/[PAMELA software]/PamelaLevel2/src/PamLevel2.cpp
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Diff of /PamelaLevel2/src/PamLevel2.cpp

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revision 1.6 by pam-fi, Tue Oct 24 10:24:27 2006 UTC revision 1.13 by pam-fi, Mon Jan 15 11:51:40 2007 UTC
# Line 7  Line 7 
7   * Default constructor   * Default constructor
8   */   */
9  PamTrack::PamTrack(){  PamTrack::PamTrack(){
10      trk_track  = this->TrkTrack::GetTrkTrack();      trk_track  = 0;
11      calo_track = this->CaloTrkVar::GetCaloTrkVar();      calo_track = 0;
12      tof_track  = this->ToFTrkVar::GetToFTrkVar();      tof_track  = 0;
13        candeleteobj = 0;
14  };  };
15  //--------------------------------------  //--------------------------------------
16  //  //
# Line 19  PamTrack::PamTrack(){ Line 20  PamTrack::PamTrack(){
20   * Constructor   * Constructor
21   */   */
22  PamTrack::PamTrack(TrkTrack* t, CaloTrkVar* c, ToFTrkVar* o){  PamTrack::PamTrack(TrkTrack* t, CaloTrkVar* c, ToFTrkVar* o){
23      trk_track  = this->TrkTrack::GetTrkTrack();  
24      calo_track = this->CaloTrkVar::GetCaloTrkVar();      trk_track  = 0;
25      tof_track  = this->ToFTrkVar::GetToFTrkVar();      calo_track = 0;
26      if(t) *trk_track  = *t;      tof_track  = 0;
27      if(c) *calo_track = *c;  //     if(t)trk_track  = new TrkTrack(*t);
28      if(o) *tof_track  = *o;      //     if(c)calo_track = new CaloTrkVar(*c);
29    //     if(o)tof_track  = new ToFTrkVar(*o);
30        if(t)trk_track  = t;
31        if(c)calo_track = c;
32        if(o)tof_track  = o;
33        candeleteobj = 0;
34    
35  };  };
36    PamTrack::PamTrack(const PamTrack& track){
37    
38        TrkTrack   *t = track.trk_track;
39        CaloTrkVar *c = track.calo_track;
40        ToFTrkVar  *o = track.tof_track;
41    
42        trk_track  = 0;
43        calo_track = 0;
44        tof_track  = 0;
45        if(t)trk_track  = new TrkTrack(*t);
46        if(c)calo_track = new CaloTrkVar(*c);
47        if(o)tof_track  = new ToFTrkVar(*o);
48        candeleteobj = 1;
49        
50    }
51    void PamTrack::Clear(){
52    
53    //    cout << "PamTrack::Clear() "<<candeleteobj<<endl;
54        if(candeleteobj){
55            if(trk_track)  trk_track->TrkTrack::Clear();
56            if(calo_track) calo_track->CaloTrkVar::Clear();//???
57            if(tof_track)  tof_track->ToFTrkVar::Clear();//???
58        }else{
59            trk_track  = 0;
60            calo_track = 0;
61            tof_track  = 0;
62        }
63    }
64    void PamTrack::Delete(){
65    //    cout << "PamTrack::Delete() "<<candeleteobj<<endl;
66        if(candeleteobj){
67            if(trk_track)  {
68                trk_track->TrkTrack::Clear();
69                delete trk_track;
70            }
71            if(calo_track){
72                calo_track->CaloTrkVar::Clear();//???
73                delete calo_track;
74            }
75            if(tof_track){
76                tof_track->ToFTrkVar::Clear();//???
77                delete tof_track;
78            }
79        }else{
80            Clear();
81        }
82    }
83  //--------------------------------------  //--------------------------------------
84  //  //
85  //  //
# Line 36  PamTrack::PamTrack(TrkTrack* t, CaloTrkV Line 89  PamTrack::PamTrack(TrkTrack* t, CaloTrkV
89   */   */
90  PamLevel2::PamLevel2(){  PamLevel2::PamLevel2(){
91                    
92      trk_l1_obj  = this->TrkLevel1::GetTrkLevel1();        //     trk2_obj  = TrkLevel2::GetTrkLevel2();
93      trk_obj     = this->TrkLevel2::GetTrkLevel2();  //     trk1_obj  = TrkLevel1::GetTrkLevel1();
94      calo_obj    = this->CaloLevel2::GetCaloLevel2();  //     trkh_obj  = TrkHough::GetTrkHough();
95      tof_obj     = this->ToFLevel2::GetToFLevel2();  //     calo1_obj = CaloLevel1::GetCaloLevel1();
96      trig_obj    = this->TrigLevel2::GetTrigLevel2();  //     calo2_obj = CaloLevel2::GetCaloLevel2();
97      s4_obj      = this->S4Level2::GetS4Level2();  //     tof_obj   = ToFLevel2::GetToFLevel2();
98      nd_obj      = this->NDLevel2::GetNDLevel2();  //     trig_obj  = TrigLevel2::GetTrigLevel2();
99      ac_obj      = this->AcLevel2::GetAcLevel2();  //     s4_obj    = S4Level2::GetS4Level2();
100      orb_obj     = this->OrbitalInfo::GetOrbitalInfo();  //     nd_obj    = NDLevel2::GetNDLevel2();
101    //     ac_obj    = AcLevel2::GetAcLevel2();
102      run_obj     = new GL_RUN();  //     orb_obj   = OrbitalInfo::GetOrbitalInfo();
103            trk2_obj  = 0;
104      sorted_tracks = new TRefArray();      trk1_obj  = 0;
105            trkh_obj  = 0;
106      CAL = true;      calo1_obj = 0;
107      TRK = true;      calo2_obj = 0;
108        tof_obj   = 0;
109        trig_obj  = 0;
110        s4_obj    = 0;
111        nd_obj    = 0;
112        ac_obj    = 0;
113        orb_obj   = 0;
114    
115        run_obj   = 0;//new GL_RUN();
116        
117    
118        for(Int_t i=0; i<8; i++ )tree_clone[i]=NULL;
119    
120    //    sorted_tracks = 0;//new TRefArray();
121        
122        CAL1 = true;
123        CAL2 = true;
124        TRK2 = true;
125        TRK1 = false;
126        TRKh = false;
127      TRG = true;      TRG = true;
128      TOF = true;      TOF = true;
129      S4  = true;      S4  = true;
# Line 59  PamLevel2::PamLevel2(){ Line 131  PamLevel2::PamLevel2(){
131      AC  = true;      AC  = true;
132      ORB = true;      ORB = true;
133            
134      TRK_L1 = false;      RUN = true;
135        
136      Tout  = NULL;      tsorted=0;
137        timage=0;
138    
139  };  };
140  /**  /**
141   * Destructor   * Delete the event (act as Dtor)
142   */   */
143  PamLevel2::~PamLevel2(){  void PamLevel2::Delete(){
                   
     TrkLevel1::Clear();  
       
     TrkLevel2::Clear();  
     CaloLevel2::Clear();  
     ToFLevel2::Clear();  
     TrigLevel2::Clear();  
     S4Level2::Clear();  
     NDLevel2::Clear();  
     AcLevel2::Clear();  
     OrbitalInfo::Clear();  
       
     delete run_obj;  
       
 //      delete sorted_tracks;  
     sorted_tracks->Delete(); // clean the reference array  
           
     if(Tout)Tout->Delete(); // delete loaded tree from memory  
144                    
145        if(run_obj)delete run_obj;
146    
147    //    cout << "void PamLevel2::Clear()"<<endl;
148        if(trk1_obj) delete trk1_obj;      
149        if(trk2_obj) delete trk2_obj;
150        if(trkh_obj) delete trkh_obj;
151        if(calo1_obj)delete calo1_obj;
152        if(calo2_obj)delete calo2_obj;
153        if(tof_obj)  delete tof_obj;
154        if(trig_obj) delete trig_obj;
155        if(s4_obj)   delete s4_obj;
156        if(nd_obj)   delete nd_obj;
157        if(ac_obj)   delete ac_obj;
158        if(orb_obj)  delete orb_obj;
159        
160        if(tsorted){
161            tsorted->Delete();
162            delete tsorted;
163        }
164        if(timage){
165            timage->Delete();
166            delete timage;
167        }
168  };  };
169    
170  /**  /**
171   * Clear the event   * Clear the event (NB! does not deallocate objects)
172   */   */
173  void PamLevel2::Clear(){  void PamLevel2::Clear(){
174                    
175      TrkLevel1::Clear();  //    cout << "void PamLevel2::Clear()"<<endl;
176                if(run_obj)delete run_obj;
177      TrkLevel2::Clear();  
178      CaloLevel2::Clear();      if(trk1_obj) trk1_obj->Clear();    
179      ToFLevel2::Clear();      if(trk2_obj) trk2_obj->Clear();
180      TrigLevel2::Clear();      if(trkh_obj) trkh_obj->Clear();
181      S4Level2::Clear();      if(calo1_obj)calo1_obj->Clear();
182      NDLevel2::Clear();      if(calo2_obj)calo2_obj->Clear();
183      AcLevel2::Clear();      if(tof_obj)  tof_obj->Clear();
184      OrbitalInfo::Clear();      if(trig_obj) trig_obj->Clear();
185        if(s4_obj)   s4_obj->Clear();
186        if(nd_obj)   nd_obj->Clear();
187        if(ac_obj)   ac_obj->Clear();
188        if(orb_obj)  orb_obj->Clear();
189            
190      sorted_tracks->Delete(); // clean the reference array  //    if(sorted_tracks)sorted_tracks->Clear();
191    //    sorted_tracks.Clear();
192    
193        if(tsorted){
194            tsorted->Delete();
195        }
196        if(timage){
197            timage->Delete();
198        }
199            
200  };  };
201    
# Line 112  void PamLevel2::Clear(){ Line 204  void PamLevel2::Clear(){
204  //  //
205  //  //
206  //--------------------------------------  //--------------------------------------
207    void *PamLevel2::GetPointerTo(const char* c ){
208    
209        TString objname = c;
210    
211        if(!objname.CompareTo("TrkLevel1"))  {
212            if(!trk1_obj)  trk1_obj  = new TrkLevel1();
213            return &trk1_obj;
214        };
215        if(!objname.CompareTo("TrkLevel2"))  {
216            if(!trk2_obj)  trk2_obj  = new TrkLevel2();
217            return &trk2_obj;
218        };
219        if(!objname.CompareTo("TrkHough"))   {
220            if(!trkh_obj)  trkh_obj  = new TrkHough();
221            return &trkh_obj;
222        };
223        if(!objname.CompareTo("CaloLevel1")) {
224            if(!calo1_obj) calo1_obj = new CaloLevel1();
225            return &calo1_obj;
226        };
227        if(!objname.CompareTo("CaloLevel2")) {
228            if(!calo2_obj) calo2_obj = new CaloLevel2();
229            return &calo2_obj;
230        };
231        if(!objname.CompareTo("ToFLevel2"))  {
232            if(!tof_obj)   tof_obj   = new ToFLevel2();
233            return &tof_obj;
234        };
235        if(!objname.CompareTo("TrigLevel2")) {
236            if(!trig_obj)  trig_obj  = new TrigLevel2();
237            return &trig_obj;
238        };
239        if(!objname.CompareTo("S4Level2"))   {
240            if(!s4_obj)    s4_obj    = new S4Level2();
241            return &s4_obj;
242        };
243        if(!objname.CompareTo("NDLevel2"))   {
244            if(!nd_obj)    nd_obj    = new NDLevel2();
245            return &nd_obj;
246        };
247        if(!objname.CompareTo("AcLevel2"))   {
248            if(!ac_obj)    ac_obj    = new AcLevel2();
249            return &ac_obj;
250        };
251        if(!objname.CompareTo("OrbitalInfo")){
252            if(!orb_obj)   orb_obj   = new OrbitalInfo();
253            return &orb_obj;
254        };
255        
256        if(!objname.CompareTo("RunInfo"))return &run_obj;
257        return NULL;
258    };
259    //--------------------------------------
260    //
261    //
262    //--------------------------------------
263  /**  /**
264   * Retrieves the calorimeter track matching the seqno-th tracker stored track.   * Retrieves the calorimeter track matching the seqno-th tracker stored track.
