/[PAMELA software]/PamelaLevel2/src/PamLevel2.cpp
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Diff of /PamelaLevel2/src/PamLevel2.cpp

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revision 1.5 by pam-fi, Mon Oct 9 08:57:42 2006 UTC revision 1.27 by pam-fi, Fri Mar 16 20:34:08 2007 UTC
# Line 7  Line 7 
7   * Default constructor   * Default constructor
8   */   */
9  PamTrack::PamTrack(){  PamTrack::PamTrack(){
10      trk_track  = this->TrkTrack::GetTrkTrack();      trk_track  = 0;
11      calo_track = this->CaloTrkVar::GetCaloTrkVar();      calo_track = 0;
12      tof_track  = this->ToFTrkVar::GetToFTrkVar();      tof_track  = 0;
13        candeleteobj = 0;
14  };  };
15  //--------------------------------------  //--------------------------------------
16  //  //
# Line 19  PamTrack::PamTrack(){ Line 20  PamTrack::PamTrack(){
20   * Constructor   * Constructor
21   */   */
22  PamTrack::PamTrack(TrkTrack* t, CaloTrkVar* c, ToFTrkVar* o){  PamTrack::PamTrack(TrkTrack* t, CaloTrkVar* c, ToFTrkVar* o){
23      trk_track  = this->TrkTrack::GetTrkTrack();  
24      calo_track = this->CaloTrkVar::GetCaloTrkVar();      trk_track  = 0;
25      tof_track  = this->ToFTrkVar::GetToFTrkVar();      calo_track = 0;
26      if(t) *trk_track  = *t;      tof_track  = 0;
27      if(c) *calo_track = *c;  //     if(t)trk_track  = new TrkTrack(*t);
28      if(o) *tof_track  = *o;      //     if(c)calo_track = new CaloTrkVar(*c);
29    //     if(o)tof_track  = new ToFTrkVar(*o);
30        if(t)trk_track  = t;
31        if(c)calo_track = c;
32        if(o)tof_track  = o;
33        candeleteobj = 0;
34    
35  };  };
36    PamTrack::PamTrack(const PamTrack& track){
37    
38        TrkTrack   *t = track.trk_track;
39        CaloTrkVar *c = track.calo_track;
40        ToFTrkVar  *o = track.tof_track;
41    
42        trk_track  = 0;
43        calo_track = 0;
44        tof_track  = 0;
45        if(t)trk_track  = new TrkTrack(*t);
46        if(c)calo_track = new CaloTrkVar(*c);
47        if(o)tof_track  = new ToFTrkVar(*o);
48        candeleteobj = 1;
49        
50    }
51    void PamTrack::Clear(){
52    
53    //    cout << "PamTrack::Clear() "<<candeleteobj<<endl;
54        if(candeleteobj){
55            if(trk_track)  trk_track->TrkTrack::Clear();
56            if(calo_track) calo_track->CaloTrkVar::Clear();//???
57            if(tof_track)  tof_track->ToFTrkVar::Clear();//???
58        }else{
59            trk_track  = 0;
60            calo_track = 0;
61            tof_track  = 0;
62        }
63    }
64    void PamTrack::Delete(){
65    //    cout << "PamTrack::Delete() "<<candeleteobj<<endl;
66        if(candeleteobj){
67            if(trk_track)  {
68                trk_track->TrkTrack::Clear();
69                delete trk_track;
70            }
71            if(calo_track){
72                calo_track->CaloTrkVar::Clear();//???
73                delete calo_track;
74            }
75            if(tof_track){
76                tof_track->ToFTrkVar::Clear();//???
77                delete tof_track;
78            }
79        }else{
80            Clear();
81        }
82    }
83  //--------------------------------------  //--------------------------------------
84  //  //
85  //  //
# Line 36  PamTrack::PamTrack(TrkTrack* t, CaloTrkV Line 89  PamTrack::PamTrack(TrkTrack* t, CaloTrkV
89   */   */
90  PamLevel2::PamLevel2(){  PamLevel2::PamLevel2(){
91                    
92      trk_l1_obj  = this->TrkLevel1::GetTrkLevel1();        //     trk2_obj  = TrkLevel2::GetTrkLevel2();
93          trk_obj     = this->TrkLevel2::GetTrkLevel2();  //     trk1_obj  = TrkLevel1::GetTrkLevel1();
94          calo_obj    = this->CaloLevel2::GetCaloLevel2();  //     trkh_obj  = TrkHough::GetTrkHough();
95      tof_obj     = this->ToFLevel2::GetToFLevel2();  //     calo1_obj = CaloLevel1::GetCaloLevel1();
96      trig_obj    = this->TrigLevel2::GetTrigLevel2();  //     calo2_obj = CaloLevel2::GetCaloLevel2();
97      s4_obj      = this->S4Level2::GetS4Level2();  //     tof_obj   = ToFLevel2::GetToFLevel2();
98      nd_obj      = this->NDLevel2::GetNDLevel2();  //     trig_obj  = TrigLevel2::GetTrigLevel2();
99      ac_obj      = this->AcLevel2::GetAcLevel2();  //     s4_obj    = S4Level2::GetS4Level2();
100          orb_obj     = this->OrbitalInfo::GetOrbitalInfo();  //     nd_obj    = NDLevel2::GetNDLevel2();
101    //     ac_obj    = AcLevel2::GetAcLevel2();
102    //     orb_obj   = OrbitalInfo::GetOrbitalInfo();
103        
104        h0_obj    = 0;
105        trk0_obj  = 0;
106    
107          run_obj     = new GL_RUN();      trk2_obj  = 0;
108                trk1_obj  = 0;
109          sorted_tracks = new TRefArray();      trkh_obj  = 0;
110        calo1_obj = 0;
111        calo2_obj = 0;
112        tof_obj   = 0;
113        trig_obj  = 0;
114        s4_obj    = 0;
115        nd_obj    = 0;
116        ac_obj    = 0;
117        orb_obj   = 0;
118    
119        run_obj   = 0;//new GL_RUN();
120        soft_obj   = 0;// Emiliano
121        irun = -1;
122        runfirstentry = 0ULL;
123        runlastentry = 0ULL;
124    
125        l0_file = NULL;
126        l0_tree = NULL;
127        iroot   = -1;
128        dbc     = 0;
129        
130        irun = -1;
131        run_tree = NULL;
132        run_tree_clone = NULL;
133        sel_tree = NULL;
134        sel_tree_clone = NULL;
135        
136        irunentry = -1;
137        pam_tree = NULL;
138        for(Int_t i=0; i<NCLONES; i++ )pam_tree_clone[i]=NULL;
139    
140        host = "mysql://localhost/pamelaprod";
141        user = "anonymous";
142        psw = "";
143        const char *pamdbhost=gSystem->Getenv("PAM_DBHOST");
144        const char *pamdbuser=gSystem->Getenv("PAM_DBUSER");
145        const char *pamdbpsw=gSystem->Getenv("PAM_DBPSW");
146        if ( !pamdbhost ) pamdbhost = "";
147        if ( !pamdbuser ) pamdbuser = "";
148        if ( !pamdbpsw ) pamdbpsw = "";
149        if ( strcmp(pamdbhost,"") ) host = pamdbhost;
150        if ( strcmp(pamdbuser,"") ) user = pamdbuser;
151        if ( strcmp(pamdbpsw,"") ) psw = pamdbpsw;
152    
153          CAL = true;      
154          TRK = true;  
155          TRG = true;  //    sorted_tracks = 0;//new TRefArray();
156          TOF = true;      
157          S4  = true;      CAL0 = false;
158          ND  = true;      CAL1 = true;
159          AC  = true;      CAL2 = true;
160          ORB = true;      TRK2 = true;
161        TRK1 = false;
162        TRKh = false;
163        TRKh = false;
164        TRG  = true;
165        TOF  = true;
166        TOF0 = false;
167        S4   = true;
168        ND   = true;
169        AC   = true;
170        ORB  = true;
171        
172        RUN  = true;
173    
174          TRK_L1 = false;      SELLI = -1;
175    
176        tsorted=0;
177        timage=0;
178    
         Tout  = NULL;  
179  };  };
180  /**  /**
181   * Destructor   * Delete the event (act as Dtor)
182   */   */
183  PamLevel2::~PamLevel2(){  void PamLevel2::Delete(){
                   
