector list --> ";
1844      f->Close();  //     if(TRK1__ok)cout<<"TRK1 ";
1845        //     if(TRK2__ok)cout<<"TRK2 ";
1846      Bool_t FLAG = true;  //     if(TRKh__ok)cout<<"TRKH ";
1847    //     if(CAL1__ok)cout<<"CAL1 ";
1848    //     if(CAL2__ok)cout<<"CAL2 ";
1849    //     if(TOF__ok)cout<<"TOF ";
1850    //     if(TRG__ok)cout<<"TRG ";
1851    //     if(AC__ok)cout<<"AC ";
1852    //     if(ND__ok)cout<<"ND ";
1853    //     if(S4__ok)cout<<"S4 ";
1854    //     if(ORB__ok)cout<<"ORB ";
1855    //     cout << endl;
1856    
1857    
1858        if(TRK2 && TRK1__ok)TRK1=1;
1859    // ----------------------------------------------------------------------------
1860    // NOTA
1861    // se c'e` il level1, lo devo necessarimente leggere.
1862    // infatti (non ho capito perche`) i cluster vengono letti e allocati in memoria
1863    // comunque, ma non vengono disallocati da PamLevel2::Clear()
1864    // ----------------------------------------------------------------------------
1865    
1866    
1867      if(!RUN__ok) {      if(!RUN__ok) {
1868          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing RunInfo tree"<< endl; return false;          cout << "File: "<< f->GetName() <<" *WARNING* ---- Missing RunInfo tree"<< endl;
1869  //      FLAG = false;  //      return false;
1870      };      };
1871      if(CAL && !CAL__ok){  
1872          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing Calorimeter tree"<< endl; return false;      if(CAL1 && !CAL1__ok){
1873  //      FLAG = false;          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing CaloLevel1 branch"<< endl;
1874      };          return false;
     if(TRK && !TRK__ok){  
         cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing Tracker tree"<< endl; return false;  
 //      FLAG = false;  
     };  
     if(TRK_L1 && !TRK_L1__ok){  
         cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing Tracker Level1 Branch"<< endl; return false;  
 //      FLAG = false;  
1875      };      };
1876      if(TRG && !TRG__ok){      if(CAL2 && !CAL2__ok){
1877          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing Trigger tree"<< endl; return false;          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing CaloLevel2 branch"<< endl;
1878  //      FLAG = false;          return false;
1879      };      };
1880      if(TOF && !TOF__ok){      if(TRK2 && !TRK2__ok){
1881          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ToF tree"<< endl; return false;          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing TrkLevel2 branch"<< endl;
1882  //      FLAG = false;          return false;
1883      };      };
1884      if(S4 && !S4__ok){      if(TRK1 && !TRK1__ok){
1885          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing S4 tree"<< endl; return false;          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing TrkLevel1 branch"<< endl;
1886  //      FLAG = false;          return false;
1887      };      };
1888      if(ND && !ND__ok){      if(TRKh && !TRKh__ok){
1889          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ND tree"<< endl; return false;          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing TrkHough branch"<< endl;
1890  //      FLAG = false;          return false;
1891        };
1892        if(ORB && !ORB__ok){
1893            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ORB tree"<< endl;
1894            return false;
1895      };      };
1896      if(AC && !AC__ok){      if(AC && !AC__ok){
1897          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing AC tree"<< endl; return false;          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing AC tree"<< endl;
1898  //      FLAG = false;          return false;
1899      };      };
1900      if(ORB && !ORB__ok){      if(S4 && !S4__ok){
1901          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ORB tree"<< endl; return false;          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing S4 tree"<< endl;
1902  //      FLAG = false;          return false;
1903        };
1904        if(TOF && !TOF__ok){
1905            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ToF tree"<< endl;
1906            return false;
1907        };
1908    
1909        if(ND && !ND__ok){
1910            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ND tree"<< endl;
1911            return false;
1912        };
1913        if(TRG && !TRG__ok){
1914            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing Trigger tree"<< endl;
1915            return false;
1916      };      };
1917            
1918      return FLAG;  
1919    //    lk->Delete();