265   * (If seqno = -1 retrieves the self-trigger calorimeter track)   * (If seqno = -1 retrieves the self-trigger calorimeter track)
266   */   */
267   CaloTrkVar *PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int seqno){   CaloTrkVar *PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int seqno){
268                
269       if( CaloLevel2::ntrk()==0 ){       if( !calo2_obj )return 0;
270    
271         if( calo2_obj->CaloLevel2::ntrk()==0 ){
272           cout << "PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" but no Calorimeter tracks are stored"<<endl;           cout << "PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" but no Calorimeter tracks are stored"<<endl;
273           return NULL;           return NULL;
274       };       };
# Line 127  void PamLevel2::Clear(){ Line 277  void PamLevel2::Clear(){
277       Int_t it_calo=0;       Int_t it_calo=0;
278            
279       do{       do{
280           c = CaloLevel2::GetCaloTrkVar(it_calo);           c = calo2_obj->CaloLevel2::GetCaloTrkVar(it_calo);
281           it_calo++;           it_calo++;
282       } while( c && seqno != c->trkseqno && it_calo < CaloLevel2::ntrk());             } while( c && seqno != c->trkseqno && it_calo < calo2_obj->CaloLevel2::ntrk());    
283            
284       if(!c || seqno != c->trkseqno){       if(!c || seqno != c->trkseqno){
285           c = 0;           c = 0;
# Line 148  void PamLevel2::Clear(){ Line 298  void PamLevel2::Clear(){
298   */   */
299   ToFTrkVar *PamLevel2::GetToFStoredTrack(int seqno){   ToFTrkVar *PamLevel2::GetToFStoredTrack(int seqno){
300                    
301       if( ToFLevel2::ntrk()==0 ){       if( !tof_obj )return 0;
302    
303         if( tof_obj->ToFLevel2::ntrk()==0 ){
304           cout << "PamLevel2::GetToFStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" but no ToF tracks are stored"<<endl;           cout << "PamLevel2::GetToFStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" but no ToF tracks are stored"<<endl;
305           return NULL;           return NULL;
306       };       };
# Line 157  void PamLevel2::Clear(){ Line 309  void PamLevel2::Clear(){
309       Int_t it_tof=0;       Int_t it_tof=0;
310            
311       do{       do{
312           c = ToFLevel2::GetToFTrkVar(it_tof);           c = tof_obj->ToFLevel2::GetToFTrkVar(it_tof);
313           it_tof++;           it_tof++;
314       } while( c && seqno != c->trkseqno && it_tof < ToFLevel2::ntrk());       } while( c && seqno != c->trkseqno && it_tof < tof_obj->ToFLevel2::ntrk());        
315            
316       if(!c || seqno != c->trkseqno){       if(!c || seqno != c->trkseqno){
317           c = 0;           c = 0;
# Line 177  void PamLevel2::Clear(){ Line 329  void PamLevel2::Clear(){
329   * Give the pamela track associated to a tracker track, retrieving related calorimeter and tof track information.   * Give the pamela track associated to a tracker track, retrieving related calorimeter and tof track information.
330   */   */
331   PamTrack* PamLevel2::GetPamTrackAlong(TrkTrack* t){   PamTrack* PamLevel2::GetPamTrackAlong(TrkTrack* t){
332                
333         cout <<"PamLevel2::GetPamTrackAlong(TrkTrack* t) **obsolete** "<<endl;
334         cout <<"(if you use it, remember to delete the PamTrack object)"<<endl;
335    
336       CaloTrkVar *c = 0;       CaloTrkVar *c = 0;
337       ToFTrkVar  *o = 0;       ToFTrkVar  *o = 0;
338            
339       if(CAL) c = GetCaloStoredTrack(t->GetSeqNo());       if(CAL2) c = GetCaloStoredTrack(t->GetSeqNo());
340       if(TOF) o = GetToFStoredTrack(t->GetSeqNo());       if(TOF) o = GetToFStoredTrack(t->GetSeqNo());
341            
342  //    if(t && c && o)track = new PamTrack(t,c,o);  //    if(t && c && o)track = new PamTrack(t,c,o);
# Line 202  void PamLevel2::Clear(){ Line 357  void PamLevel2::Clear(){
357    
358  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_t itrk){  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_t itrk){
359            
360        cout <<"PamLevel2::GetStoredTrack(Int_t itrk) **to-be-updated** "<<endl;
361        cout <<"for the moment, better use separately the methods: TrkLevel2::GetStoredTrack(seqno) CaloLevel2::GetCaloTrkVar(Int_t notrack) ToFLevel2::GetToFTrkVar(Int_t notrack)"<<endl;
362        cout <<"(if you use it, remember to delete the PamTrack object)"<<endl;
363      PamTrack *track = 0;      PamTrack *track = 0;
364            
365      if( itrk >=0 && itrk < TrkLevel2::ntrk() ){      if( itrk >=0 && itrk < trk2_obj->TrkLevel2::ntrk() ){
366                    
367          TrkTrack *t = TrkLevel2::GetStoredTrack(itrk);          TrkTrack *t = trk2_obj->TrkLevel2::GetStoredTrack(itrk);
368          track = GetPamTrackAlong(t);          track = GetPamTrackAlong(t);
369                    
370            
371    
372      }else{      }else{
373          cout << "PamLevel2::GetStoredTrack(int) : tracker track SeqNo "<< itrk <<" does not exist (GetNTracks() = "<<TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;          cout << "PamLevel2::GetStoredTrack(int) : tracker track SeqNo "<< itrk <<" does not exist (GetNTracks() = "<<trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
374      };      };
375            
376      return track;      return track;
# Line 224  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_ Line 384  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_
384   * Sort physical (tracker) tracks and stores them in the TRefArray (of TrkTrack objects) which pointer is  PamLevel2::sorted_tracks.   * Sort physical (tracker) tracks and stores them in the TRefArray (of TrkTrack objects) which pointer is  PamLevel2::sorted_tracks.
385   * @param how String to set the sorting cryterium (es: "CAL" or "TRK+CAL+TOF" ecc...).   * @param how String to set the sorting cryterium (es: "CAL" or "TRK+CAL+TOF" ecc...).
386   * Sorting cryteria:   * Sorting cryteria:
387   * TRK: lower chi**2   * TRK: lower chi**2
388   * CAL: lower Y spatial residual on the first calorimeter plane   * CAL: lower Y spatial residual on the first calorimeter plane
389   * TOF: bigger numebr of hit PMTs along the track, on S12 S21 S32 (where paddles are along the Y axis).   * TOF: bigger numebr of hit PMTs along the track, on S12 S21 S32 (where paddles are along the Y axis).
390   * The default sorting cryterium is "TOF+CAL".   * The default sorting cryterium is "TOF+CAL".
# Line 233  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_ Line 393  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_
393   */   */
394  void PamLevel2::SortTracks(TString how){  void PamLevel2::SortTracks(TString how){
395    
396    //    cout <<" PamLevel2::SortTracks(TString how) "<<endl;
397        if( !trk2_obj ){
398            cout << "void PamLevel2::SortTracks(TString how):  TrkLevel2 not loaded !!!";
399            return;
400        };
401    //    cout << "call SortTracs() "<<endl;
402    //Save current Object count    //Save current Object count
403      Int_t ObjectNumber = TProcessID::GetObjectCount();      Int_t ObjectNumber = TProcessID::GetObjectCount();
404        
405      sorted_tracks->Delete(); //temporaneo???  //    cout << "ObjectNumber  "<<ObjectNumber <<endl;
406            
407    //     if(!sorted_tracks)sorted_tracks = new TRefArray();
408    //     sorted_tracks->Clear();
409    //    sorted_tracks.Clear();
410    
411        if(!tsorted)tsorted = new TClonesArray("PamTrack",trk2_obj->GetNTracks());
412        tsorted->Delete();
413        TClonesArray &ttsorted = *tsorted;
414        if(!timage)timage = new TClonesArray("PamTrack",trk2_obj->GetNTracks());
415        timage->Delete();
416        TClonesArray &ttimage = *timage;
417    
418    
419      // loop over the tracks sorted by the tracker      // loop over the tracks sorted by the tracker
420      Bool_t use_TRK = how.Contains("TRK", TString::kIgnoreCase);      Bool_t use_TRK = how.Contains("TRK", TString::kIgnoreCase);
421      Bool_t use_CAL = how.Contains("CAL", TString::kIgnoreCase);      Bool_t use_CAL = how.Contains("CAL", TString::kIgnoreCase);
422      Bool_t use_TOF = how.Contains("TOF", TString::kIgnoreCase);      Bool_t use_TOF = how.Contains("TOF", TString::kIgnoreCase);
423            
424      if( !CAL &&  use_CAL) use_CAL = false;      if( !CAL2 &&  use_CAL) use_CAL = false;
425      if( !TOF &&  use_TOF) use_TOF = false;      if( !TOF &&  use_TOF) use_TOF = false;
426            
427      if( !TRK ){      if( !TRK2 ){
428          cout << "SortTracks() : without tracker does not work!!! (not yet)" << endl;  //      cout << "SortTracks() : without tracker does not work!!! (not yet)" << endl;
429          return;          return;
430      };      };
431    
432        //   cout << "use_CAL "<<use_CAL<<" use_TOF "<<use_TOF<<" use_TRK "<<use_TRK <<endl;
433            
434      for(Int_t i=0; i < TrkLevel2::GetNTracks(); i++){      for(Int_t i=0; i < trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks(); i++){
435                    
436          TrkTrack *ts = 0;          TrkTrack   *ts = 0;
437            CaloTrkVar *cs = 0;
438            ToFTrkVar  *os = 0;
439                    
440          // get tracker tracks          // get tracker tracks
441          TrkTrack   *tp = TrkLevel2::GetTrack(i);                    //tracker          TrkTrack   *tp = trk2_obj->TrkLevel2::GetTrack(i);                    //tracker
442  //              CaloTrkVar *cp = GetCaloStoredTrack(tp->GetSeqNo());          CaloTrkVar *cp = GetCaloStoredTrack(tp->GetSeqNo());
443  //              ToFTrkVar  *op = GetToFStoredTrack(tp->GetSeqNo());          ToFTrkVar  *op = GetToFStoredTrack(tp->GetSeqNo());
444          CaloTrkVar *cp = 0;  
445          ToFTrkVar  *op = 0;          TrkTrack   *ti = 0;              //tracker (image)
446                    CaloTrkVar *ci = 0;
447            ToFTrkVar  *oi = 0;
448    //      cout << "trk track n. "<<i << " "<<hex<< tp <<dec<< endl;
449          // if track has an image, check image selection          // if track has an image, check image selection
450          if(tp->HasImage()){          if(tp->HasImage()){
451                            
452              TrkTrack   *ti = TrkLevel2::GetTrackImage(i);              //tracker (image)              ti = trk2_obj->TrkLevel2::GetTrackImage(i);              //tracker (image)
453  //                      CaloTrkVar *ci = GetCaloStoredTrack(ti->GetSeqNo());              ci = GetCaloStoredTrack(ti->GetSeqNo());
454  //                      ToFTrkVar  *oi = GetToFStoredTrack(ti->GetSeqNo());              oi = GetToFStoredTrack(ti->GetSeqNo());
             CaloTrkVar *ci = 0;  
             ToFTrkVar  *oi = 0;  
455                            
456    //          cout << "its image "<<i << " "<<hex<< ti <<dec<< endl;
457    
458              //assign starting scores              //assign starting scores
459              Int_t tp_score = 0;  //main track sorted by the tracker              Int_t tp_score = 0;  //main track sorted by the tracker
460              Int_t ti_score = 0;  //image track              Int_t ti_score = 0;  //image track
# Line 280  void PamLevel2::SortTracks(TString how){ Line 464  void PamLevel2::SortTracks(TString how){
464              // ------------------------              // ------------------------
465              // check the Y spatial residual on the first calorimeter plane              // check the Y spatial residual on the first calorimeter plane
466              // (cut on calorimeter variables from Emiliano)              // (cut on calorimeter variables from Emiliano)
467                if( use_CAL && !calo2_obj ){
468                    cout << "void PamLevel2::SortTracks(TString how): how= "<<how<<" but CaloLevel2 not loaded !!!";
469                    return;
470                };
471              if(              if(
472                  use_CAL            &&                  use_CAL            &&
473                  npcfit[1] > 15     &&   //no. of fit planes on Y view                  calo2_obj->npcfit[1] > 15     &&   //no. of fit planes on Y view
474                  varcfit[1] < 1000. &&  //fit variance on Y view                  calo2_obj->varcfit[1] < 1000. &&  //fit variance on Y view
475                  true){                  true){
476    
477                                    
478                  cp = GetCaloStoredTrack(tp->GetSeqNo());                  Float_t resy_p = cp->tbar[0][1] - calo2_obj->cbar[0][1]; if(resy_p < 0)resy_p= - resy_p;
479                  ci = GetCaloStoredTrack(ti->GetSeqNo());                  Float_t resy_i = ci->tbar[0][1] - calo2_obj->cbar[0][1]; if(resy_i < 0)resy_i= - resy_i;
                   