         TrkLevel1::Clear();  
           
         TrkLevel2::Clear();  
         CaloLevel2::Clear();  
         ToFLevel2::Clear();  
         TrigLevel2::Clear();  
         S4Level2::Clear();  
         NDLevel2::Clear();  
         AcLevel2::Clear();  
         OrbitalInfo::Clear();  
           
         delete run_obj;  
           
 //      delete sorted_tracks;  
         sorted_tracks->Delete(); // clean the reference array  
           
         if(Tout)Tout->Delete(); // delete loaded tree from memory  
184                    
185        if(run_obj)delete run_obj;
186        if(soft_obj)delete soft_obj; //Emiliano
187    
188    //    cout << "void PamLevel2::Clear()"<<endl;
189        if(h0_obj)   delete h0_obj;
190        if(trk0_obj) delete trk0_obj;      
191        if(trk1_obj) delete trk1_obj;      
192        if(trk2_obj) delete trk2_obj;
193        if(trkh_obj) delete trkh_obj;
194        if(calo1_obj)delete calo1_obj;
195        if(calo2_obj)delete calo2_obj;
196        if(tof_obj)  delete tof_obj;
197        if(trig_obj) delete trig_obj;
198        if(s4_obj)   delete s4_obj;
199        if(nd_obj)   delete nd_obj;
200        if(ac_obj)   delete ac_obj;
201        if(orb_obj)  delete orb_obj;
202        
203        if(tsorted){
204            tsorted->Delete();
205            delete tsorted;
206        }
207        if(timage){
208            timage->Delete();
209            delete timage;
210        }
211    
212        if(dbc){
213            dbc->Close();
214            delete dbc;
215        }
216        
217        if(l0_file)l0_file->Close();
218        if(pam_tree)pam_tree->Delete();;
219        if(run_tree)run_tree->Delete();;
220        if(sel_tree)sel_tree->Delete();;
221        for(Int_t i=0; i<NCLONES; i++ )if(pam_tree_clone[i])pam_tree_clone[i]->Delete();;
222        if(run_tree_clone)run_tree_clone->Delete();;
223        if(sel_tree_clone)sel_tree_clone->Delete();;
224        
225    
226  };  };
227    
228  /**  /**
229   * Clear the event   * Clear the event (NB! does not deallocate objects)
230   */   */
231  void PamLevel2::Clear(){  void PamLevel2::Clear(){
232                    
233          TrkLevel1::Clear();  //    cout << "void PamLevel2::Clear()"<<endl;
234            
235          TrkLevel2::Clear();  //
236          CaloLevel2::Clear();  // This method is called once for every entry but RunInfo and SoftInfo do not change until the next run so we cannot clear them here unless we don't
237          ToFLevel2::Clear();  // want to load them for each event even if they are the same...
238          TrigLevel2::Clear();  //
239          S4Level2::Clear();  //    if(run_obj)delete run_obj;
240          NDLevel2::Clear();  //    if(run_obj) run_obj->Clear();  // Emiliano: Do not deallocate run_obj here, it will give segmentation fault! call clear instead
241          AcLevel2::Clear();  //    if(soft_obj) soft_obj->Clear();
242          OrbitalInfo::Clear();  
243                if(h0_obj)   h0_obj->Clear();      
244          sorted_tracks->Delete(); // clean the reference array      if(trk0_obj) trk0_obj->Clear();    
245                if(trk1_obj) trk1_obj->Clear();    
246        if(trk2_obj) trk2_obj->Clear();
247        if(trkh_obj) trkh_obj->Clear();
248        if(calo1_obj)calo1_obj->Clear();
249        if(calo2_obj)calo2_obj->Clear();
250        if(tof_obj)  tof_obj->Clear();
251        if(trig_obj) trig_obj->Clear();
252        if(s4_obj)   s4_obj->Clear();
253        if(nd_obj)   nd_obj->Clear();
254        if(ac_obj)   ac_obj->Clear();
255        if(orb_obj)  orb_obj->Clear();
256        
257    //    if(sorted_tracks)sorted_tracks->Clear();
258    //    sorted_tracks.Clear();
259    
260        if(tsorted){
261            tsorted->Delete();
262        }
263        if(timage){
264            timage->Delete();
265        }
266        
267  };  };
268    
269    
# Line 112  void PamLevel2::Clear(){ Line 271  void PamLevel2::Clear(){
271  //  //
272  //  //
273  //--------------------------------------  //--------------------------------------
274    void *PamLevel2::GetPointerTo(const char* c ){
275    
276        TString objname = c;
277    
278        if(!objname.CompareTo("TrkLevel1"))  {
279            if(!trk1_obj){
280                trk1_obj  = new TrkLevel1();
281                trk1_obj->Set();
282            }
283            return &trk1_obj;
284        };
285        if(!objname.CompareTo("TrkLevel2"))  {
286            if(!trk2_obj){  
287                trk2_obj  = new TrkLevel2();
288                trk2_obj->Set();
289            }
290            return &trk2_obj;
291        };
292        if(!objname.CompareTo("TrkHough"))   {
293            if(!trkh_obj)  trkh_obj  = new TrkHough();
294            return &trkh_obj;
295        };
296        if(!objname.CompareTo("CaloLevel1")) {
297            if(!calo1_obj) calo1_obj = new CaloLevel1();
298            return &calo1_obj;
299        };
300        if(!objname.CompareTo("CaloLevel2")) {
301            if(!calo2_obj){
302                calo2_obj = new CaloLevel2();
303                calo2_obj->Set();
304            };
305            return &calo2_obj;
306        };
307        if(!objname.CompareTo("ToFLevel2"))  {
308            if(!tof_obj){
309                tof_obj   = new ToFLevel2();
310                tof_obj->Set();
311            }
312            return &tof_obj;
313        };
314        if(!objname.CompareTo("TrigLevel2")) {
315            if(!trig_obj)  trig_obj  = new TrigLevel2();
316            return &trig_obj;
317        };
318        if(!objname.CompareTo("S4Level2"))   {
319            if(!s4_obj)    s4_obj    = new S4Level2();
320            return &s4_obj;
321        };
322        if(!objname.CompareTo("NDLevel2"))   {
323            if(!nd_obj)    nd_obj    = new NDLevel2();
324            return &nd_obj;
325        };
326        if(!objname.CompareTo("AcLevel2"))   {
327            if(!ac_obj)    ac_obj    = new AcLevel2();
328            return &ac_obj;
329        };
330        if(!objname.CompareTo("OrbitalInfo")){
331            if(!orb_obj)   orb_obj   = new OrbitalInfo();
332            return &orb_obj;
333        };
334        
335        if(!objname.CompareTo("RunInfo"))return &run_obj;
336    
337        if(!objname.CompareTo("SoftInfo"))return &soft_obj; // Emiliano
338    
339        return NULL;
340    };
341    //--------------------------------------
342    //
343    //
344    //--------------------------------------
345  /**  /**
346   * Retrieves the calorimeter track matching the seqno-th tracker stored track.   * Retrieves the calorimeter track matching the seqno-th tracker stored track.
347   * (If seqno = -1 retrieves the self-trigger calorimeter track)   * (If seqno = -1 retrieves the self-trigger calorimeter track)
348   */   */
349   CaloTrkVar *PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int seqno){   CaloTrkVar *PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int seqno){
350                
351           if( CaloLevel2::ntrk()==0 ){       if( !calo2_obj )return 0;
                  cout << "PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" but no Calorimeter tracks are stored"<<endl;  
                  return NULL;  
          };  
           