1920    //    delete lk;
1921        f->Close();
1922    
1923    //     cout<< "CheckLevel2File(TString): detector list --> ";
1924    //     if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
1925    //     if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
1926    //     if(TRKh)cout<<"TRKH ";
1927    //     if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
1928    //     if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
1929    //     if(TOF)cout<<"TOF ";
1930    //     if(TRG)cout<<"TRG ";
1931    //     if(AC)cout<<"AC ";
1932    //     if(ND)cout<<"ND ";
1933    //     if(S4)cout<<"S4 ";
1934    //     if(ORB)cout<<"ORB ";
1935    //     cout << endl;
1936          
1937        return true;
1938                    
1939  };  };
1940    
1941    
1942    /**
1943     * Create clone-trees
1944     */
1945    void PamLevel2::CreateCloneTrees0( TChain *fChain, TFile *ofile ){
1946    
1947        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
1948        cout << "Create clones of PAMELA trees "<<endl;
1949        
1950        Int_t i=0;
1951        tree_clone[i] = fChain->GetTree()->CloneTree(0);
1952        TString name =  tree_clone[i]->GetName();
1953        name.Append("_clone");
1954    //    tree_clone[i]->SetName(name.Data());
1955        cout << tree_clone[i]->GetName() <<endl;
1956        i++;
1957    
1958        TList *li = fChain->GetListOfFriends();
1959        TIter next(li);
1960        TFriendElement* T_friend=0;
1961        ofile->cd();
1962        while( (T_friend = (TFriendElement*)next()) ){
1963    //      cout<<T_friend->IsA()->GetName()<<" "<<T_friend->GetName()<<hex << T_friend->GetTree() << dec<<endl;
1964    //      cout<<T_friend->GetTree()->GetName()<< endl;
1965            tree_clone[i] = T_friend->GetTree()->CloneTree(0);
1966            tree_clone[i]->SetAutoSave(1000000);
1967            name =  tree_clone[i]->GetName();
1968            name.Append("_clone");
1969    //      tree_clone[i]->SetName(name.Data());
1970            cout << tree_clone[i]->GetName() << endl;
1971            i++;
1972        }
1973        
1974        delete li;
1975    
1976        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
1977    
1978    }
1979    
1980    /**
1981     * Create clone-trees
1982     */
1983    void PamLevel2::CreateCloneTrees(TFile *ofile){
1984    
1985        ofile->cd();
1986    
1987        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
1988        cout << "Create new PAMELA trees "<<endl;
1989            
1990        Int_t i=0;
1991    
1992        if(TRK1||TRK2||TRKh){
1993            tree_clone[i] = new TTree("Tracker","PAMELA tracker level2 data ");    
1994            if(TRK1) {
1995                tree_clone[i]->Branch("TrkLevel1","TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel1"));
1996                tree_clone[i]->BranchRef();
1997                cout << "Tracker      : branch TrkLevel1"<<endl;
1998            };
1999            if(TRK2) {
2000                tree_clone[i]->Branch("TrkLevel2", "TrkLevel2",GetPointerTo("TrkLevel2"));
2001                cout << "Tracker      : branch TrkLevel2"<<endl;        
2002            };
2003            if(TRKh) {
2004                tree_clone[i]->Branch("TrkHough","TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
2005                cout << "Tracker      : branch TrkHough"<<endl;
2006            };
2007            i++;
2008        }
2009    
2010        // Calorimeter
2011        if(CAL1||CAL2){
2012            tree_clone[i] = new TTree("Calorimeter","PAMELA calorimeter level2 data ");    
2013            if(CAL1) {
2014                tree_clone[i]->Branch("CaloLevel1", "CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
2015                cout << "Calorimeter  : branch CaloLevel1"<<endl;
2016            };
2017            if(CAL2) {
2018                tree_clone[i]->Branch("CaloLevel2","CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
2019                cout << "Calorimeter  : branch CaloLevel2"<<endl;
2020            };
2021            i++;
2022        }    
2023    
2024        // ToF    
2025        if(TOF) {
2026            tree_clone[i] = new TTree("ToF","PAMELA ToF level2 data ");    
2027            tree_clone[i]->Branch("ToFLevel2","ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
2028            cout << "ToF          : branch ToFLevel2"<<endl;
2029            i++;
2030        };
2031        // Trigger
2032        if(TRG) {
2033            tree_clone[i] = new TTree("Trigger","PAMELA trigger level2 data ");    
2034            tree_clone[i]->Branch("TrigLevel2","TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