                 Float_t resy_p = cp->tbar[0][1] - cbar[0][1]; if(resy_p < 0)resy_p= - resy_p;  
                 Float_t resy_i = ci->tbar[0][1] - cbar[0][1]; if(resy_i < 0)resy_i= - resy_i;  
480                                    
481                  if(resy_p <= resy_i) tp_score++;                  if(resy_p <= resy_i) tp_score++;
482                  else                 ti_score++;                  else                 ti_score++;
483    
484    //              cout << "CALO "<<tp_score<<ti_score<<endl;
485    
486              };              };
487              // ------------------------              // ------------------------
488              // TOF check              // TOF check
489              // ------------------------                  // ------------------------    
490              // check the number of hit pmts along the track              // check the number of hit pmts along the track
491              // on S12 S21 and S32, where paddles are parallel to Y axis              // on S12 S21 and S32, where paddles are parallel to Y axis
492                if( use_TOF && !tof_obj ){
493                    cout << "void PamLevel2::SortTracks(TString how): how= "<<how<<" but ToFLevel2 not loaded !!!";
494                    return;
495                };
496              if( use_TOF ){              if( use_TOF ){
497                                    
498                  Int_t nphit_p =0;                  Int_t nphit_p =0;
499                  Int_t nphit_i =0;                  Int_t nphit_i =0;
500                                    
                 op = GetToFStoredTrack(tp->GetSeqNo());  
                 oi = GetToFStoredTrack(ti->GetSeqNo());  
501                                    
502  /*                              cout << "track: npmtadc "<< op->npmtadc << endl;  /*                              cout << "track: npmtadc "<< op->npmtadc << endl;
503                                  cout << "track: npmttdc "<< op->npmttdc << endl;                                  cout << "track: npmttdc "<< op->npmttdc << endl;
# Line 314  void PamLevel2::SortTracks(TString how){ Line 505  void PamLevel2::SortTracks(TString how){
505                                  cout << "image: npmttdc "<< oi->npmttdc << endl;*/                                  cout << "image: npmttdc "<< oi->npmttdc << endl;*/
506                                    
507                  for (Int_t ih=0; ih < op->npmtadc; ih++){                  for (Int_t ih=0; ih < op->npmtadc; ih++){
508                      Int_t pl = GetPlaneIndex( (op->pmtadc).At(ih) );                      Int_t pl = tof_obj->GetPlaneIndex( (op->pmtadc).At(ih) );
509                      if(pl == 1 || pl == 2 || pl == 5)nphit_p++;                      if(pl == 1 || pl == 2 || pl == 5)nphit_p++;
510                  };                  };
511                                    
512                  for (Int_t ih=0; ih < oi->npmtadc; ih++){                  for (Int_t ih=0; ih < oi->npmtadc; ih++){
513                      Int_t pl = GetPlaneIndex( (oi->pmtadc).At(ih) );                      Int_t pl = tof_obj->GetPlaneIndex( (oi->pmtadc).At(ih) );
514                      if(pl == 1 || pl == 2 || pl == 5)nphit_i++;                      if(pl == 1 || pl == 2 || pl == 5)nphit_i++;
515                  };                  };
516                                    
# Line 331  void PamLevel2::SortTracks(TString how){ Line 522  void PamLevel2::SortTracks(TString how){
522                      if( nphit_p >= nphit_i) tp_score++;                      if( nphit_p >= nphit_i) tp_score++;
523                      else ti_score++;                      else ti_score++;
524                  };                  };
525    //              cout << "TOF "<<tp_score<<ti_score<<endl;
526              };              };
527              if(tp_score == ti_score) use_TRK = true;              if(tp_score == ti_score) use_TRK = true;
528              // ------------------------              // ------------------------
# Line 342  void PamLevel2::SortTracks(TString how){ Line 534  void PamLevel2::SortTracks(TString how){
534              if(use_TRK){              if(use_TRK){
535                  if(      tp->chi2 > 0 && tp->chi2 < ti->chi2 ) tp_score++ ;                  if(      tp->chi2 > 0 && tp->chi2 < ti->chi2 ) tp_score++ ;
536                  else if( ti->chi2 > 0 && ti->chi2 < tp->chi2 ) ti_score++ ;                  else if( ti->chi2 > 0 && ti->chi2 < tp->chi2 ) ti_score++ ;
537    //              cout << "TRK "<<tp_score<<ti_score<<endl;
538              };              };
539                            
540              // ------------------------              // ------------------------
541              // the winner is....              // the winner is....
542              // ------------------------                  // ------------------------    
543              if      (tp_score > ti_score) ts = tp;//the track sorted by the tracker!!              if      (tp_score > ti_score) {
544              else if (tp_score < ti_score) ts = ti;//its image!!  //              ts = tp;//the track sorted by the tracker!!
545              else {  //              cs = cp;
546                  ts = tp;  //              os = op;
547                }else if (tp_score < ti_score) {
548                    ts = ti;//its image!!
549                    cs = ci;
550                    os = oi;
551    
552                    ti = tp;//its image!!
553                    ci = cp;
554                    oi = op;
555    
556                    tp = ts;//its image!!
557                    cp = cs;
558                    op = os;
559    
560                    
561                }else {
562    //              ts = tp;
563    //              cs = cp;
564    //              os = op;
565  //                              cout << "Warning - track image ambiguity not solved" << endl;  //                              cout << "Warning - track image ambiguity not solved" << endl;
566  //                              cout << ts->GetNtot() << " "<< ts->chi2 << " " << npcfit[1] << " "<< nphit_p << endl;  //                              cout << ts->GetNtot() << " "<< ts->chi2 << " " << npcfit[1] << " "<< nphit_p << endl;
567              };              };
568                            
569          }else{          }else{
570              ts = tp;  //          ts = tp;
571    //          cs = cp;
572    //          os = op;
573          };          };
574                    
575  //              cout <<" SortTracks() "<<i<<" -- "<<ts<<endl;  //      cout <<" SortTracks() "<<i<<" -- "<<ts<<endl;
576          sorted_tracks->Add(ts);//save the track in the sorted array  //      sorted_tracks->Add(ts);//save the track in the sorted array
577  //              cout << "SortTracks:: sorted_tracks->Add(it) "<<i<<" "<<ts<<endl;  //      sorted_tracks.Add(ts);//save the track in the sorted array
578            //      sorted_tracks.Add(tp);//save the track in the sorted array
579      };  //      cout << "SortTracks:: sorted_tracks->Add(it) "<<i<<" "<<ts<<endl;
580    //      cout<<"o "<<tp<<endl;
581    //      cout<<"o "<<cp<<endl;
582    //      cout<<"o "<<op<<endl;
583            new(ttsorted[i]) PamTrack(tp,cp,op);
584            new(ttimage[i])  PamTrack(ti,ci,oi);
585        };
586    
587        if( tsorted->GetEntries() != trk2_obj->GetNTracks() ){
588            cout << "void PamLevel2::SortTracks(TString how): tsorted->GetEntries() "<<tsorted->GetEntries()<<" != trk2_obj->GetNTracks() = "<<trk2_obj->GetNTracks() <<endl;
589            tsorted->Delete(); tsorted=0;
590            timage->Delete(); timage=0;    
591        }
592    
593      //Restore Object count      //Restore Object count
594      //To save space in the table keeping track of all referenced objects      //To save space in the table keeping track of all referenced objects
595      //we assume that our events do not address each other. We reset the      //We reset the object count to what it was at the beginning of the event.
     //object count to what it was at the beginning of the event.  
596      TProcessID::SetObjectCount(ObjectNumber);      TProcessID::SetObjectCount(ObjectNumber);
597            
598  };  };
# Line 379  void PamLevel2::SortTracks(TString how){ Line 604  void PamLevel2::SortTracks(TString how){
604   * This method overrides TrkLevel2::GetTracks(), where sorting is done by decreasing number of fit points and increasing chi^2.   * This method overrides TrkLevel2::GetTracks(), where sorting is done by decreasing number of fit points and increasing chi^2.
605   * PamLevel2::GetTracks() keeps the same track order given by TrkLevel2::GetTracks(), but checks image selection by using calorimeter and ToF tracking information.   * PamLevel2::GetTracks() keeps the same track order given by TrkLevel2::GetTracks(), but checks image selection by using calorimeter and ToF tracking information.
606   */   */
607   TRefArray *PamLevel2::GetTracks(){  // TRefArray *PamLevel2::GetTracks(){
608           //  
609  //      SortTracks("+CAL+TOF");  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
610           SortTracks("+CAL+TRK");//TEMP!!!!!!!!!!!!!  //     SortTracks("+CAL+TOF");
611          //  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
612          return sorted_tracks;  
613    // //   return  sorted_tracks;
614    //     return &sorted_tracks;
615        
616    //  };
617    TClonesArray *PamLevel2::GetTracks(){
618    
619    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
620        SortTracks("+CAL+TOF");
621    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
622    
623        return tsorted;
624        
625   };   };
626  //--------------------------------------  //--------------------------------------
627   //   //
# Line 396  void PamLevel2::SortTracks(TString how){ Line 633  void PamLevel2::SortTracks(TString how){
633   * @param it Track number, ranging from 0 to GetNTracks().   * @param it Track number, ranging from 0 to GetNTracks().
634   */   */
635  PamTrack *PamLevel2::GetTrack(int it){  PamTrack *PamLevel2::GetTrack(int it){
636    
637    //    if(!trk2_obj) return 0;
638                    
639  //  *-*-*-*-*-*-*  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
640  //      SortTracks("+CAL+TOF");  //     SortTracks("+CAL+TOF");
641      SortTracks("+CAL+TRK");//TEMP!!!!!!!!!!!!!  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
642  //  *-*-*-*-*-*-*  // //    if(!sorted_tracks)return 0;
643    //     if(sorted_tracks.IsEmpty())return 0;
644    
645    //     PamTrack *track = 0;
646        
647    //     if( it >=0 && it < trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks() && it<sorted_tracks.GetEntriesFast() ){    
648    //      TrkTrack   *t = (TrkTrack*)sorted_tracks.At(it);
649    //      track = GetPamTrackAlong(t);
650    //     }else{
651    //      cout << "PamLevel2::GetTrack(int) : tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
652    //     };
653        
654    //     return track;
655    
656    //    cout << "PamLevel2::GetTrack(int it) "<<endl;
657    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
658        SortTracks("+CAL+TOF");
659    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
660        if(!tsorted)return 0;
661        if(!tsorted->GetEntries())return 0;
662    
663      PamTrack *track = 0;      PamTrack *track = 0;
664            
665      if( it >=0 && it < TrkLevel2::GetNTracks() && it<sorted_tracks->GetEntriesFast() ){      if( it >=0 && it < trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()){
666          TrkTrack   *t = (TrkTrack*)sorted_tracks->At(it);  //      TrkTrack   *t = (TrkTrack*)sorted_tracks.At(it);
667          track = GetPamTrackAlong(t);  //      track = GetPamTrackAlong(t);
668            TClonesArray &t = *(tsorted);
669            track = (PamTrack*)t[it];
670            
671      }else{      }else{
672          cout << "PamLevel2::GetTrack(int) : tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;          cout << "PamLevel2::GetTrack(int) : tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
673      };      };
674            
675      return track;      return track;
# Line 425  PamTrack *PamLevel2::GetTrack(int it){ Line 686  PamTrack *PamLevel2::GetTrack(int it){
686   */   */
687  PamTrack *PamLevel2::GetTrackImage(int it){  PamTrack *PamLevel2::GetTrackImage(int it){
688    
689  //      SortTracks("+CAL+TOF");  //     if(!trk2_obj) return 0;
         SortTracks("+CAL+TRK");//TEMP!!!!!!!!!!!!!  