          CaloTrkVar *c = 0;  
          Int_t it_calo=0;  
           
          do{  
                  c = CaloLevel2::GetCaloTrkVar(it_calo);  
                  it_calo++;  
          } while( seqno != c->trkseqno && it_calo < CaloLevel2::ntrk());          
           
          if(seqno != c->trkseqno){  
                  c = 0;  
                  if(seqno!=-1)cout << "PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" does not match Calorimeter stored tracks"<<endl;  
          };  
          return c;  
352    
353         if( calo2_obj->CaloLevel2::ntrk()==0 ){
354             cout << "PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" but no Calorimeter tracks are stored"<<endl;
355             return NULL;
356         };
357        
358         CaloTrkVar *c = 0;
359         Int_t it_calo=0;
360        
361         do{
362             c = calo2_obj->CaloLevel2::GetCaloTrkVar(it_calo);
363             it_calo++;
364         } while( c && seqno != c->trkseqno && it_calo < calo2_obj->CaloLevel2::ntrk());    
365        
366         if(!c || seqno != c->trkseqno){
367             c = 0;
368             if(seqno!=-1)cout << "PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" does not match Calorimeter stored tracks"<<endl;
369         };
370         return c;
371        
372   };   };
373  //--------------------------------------  //--------------------------------------
374   //   //
# Line 148  void PamLevel2::Clear(){ Line 380  void PamLevel2::Clear(){
380   */   */
381   ToFTrkVar *PamLevel2::GetToFStoredTrack(int seqno){   ToFTrkVar *PamLevel2::GetToFStoredTrack(int seqno){
382                    
383           if( ToFLevel2::ntrk()==0 ){       if( !tof_obj )return 0;
                  cout << "PamLevel2::GetToFStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" but no ToF tracks are stored"<<endl;  
                  return NULL;  
          };  
           
          ToFTrkVar *c = 0;  
          Int_t it_tof=0;  
           
          do{  
                  c = ToFLevel2::GetToFTrkVar(it_tof);  
                  it_tof++;  
          } while( seqno != c->trkseqno && it_tof < ToFLevel2::ntrk());    
           
          if(seqno != c->trkseqno){  
                  c = 0;  
                  if(seqno!=-1)cout << "PamLevel2::GetToFStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" does not match ToF stored tracks"<<endl;  
          };  
          return c;  
384    
385         if( tof_obj->ToFLevel2::ntrk()==0 ){
386             cout << "PamLevel2::GetToFStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" but no ToF tracks are stored"<<endl;
387             return NULL;
388         };
389        
390         ToFTrkVar *c = 0;
391         Int_t it_tof=0;
392        
393         do{
394             c = tof_obj->ToFLevel2::GetToFTrkVar(it_tof);
395             it_tof++;
396         } while( c && seqno != c->trkseqno && it_tof < tof_obj->ToFLevel2::ntrk());        
397        
398         if(!c || seqno != c->trkseqno){
399             c = 0;
400             if(seqno!=-1)cout << "PamLevel2::GetToFStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" does not match ToF stored tracks"<<endl;
401         };
402         return c;
403        
404   };   };
405    
406  //--------------------------------------  //--------------------------------------
# Line 177  void PamLevel2::Clear(){ Line 411  void PamLevel2::Clear(){
411   * Give the pamela track associated to a tracker track, retrieving related calorimeter and tof track information.   * Give the pamela track associated to a tracker track, retrieving related calorimeter and tof track information.
412   */   */
413   PamTrack* PamLevel2::GetPamTrackAlong(TrkTrack* t){   PamTrack* PamLevel2::GetPamTrackAlong(TrkTrack* t){
414                
415           CaloTrkVar *c = 0;       cout <<"PamLevel2::GetPamTrackAlong(TrkTrack* t) **obsolete** "<<endl;
416           ToFTrkVar  *o = 0;       cout <<"(if you use it, remember to delete the PamTrack object)"<<endl;
417            
418           if(CAL) c = GetCaloStoredTrack(t->GetSeqNo());       CaloTrkVar *c = 0;
419           if(TOF) o = GetToFStoredTrack(t->GetSeqNo());       ToFTrkVar  *o = 0;
420                
421         if(CAL2) c = GetCaloStoredTrack(t->GetSeqNo());
422         if(TOF) o = GetToFStoredTrack(t->GetSeqNo());
423        
424  //    if(t && c && o)track = new PamTrack(t,c,o);  //    if(t && c && o)track = new PamTrack(t,c,o);
425           PamTrack *track = new PamTrack(t,c,o);       PamTrack *track = new PamTrack(t,c,o);
426                
427           return track;       return track;
428    
429   };   };
430  //--------------------------------------  //--------------------------------------
# Line 202  void PamLevel2::Clear(){ Line 439  void PamLevel2::Clear(){
439    
440  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_t itrk){  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_t itrk){
441            
442          PamTrack *track = 0;      cout <<"PamLevel2::GetStoredTrack(Int_t itrk) **to-be-updated** "<<endl;
443        cout <<"for the moment, better use separately the methods: TrkLevel2::GetStoredTrack(seqno) CaloLevel2::GetCaloTrkVar(Int_t notrack) ToFLevel2::GetToFTrkVar(Int_t notrack)"<<endl;
444          if( itrk >=0 && itrk < TrkLevel2::ntrk() ){      cout <<"(if you use it, remember to delete the PamTrack object)"<<endl;
445                        PamTrack *track = 0;
446                  TrkTrack *t = TrkLevel2::GetStoredTrack(itrk);      
447                  track = GetPamTrackAlong(t);      if( itrk >=0 && itrk < trk2_obj->TrkLevel2::ntrk() ){
448            
449            TrkTrack *t = trk2_obj->TrkLevel2::GetStoredTrack(itrk);
450            track = GetPamTrackAlong(t);
451                    
         }else{  
                 cout << "PamLevel2::GetStoredTrack(int) : tracker track SeqNo "<< itrk <<" does not exist (GetNTracks() = "<<TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;  
         };  
   
         return track;  
452                    
453    
454        }else{
455            cout << "PamLevel2::GetStoredTrack(int) : tracker track SeqNo "<< itrk <<" does not exist (GetNTracks() = "<<trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
456        };
457        
458        return track;
459        
460  }  }
461  //--------------------------------------  //--------------------------------------
462  //  //
# Line 224  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_ Line 466  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_
466   * Sort physical (tracker) tracks and stores them in the TRefArray (of TrkTrack objects) which pointer is  PamLevel2::sorted_tracks.   * Sort physical (tracker) tracks and stores them in the TRefArray (of TrkTrack objects) which pointer is  PamLevel2::sorted_tracks.
467   * @param how String to set the sorting cryterium (es: "CAL" or "TRK+CAL+TOF" ecc...).   * @param how String to set the sorting cryterium (es: "CAL" or "TRK+CAL+TOF" ecc...).
468   * Sorting cryteria:   * Sorting cryteria:
469   * TRK: lower chi**2   * TRK: lower chi**2
470   * CAL: lower Y spatial residual on the first calorimeter plane   * CAL: lower Y spatial residual on the first calorimeter plane
471   * TOF: bigger numebr of hit PMTs along the track, on S12 S21 S32 (where paddles are along the Y axis).   * TOF: bigger numebr of hit PMTs along the track, on S12 S21 S32 (where paddles are along the Y axis).
472   * The default sorting cryterium is "TOF+CAL".   * The default sorting cryterium is "TOF+CAL".
# Line 233  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_ Line 475  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_
475   */   */
476  void PamLevel2::SortTracks(TString how){  void PamLevel2::SortTracks(TString how){
477    
478    //    cout <<" PamLevel2::SortTracks(TString how) "<<endl;
479        if( !trk2_obj ){
480            cout << "void PamLevel2::SortTracks(TString how):  TrkLevel2 not loaded !!!";
481            return;
482        };
483    //    cout << "call SortTracs() "<<endl;
484    //Save current Object count    //Save current Object count
485          Int_t ObjectNumber = TProcessID::GetObjectCount();      Int_t ObjectNumber = TProcessID::GetObjectCount();
486            
487          sorted_tracks->Delete(); //temporaneo???  //    cout << "ObjectNumber  "<<ObjectNumber <<endl;
488            
489    //     if(!sorted_tracks)sorted_tracks = new TRefArray();
490    //     sorted_tracks->Clear();
491    //    sorted_tracks.Clear();
492    
493        if(!tsorted)tsorted = new TClonesArray("PamTrack",trk2_obj->GetNTracks());
494        tsorted->Delete();
495        TClonesArray &ttsorted = *tsorted;
496        if(!timage)timage = new TClonesArray("PamTrack",trk2_obj->GetNTracks());
497        timage->Delete();
498        TClonesArray &ttimage = *timage;
499    
500    
501      // loop over the tracks sorted by the tracker      // loop over the tracks sorted by the tracker
502          Bool_t use_TRK = how.Contains("TRK", TString::kIgnoreCase);      Bool_t use_TRK = how.Contains("TRK", TString::kIgnoreCase);
503          Bool_t use_CAL = how.Contains("CAL", TString::kIgnoreCase);      Bool_t use_CAL = how.Contains("CAL", TString::kIgnoreCase);
504          Bool_t use_TOF = how.Contains("TOF", TString::kIgnoreCase);      Bool_t use_TOF = how.Contains("TOF", TString::kIgnoreCase);
505                
506          if( !CAL &&  use_CAL) use_CAL = false;      if( !CAL2 &&  use_CAL) use_CAL = false;
507          if( !TOF &&  use_TOF) use_TOF = false;      if( !TOF &&  use_TOF) use_TOF = false;
508        
509        if( !TRK2 ){
510    //      cout << "SortTracks() : without tracker does not work!!! (not yet)" << endl;
511            return;
512        };
513    
514        //   cout << "use_CAL "<<use_CAL<<" use_TOF "<<use_TOF<<" use_TRK "<<use_TRK <<endl;
515        
516        for(Int_t i=0; i < trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks(); i++){
517                    
518          if( !TRK ){          TrkTrack   *ts = 0;
519                  cout << "SortTracks() : without tracker does not work!!! (not yet)" << endl;          CaloTrkVar *cs = 0;
520                  return;          ToFTrkVar  *os = 0;
         };  
521                    
         for(Int_t i=0; i < TrkLevel2::GetNTracks(); i++){  
   