2035            cout << "Trigger      : branch TrigLevel2"<<endl;
2036            i++;
2037        };
2038        // S4
2039        if(S4) {
2040            tree_clone[i] = new TTree("S4","PAMELA S4 level2 data ");      
2041            tree_clone[i]->Branch("S4Level2","S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
2042            cout << "S4           : branch S4Level2"<<endl;
2043            i++;
2044        };
2045        // Neutron Detector
2046        if(ND) {
2047            tree_clone[i] = new TTree("NeutronD","PAMELA neutron detector level2 data ");  
2048            tree_clone[i]->Branch("NDLevel2","NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
2049            cout << "NeutronD     : branch NDLevel2"<<endl;
2050            i++;
2051        };
2052        // Anticounters
2053        if(AC) {
2054            tree_clone[i] = new TTree("Anticounter","PAMELA anticounter detector level2 data ");    
2055            tree_clone[i]->Branch("AcLevel2","AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
2056            cout << "Anticounter  : branch AcLevel2"<<endl;
2057            i++;
2058        };
2059        // OrbitalInfo
2060        if(ORB) {
2061            tree_clone[i] = new TTree("OrbitalInfo","PAMELA oribital info  ");      
2062            tree_clone[i]->Branch("OrbitalInfo","OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
2063            cout << "OrbitalInfo  : branch OrbitalInfo"<<endl;
2064            i++;
2065        };
2066        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2067    
2068    }
2069    
2070    
2071    /**
2072     * Fill tree (created with CreateCloneTrees)
2073     *
2074     */
2075    //void PamLevel2::FillNewPamTree(TTree *T){
2076    void PamLevel2::FillCloneTrees(){
2077            
2078        for(Int_t i=0; i<8; i++){
2079            if(tree_clone[i])tree_clone[i]->Fill();
2080        }
2081    }
2082    
2083    
2084    TTree* PamLevel2::GetCloneTree(TString name){
2085    
2086        for(Int_t i=0; i<8; i++){  
2087            if(tree_clone[i]){
2088                TString na = tree_clone[i]->GetName();
2089                if(!name.CompareTo(na))return tree_clone[i];
2090            };
2091        }
2092        return NULL;
2093    
2094    }
2095    void PamLevel2::WriteCloneTrees(){
2096        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2097        cout << "Write clones of PAMELA trees "<<endl;
2098        for(Int_t i=0; i<8; i++){  
2099            if(tree_clone[i]){
2100                cout << tree_clone[i]->GetName()<<endl;
2101                tree_clone[i]->Write();
2102            };
2103        }
2104        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2105    
2106    }
2107    
2108    /**
2109     * Create a new (empty) Pamela trees
2110     */
2111    // TTree* PamLevel2::GetNewPamTree(){
2112    
2113    //     if(tree_clone)return tree_clone;
2114    
2115    //     TTree *Tout = 0;
2116        
2117    //     cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2118    //     cout << "Create new PAMELA trees "<<endl;
2119        
2120        
2121    //     if(TRK1||TRK2||TRKh){
2122    //      TTree *T = new TTree("Tracker_clone","PAMELA tracker level2 data ");    
2123    //      if(TRK1) {
2124    //          trk1_clone = new TrkLevel1();
2125    //          T->Branch("TrkLevel1","TrkLevel1", &trk1_clone);
2126    //          T->BranchRef();
2127    //          cout << "Tracker      : branch TrkLevel1"<<endl;
2128    //      };
2129    //      if(TRK2) {
2130    //          trk2_clone = new TrkLevel2();
2131    //          T->Branch("TrkLevel2", "TrkLevel2",&trk2_clone);
2132    //          cout << "Tracker      : branch TrkLevel2"<<endl;        
2133    //      };
2134    //      if(TRKh) {
2135    //          trkh_clone = new TrkHough();
2136    //          T->Branch("TrkHough","TrkHough", &trkh_clone);
2137    //          cout << "Tracker      : branch TrkHough"<<endl;
2138    //      };
2139    //      if(!Tout)Tout=T;
2140    //      else Tout->AddFriend("Tracker_clone");
2141    //     }
2142    
2143    //     // Calorimeter
2144    //     if(CAL1||CAL2){
2145    //      TTree *C = new TTree("Calorimeter_clone","PAMELA calorimeter level2 data ");    
2146    //      if(CAL1) {
2147    //          calo1_clone = new CaloLevel1();
2148    //          C->Branch("CaloLevel1", "CaloLevel1", &calo1_clone);
2149    //          cout << "Calorimeter  : branch CaloLevel1"<<endl;
2150    //      };
2151    //      if(CAL2) {
2152    //          calo2_clone = new CaloLevel2();
2153    //          C->Branch("CaloLevel2","CaloLevel2", &calo2_clone);
2154    //          cout << "Calorimeter  : branch CaloLevel2"<<endl;