           
         PamTrack *image = 0;  
690    
691          if( it >=0 && it < TrkLevel2::GetNTracks() ){  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
692                  TrkTrack *temp = (TrkTrack*)sorted_tracks->At(it);  //     SortTracks("+CAL+TOF");
693                  if( temp->HasImage() ){  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
694                          TrkTrack   *t = TrkLevel2::GetStoredTrack(temp->GetImageSeqNo());  // //    if(!sorted_tracks)return 0;
695                          image = GetPamTrackAlong(t);  //     if(sorted_tracks.IsEmpty())return 0;
696                  }else{      
697                          cout <<"PamLevel2::GetTrackImage(int) : Track SeqNo "<<it<<" does not have image"<<endl;  //     PamTrack *image = 0;
698                  };      
699    //     if( it >=0 && it < trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks() ){
700    //      TrkTrack *temp = (TrkTrack*)sorted_tracks.At(it);
701    //      if( temp->HasImage() ){
702    //          TrkTrack   *t = trk2_obj->TrkLevel2::GetStoredTrack(temp->GetImageSeqNo());
703    //          image = GetPamTrackAlong(t);
704    //      }else{
705    //          cout <<"PamLevel2::GetTrackImage(int) : Track SeqNo "<<it<<" does not have image"<<endl;
706    //      };
707    //     }else{
708    //      cout << "PamLevel2::GetTrackImage(int) : Tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
709    //     };
710        
711    //     return image;
712    
713    
714    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
715        SortTracks("+CAL+TOF");
716    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
717        if(!timage)return 0;
718        if(!timage->GetEntries())return 0;
719        
720        PamTrack *image = 0;
721        
722        if( it >=0 && it < trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks() ){
723            TClonesArray &t = *(tsorted);
724            PamTrack *temp = (PamTrack*)t[it];
725            if( temp->GetTrkTrack()->HasImage() ){
726                TClonesArray &t = *(timage);
727                image = (PamTrack*)t[it];
728          }else{          }else{
729                  cout << "PamLevel2::GetTrackImage(int) : Tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;  //          cout <<"PamLevel2::GetTrackImage(int) : Track SeqNo "<<it<<" does not have image"<<endl;
730          };          };
731        }else{
732            cout << "PamLevel2::GetTrackImage(int) : Tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
733        };
734            
735          return image;      return image;
736  }  }
737    
738  //--------------------------------------  //--------------------------------------
# Line 455  PamTrack *PamLevel2::GetTrackImage(int i Line 745  PamTrack *PamLevel2::GetTrackImage(int i
745   * @param detlist String to select trees to be included   * @param detlist String to select trees to be included
746   * @return Pointer to a TTree   * @return Pointer to a TTree
747   */   */
748  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, TString detlist="+ALL"){  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, TString detlist ){
749    
750  //      cout << "WARNING!!! -- obsolete method -- \n";  //     if( !detlist.IsNull() ) SetWhichTrees(detlist);
751  //      cout << "better use TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList*, TString) \n";  //     else                    GetWhichTrees(f);
           
     TTree *Trout =0;  
       
752      SetWhichTrees(detlist);      SetWhichTrees(detlist);
753    
754        TTree *Trout =0;
755    
756        TString fname = f->GetName();
757        if(!CheckLevel2File(fname))return NULL;
758    
759        UInt_t *found=0;    
760    
761        cout<< "GetPamTree(TFile*,TString): detector list --> ";
762        if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
763        if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
764        if(TRKh)cout<<"TRKH ";
765        if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
766        if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
767        if(TOF)cout<<"TOF ";
768        if(TRG)cout<<"TRG ";
769        if(AC)cout<<"AC ";
770        if(ND)cout<<"ND ";
771        if(S4)cout<<"S4 ";
772        if(ORB)cout<<"ORB ";
773        cout << endl;
774    
775        f->cd();
776    
777  // Tracker  // Tracker
778      TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");      TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");
779      if(T && TRK) {      if(T && (TRK2||TRK1||TRKh)) {
780          if(TRK_L1){          if(TRK2)T->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerTo("TrkLevel2"));
781              T->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerToTrk(1));          else    T->SetBranchStatus("TrkLevel2",0,found);
782              cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;          if(TRK2)cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;
783          };          if(TRK1)T->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel1"));
784          T->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerToTrk(2));          else    T->SetBranchStatus("TrkLevel1",0,found);
785          cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;          if(TRK1)cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;
786          Trout=T;          if(TRKh)T->SetBranchAddress("TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
787            else    T->SetBranchStatus("TrkHough",0,found);
788            if(TRKh)cout << "Tracker      : set branch address TrkHough"<<endl;
789            if(!Trout)Trout=T;
790            else Trout->AddFriend(T);
791      }else{      }else{
792          cout << "Tracker      : missing tree"<<endl;          cout << "Tracker      : missing tree"<<endl;
793      };      };
794      // Calorimeter      // Calorimeter
795      TTree *C = (TTree*)f->Get("Calorimeter");      TTree *C = (TTree*)f->Get("Calorimeter");
796      if(C && CAL) {      if(C && (CAL2||CAL1)) {
797          C->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerToCalo());          if(CAL2)C->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
798          cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;          else    C->SetBranchStatus("CaloLevel2",0,found);
799            if(CAL2)cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;
800            if(CAL1)C->SetBranchAddress("CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
801            else    C->SetBranchStatus("CaloLevel1",0,found);
802            if(CAL1)cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel1"<<endl;
803          if(!Trout)Trout=C;          if(!Trout)Trout=C;
804          else Trout->AddFriend(C);          else Trout->AddFriend(C);
805      }else{      }else{
806          cout << "Calorimeter  : missing tree"<<endl;          cout << "Calorimeter  : missing tree"<<endl;
807      };      };
808    
809      // ToF          // ToF    
810      TTree *O = (TTree*)f->Get("ToF");      TTree *O = (TTree*)f->Get("ToF");
811      if(O && TOF) {      if(O && TOF) {
812          O->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerToToF());          O->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
813          cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;          cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;
814          if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
815          else Trout->AddFriend(O);          else Trout->AddFriend(O);
# Line 499  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 819  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
819      // Trigger      // Trigger
820      TTree *R = (TTree*)f->Get("Trigger");      TTree *R = (TTree*)f->Get("Trigger");
821      if(R && TRG) {      if(R && TRG) {
822          R->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerToTrig());          R->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
823          cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;          cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;
824          if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
825          else Trout->AddFriend(R);          else Trout->AddFriend(R);
# Line 509  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 829  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
829      // S4      // S4
830      TTree *S = (TTree*)f->Get("S4");      TTree *S = (TTree*)f->Get("S4");
831      if(S && S4) {      if(S && S4) {
832          S->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerToS4());          S->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
833          cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;          cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;
834          if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
835          else Trout->AddFriend(S);          else Trout->AddFriend(S);
# Line 519  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 839  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
839      // Neutron Detector      // Neutron Detector
840      TTree *N = (TTree*)f->Get("NeutronD");      TTree *N = (TTree*)f->Get("NeutronD");
841      if(N && ND) {      if(N && ND) {
842          N->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerToND());          N->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
843          cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;          cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;
844          if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
845          else Trout->AddFriend(N);          else Trout->AddFriend(N);
# Line 529  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 849  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
849      // Anticounters      // Anticounters
850      TTree *A = (TTree*)f->Get("Anticounter");      TTree *A = (TTree*)f->Get("Anticounter");
851      if(A && AC) {      if(A && AC) {
852          A->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerToAc());          A->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
853          cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;          cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;
854          if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
855          else Trout->AddFriend(A);          else Trout->AddFriend(A);
# Line 537  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 857  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
857          cout << "Anticounter  : missing tree"<<endl;          cout << "Anticounter  : missing tree"<<endl;
858      };      };
859      // Orbital Info      // Orbital Info
860          TTree *B = (TTree*)f->Get("OrbitalInfo");      TTree *B = (TTree*)f->Get("OrbitalInfo");
861          if(B && ORB) {      if(B && ORB) {
862                  B->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerToOrb());          B->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
863                  cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;          cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;
864                  if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
865                  else Trout->AddFriend(B);          else Trout->AddFriend(B);
866          }else{      }else{
867                  cout << "OrbitalInfo  : missing tree"<<endl;          cout << "OrbitalInfo  : missing tree"<<endl;
868          };      };
869            
870          cout<<endl<<" Number of entries: "<<Trout->GetEntries()<<endl<<endl;      cout<<endl<<" Number of entries: "<<Trout->GetEntries()<<endl<<endl;
871                
872          return Trout;      return Trout;
873            
874  }  }
875  //--------------------------------------  //--------------------------------------
# Line 579  TList*  PamLevel2::GetListOfLevel2Files( Line 899  TList*  PamLevel2::GetListOfLevel2Files(
899      // if no input file list is given:        // if no input file list is given:  
900      if ( flisttxt != "" ){      if ( flisttxt != "" ){
901                    
902          if( !gSystem->IsFileInIncludePath(flisttxt,&fullpath) )return 0;          if( !gSystem->IsFileInIncludePath(flisttxt,&fullpath) ){
903                        cout <<"File "<<flisttxt<<" not found"<<endl;
904                return 0;
905            }      
906  //              flisttxt = gSystem->ConcatFileName(gSystem->DirName(flisttxt),gSystem->BaseName(flisttxt));  //              flisttxt = gSystem->ConcatFileName(gSystem->DirName(flisttxt),gSystem->BaseName(flisttxt));
907          flisttxt = fullpath;          flisttxt = fullpath;
908                    
909          if( !gSystem->ChangeDirectory(ddir) )return 0;          if( !gSystem->ChangeDirectory(ddir) ){
910                cout << "Cannot change directory : "<<ddir<<endl;
911                return 0;
912            }
913                    
914          cout <<"Input file list : " << flisttxt <<endl;          cout <<"Input file list : " << flisttxt <<endl;
915          ifstream in;          ifstream in;
916          in.open(flisttxt, ios::in); //open input file list          in.open(flisttxt, ios::in); //open input file list
917            int line=0;
918          while (1) {          while (1) {
919              TString file;              TString file;
920              in >> file;              in >> file;
921              if (!in.good()) break;              if (!in.good()) break;
922                line++;
923    //          cout <<"(1) " << file << endl;
924                if(file.IsNull()){
925                    cout << "-- list interrupted at line "<<line <<endl;
926                    break;
927                }
928                if(file.Contains("#"))file = file(0,file.First("#"));
929    //          cout <<"(2) " << file << endl;
930              if( gSystem->IsFileInIncludePath(file,&fullpath) ){              if( gSystem->IsFileInIncludePath(file,&fullpath) ){
931  //                              contents->Add(new TSystemDirectory(fullpath,ddir)); // add file to the list  
 //                              contents->Add(new TSystemFile(fullpath,ddir)); // add file to the list  
932                  contents->Add(new TSystemFile(fullpath,gSystem->DirName(fullpath)));// add file to the list                  contents->Add(new TSystemFile(fullpath,gSystem->DirName(fullpath)));// add file to the list
933    
934              }else{              }else{
935                  cout << "warning! --- File "<<file<<" does not exists"<< endl;  //              if(file.Data()!="")cout << "File: "<<file<<" ---> missing "<< endl;
936              };              };
937          };          };
938          in.close();          in.close();
# Line 648  TList*  PamLevel2::GetListOfLevel2Files( Line 982  TList*  PamLevel2::GetListOfLevel2Files(
982   * @param detlist String to select trees to be included   * @param detlist String to select trees to be included
983   * @return Pointer to a TChain   * @return Pointer to a TChain
984   */   */
985  TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList *fl, TString detlist="+ALL"){  TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList *fl, TString detlist ){
   
 //      TChain *Tout=0;  
     if(Tout)Tout->Delete();  
     Tout = NULL;  
986            
987        TChain *Trout =0;
988    