                 TrkTrack *ts = 0;  
   
522          // get tracker tracks          // get tracker tracks
523                  TrkTrack   *tp = TrkLevel2::GetTrack(i);                    //tracker          TrkTrack   *tp = trk2_obj->TrkLevel2::GetTrack(i);                    //tracker
524  //              CaloTrkVar *cp = GetCaloStoredTrack(tp->GetSeqNo());          CaloTrkVar *cp = GetCaloStoredTrack(tp->GetSeqNo());
525  //              ToFTrkVar  *op = GetToFStoredTrack(tp->GetSeqNo());          ToFTrkVar  *op = GetToFStoredTrack(tp->GetSeqNo());
526                  CaloTrkVar *cp = 0;  
527                  ToFTrkVar  *op = 0;          TrkTrack   *ti = 0;              //tracker (image)
528            CaloTrkVar *ci = 0;
529            ToFTrkVar  *oi = 0;
530    //      cout << "trk track n. "<<i << " "<<hex<< tp <<dec<< endl;
531          // if track has an image, check image selection          // if track has an image, check image selection
532                  if(tp->HasImage()){          if(tp->HasImage()){
533                                        
534                          TrkTrack   *ti = TrkLevel2::GetTrackImage(i);              //tracker (image)              ti = trk2_obj->TrkLevel2::GetTrackImage(i);              //tracker (image)
535  //                      CaloTrkVar *ci = GetCaloStoredTrack(ti->GetSeqNo());              ci = GetCaloStoredTrack(ti->GetSeqNo());
536  //                      ToFTrkVar  *oi = GetToFStoredTrack(ti->GetSeqNo());              oi = GetToFStoredTrack(ti->GetSeqNo());
537                          CaloTrkVar *ci = 0;              
538                          ToFTrkVar  *oi = 0;  //          cout << "its image "<<i << " "<<hex<< ti <<dec<< endl;
539    
540              //assign starting scores              //assign starting scores
541                          Int_t tp_score = 0;  //main track sorted by the tracker              Int_t tp_score = 0;  //main track sorted by the tracker
542                          Int_t ti_score = 0;  //image track              Int_t ti_score = 0;  //image track
543                                                                
544              // ------------------------              // ------------------------
545              // calorimeter check              // calorimeter check
546              // ------------------------              // ------------------------
547                  // check the Y spatial residual on the first calorimeter plane              // check the Y spatial residual on the first calorimeter plane
548                  // (cut on calorimeter variables from Emiliano)              // (cut on calorimeter variables from Emiliano)
549                          if(              if( use_CAL && !calo2_obj ){
550                                  use_CAL            &&                  cout << "void PamLevel2::SortTracks(TString how): how= "<<how<<" but CaloLevel2 not loaded !!!";
551                                  npcfit[1] > 15     &&   //no. of fit planes on Y view                  return;
552                                  varcfit[1] < 1000. &&  //fit variance on Y view              };
553                                  true){              if(
554                    use_CAL            &&
555                                  cp = GetCaloStoredTrack(tp->GetSeqNo());                  calo2_obj->npcfit[1] > 15     &&   //no. of fit planes on Y view
556                                  ci = GetCaloStoredTrack(ti->GetSeqNo());                  calo2_obj->varcfit[1] < 1000. &&  //fit variance on Y view
557                                                    cp && ci &&
558                                  Float_t resy_p = cp->tbar[0][1] - cbar[0][1]; if(resy_p < 0)resy_p= - resy_p;                  true){
559                                  Float_t resy_i = ci->tbar[0][1] - cbar[0][1]; if(resy_i < 0)resy_i= - resy_i;  
560                    
561                                  if(resy_p <= resy_i) tp_score++;                  Float_t resy_p = cp->tbar[0][1] - calo2_obj->cbar[0][1]; if(resy_p < 0)resy_p= - resy_p;
562                                  else                 ti_score++;                  Float_t resy_i = ci->tbar[0][1] - calo2_obj->cbar[0][1]; if(resy_i < 0)resy_i= - resy_i;
563                          };                  
564                    if(resy_p <= resy_i) tp_score++;
565                    else                 ti_score++;
566    
567    //              cout << "CALO "<<tp_score<<ti_score<<endl;
568    
569                };
570              // ------------------------              // ------------------------
571              // TOF check              // TOF check
572              // ------------------------                  // ------------------------    
573                  // check the number of hit pmts along the track              // check the number of hit pmts along the track
574                  // on S12 S21 and S32, where paddles are parallel to Y axis              // on S12 S21 and S32, where paddles are parallel to Y axis
575                          if( use_TOF ){              if( use_TOF && !tof_obj ){
576                                            cout << "void PamLevel2::SortTracks(TString how): how= "<<how<<" but ToFLevel2 not loaded !!!";
577                                  Int_t nphit_p =0;                  return;
578                                  Int_t nphit_i =0;              };
579                                                        if( use_TOF && op && oi ){
580                                  op = GetToFStoredTrack(tp->GetSeqNo());                  
581                                  oi = GetToFStoredTrack(ti->GetSeqNo());                  Int_t nphit_p =0;
582                                                    Int_t nphit_i =0;
583                    
584                    
585  /*                              cout << "track: npmtadc "<< op->npmtadc << endl;  /*                              cout << "track: npmtadc "<< op->npmtadc << endl;
586                                  cout << "track: npmttdc "<< op->npmttdc << endl;                                  cout << "track: npmttdc "<< op->npmttdc << endl;
587                                  cout << "image: npmtadc "<< oi->npmtadc << endl;                                  cout << "image: npmtadc "<< oi->npmtadc << endl;
588                                  cout << "image: npmttdc "<< oi->npmttdc << endl;*/                                  cout << "image: npmttdc "<< oi->npmttdc << endl;*/
589                                                    
590                                  for (Int_t ih=0; ih < op->npmtadc; ih++){                  for (Int_t ih=0; ih < op->npmtadc; ih++){
591                                          Int_t pl = GetPlaneIndex( (op->pmtadc).At(ih) );                      Int_t pl = tof_obj->GetPlaneIndex( (op->pmtadc).At(ih) );
592                                          if(pl == 1 || pl == 2 || pl == 5)nphit_p++;                      if(pl == 1 || pl == 2 || pl == 5)nphit_p++;
593                                  };                  };
594                                                                            
595                                  for (Int_t ih=0; ih < oi->npmtadc; ih++){                  for (Int_t ih=0; ih < oi->npmtadc; ih++){
596                                          Int_t pl = GetPlaneIndex( (oi->pmtadc).At(ih) );                      Int_t pl = tof_obj->GetPlaneIndex( (oi->pmtadc).At(ih) );
597                                          if(pl == 1 || pl == 2 || pl == 5)nphit_i++;                          if(pl == 1 || pl == 2 || pl == 5)nphit_i++;
598                                  };                  };
599                                                    
600                                  if(                  if(
601                                          use_TOF            &&                      use_TOF            &&
602                                          (nphit_p+nphit_i) !=0 &&                              (nphit_p+nphit_i) !=0 &&    
603                                          true){                      true){
604                                                                
605                                          if( nphit_p >= nphit_i) tp_score++;                      if( nphit_p >= nphit_i) tp_score++;
606                                          else                                              ti_score++;                      else ti_score++;
607                                  };                  };
608                          };  //              cout << "TOF "<<tp_score<<ti_score<<endl;
609                          if(tp_score == ti_score) use_TRK = true;              };
610                  // ------------------------              if(tp_score == ti_score) use_TRK = true;
611                // ------------------------
612              // tracker check              // tracker check
613              // ------------------------              // ------------------------
614                  // chi**2 difference is not always large enough to distinguish among              // chi**2 difference is not always large enough to distinguish among
615                  // the real track and its image.              // the real track and its image.
616                  // Tracker check will be applied always when calorimeter and tof information is ambiguous.              // Tracker check will be applied always when calorimeter and tof information is ambiguous.
617                          if(use_TRK){              if(use_TRK){
618                                  if(      tp->chi2 > 0 && tp->chi2 < ti->chi2 ) tp_score++ ;                  if(      tp->chi2 > 0 && tp->chi2 < ti->chi2 ) tp_score++ ;
619                                  else if( ti->chi2 > 0 && ti->chi2 < tp->chi2 ) ti_score++ ;                  else if( ti->chi2 > 0 && ti->chi2 < tp->chi2 ) ti_score++ ;
620                          };  //              cout << "TRK "<<tp_score<<ti_score<<endl;
621                };
622                
623              // ------------------------              // ------------------------
624              // the winner is....              // the winner is....
625              // ------------------------                  // ------------------------    
626                          if      (tp_score > ti_score) ts = tp;//the track sorted by the tracker!!              if      (tp_score > ti_score) {
627                          else if (tp_score < ti_score) ts = ti;//its image!!  //              ts = tp;//the track sorted by the tracker!!
628                          else {  //              cs = cp;
629                                  ts = tp;  //              os = op;
630  //                              cout << "Warning - track image ambiguity not solved" << endl;              }else if (tp_score < ti_score) {
631  //                              cout << ts->GetNtot() << " "<< ts->chi2 << " " << npcfit[1] << " "<< nphit_p << endl;                  ts = ti;//its image!!
632                          };                  cs = ci;
633                    os = oi;
634    
635                    ti = tp;//its image!!
636                    ci = cp;
637                    oi = op;
638    
639                    tp = ts;//its image!!
640                    cp = cs;
641                    op = os;
642    
                 }else{  
                         ts = tp;  
                 };  
                   