2155    //      };
2156    //      if(!Tout)Tout=C;
2157    //      else Tout->AddFriend("Calorimeter_clone");
2158    //     }    
2159    
2160    //     // ToF    
2161    //     if(TOF) {
2162    //      TTree *O = new TTree("ToF_clone","PAMELA ToF level2 data ");    
2163    //      tof_clone = new ToFLevel2();
2164    //      O->Branch("ToFLevel2","ToFLevel2", &tof_clone);
2165    //      cout << "ToF          : branch ToFLevel2"<<endl;
2166    //      if(!Tout)Tout=O;
2167    //      else Tout->AddFriend("ToF_clone");
2168    //     };
2169    //     // Trigger
2170    //     if(TRG) {
2171    //      TTree *R = new TTree("Trigger_clone","PAMELA trigger level2 data ");    
2172    //      trig_clone = new TrigLevel2();
2173    //      R->Branch("TrigLevel2","TrigLevel2", &trig_clone);
2174    //      cout << "Trigger      : branch TrigLevel2"<<endl;
2175    //      if(!Tout)Tout=R;
2176    //      else Tout->AddFriend("Trigger_clone");
2177    //     };
2178    //     // S4
2179    //     if(S4) {
2180    //      TTree *S = new TTree("S4_clone","PAMELA S4 level2 data ");      
2181    //      s4_clone = new S4Level2();
2182    //      S->Branch("S4Level2","S4Level2", &s4_clone);
2183    //      cout << "S4           : branch S4Level2"<<endl;
2184    //      if(!Tout)Tout=S;
2185    //      else Tout->AddFriend("S4_clone");
2186    //     };
2187    //     // Neutron Detector
2188    //     if(ND) {
2189    //      TTree *N = new TTree("NeutronD_clone","PAMELA neutron detector level2 data ");  
2190    //      nd_clone = new NDLevel2();
2191    //      N->Branch("NDLevel2","NDLevel2", &nd_clone);
2192    //      cout << "NeutronD     : branch NDLevel2"<<endl;
2193    //      if(!Tout)Tout=N;
2194    //      else Tout->AddFriend("NeutronD_clone");
2195    //     };
2196    //     // Anticounters
2197    //     if(AC) {
2198    //      TTree *A = new TTree("Anticounter_clone","PAMELA anticounter detector level2 data ");  
2199    //      ac_clone = new AcLevel2();
2200    //      A->Branch("AcLevel2","AcLevel2", &ac_clone);
2201    //      cout << "Anticounter  : branch AcLevel2"<<endl;
2202    //      if(!Tout)Tout=A;
2203    //      else Tout->AddFriend("Anticounter_clone");
2204    //     };
2205    //     // OrbitalInfo
2206    //     if(ORB) {
2207    //      TTree *B = new TTree("OrbitalInfo_clone","PAMELA oribital info  ");    
2208    //      orb_clone = new OrbitalInfo();
2209    //      B->Branch("OrbitalInfo","OrbitalInfo", &orb_clone);
2210    //      cout << "OrbitalInfo  : branch OrbitalInfo"<<endl;
2211    //      if(!Tout)Tout=B;
2212    //      else Tout->AddFriend("OrbitalInfo_clone");
2213    //     };
2214    //     cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2215    
2216    //     tree_clone = Tout;
2217    //     tree_clone->SetDirectory(0);
2218    
2219    //     return Tout;
2220    // }
2221    // /**
2222    //  * Fill a tree (created with GetNewPamTree)
2223    //  *
2224    //  */
2225    // //void PamLevel2::FillNewPamTree(TTree *T){
2226    // void PamLevel2::FillNewPamTree(){
2227            
2228    
2229    //     if(trk1_clone)  *trk1_clone = *trk1_obj;
2230    //     if(trk2_clone){
2231    //      trk2_clone->Clear();
2232    //      trk2_obj->Copy(*trk2_clone);
2233    // //   *trk2_clone = *trk2_obj;
2234    //     }
2235    //     if(trkh_clone)  *trkh_clone = *trkh_obj;
2236    //     if(calo1_clone){
2237    // //   *calo1_clone = *calo1_obj;
2238    //      calo1_clone->Clear();
2239    //      calo1_obj->Copy(*calo1_clone);
2240    //     }
2241    //     if(calo2_clone){
2242    // //   *calo2_clone = *calo2_obj;
2243    //      calo2_clone->Clear();
2244    //      calo2_obj->Copy(*calo2_clone);
2245    //     }
2246    //     if(tof_clone)   *tof_clone  = *tof_obj;
2247    //     if(trig_clone)  *trig_clone = *trig_obj;
2248    //     if(s4_clone)    *s4_clone   = *s4_obj;
2249    //     if(nd_clone)    *nd_clone   = *nd_obj;
2250    //     if(ac_clone)    *ac_clone   = *ac_obj;
2251    //     if(orb_clone)   *orb_clone  = *orb_obj;
2252    
2253    //     TTree *T = tree_clone;
2254    
2255    //     T->Fill(); //fill main tree
2256    // //    cout<<T->IsA()->GetName()<<" "<<T->GetName()<<endl;
2257    //     TList *li = T->GetListOfFriends();
2258    //     TIter next(li);
2259    //     TFriendElement* T_friend=0;
2260    //     while( (T_friend = (TFriendElement*)next()) ){
2261    // //   cout<<T_friend->IsA()->GetName()<<" "<<T_friend->GetName()<<hex << T_friend->GetTree() << dec<<endl;
2262    //      T_friend->GetTree()->Fill();//fill friends
2263    //     }
2264    
2265    // }

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