989    //    if( !detlist.IsNull() )SetWhichTrees(detlist);
990      SetWhichTrees(detlist);      SetWhichTrees(detlist);
991            
992        cout<< "GetPamTree(TList*,TString): input detector list --> ";
993        if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
994        if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
995        if(TRKh)cout<<"TRKH ";
996        if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
997        if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
998        if(TOF)cout<<"TOF ";
999        if(TRG)cout<<"TRG ";
1000        if(AC)cout<<"AC ";
1001        if(ND)cout<<"ND ";
1002        if(S4)cout<<"S4 ";
1003        if(ORB)cout<<"ORB ";
1004        cout << endl;
1005    
1006      TChain *T = 0;            TChain *T = 0;      
1007      TChain *C = 0;      TChain *C = 0;
1008      TChain *O = 0;      TChain *O = 0;
# Line 665  TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList *fl, Line 1012  TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList *fl,
1012      TChain *A = 0;      TChain *A = 0;
1013      TChain *B = 0;      TChain *B = 0;
1014            
1015      if(TRK) T = new TChain("Tracker");        if(TRK2||TRK1||TRKh) T = new TChain("Tracker");    
1016      if(CAL) C = new TChain("Calorimeter");      if(CAL2||CAL1)       C = new TChain("Calorimeter");
1017      if(TOF) O = new TChain("ToF");      if(TOF)              O = new TChain("ToF");
1018      if(TRG) R = new TChain("Trigger");      if(TRG)              R = new TChain("Trigger");
1019      if(S4)  S = new TChain("S4");      if(S4)               S = new TChain("S4");
1020      if(ND)  N = new TChain("NeutronD");      if(ND)               N = new TChain("NeutronD");
1021      if(AC)  A = new TChain("Anticounter");      if(AC)               A = new TChain("Anticounter");
1022      if(ORB) B = new TChain("OrbitalInfo");      if(ORB)              B = new TChain("OrbitalInfo");
1023            
1024      // loop over files and create chains              // loop over files and create chains        
1025      TIter next(fl);      TIter next(fl);
1026      TSystemFile *questo = 0;      TSystemFile *questo = 0;
1027      while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {      while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {
1028          TString name =  questo->GetName();          TString name =  questo->GetName();
1029  //              cout << "File: "<< name << endl;          cout << "File: "<< name << endl;
1030          if( CheckLevel2File(name) ){          if( CheckLevel2File(name) ){
1031              if(TRK) T->Add(name);              if(TRK2||TRK1||TRKh) T->Add(name);
1032              if(CAL) C->Add(name);              if(CAL1||CAL2)       C->Add(name);
1033              if(TOF) O->Add(name);              if(TOF)              O->Add(name);
1034              if(TRG) R->Add(name);              if(TRG)              R->Add(name);
1035              if(S4)  S->Add(name);              if(S4)               S->Add(name);
1036              if(ND)  N->Add(name);              if(ND)               N->Add(name);
1037              if(AC)  A->Add(name);              if(AC)               A->Add(name);
1038              if(ORB) B->Add(name);              if(ORB)              B->Add(name);
1039          };          };
1040      }      }
1041            
1042      cout << "done chain \n";      cout << "done chain \n";
1043    
1044      // Tracker      UInt_t *found=0;
1045      if(TRK) if(!Tout)Tout=T;  // Tracker
1046        if(T && (TRK2||TRK1||TRKh)) {
1047            if(TRK2)T->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerTo("TrkLevel2"));
1048            else    T->SetBranchStatus("TrkLevel2",0,found);
1049            if(TRK2)cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;
1050            if(TRK1)T->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel1"));
1051            else    T->SetBranchStatus("TrkLevel1",0,found);
1052            if(TRK1)cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;
1053            if(TRKh)T->SetBranchAddress("TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
1054            else    T->SetBranchStatus("TrkHough",0,found);
1055            if(TRKh)cout << "Tracker      : set branch address TrkHough"<<endl;
1056            if(!Trout)Trout=T;
1057            else Trout->AddFriend("Tracker");
1058        }else{
1059            cout << "Tracker      : missing tree"<<endl;
1060        };
1061      // Calorimeter      // Calorimeter
1062      if(CAL) {                if(C && (CAL2||CAL1)) {
1063          if(!Tout)Tout=C;          if(CAL2)C->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
1064          else Tout->AddFriend("Calorimeter");          else    C->SetBranchStatus("CaloLevel2",0,found);
1065            if(CAL2)cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;
1066            if(CAL1)C->SetBranchAddress("CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
1067            else    C->SetBranchStatus("CaloLevel1",0,found);
1068            if(CAL1)cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel1"<<endl;
1069            if(!Trout)Trout=C;
1070            else Trout->AddFriend("Calorimeter");
1071        }else{
1072            cout << "Calorimeter  : missing tree"<<endl;
1073      };      };
1074      // ToF          // ToF    
1075      if(TOF) {      if(O && TOF) {
1076          if(!Tout)Tout=O;          O->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
1077          else Tout->AddFriend("ToF");          cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;
1078            if(!Trout)Trout=O;
1079            else Trout->AddFriend("ToF");
1080        }else{
1081            cout << "ToF         : missing tree"<<endl;
1082      };      };
1083      // Trigger      // Trigger
1084      if(TRG) {      if(R && TRG) {
1085          if(!Tout)Tout=O;          R->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
1086          else Tout->AddFriend("Trigger");          cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;
1087            if(!Trout)Trout=O;
1088            else Trout->AddFriend("Trigger");
1089        }else{
1090            cout << "Trigger      : missing tree"<<endl;
1091      };      };
1092      // S4      // S4
1093      if(S4) {      if(S && S4) {
1094          if(!Tout)Tout=O;          S->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
1095          else Tout->AddFriend("S4");          cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;
1096            if(!Trout)Trout=O;
1097            else Trout->AddFriend("S4");
1098        }else{
1099            cout << "S4           : missing tree"<<endl;
1100      };      };
1101      // Neutron Detector      // Neutron Detector
1102      if(ND) {      if(N && ND) {
1103          if(!Tout)Tout=O;          N->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
1104          else Tout->AddFriend("NeutronD");          cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;
1105            if(!Trout)Trout=O;
1106            else Trout->AddFriend("NeutronD");
1107        }else{
1108            cout << "NeutronD     : missing tree"<<endl;
1109      };      };
1110      // Anticounters      // Anticounters
1111      if(AC) {      if(A && AC) {
1112          if(!Tout)Tout=O;          A->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
1113          else Tout->AddFriend("Anticounter");          cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;
1114            if(!Trout)Trout=O;
1115            else Trout->AddFriend("Anticounter");
1116        }else{
1117            cout << "Anticounter  : missing tree"<<endl;
1118      };      };
1119      // OrbitalInfo      // Orbital Info
1120      if(ORB) {      if(B && ORB) {
1121          if(!Tout)Tout=O;          B->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
1122          else Tout->AddFriend("OrbitalInfo");          cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;
1123            if(!Trout)Trout=O;
1124            else Trout->AddFriend("OrbitalInfo");
1125        }else{
1126            cout << "OrbitalInfo  : missing tree"<<endl;
1127      };      };
1128            
1129    //    cout<<endl<<" Number of entries: "<<Trout->GetEntries()<<endl<<endl;
1130    
1131        
1132    //     // Tracker
1133    //     if(TRK2||TRK1||TRKh){
1134    //      if(!Tout)Tout=T;
1135    //      else Tout->AddFriend("Tracker");
1136    //     }
1137    //     // Calorimeter
1138    //     if(CAL2||CAL1) {        
1139    //      if(!Tout)Tout=C;
1140    //      else Tout->AddFriend("Calorimeter");
1141    //     };
1142    //     // ToF    
1143    //     if(TOF) {
1144    //      if(!Tout)Tout=O;
1145    //      else Tout->AddFriend("ToF");
1146    //     };
1147    //     // Trigger
1148    //     if(TRG) {
1149    //      if(!Tout)Tout=R;
1150    //      else Tout->AddFriend("Trigger");
1151    //     };
1152    //     // S4
1153    //     if(S4) {
1154    //      if(!Tout)Tout=S;
1155    //      else Tout->AddFriend("S4");
1156    //     };
1157    //     // Neutron Detector
1158    //     if(ND) {
1159    //      if(!Tout)Tout=N;
1160    //      else Tout->AddFriend("NeutronD");
1161    //     };
1162    //     // Anticounters
1163    //     if(AC) {
1164    //      if(!Tout)Tout=A;
1165    //      else Tout->AddFriend("Anticounter");
1166    //     };
1167    //     // OrbitalInfo
1168    //     if(ORB) {
1169    //      if(!Tout)Tout=B;
1170    //      else Tout->AddFriend("OrbitalInfo");
1171    //     };
1172        
1173  //    cout<<endl<<" Number of entries: "<<Tout->GetEntries()<<endl<<endl;  //    cout<<endl<<" Number of entries: "<<Tout->GetEntries()<<endl<<endl;
1174            
1175      if( Tout->GetEntries() )PamLevel2::SetBranchAddress();  //    if( Tout->GetEntries() )PamLevel2::SetBranchAddress( Tout );
1176            
1177      return Tout;      return Trout;
1178  }  }
1179    
1180    
1181    
1182  //--------------------------------------  //--------------------------------------
1183  //  //
1184  //  //
# Line 745  TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList *fl, Line 1186  TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList *fl,
1186  /**  /**
1187   * Set branch addresses for Pamela friend trees   * Set branch addresses for Pamela friend trees
1188   */   */
1189  void PamLevel2::SetBranchAddress(){  void PamLevel2::SetBranchAddress(TTree *t){
1190    
1191        TRK2    = TRK2 & t->GetBranchStatus("TrkLevel2");
1192        TRK1    = TRK1 & t->GetBranchStatus("TrkLevel1");
1193        TRKh    = TRKh & t->GetBranchStatus("TrkHough");
1194        CAL2    = CAL2 & t->GetBranchStatus("CaloLevel2");
1195        CAL1    = CAL1 & t->GetBranchStatus("CaloLevel1");
1196        TOF    = TOF & t->GetBranchStatus("ToFLevel2");
1197        TRG    = TRG & t->GetBranchStatus("TrigLevel2");
1198        S4     = S4  & t->GetBranchStatus("S4Level2");
1199        ND     = ND  & t->GetBranchStatus("NDLevel2");
1200        AC     = AC  & t->GetBranchStatus("AcLevel2");
1201        ORB    = ORB & t->GetBranchStatus("OrbitalInfo");
1202    
1203    
1204      // Tracker      // Tracker
1205      if(TRK) {      if(TRK1) {
1206          if(TRK_L1){          t->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel2"));
1207              Tout->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerToTrk(1));          cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;
1208              cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;      };
1209          };      if(TRK2) {
1210          Tout->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerToTrk(2));          t->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerTo("TrkLevel1"));
1211          cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;          cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;
1212      };      };
1213        if(TRKh) {
1214            t->SetBranchAddress("TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
1215            cout << "Tracker      : set branch address TrkHough"<<endl;
1216        };
1217            
1218      // Calorimeter      // Calorimeter
1219      if(CAL) {      if(CAL1) {
1220          Tout->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerToCalo());          t->SetBranchAddress("CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
1221            cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel1"<<endl;
1222        };
1223        if(CAL2) {
1224            t->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
1225          cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;          cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;
1226      };      };
1227            
1228      // ToF          // ToF    
1229      if(TOF) {      if(TOF) {
1230          Tout->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerToToF());          t->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
1231          cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;          cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;
1232      };      };
1233      // Trigger      // Trigger
1234      if(TRG) {      if(TRG) {
1235          Tout->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerToTrig());          t->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
1236          cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;          cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;
1237      };      };
1238      // S4      // S4
1239      if(S4) {      if(S4) {
1240          Tout->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerToS4());          t->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
1241          cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;          cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;
1242      };      };
1243      // Neutron Detector      // Neutron Detector
1244      if(ND) {      if(ND) {
1245          Tout->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerToND());          t->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
1246          cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;          cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;
1247      };      };
1248      // Anticounters      // Anticounters
1249      if(AC) {      if(AC) {
1250          Tout->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerToAc());          t->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
1251          cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;          cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;
1252      };      };
1253      // OrbitalInfo      // OrbitalInfo
1254      if(ORB) {      if(ORB) {
1255          Tout->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerToOrb());          t->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
1256          cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;          cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;
1257      };      };
1258            
1259  }  }
1260    /**
1261     * Set branch addresses for Pamela friend trees
1262     */
1263    void PamLevel2::SetBranchAddress(TChain *t){
1264    
1265  //--------------------------------------      TRK2    = TRK2 & t->GetBranchStatus("TrkLevel2");
1266  //      TRK1    = TRK1 & t->GetBranchStatus("TrkLevel1");
1267  //      TRKh    = TRKh & t->GetBranchStatus("TrkHough");
1268  //--------------------------------------      CAL1    = CAL1 & t->GetBranchStatus("CaloLevel1");