 //              cout <<" SortTracks() "<<i<<" -- "<<ts<<endl;  
                 sorted_tracks->Add(ts);//save the track in the sorted array  
 //              cout << "SortTracks:: sorted_tracks->Add(it) "<<i<<" "<<ts<<endl;  
643                                    
644                }else {
645    //              ts = tp;
646    //              cs = cp;
647    //              os = op;
648    //                              cout << "Warning - track image ambiguity not solved" << endl;
649    //                              cout << ts->GetNtot() << " "<< ts->chi2 << " " << npcfit[1] << " "<< nphit_p << endl;
650                };
651                
652            }else{
653    //          ts = tp;
654    //          cs = cp;
655    //          os = op;
656          };          };
657    //Restore Object count          
658    //To save space in the table keeping track of all referenced objects  //      cout <<" SortTracks() "<<i<<" -- "<<ts<<endl;
659    //we assume that our events do not address each other. We reset the  //      sorted_tracks->Add(ts);//save the track in the sorted array
660    //object count to what it was at the beginning of the event.  //      sorted_tracks.Add(ts);//save the track in the sorted array
661          TProcessID::SetObjectCount(ObjectNumber);  //      sorted_tracks.Add(tp);//save the track in the sorted array
662    //      cout << "SortTracks:: sorted_tracks->Add(it) "<<i<<" "<<ts<<endl;
663    //      cout<<"o "<<tp<<endl;
664    //      cout<<"o "<<cp<<endl;
665    //      cout<<"o "<<op<<endl;
666            new(ttsorted[i]) PamTrack(tp,cp,op);
667            new(ttimage[i])  PamTrack(ti,ci,oi);
668        };
669    
670        if( tsorted->GetEntries() != trk2_obj->GetNTracks() ){
671            cout << "void PamLevel2::SortTracks(TString how): tsorted->GetEntries() "<<tsorted->GetEntries()<<" != trk2_obj->GetNTracks() = "<<trk2_obj->GetNTracks() <<endl;
672            tsorted->Delete(); tsorted=0;
673            timage->Delete(); timage=0;    
674        }
675    
676        //Restore Object count
677        //To save space in the table keeping track of all referenced objects
678        //We reset the object count to what it was at the beginning of the event.
679        TProcessID::SetObjectCount(ObjectNumber);
680        
681  };  };
682  //--------------------------------------  //--------------------------------------
683  //  //
# Line 379  void PamLevel2::SortTracks(TString how){ Line 687  void PamLevel2::SortTracks(TString how){
687   * This method overrides TrkLevel2::GetTracks(), where sorting is done by decreasing number of fit points and increasing chi^2.   * This method overrides TrkLevel2::GetTracks(), where sorting is done by decreasing number of fit points and increasing chi^2.
688   * PamLevel2::GetTracks() keeps the same track order given by TrkLevel2::GetTracks(), but checks image selection by using calorimeter and ToF tracking information.   * PamLevel2::GetTracks() keeps the same track order given by TrkLevel2::GetTracks(), but checks image selection by using calorimeter and ToF tracking information.
689   */   */
690   TRefArray *PamLevel2::GetTracks(){  // TRefArray *PamLevel2::GetTracks(){
691           //  
692  //      SortTracks("+CAL+TOF");  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
693           SortTracks("+CAL+TRK");//TEMP!!!!!!!!!!!!!  //     SortTracks("+CAL+TOF");
694          //  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
695          return sorted_tracks;  
696    // //   return  sorted_tracks;
697    //     return &sorted_tracks;
698        
699    //  };
700    TClonesArray *PamLevel2::GetTracks(){
701    
702    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
703        SortTracks("+CAL+TOF");
704    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
705    
706        return tsorted;
707        
708   };   };
709  //--------------------------------------  //--------------------------------------
710   //   //
# Line 396  void PamLevel2::SortTracks(TString how){ Line 716  void PamLevel2::SortTracks(TString how){
716   * @param it Track number, ranging from 0 to GetNTracks().   * @param it Track number, ranging from 0 to GetNTracks().
717   */   */
718  PamTrack *PamLevel2::GetTrack(int it){  PamTrack *PamLevel2::GetTrack(int it){
719    
720    //    if(!trk2_obj) return 0;
721                    
722  //  *-*-*-*-*-*-*  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
723  //      SortTracks("+CAL+TOF");  //     SortTracks("+CAL+TOF");
724          SortTracks("+CAL+TRK");//TEMP!!!!!!!!!!!!!  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
725  //  *-*-*-*-*-*-*  // //    if(!sorted_tracks)return 0;
726    //     if(sorted_tracks.IsEmpty())return 0;
727          PamTrack *track = 0;  
728            //     PamTrack *track = 0;
729          if( it >=0 && it < TrkLevel2::GetNTracks() ){      
730                  TrkTrack   *t = (TrkTrack*)sorted_tracks->At(it);  //     if( it >=0 && it < trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks() && it<sorted_tracks.GetEntriesFast() ){    
731  //              cout << "GetTrack(int it):: sorted_tracks->At(it) "<<it<<" "<<t<<endl;  //      TrkTrack   *t = (TrkTrack*)sorted_tracks.At(it);
732                  track = GetPamTrackAlong(t);  //      track = GetPamTrackAlong(t);
733          }else{  //     }else{
734                  cout << "PamLevel2::GetTrack(int) : tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;  //      cout << "PamLevel2::GetTrack(int) : tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
735          };  //     };
736                
737          return track;  //     return track;
738    
739    //    cout << "PamLevel2::GetTrack(int it) "<<endl;
740    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
741        SortTracks("+CAL+TOF");
742    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
743        if(!tsorted)return 0;
744        if(!tsorted->GetEntries())return 0;
745    
746        PamTrack *track = 0;
747        
748        if( it >=0 && it < trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()){
749    //      TrkTrack   *t = (TrkTrack*)sorted_tracks.At(it);
750    //      track = GetPamTrackAlong(t);
751            TClonesArray &t = *(tsorted);
752            track = (PamTrack*)t[it];
753            
754        }else{
755            cout << "PamLevel2::GetTrack(int) : tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
756        };
757        
758        return track;
759        
760  };  };
761    
762  //--------------------------------------  //--------------------------------------
# Line 426  PamTrack *PamLevel2::GetTrack(int it){ Line 769  PamTrack *PamLevel2::GetTrack(int it){
769   */   */
770  PamTrack *PamLevel2::GetTrackImage(int it){  PamTrack *PamLevel2::GetTrackImage(int it){
771    
772  //      SortTracks("+CAL+TOF");  //     if(!trk2_obj) return 0;
         SortTracks("+CAL+TRK");//TEMP!!!!!!!!!!!!!  
           
         PamTrack *image = 0;  
773    
774          if( it >=0 && it < TrkLevel2::GetNTracks() ){  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
775                  TrkTrack *temp = (TrkTrack*)sorted_tracks->At(it);  //     SortTracks("+CAL+TOF");
776                  if( temp->HasImage() ){  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
777                          TrkTrack   *t = TrkLevel2::GetStoredTrack(temp->GetImageSeqNo());  // //    if(!sorted_tracks)return 0;
778                          image = GetPamTrackAlong(t);  //     if(sorted_tracks.IsEmpty())return 0;
779                  }else{      
780                          cout <<"PamLevel2::GetTrackImage(int) : Track SeqNo "<<it<<" does not have image"<<endl;  //     PamTrack *image = 0;
781                  };      
782    //     if( it >=0 && it < trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks() ){
783    //      TrkTrack *temp = (TrkTrack*)sorted_tracks.At(it);
784    //      if( temp->HasImage() ){
785    //          TrkTrack   *t = trk2_obj->TrkLevel2::GetStoredTrack(temp->GetImageSeqNo());
786    //          image = GetPamTrackAlong(t);
787    //      }else{
788    //          cout <<"PamLevel2::GetTrackImage(int) : Track SeqNo "<<it<<" does not have image"<<endl;
789    //      };
790    //     }else{
791    //      cout << "PamLevel2::GetTrackImage(int) : Tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
792    //     };
793        
794    //     return image;
795    
796    
797    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
798        SortTracks("+CAL+TOF");
799    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
800        if(!timage)return 0;
801        if(!timage->GetEntries())return 0;
802        
803        PamTrack *image = 0;
804        
805        if( it >=0 && it < trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks() ){
806            TClonesArray &t = *(tsorted);
807            PamTrack *temp = (PamTrack*)t[it];
808            if( temp->GetTrkTrack()->HasImage() ){
809                TClonesArray &t = *(timage);
810                image = (PamTrack*)t[it];
811          }else{          }else{
812                  cout << "PamLevel2::GetTrackImage(int) : Tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;  //          cout <<"PamLevel2::GetTrackImage(int) : Track SeqNo "<<it<<" does not have image"<<endl;
813          };          };
814        }else{
815            cout << "PamLevel2::GetTrackImage(int) : Tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
816        };
817            
818          return image;      return image;
819  }  }
820    
821  //--------------------------------------  //--------------------------------------
# Line 456  PamTrack *PamLevel2::GetTrackImage(int i Line 828  PamTrack *PamLevel2::GetTrackImage(int i
828   * @param detlist String to select trees to be included   * @param detlist String to select trees to be included
829   * @return Pointer to a TTree   * @return Pointer to a TTree
830   */   */
831  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, TString detlist="+ALL"){  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, TString detlist ){
832    
833    //     if( !detlist.IsNull() ) SetWhichTrees(detlist);
834    //     else                    GetWhichTrees(f);
835        
836        cout << "TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, TString detlist ) -- obsolte "<<endl;
837    
838        SetWhichTrees(detlist);
839    
840        TTree *Trout =0;
841    
842        TString fname = f->GetName();
843        if(!CheckLevel2File(fname))return NULL;
844    
845    //    UInt_t *found=0;    
846    
847        cout<< "GetPamTree(TFile*,TString): detector list --> ";
848        if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
849        if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
850        if(TRKh)cout<<"TRKH ";
851        if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
852        if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
853        if(TOF)cout<<"TOF ";
854        if(TRG)cout<<"TRG ";
855        if(AC)cout<<"AC ";
856        if(ND)cout<<"ND ";
857        if(S4)cout<<"S4 ";
858        if(ORB)cout<<"ORB ";
859        cout << endl;
860        if(SELLI)cout<<">>> Found selection-list <<<"<<endl;
861    
862        f->cd();
863    
 //      cout << "WARNING!!! -- obsolete method -- \n";  
 //      cout << "better use TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList*, TString) \n";  
           
         TTree *Trout =0;  
           