1269  void *PamLevel2::GetPointerTo(const char* c ){      CAL2    = CAL2 & t->GetBranchStatus("CaloLevel2");
1270  //      cout << "objname "<< objname << endl;      TOF    = TOF & t->GetBranchStatus("ToFLevel2");
1271      TString objname = c;      TRG    = TRG & t->GetBranchStatus("TrigLevel2");
1272      if(!objname.CompareTo("TrkLevel1"))return &trk_l1_obj;      S4     = S4  & t->GetBranchStatus("S4Level2");
1273      if(!objname.CompareTo("TrkLevel2"))return &trk_obj;      ND     = ND  & t->GetBranchStatus("NDLevel2");
1274        AC     = AC  & t->GetBranchStatus("AcLevel2");
1275        ORB    = ORB & t->GetBranchStatus("OrbitalInfo");
1276    
1277        // Tracker
1278         if(TRK2) {
1279            t->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerTo("TrkLevel2"));
1280            cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;
1281        };
1282        if(TRK1) {
1283            t->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel1"));
1284            cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;
1285        };
1286         if(TRKh) {
1287            t->SetBranchAddress("TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
1288            cout << "Tracker      : set branch address TrkHough"<<endl;
1289         };
1290            
1291      return NULL;      // Calorimeter
1292  };      if(CAL2) {
1293            t->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
1294            cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;
1295        };  
1296        if(CAL1) {
1297            t->SetBranchAddress("CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
1298            cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel1"<<endl;
1299        };
1300        
1301        // ToF    
1302        if(TOF) {
1303            t->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
1304            cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;
1305        };
1306        // Trigger
1307        if(TRG) {
1308            t->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
1309            cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;
1310        };
1311        // S4
1312        if(S4) {
1313            t->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
1314            cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;
1315        };
1316        // Neutron Detector
1317        if(ND) {
1318            t->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
1319            cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;
1320        };
1321        // Anticounters
1322        if(AC) {
1323            t->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
1324            cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;
1325        };
1326        // OrbitalInfo
1327        if(ORB) {
1328            t->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
1329            cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;
1330        };
1331        
1332    }
1333    
1334    
1335  //--------------------------------------  //--------------------------------------
1336  //  //
1337  //  //
# Line 831  TChain *PamLevel2::GetRunTree(TList *fl) Line 1356  TChain *PamLevel2::GetRunTree(TList *fl)
1356          };          };
1357      }      }
1358            
1359      R->SetBranchAddress("RunInfo", GetPointerToRun());      R->SetBranchAddress("RunInfo", GetPointerTo("RunInfo"));
1360      cout << "Run         : set branch address RunInfo"<<endl;      cout << "Run         : set branch address RunInfo"<<endl;
1361            
1362      return R;      return R;
# Line 851  TTree *PamLevel2::GetRunTree(TFile *f){ Line 1376  TTree *PamLevel2::GetRunTree(TFile *f){
1376    
1377      TTree *R = (TTree*)f->Get("Run");      TTree *R = (TTree*)f->Get("Run");
1378            
1379      R->SetBranchAddress("RunInfo", GetPointerToRun());      R->SetBranchAddress("RunInfo", GetPointerTo("RunInfo"));
1380      cout << "Run         : set branch address RunInfo"<<endl;      cout << "Run         : set branch address RunInfo"<<endl;
1381            
1382      return R;      return R;
# Line 862  TTree *PamLevel2::GetRunTree(TFile *f){ Line 1387  TTree *PamLevel2::GetRunTree(TFile *f){
1387  //  //
1388  //--------------------------------------  //--------------------------------------
1389  /**  /**
1390   * Set which trees should be analysed   * Set which trees shoul be analysed
1391   * @param detlist TString containing the sequence of trees required   * @param detlist TString containing the sequence of trees required
1392  */  */
1393  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString detlist){  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString detlist){
1394                    
1395      if(detlist.Contains("+ALL", TString::kIgnoreCase)){      if(detlist.IsNull() || detlist.Contains("+ALL", TString::kIgnoreCase)){
1396          CAL = true;          CAL1 = true;
1397          TRK = true;          CAL2 = true;
1398          TRK_L1 = false;          TRK2 = true;
1399            TRK1 = false;
1400            TRKh = false;
1401          TRG = true;          TRG = true;
1402          TOF = true;          TOF = true;
1403          S4  = true;          S4  = true;
# Line 878  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString de Line 1405  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString de
1405          AC  = true;          AC  = true;
1406          ORB = true;          ORB = true;
1407      }else if( detlist.Contains("-ALL", TString::kIgnoreCase) ){      }else if( detlist.Contains("-ALL", TString::kIgnoreCase) ){
1408          CAL = false;          CAL1 = false;
1409          TRK = false;          CAL2 = false;
1410          TRK_L1 = false;          TRK2 = false;
1411            TRK1 = false;
1412            TRKh = false;
1413          TRG = false;          TRG = false;
1414          TOF = false;          TOF = false;
1415          S4  = false;          S4  = false;
# Line 889  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString de Line 1418  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString de
1418          ORB = false;          ORB = false;
1419      };      };
1420            
1421      if( detlist.Contains("-CAL", TString::kIgnoreCase) )CAL = false;  //  -------------------------------------------------------------------------
1422      else if( detlist.Contains("+CAL", TString::kIgnoreCase) )CAL = true;      if( detlist.Contains("CAL1", TString::kIgnoreCase) ){
1423                if ( detlist.Contains("-CAL1", TString::kIgnoreCase) )CAL1=false;
1424      if( detlist.Contains("-TRK", TString::kIgnoreCase) )TRK = false;          if ( detlist.Contains("+CAL1", TString::kIgnoreCase) )CAL1=true;
1425      else if( detlist.Contains("+TRK", TString::kIgnoreCase) )TRK = true;      };
1426                
1427      if( detlist.Contains("-TRK1", TString::kIgnoreCase) )TRK_L1 = false;      if( detlist.Contains("CAL2", TString::kIgnoreCase)){
1428      else if( detlist.Contains("+TRK1", TString::kIgnoreCase) )TRK_L1 = true;          if ( detlist.Contains("-CAL2", TString::kIgnoreCase) )CAL2=false;
1429            if ( detlist.Contains("+CAL2", TString::kIgnoreCase) )CAL2=true;
1430        };
1431            
1432        if( detlist.Contains("+CAL", TString::kIgnoreCase) && !CAL1 && !CAL2 )CAL2=true;
1433        if( detlist.Contains("-CAL", TString::kIgnoreCase) && CAL1 && CAL2 ){
1434            CAL2=false;
1435            CAL1=false;
1436        }
1437    //  -------------------------------------------------------------------------
1438        if( detlist.Contains("TRK1", TString::kIgnoreCase) ){
1439            if ( detlist.Contains("-TRK1", TString::kIgnoreCase) )TRK1=false;
1440            if ( detlist.Contains("+TRK1", TString::kIgnoreCase) )TRK1=true;
1441        };
1442            
1443        if( detlist.Contains("TRK2", TString::kIgnoreCase)){
1444            if ( detlist.Contains("-TRK2", TString::kIgnoreCase) )TRK2=false;
1445            if ( detlist.Contains("+TRK2", TString::kIgnoreCase) )TRK2=true;
1446        };
1447    
1448        if( detlist.Contains("TRKh", TString::kIgnoreCase)){
1449            if ( detlist.Contains("-TRKh", TString::kIgnoreCase) )TRKh=false;
1450            if ( detlist.Contains("+TRKh", TString::kIgnoreCase) )TRKh=true;
1451        };
1452            
1453        if( detlist.Contains("+TRK", TString::kIgnoreCase) && !TRK1 && !TRK2 && !TRKh )TRK2=true;
1454        if( detlist.Contains("-TRK", TString::kIgnoreCase) && TRK1 && TRK2 && TRKh){
1455            TRK2=false;
1456            TRK1=false;
1457            TRKh=false;
1458        }
1459    //  -------------------------------------------------------------------------
1460            
1461      if( detlist.Contains("-TRG", TString::kIgnoreCase) )TRG = false;      if( detlist.Contains("-TRG", TString::kIgnoreCase) )TRG = false;
1462      else if( detlist.Contains("+TRG", TString::kIgnoreCase) )TRG = true;      else if( detlist.Contains("+TRG", TString::kIgnoreCase) )TRG = true;
# Line 915  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString de Line 1475  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString de
1475            
1476      if( detlist.Contains("-ORB", TString::kIgnoreCase) )ORB = false;      if( detlist.Contains("-ORB", TString::kIgnoreCase) )ORB = false;
1477      else if( detlist.Contains("+ORB", TString::kIgnoreCase) )ORB = true;      else if( detlist.Contains("+ORB", TString::kIgnoreCase) )ORB = true;
1478    
1479    //     cout<< "Set detector list --> ";
1480    //     if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
1481    //     if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
1482    //     if(TRKh)cout<<"TRKH ";
1483    //     if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
1484    //     if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
1485    //     if(TOF)cout<<"TOF ";
1486    //     if(TRG)cout<<"TRG ";
1487    //     if(AC)cout<<"AC ";
1488    //     if(ND)cout<<"ND ";
1489    //     if(S4)cout<<"S4 ";
1490    //     if(ORB)cout<<"ORB ";
1491    //     cout << endl;
1492            
1493  };  };
1494    
1495    
1496    /**
1497     * Set tree/branch detector flags from the content of a tree
1498     */
1499    void  PamLevel2::GetWhichTrees(TFile* f){
1500            
1501        // -----------
1502        // reset flags
1503        // -----------
1504        CAL1   = false;    
1505        CAL2   = false;    
1506        TRK2   = false;    
1507        TRK1   = false;    
1508        TRKh   = false;    
1509        TRG    = false;    
1510        TOF    = false;    
1511        S4     = false;    
1512        ND     = false;    
1513        AC     = false;    
1514        ORB    = false;    
1515        
1516        RUN    = false;
1517            
1518        cout << "Checking file: "<<f->GetName()<<endl;
1519        if( !f || f->IsZombie() ){
1520            cout << "File: "<< f->GetName() <<" Non valid root file"<< endl;
1521            return;
1522        }
1523    
1524        TList *lk = f->GetListOfKeys();
1525        TIter next(lk);
1526        TKey *key =0;
1527    
1528        Int_t nev = 0;
1529    
1530        while( (key = (TKey*)next()) ){
1531            
1532            if( !strcmp(key->GetName(),"Run"        ) )RUN = true;
1533    
1534            //=========================================================    
1535            if( !strcmp(key->GetName(),"Trigger"    ) ){
1536                TRG = true;
1537                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("Trigger"))->GetEntries();
1538                if( nev && nevt!=nev){
1539                    cout << "File: "<< f->GetName() <<" Trigger tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1540                    TRG = false;
1541                }else nev=nevt;
1542            }
1543            //=========================================================    
1544            if( !strcmp(key->GetName(),"ToF"        ) ){
1545                TOF = true;
1546                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("ToF"))->GetEntries();
1547                if( nev && nevt!=nev){
1548                    cout << "File: "<< f->GetName() <<"     ToF tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1549                    TOF = false;
1550                }else nev=nevt;
1551            }
1552            //=========================================================  
1553            if( !strcmp(key->GetName(),"S4"         ) ){
1554                S4 = true;
1555                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("S4"))->GetEntries();
1556                if( nev && nevt!=nev){
1557                    cout << "File: "<< f->GetName() <<"      S4 tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1558                    S4 = false;
1559                }else nev=nevt;
1560            }
1561            //=========================================================  
1562    
1563            if( !strcmp(key->GetName(),"NeutronD"   ) ){
1564                ND = true;
1565                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("NeutronD"))->GetEntries();
1566                if( nev && nevt!=nev){
1567                    cout << "File: "<< f->GetName() <<"NeutronD tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1568                    ND =false;
1569                }else nev=nevt;
1570            }      
1571            //=========================================================  
1572            if( !strcmp(key->GetName(),"Anticounter") ){
1573                AC = true;
1574                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("Anticounter"))->GetEntries();
1575                if( nev && nevt!=nev){
1576                    cout << "File: "<< f->GetName() <<" Anticounter tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1577                    AC =false;
1578                }else nev=nevt;
1579            }
1580            //=========================================================  
1581            if( !strcmp(key->GetName(),"OrbitalInfo") ){
1582                ORB = true;
1583                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("OrbitalInfo"))->GetEntries();
1584                if( nev && nevt!=nev){
1585                    cout << "File: "<< f->GetName() <<" OrbitalInfo tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1586                    ORB = false;
1587                }else nev=nevt;
1588            }
1589            //=========================================================  
1590            if( !strcmp(key->GetName(),"Tracker"    ) ){
1591                TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");
1592                for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){
1593                    TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();
1594                    if( !name.CompareTo("TrkLevel1") )TRK1=true;
1595                    if( !name.CompareTo("TrkLevel2") )TRK2=true;
1596                    if( !name.CompareTo("TrkHough") )TRKh=true;
1597                };      
1598                Int_t nevt = T->GetEntries();
1599                if( nev && nevt!=nev){
1600                    cout << "File: "<< f->GetName() <<" Tracker tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1601                    TRK1 = false;