         SetWhichTrees(detlist);  
864  // Tracker  // Tracker
865      TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");      TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");
866      if(T && TRK) {      if(T && (TRK2||TRK1||TRKh)) {
867                  if(TRK_L1){          if(TRK2)T->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerTo("TrkLevel2"));
868                          T->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerToTrk(1));  //      else    T->SetBranchStatus("TrkLevel2",0,found);
869                          cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;          if(TRK2)cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;
870                  };          if(TRK1)T->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel1"));
871                  T->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerToTrk(2));  //      else    T->SetBranchStatus("TrkLevel1",0,found);
872                  cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;          if(TRK1)cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;
873                  Trout=T;          if(TRKh)T->SetBranchAddress("TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
874    //      else    T->SetBranchStatus("TrkHough",0,found);
875            if(TRKh)cout << "Tracker      : set branch address TrkHough"<<endl;
876            if(!Trout)Trout=T;
877            else Trout->AddFriend(T);
878      }else{      }else{
879          cout << "Tracker      : missing tree"<<endl;          cout << "Tracker      : missing tree"<<endl;
880      };      };
881      // Calorimeter      // Calorimeter
882      TTree *C = (TTree*)f->Get("Calorimeter");      TTree *C = (TTree*)f->Get("Calorimeter");
883      if(C && CAL) {      if(C && (CAL2||CAL1)) {
884          C->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerToCalo());          if(CAL2)C->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
885          cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;  //      else    C->SetBranchStatus("CaloLevel2",0,found);
886            if(CAL2)cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;
887            if(CAL1)C->SetBranchAddress("CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
888    //      else    C->SetBranchStatus("CaloLevel1",0,found);
889            if(CAL1)cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel1"<<endl;
890          if(!Trout)Trout=C;          if(!Trout)Trout=C;
891          else Trout->AddFriend(C);          else Trout->AddFriend(C);
892      }else{      }else{
893          cout << "Calorimeter  : missing tree"<<endl;          cout << "Calorimeter  : missing tree"<<endl;
894      };      };
895    
896      // ToF          // ToF    
897      TTree *O = (TTree*)f->Get("ToF");      TTree *O = (TTree*)f->Get("ToF");
898      if(O && TOF) {      if(O && TOF) {
899          O->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerToToF());          O->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
900          cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;          cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;
901          if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
902          else Trout->AddFriend(O);          else Trout->AddFriend(O);
# Line 500  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 906  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
906      // Trigger      // Trigger
907      TTree *R = (TTree*)f->Get("Trigger");      TTree *R = (TTree*)f->Get("Trigger");
908      if(R && TRG) {      if(R && TRG) {
909          R->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerToTrig());          R->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
910          cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;          cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;
911          if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
912          else Trout->AddFriend(R);          else Trout->AddFriend(R);
# Line 510  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 916  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
916      // S4      // S4
917      TTree *S = (TTree*)f->Get("S4");      TTree *S = (TTree*)f->Get("S4");
918      if(S && S4) {      if(S && S4) {
919          S->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerToS4());          S->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
920          cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;          cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;
921          if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
922          else Trout->AddFriend(S);          else Trout->AddFriend(S);
# Line 520  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 926  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
926      // Neutron Detector      // Neutron Detector
927      TTree *N = (TTree*)f->Get("NeutronD");      TTree *N = (TTree*)f->Get("NeutronD");
928      if(N && ND) {      if(N && ND) {
929          N->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerToND());          N->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
930          cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;          cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;
931          if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
932          else Trout->AddFriend(N);          else Trout->AddFriend(N);
# Line 530  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 936  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
936      // Anticounters      // Anticounters
937      TTree *A = (TTree*)f->Get("Anticounter");      TTree *A = (TTree*)f->Get("Anticounter");
938      if(A && AC) {      if(A && AC) {
939          A->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerToAc());          A->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
940          cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;          cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;
941          if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
942          else Trout->AddFriend(A);          else Trout->AddFriend(A);
# Line 538  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 944  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
944          cout << "Anticounter  : missing tree"<<endl;          cout << "Anticounter  : missing tree"<<endl;
945      };      };
946      // Orbital Info      // Orbital Info
947          TTree *B = (TTree*)f->Get("OrbitalInfo");      TTree *B = (TTree*)f->Get("OrbitalInfo");
948          if(B && ORB) {      if(B && ORB) {
949                  B->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerToOrb());          B->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
950                  cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;          cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;
951                  if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
952                  else Trout->AddFriend(B);          else Trout->AddFriend(B);
953          }else{      }else{
954                  cout << "OrbitalInfo  : missing tree"<<endl;          cout << "OrbitalInfo  : missing tree"<<endl;
955          };      };
956    
957        TTree *L = (TTree*)f->Get("SelectionList");
958        if(L && SELLI==1) {
959    //      L->SetBranchAddress("RunEntry",&irun);
960    //      cout << "SelectionList: set branch address RunEntry"<<endl;
961    //      L->SetBranchAddress("EventEntry",&irunentry);
962    //      cout << "SelectionList: set branch address EventEntry"<<endl;
963    //      if(!Trout)Trout=O;
964    //      else Trout->AddFriend("SelectionList");
965            cout << " TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile, TString) >>> SelectionList not implemente!!!!"<<endl;
966            sel_tree = 0;
967        }else{
968            cout << "SelectionList  : missing tree"<<endl;
969        };
970            
971          cout<<endl<<" Number of entries: "<<Trout->GetEntries()<<endl<<endl;      cout<<endl<<" Number of entries: "<<Trout->GetEntries()<<endl<<endl;
972                
973          return Trout;      return Trout;
974            
975  }  }
976  //--------------------------------------  //--------------------------------------
# Line 566  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 986  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
986   */   */
987  TList*  PamLevel2::GetListOfLevel2Files(TString ddir, TString flisttxt = ""){  TList*  PamLevel2::GetListOfLevel2Files(TString ddir, TString flisttxt = ""){
988                    
989          TString wdir = gSystem->WorkingDirectory();          TString wdir = gSystem->WorkingDirectory();
990                
991          if(ddir=="")ddir = wdir;      if(ddir=="")ddir = wdir;
992  //      TSystemDirectory *datadir = new TSystemDirectory(gSystem->BaseName(ddir),ddir);  //      TSystemDirectory *datadir = new TSystemDirectory(gSystem->BaseName(ddir),ddir);
993          cout << "Level2 data directory : "<<  ddir << endl;      cout << "Level2 data directory : "<<  ddir << endl;
994                        
995          TList *contents  = new TList; // create output list      TList *contents  = new TList; // create output list
996          contents->SetOwner();      contents->SetOwner();
997        
998    //    char *fullpath;
999    //    const char *fullpath;
1000        
1001        // if no input file list is given:  
1002        if ( flisttxt != "" ){
1003                    
1004          char *fullpath;  //      if( !gSystem->IsFileInIncludePath(flisttxt,&fullpath) ){        
1005                    //      if( !(fullpath = gSystem->FindFile("./",flisttxt)) ){
1006          // if no input file list is given:        //          cout <<"File "<<flisttxt<<" not found"<<endl;
1007          if ( flisttxt != "" ){  //          return 0;
1008                                    //      }      
1009                  if( !gSystem->IsFileInIncludePath(flisttxt,&fullpath) )return 0;  //      flisttxt = fullpath;
1010                    
1011  //              flisttxt = gSystem->ConcatFileName(gSystem->DirName(flisttxt),gSystem->BaseName(flisttxt));          flisttxt = gSystem->ConcatFileName(gSystem->DirName(flisttxt),gSystem->BaseName(flisttxt));
1012                  flisttxt = fullpath;  
1013                            if( !gSystem->ChangeDirectory(ddir) ){
1014                  if( !gSystem->ChangeDirectory(ddir) )return 0;              cout << "Cannot change directory : "<<ddir<<endl;
1015                return 0;
1016            }
1017                    
1018                  cout <<"Input file list : " << flisttxt <<endl;          cout <<"Input file list : " << flisttxt <<endl;
1019                  ifstream in;          ifstream in;
1020                  in.open(flisttxt, ios::in); //open input file list          in.open(flisttxt, ios::in); //open input file list
1021                  while (1) {          if(!in.good()){
1022                          TString file;              cout <<" ERROR opening the file "<<endl;
1023                          in >> file;              gSystem->ChangeDirectory(wdir); // back to the working directory
1024                          if (!in.good()) break;              return 0;
1025                          if( gSystem->IsFileInIncludePath(file,&fullpath) ){          }      
1026  //                              contents->Add(new TSystemDirectory(fullpath,ddir)); // add file to the list          int line=0;
1027  //                              contents->Add(new TSystemFile(fullpath,ddir)); // add file to the list          while (1) {
1028                                  contents->Add(new TSystemFile(fullpath,gSystem->DirName(fullpath)));// add file to the list              TString file;
1029                          }else{              in >> file;
1030                                  cout << "warning! --- File "<<file<<" does not exists"<< endl;              if (!in.good()) break;
1031                          };              line++;
1032                  };  //          cout <<"(1) " << file << endl;
1033                  in.close();              if(file.IsNull()){
1034                                    cout << "-- list interrupted at line "<<line <<endl;
1035          }else{                  break;
1036                }
1037                if(file.Contains("#"))file = file(0,file.First("#"));
1038    //          cout <<"(2) " << file << endl;
1039    //          if( gSystem->IsFileInIncludePath(file,&fullpath) ){
1040    //          if( (fullpath = gSystem->FindFile(ddir,file)) ){
1041                if( file.EndsWith(".root") ){
1042                    char *fullpath = gSystem->ConcatFileName(gSystem->DirName(ddir),gSystem->BaseName(file));
1043                    contents->Add(new TSystemFile(fullpath,gSystem->DirName(fullpath)));// add file to the list
1044                    delete fullpath;
1045                }
1046    //          }else{
1047    //              if(file.Data()!="")cout << "File: "<<file<<" ---> missing "<< endl;
1048    //          };
1049            };
1050            in.close();
1051                    
1052                  cout << "No input file list given."<<endl;      }else{
1053                  cout << "Check for existing root files."<<endl;          
1054            cout << "No input file list given."<<endl;
1055            cout << "Check for existing root files."<<endl;
1056  //              cout << "Warking directory: "<< gSystem->WorkingDirectory()<< endl;  //              cout << "Warking directory: "<< gSystem->WorkingDirectory()<< endl;
1057                            
1058                  TSystemDirectory *datadir = new TSystemDirectory(gSystem->BaseName(ddir),ddir);          TSystemDirectory *datadir = new TSystemDirectory(gSystem->BaseName(ddir),ddir);
1059                  TList *temp = datadir->GetListOfFiles();          TList *temp = datadir->GetListOfFiles();
1060  //              temp->Print();  //              temp->Print();
1061  //              cout << "*************************************" << endl;  //              cout << "*************************************" << endl;
                   