1602                    TRK2 = false;
1603                    TRKh = false;
1604                }else nev=nevt;
1605                T->Delete();
1606            };
1607            //=========================================================  
1608            if( !strcmp(key->GetName(),"Calorimeter"    ) ){
1609                TTree *T = (TTree*)f->Get("Calorimeter");
1610                for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){
1611                    TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();
1612                    if( !name.CompareTo("CaloLevel1") )CAL1=true;
1613                    if( !name.CompareTo("CaloLevel2") )CAL2=true;
1614                };    
1615                Int_t nevt = T->GetEntries();
1616                if( nev && nevt!=nev){
1617                    cout << "File: "<< f->GetName() <<"  Calorimeter tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1618                    CAL1 = false;
1619                    CAL2 = false;
1620                }else nev=nevt;
1621                T->Delete();
1622            };      
1623    
1624        };
1625        
1626        delete lk;
1627    
1628    //     cout<< "Get detector list from input file --> ";
1629    //     if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
1630    //     if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
1631    //     if(TRKh)cout<<"TRKH ";
1632    //     if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
1633    //     if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
1634    //     if(TOF)cout<<"TOF ";
1635    //     if(TRG)cout<<"TRG ";
1636    //     if(AC)cout<<"AC ";
1637    //     if(ND)cout<<"ND ";
1638    //     if(S4)cout<<"S4 ";
1639    //     if(ORB)cout<<"ORB ";
1640    //     cout << endl;
1641          
1642        return ;
1643            
1644    };
1645    
1646    
1647  //--------------------------------------  //--------------------------------------
1648  //  //
1649  //  //
# Line 928  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString de Line 1655  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString de
1655   */   */
1656  Bool_t  PamLevel2::CheckLevel2File(TString name){  Bool_t  PamLevel2::CheckLevel2File(TString name){
1657                    
1658      Bool_t CAL__ok = false;          Bool_t CAL1__ok   = false;    
1659      Bool_t TRK__ok = false;          Bool_t CAL2__ok   = false;    
1660      Bool_t TRK_L1__ok = false;          Bool_t TRK2__ok   = false;    
1661      Bool_t TRG__ok = false;          Bool_t TRK1__ok   = false;    
1662      Bool_t TOF__ok = false;          Bool_t TRKh__ok   = false;    
1663      Bool_t S4__ok  = false;          Bool_t TRG__ok    = false;    
1664      Bool_t ND__ok  = false;          Bool_t TOF__ok    = false;    
1665      Bool_t AC__ok  = false;          Bool_t S4__ok     = false;    
1666      Bool_t ORB__ok = false;          Bool_t ND__ok     = false;    
1667        Bool_t AC__ok     = false;    
1668        Bool_t ORB__ok    = false;    
1669            
1670      Bool_t RUN__ok = false;      Bool_t RUN__ok    = false;
1671            
1672  //    cout << "Checking file: "<<name<<endl;      
1673    
1674        cout << "Checking file: "<<name<<endl;
1675      TFile *f = new TFile(name.Data());      TFile *f = new TFile(name.Data());
1676      if( !f || f->IsZombie() ){      if( !f || f->IsZombie() ){
1677          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Non valid root file"<< endl; return false;          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Non valid root file"<< endl; return false;
1678      }      }
1679      //   cout << "Get list of keys: "<<f<<endl;  //    cout << "Get list of keys: "<<f<<endl;
1680      TList *lk = f->GetListOfKeys();      TList *lk = f->GetListOfKeys();
1681  //      lk->Print();  //    lk->Print();
1682      TIter next(lk);      TIter next(lk);
1683      TKey *key =0;      TKey *key =0;
1684      Int_t nev =0;  
1685      Int_t nev_previous =0;      Int_t nev = 0;
1686    
1687      while( (key = (TKey*)next()) ){      while( (key = (TKey*)next()) ){
1688                    
1689          nev_previous = nev;  //      cout << key->GetName() << ""<<key->GetClassName()<<endl;
1690          nev = ((TTree*)f->Get(key->GetName()))->GetEntries();  //              cout << " Get tree: " << f->Get(key->GetName())<<endl;
1691          if( key->GetClassName()=="TTree" && nev_previous && nev != nev_previous ){  //      nev_previous = nev;
1692              cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- "<< key->GetName() << " tree: n.entries does not match "<<nev<<" "<<nev_previous<< endl;  //      cout << " n.entries  "<< nev <<endl;
1693              return false;  //      if( key->GetClassName()=="TTree" && nev_previous && nev != nev_previous ){
1694          };  //          nev = ((TTree*)f->Get(key->GetName()))->GetEntries();
1695    //          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- "<< key->GetName() << " tree: n.entries does not match "<<nev<<" "<<nev_previous<< endl;
1696    //          return false;
1697    //      };
1698    
         if( !strcmp(key->GetName(),"Calorimeter") )CAL__ok = true;  
         if( !strcmp(key->GetName(),"Trigger"    ) )TRG__ok = true;  
         if( !strcmp(key->GetName(),"ToF"        ) )TOF__ok = true;  
         if( !strcmp(key->GetName(),"S4"         ) )S4__ok = true;  
         if( !strcmp(key->GetName(),"NeutronD"   ) )ND__ok = true;  
         if( !strcmp(key->GetName(),"Anticounter") )AC__ok = true;  
         if( !strcmp(key->GetName(),"OrbitalInfo") )ORB__ok = true;  
1699          if( !strcmp(key->GetName(),"Run"        ) )RUN__ok = true;                if( !strcmp(key->GetName(),"Run"        ) )RUN__ok = true;      
1700    
1701            //=========================================================    
1702            if( !strcmp(key->GetName(),"Trigger"    ) ){
1703                TRG__ok = true;
1704                if(TRG){
1705                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("Trigger"))->GetEntries();
1706                    if( nev && nevt!=nev){
1707                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Trigger tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1708                        return false;
1709                    }
1710                    nev=nevt;
1711                }
1712            }
1713            //=========================================================    
1714            if( !strcmp(key->GetName(),"ToF"        ) ){
1715                TOF__ok = true;
1716                if(TOF){
1717                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("ToF"))->GetEntries();
1718                    if( nev && nevt!=nev){
1719                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- ToF tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1720                        return false;
1721                    }
1722                    nev=nevt;
1723                }
1724            }
1725            //=========================================================  
1726            if( !strcmp(key->GetName(),"S4"         ) ){
1727                S4__ok = true;
1728                if(S4){
1729                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("S4"))->GetEntries();
1730                    if( nev && nevt!=nev){
1731                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- S4 tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1732                        return false;
1733                    }
1734                    nev=nevt;
1735                }
1736            }
1737            //=========================================================  
1738    
1739            if( !strcmp(key->GetName(),"NeutronD"   ) ){
1740                ND__ok = true;
1741                if(ND){
1742                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("NeutronD"))->GetEntries();
1743                    if( nev && nevt!=nev){
1744                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- NeutronD tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1745                        return false;
1746                    }
1747                    nev=nevt;
1748                }
1749            }      
1750            //=========================================================  
1751            if( !strcmp(key->GetName(),"Anticounter") ){
1752                AC__ok = true;
1753                if(AC){
1754                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("Anticounter"))->GetEntries();
1755                    if( nev && nevt!=nev){
1756                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Anticounter tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1757                        return false;
1758                    }
1759                    nev=nevt;
1760                }
1761            }
1762            //=========================================================  
1763            if( !strcmp(key->GetName(),"OrbitalInfo") ){
1764                ORB__ok = true;
1765                if(ORB){
1766                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("OrbitalInfo"))->GetEntries();
1767                    if( nev && nevt!=nev){
1768                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- OrbitalInfo tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1769                        return false;
1770                    }
1771                    nev=nevt;
1772                }
1773            }
1774            //=========================================================  
1775          if( !strcmp(key->GetName(),"Tracker"    ) ){          if( !strcmp(key->GetName(),"Tracker"    ) ){
             TRK__ok = true;  
1776              TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");              TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");
1777                if(TRK1||TRK2||TRKh){
1778                    Int_t nevt = T->GetEntries();
1779                    if( nev && nevt!=nev){
1780                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Tracker tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1781                        return false;
1782                    }
1783                    nev=nevt;
1784                }
1785              for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){              for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){
1786                  TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();                  TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();
1787                  if( !name.CompareTo("TrkLevel1") )TRK_L1__ok=true;                  if( !name.CompareTo("TrkLevel1") )TRK1__ok=true;
1788              };                  if( !name.CompareTo("TrkLevel2") )TRK2__ok=true;
1789                    if( !name.CompareTo("TrkHough") )TRKh__ok=true;
1790                };      
1791                T->Delete();
1792          };          };
1793                    //=========================================================  
1794            if( !strcmp(key->GetName(),"Calorimeter"    ) ){
1795                TTree *T = (TTree*)f->Get("Calorimeter");
1796                if(CAL1||CAL2){
1797                    Int_t nevt = T->GetEntries();
1798                    if( nev && nevt!=nev){
1799                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Calorimeter tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1800                        return false;
1801                    }
1802                    nev=nevt;
1803                }
1804                for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){
1805                    TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();
1806                    if( !name.CompareTo("CaloLevel1") )CAL1__ok=true;
1807                    if( !name.CompareTo("CaloLevel2") )CAL2__ok=true;
1808                };    
1809                T->Delete();
1810            };      
1811    
1812      };      };
1813            
1814      lk->Delete();  //     cout<< "CheckLevel2File(TString): detector list --> ";
1815      f->Close();  //     if(TRK1__ok)cout<<"TRK1 ";
1816        //     if(TRK2__ok)cout<<"TRK2 ";
1817      Bool_t FLAG = true;  //     if(TRKh__ok)cout<<"TRKH ";
1818    //     if(CAL1__ok)cout<<"CAL1 ";
1819    //     if(CAL2__ok)cout<<"CAL2 ";
1820    //     if(TOF__ok)cout<<"TOF ";
1821    //     if(TRG__ok)cout<<"TRG ";
1822    //     if(AC__ok)cout<<"AC ";
1823    //     if(ND__ok)cout<<"ND ";
1824    //     if(S4__ok)cout<<"S4 ";
1825    //     if(ORB__ok)cout<<"ORB ";
1826    //     cout << endl;
1827    
1828    
1829        if(TRK2 && TRK1__ok)TRK1=1;
1830    // ----------------------------------------------------------------------------
1831    // NOTA
1832    // se c'e` il level1, lo devo necessarimente leggere.
1833    // infatti (non ho capito perche`) i cluster vengono letti e allocati in memoria
1834    // comunque, ma non vengono disallocati da PamLevel2::Clear()
1835    // ----------------------------------------------------------------------------
1836    
1837    
1838      if(!RUN__ok) {      if(!RUN__ok) {
1839          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing RunInfo tree"<< endl; return false;          cout << "File: "<< f->GetName() <<" *WARNING* ---- Missing RunInfo tree"<< endl;
1840  //      FLAG = false;  //      return false;
1841      };      };
1842      if(CAL && !CAL__ok){  
1843          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing Calorimeter tree"<< endl; return false;      if(CAL1 && !CAL1__ok){
1844  //      FLAG = false;          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing CaloLevel1 branch"<< endl;
1845      };          return false;
     if(TRK && !TRK__ok){  
         cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing Tracker tree"<< endl; return false;  
 //      FLAG = false;  
     };  
     if(TRK_L1 && !TRK_L1__ok){  
         cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing Tracker Level1 Branch"<< endl; return false;  
 //      FLAG = false;  
1846      };      };
1847      if(TRG && !TRG__ok){      if(CAL2 && !CAL2__ok){
1848          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing Trigger tree"<< endl; return false;          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing CaloLevel2 branch"<< endl;
1849  //      FLAG = false;          return false;
1850      };      };
1851      if(TOF && !TOF__ok){      if(TRK2 && !TRK2__ok){
1852          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ToF tree"<< endl; return false;          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing TrkLevel2 branch"<< endl;
1853  //      FLAG = false;          return false;
1854      };      };
1855      if(S4 && !S4__ok){      if(TRK1 && !TRK1__ok){
1856          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing S4 tree"<< endl; return false;          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing TrkLevel1 branch"<< endl;
1857  //      FLAG = false;          return false;
1858      };      };
1859      if(ND && !ND__ok){      if(TRKh && !TRKh__ok){
1860          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ND tree"<< endl; return false;          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing TrkHough branch"<< endl;
1861  //      FLAG = false;          return false;
1862        };
1863        if(ORB && !ORB__ok){
1864            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ORB tree"<< endl;
1865            return false;
1866      };      };
1867      if(AC && !AC__ok){      if(AC && !AC__ok){
1868          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing AC tree"<< endl; return false;          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing AC tree"<< endl;
1869  //      FLAG = false;          return false;
1870      };      };
1871      if(ORB && !ORB__ok){      if(S4 && !S4__ok){
1872          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ORB tree"<< endl; return false;          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing S4 tree"<< endl;
1873  //      FLAG = false;          return false;
1874        };
1875        if(TOF && !TOF__ok){
1876            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ToF tree"<< endl;
1877            return false;
1878        };
1879    
1880        if(ND && !ND__ok){
1881            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ND tree"<< endl;
1882            return false;
1883        };
1884        if(TRG && !TRG__ok){
1885            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing Trigger tree"<< endl;
1886            return false;
1887      };      };
1888            
1889      return FLAG;  
1890    //    lk->Delete();
1891    //    delete lk;
1892        f->Close();
1893    
1894    //     cout<< "CheckLevel2File(TString): detector list --> ";
1895    //     if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
1896    //     if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
1897    //     if(TRKh)cout<<"TRKH ";
1898    //     if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
1899    //     if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
1900    //     if(TOF)cout<<"TOF ";
1901    //     if(TRG)cout<<"TRG ";
1902    //     if(AC)cout<<"AC ";
1903    //     if(ND)cout<<"ND ";
1904    //     if(S4)cout<<"S4 ";
1905    //     if(ORB)cout<<"ORB ";
1906    //     cout << endl;
1907          
1908        return true;
1909                    
1910  };  };
1911    
1912    
1913    /**
1914     * Create clone-trees
1915     */
1916    void PamLevel2::CreateCloneTrees0( TChain *fChain, TFile *ofile ){
1917    
1918        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
1919        cout << "Create clones of PAMELA trees "<<endl;
1920        
1921        Int_t i=0;
1922        tree_clone[i] = fChain->GetTree()->CloneTree(0);
1923        TString name =  tree_clone[i]->GetName();
1924        name.Append("_clone");
1925    //    tree_clone[i]->SetName(name.Data());
1926        cout << tree_clone[i]->GetName() <<endl;
1927        i++;
1928    
1929        TList *li = fChain->GetListOfFriends();
1930        TIter next(li);
1931        TFriendElement* T_friend=0;
1932        ofile->cd();
1933        while( (T_friend = (TFriendElement*)next()) ){
1934    //      cout<<T_friend->IsA()->GetName()<<" "<<T_friend->GetName()<<hex << T_friend->GetTree() << dec<<endl;
1935    //      cout<<T_friend->GetTree()->GetName()<< endl;
1936            tree_clone[i] = T_friend->GetTree()->CloneTree(0);
1937            tree_clone[i]->SetAutoSave(1000000);
1938            name =  tree_clone[i]->GetName();
1939            name.Append("_clone");
1940    //      tree_clone[i]->SetName(name.Data());
1941            cout << tree_clone[i]->GetName() << endl;
1942            i++;
1943        }
1944        
1945        delete li;
1946    
1947        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
1948    
1949    }
1950    
1951    /**
1952     * Create clone-trees
1953     */
1954    void PamLevel2::CreateCloneTrees(TFile *ofile){
1955    
1956        ofile->cd();
1957    
1958        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
1959        cout << "Create new PAMELA trees "<<endl;
1960            
1961        Int_t i=0;
1962    
1963        if(TRK1||TRK2||TRKh){
1964            tree_clone[i] = new TTree("Tracker","PAMELA tracker level2 data ");    
1965            if(TRK1) {
1966                tree_clone[i]->Branch("TrkLevel1","TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel1"));
1967                tree_clone[i]->BranchRef();
1968                cout << "Tracker      : branch TrkLevel1"<<endl;
1969            };
1970            if(TRK2) {
1971                tree_clone[i]->Branch("TrkLevel2", "TrkLevel2",GetPointerTo("TrkLevel2"));
1972                cout << "Tracker      : branch TrkLevel2"<<endl;        
1973            };
1974            if(TRKh) {
1975                tree_clone[i]->Branch("TrkHough","TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
1976                cout << "Tracker      : branch TrkHough"<<endl;
1977            };
1978            i++;
1979        }
1980    
1981        // Calorimeter
1982        if(CAL1||CAL2){
1983            tree_clone[i] = new TTree("Calorimeter","PAMELA calorimeter level2 data ");    
1984            if(CAL1) {
1985                tree_clone[i]->Branch("CaloLevel1", "CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
1986                cout << "Calorimeter  : branch CaloLevel1"<<endl;
1987            };
1988            if(CAL2) {
1989                tree_clone[i]->Branch("CaloLevel2","CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
1990                cout << "Calorimeter  : branch CaloLevel2"<<endl;
1991            };
1992            i++;
1993        }    
1994    
1995        // ToF    
1996        if(TOF) {
1997            tree_clone[i] = new TTree("ToF","PAMELA ToF level2 data ");    
1998            tree_clone[i]->Branch("ToFLevel2","ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
1999            cout << "ToF          : branch ToFLevel2"<<endl;
2000            i++;
2001        };
2002        // Trigger
2003        if(TRG) {
2004            tree_clone[i] = new TTree("Trigger","PAMELA trigger level2 data ");    
2005            tree_clone[i]->Branch("TrigLevel2","TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
2006            cout << "Trigger      : branch TrigLevel2"<<endl;
2007            i++;
2008        };
2009        // S4
2010        if(S4) {
2011            tree_clone[i] = new TTree("S4","PAMELA S4 level2 data ");      
2012            tree_clone[i]->Branch("S4Level2","S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
2013            cout << "S4           : branch S4Level2"<<endl;
2014            i++;
2015        };
2016        // Neutron Detector
2017        if(ND) {
2018            tree_clone[i] = new TTree("NeutronD","PAMELA neutron detector level2 data ");  
2019            tree_clone[i]->Branch("NDLevel2","NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
2020            cout << "NeutronD     : branch NDLevel2"<<endl;
2021            i++;
2022        };
2023        // Anticounters
2024        if(AC) {
2025            tree_clone[i] = new TTree("Anticounter","PAMELA anticounter detector level2 data ");    
2026            tree_clone[i]->Branch("AcLevel2","AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
2027            cout << "Anticounter  : branch AcLevel2"<<endl;
2028            i++;
2029        };
2030        // OrbitalInfo
2031        if(ORB) {
2032            tree_clone[i] = new TTree("OrbitalInfo","PAMELA oribital info  ");      
2033            tree_clone[i]->Branch("OrbitalInfo","OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
2034            cout << "OrbitalInfo  : branch OrbitalInfo"<<endl;
2035            i++;
2036        };
2037        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2038    
2039    }
2040    
2041    
2042    /**
2043     * Fill tree (created with CreateCloneTrees)
2044     *
2045     */
2046    //void PamLevel2::FillNewPamTree(TTree *T){
2047    void PamLevel2::FillCloneTrees(){
2048            
2049        for(Int_t i=0; i<8; i++){
2050            if(tree_clone[i])tree_clone[i]->Fill();
2051        }
2052    }
2053    
2054    
2055    TTree* PamLevel2::GetCloneTree(TString name){
2056    
2057        for(Int_t i=0; i<8; i++){  
2058            if(tree_clone[i]){
2059                TString na = tree_clone[i]->GetName();
2060                if(!name.CompareTo(na))return tree_clone[i];
2061            };
2062        }
2063        return NULL;
2064    
2065    }
2066    void PamLevel2::WriteCloneTrees(){
2067        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2068        cout << "Write clones of PAMELA trees "<<endl;
2069        for(Int_t i=0; i<8; i++){  
2070            if(tree_clone[i]){
2071                cout << tree_clone[i]->GetName()<<endl;
2072                tree_clone[i]->Write();
2073            };
2074        }
2075        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2076    
2077    }
2078    
2079    /**
2080     * Create a new (empty) Pamela trees
2081     */
2082    // TTree* PamLevel2::GetNewPamTree(){
2083    
2084    //     if(tree_clone)return tree_clone;
2085    
2086    //     TTree *Tout = 0;
2087        
2088    //     cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2089    //     cout << "Create new PAMELA trees "<<endl;
2090        
2091        
2092    //     if(TRK1||TRK2||TRKh){
2093    //      TTree *T = new TTree("Tracker_clone","PAMELA tracker level2 data ");    
2094    //      if(TRK1) {
2095    //          trk1_clone = new TrkLevel1();
2096    //          T->Branch("TrkLevel1","TrkLevel1", &trk1_clone);
2097    //          T->BranchRef();
2098    //          cout << "Tracker      : branch TrkLevel1"<<endl;
2099    //      };
2100    //      if(TRK2) {
2101    //          trk2_clone = new TrkLevel2();
2102    //          T->Branch("TrkLevel2", "TrkLevel2",&trk2_clone);
2103    //          cout << "Tracker      : branch TrkLevel2"<<endl;        
2104    //      };
2105    //      if(TRKh) {
2106    //          trkh_clone = new TrkHough();
2107    //          T->Branch("TrkHough","TrkHough", &trkh_clone);
2108    //          cout << "Tracker      : branch TrkHough"<<endl;
2109    //      };
2110    //      if(!Tout)Tout=T;
2111    //      else Tout->AddFriend("Tracker_clone");
2112    //     }
2113    
2114    //     // Calorimeter
2115    //     if(CAL1||CAL2){
2116    //      TTree *C = new TTree("Calorimeter_clone","PAMELA calorimeter level2 data ");    
2117    //      if(CAL1) {
2118    //          calo1_clone = new CaloLevel1();
2119    //          C->Branch("CaloLevel1", "CaloLevel1", &calo1_clone);
2120    //          cout << "Calorimeter  : branch CaloLevel1"<<endl;
2121    //      };
2122    //      if(CAL2) {
2123    //          calo2_clone = new CaloLevel2();
2124    //          C->Branch("CaloLevel2","CaloLevel2", &calo2_clone);
2125    //          cout << "Calorimeter  : branch CaloLevel2"<<endl;
2126    //      };
2127    //      if(!Tout)Tout=C;
2128    //      else Tout->AddFriend("Calorimeter_clone");
2129    //     }    
2130    
2131    //     // ToF    
2132    //     if(TOF) {
2133    //      TTree *O = new TTree("ToF_clone","PAMELA ToF level2 data ");    
2134    //      tof_clone = new ToFLevel2();
2135    //      O->Branch("ToFLevel2","ToFLevel2", &tof_clone);
2136    //      cout << "ToF          : branch ToFLevel2"<<endl;
2137    //      if(!Tout)Tout=O;
2138    //      else Tout->AddFriend("ToF_clone");
2139    //     };
2140    //     // Trigger
2141    //     if(TRG) {
2142    //      TTree *R = new TTree("Trigger_clone","PAMELA trigger level2 data ");    
2143    //      trig_clone = new TrigLevel2();
2144    //      R->Branch("TrigLevel2","TrigLevel2", &trig_clone);
2145    //      cout << "Trigger      : branch TrigLevel2"<<endl;
2146    //      if(!Tout)Tout=R;
2147    //      else Tout->AddFriend("Trigger_clone");
2148    //     };
2149    //     // S4
2150    //     if(S4) {
2151    //      TTree *S = new TTree("S4_clone","PAMELA S4 level2 data ");      
2152    //      s4_clone = new S4Level2();
2153    //      S->Branch("S4Level2","S4Level2", &s4_clone);
2154    //      cout << "S4           : branch S4Level2"<<endl;
2155    //      if(!Tout)Tout=S;
2156    //      else Tout->AddFriend("S4_clone");
2157    //     };
2158    //     // Neutron Detector
2159    //     if(ND) {
2160    //      TTree *N = new TTree("NeutronD_clone","PAMELA neutron detector level2 data ");  
2161    //      nd_clone = new NDLevel2();
2162    //      N->Branch("NDLevel2","NDLevel2", &nd_clone);
2163    //      cout << "NeutronD     : branch NDLevel2"<<endl;
2164    //      if(!Tout)Tout=N;
2165    //      else Tout->AddFriend("NeutronD_clone");
2166    //     };
2167    //     // Anticounters
2168    //     if(AC) {
2169    //      TTree *A = new TTree("Anticounter_clone","PAMELA anticounter detector level2 data ");  
2170    //      ac_clone = new AcLevel2();
2171    //      A->Branch("AcLevel2","AcLevel2", &ac_clone);
2172    //      cout << "Anticounter  : branch AcLevel2"<<endl;
2173    //      if(!Tout)Tout=A;
2174    //      else Tout->AddFriend("Anticounter_clone");
2175    //     };
2176    //     // OrbitalInfo
2177    //     if(ORB) {
2178    //      TTree *B = new TTree("OrbitalInfo_clone","PAMELA oribital info  ");    
2179    //      orb_clone = new OrbitalInfo();
2180    //      B->Branch("OrbitalInfo","OrbitalInfo", &orb_clone);
2181    //      cout << "OrbitalInfo  : branch OrbitalInfo"<<endl;
2182    //      if(!Tout)Tout=B;
2183    //      else Tout->AddFriend("OrbitalInfo_clone");
2184    //     };
2185    //     cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2186    
2187    //     tree_clone = Tout;
2188    //     tree_clone->SetDirectory(0);
2189    
2190    //     return Tout;
2191    // }
2192    // /**
2193    //  * Fill a tree (created with GetNewPamTree)
2194    //  *
2195    //  */
2196    // //void PamLevel2::FillNewPamTree(TTree *T){
2197    // void PamLevel2::FillNewPamTree(){
2198            
2199    
2200    //     if(trk1_clone)  *trk1_clone = *trk1_obj;
2201    //     if(trk2_clone){
2202    //      trk2_clone->Clear();
2203    //      trk2_obj->Copy(*trk2_clone);
2204    // //   *trk2_clone = *trk2_obj;
2205    //     }
2206    //     if(trkh_clone)  *trkh_clone = *trkh_obj;
2207    //     if(calo1_clone){
2208    // //   *calo1_clone = *calo1_obj;
2209    //      calo1_clone->Clear();
2210    //      calo1_obj->Copy(*calo1_clone);
2211    //     }
2212    //     if(calo2_clone){
2213    // //   *calo2_clone = *calo2_obj;
2214    //      calo2_clone->Clear();
2215    //      calo2_obj->Copy(*calo2_clone);
2216    //     }
2217    //     if(tof_clone)   *tof_clone  = *tof_obj;
2218    //     if(trig_clone)  *trig_clone = *trig_obj;
2219    //     if(s4_clone)    *s4_clone   = *s4_obj;
2220    //     if(nd_clone)    *nd_clone   = *nd_obj;
2221    //     if(ac_clone)    *ac_clone   = *ac_obj;
2222    //     if(orb_clone)   *orb_clone  = *orb_obj;
2223    
2224    //     TTree *T = tree_clone;
2225    
2226    //     T->Fill(); //fill main tree
2227    // //    cout<<T->IsA()->GetName()<<" "<<T->GetName()<<endl;
2228    //     TList *li = T->GetListOfFriends();
2229    //     TIter next(li);
2230    //     TFriendElement* T_friend=0;
2231    //     while( (T_friend = (TFriendElement*)next()) ){
2232    // //   cout<<T_friend->IsA()->GetName()<<" "<<T_friend->GetName()<<hex << T_friend->GetTree() << dec<<endl;
2233    //      T_friend->GetTree()->Fill();//fill friends
2234    //     }
2235    
2236    // }

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