                 TIter next(temp);  
                 TSystemFile *questo = 0;  
                   
                   
                 while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {  
                         TString name =  questo-> GetName();  
                         if( name.EndsWith(".root") ){  
                                 char *fullpath;  
                                 gSystem->IsFileInIncludePath(name,&fullpath);  
                                 contents->Add(new TSystemFile(fullpath,gSystem->DirName(fullpath)));  
                         };  
                 }  
                 delete temp;  
                 delete datadir;  
1062                    
1063          };          TIter next(temp);
1064          gSystem->ChangeDirectory(wdir); // back to the working directory          TSystemFile *questo = 0;
1065            
1066            
1067            while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {
1068                TString name =  questo-> GetName();
1069                if( name.EndsWith(".root") ){
1070    //              const char *fullpath = gSystem->FindFile(ddir,name);
1071    //              char *fullpath;
1072    //              gSystem->IsFileInIncludePath(name,&fullpath);
1073                    char *fullpath = gSystem->ConcatFileName(gSystem->DirName(ddir),gSystem->BaseName(name));
1074                    contents->Add(new TSystemFile(fullpath,gSystem->DirName(fullpath)));
1075                    delete fullpath;
1076                };
1077            }
1078            delete temp;
1079            delete datadir;
1080            
1081        };
1082        gSystem->ChangeDirectory(wdir); // back to the working directory
1083  //      cout << endl << "Selected files:" << endl;  //      cout << endl << "Selected files:" << endl;
1084  //      contents->Print();  //      contents->Print();
1085          cout << contents->GetEntries()<<" files selected\n";      cout << contents->GetEntries()<<" files \n";
1086  //      cout << endl;  //      cout << endl;
1087  //      cout << "Working directory: "<< gSystem->WorkingDirectory()<< endl;  //      cout << "Working directory: "<< gSystem->WorkingDirectory()<< endl;
1088          return contents;      return contents;
1089  };  };
1090  //--------------------------------------  //--------------------------------------
1091  //  //
# Line 649  TList*  PamLevel2::GetListOfLevel2Files( Line 1097  TList*  PamLevel2::GetListOfLevel2Files(
1097   * @param detlist String to select trees to be included   * @param detlist String to select trees to be included
1098   * @return Pointer to a TChain   * @return Pointer to a TChain
1099   */   */
1100  TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList *fl, TString detlist="+ALL"){  TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList *fl, TString detlist ){
1101        
1102        TChain *Trout =0;
1103    
1104  //      TChain *Tout=0;  //    if( !detlist.IsNull() )SetWhichTrees(detlist);
1105          if(Tout)Tout->Delete();      SetWhichTrees(detlist);
1106          Tout = NULL;      
1107                cout<< "GetPamTree(TList*,TString): input detector list --> ";
1108          SetWhichTrees(detlist);      if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
1109                if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
1110          TChain *T = 0;        if(TRKh)cout<<"TRKH ";
1111          TChain *C = 0;      if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
1112          TChain *O = 0;      if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
1113          TChain *R = 0;      if(TOF)cout<<"TOF ";
1114          TChain *S = 0;      if(TRG)cout<<"TRG ";
1115          TChain *N = 0;      if(AC)cout<<"AC ";
1116          TChain *A = 0;      if(ND)cout<<"ND ";
1117          TChain *B = 0;      if(S4)cout<<"S4 ";
1118                if(ORB)cout<<"ORB ";
1119          if(TRK) T = new TChain("Tracker");            cout << endl;
1120          if(CAL) C = new TChain("Calorimeter");  
1121          if(TOF) O = new TChain("ToF");      TChain *T = 0;      
1122          if(TRG) R = new TChain("Trigger");      TChain *C = 0;
1123          if(S4)  S = new TChain("S4");      TChain *O = 0;
1124          if(ND)  N = new TChain("NeutronD");      TChain *R = 0;
1125          if(AC)  A = new TChain("Anticounter");      TChain *S = 0;
1126          if(ORB) B = new TChain("OrbitalInfo");      TChain *N = 0;
1127                TChain *A = 0;
1128          // loop over files and create chains          TChain *B = 0;
1129          TIter next(fl);  
1130          TSystemFile *questo = 0;      TChain *L = 0;
1131          while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {      
1132                  TString name =  questo->GetName();      if(TRK2||TRK1||TRKh) T = new TChain("Tracker");    
1133  //              cout << "File: "<< name << endl;      if(CAL2||CAL1)       C = new TChain("Calorimeter");
1134                  if( CheckLevel2File(name) ){      if(TOF)              O = new TChain("ToF");
1135                          if(TRK) T->Add(name);      if(TRG)              R = new TChain("Trigger");
1136                          if(CAL) C->Add(name);      if(S4)               S = new TChain("S4");
1137                          if(TOF) O->Add(name);      if(ND)               N = new TChain("NeutronD");
1138                          if(TRG) R->Add(name);      if(AC)               A = new TChain("Anticounter");
1139                          if(S4)  S->Add(name);      if(ORB)              B = new TChain("OrbitalInfo");
1140                          if(ND)  N->Add(name);  
1141                          if(AC)  A->Add(name);       L = new TChain("SelectionList");
1142                          if(ORB) B->Add(name);      
1143                  };      // loop over files and create chains        
1144          }      TIter next(fl);
1145                        TSystemFile *questo = 0;
1146              // Tracker      while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {
1147          if(TRK) if(!Tout)Tout=T;          TString name =  questo->GetName();
1148                        cout << "File: "<< name << endl;
1149          // Calorimeter          if( CheckLevel2File(name) ){
1150          if(CAL) {                            if(TRK2||TRK1||TRKh) T->Add(name);
1151                  if(!Tout)Tout=C;              if(CAL1||CAL2)       C->Add(name);
1152                  else Tout->AddFriend("Calorimeter");              if(TOF)              O->Add(name);
1153                if(TRG)              R->Add(name);
1154                if(S4)               S->Add(name);
1155                if(ND)               N->Add(name);
1156                if(AC)               A->Add(name);
1157                if(ORB)              B->Add(name);
1158                if(SELLI==1)         L->Add(name);
1159          };          };
1160                }
1161        
1162        cout << "done chain \n";
1163    
1164    //    UInt_t *found=0;
1165    // Tracker
1166        if(T && (TRK2||TRK1||TRKh)) {
1167            if(TRK2)T->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerTo("TrkLevel2"));
1168    //      else    T->SetBranchStatus("TrkLevel2",0,found);
1169            if(TRK2)cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;
1170            if(TRK1)T->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel1"));
1171    //      else    T->SetBranchStatus("TrkLevel1",0,found);
1172            if(TRK1)cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;
1173            if(TRKh)T->SetBranchAddress("TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
1174    //      else    T->SetBranchStatus("TrkHough",0,found);
1175            if(TRKh)cout << "Tracker      : set branch address TrkHough"<<endl;
1176            if(!Trout)Trout=T;
1177            else Trout->AddFriend("Tracker");
1178        }else{
1179            cout << "Tracker      : missing tree"<<endl;
1180        };
1181        // Calorimeter
1182        if(C && (CAL2||CAL1)) {
1183            if(CAL2)C->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
1184    //      else    C->SetBranchStatus("CaloLevel2",0,found);
1185            if(CAL2)cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;
1186            if(CAL1)C->SetBranchAddress("CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
1187    //      else    C->SetBranchStatus("CaloLevel1",0,found);
1188            if(CAL1)cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel1"<<endl;
1189            if(!Trout)Trout=C;
1190            else Trout->AddFriend("Calorimeter");
1191        }else{
1192            cout << "Calorimeter  : missing tree"<<endl;
1193        };
1194      // ToF          // ToF    
1195          if(TOF) {      if(O && TOF) {
1196                  if(!Tout)Tout=O;          O->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
1197                  else Tout->AddFriend("ToF");          cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;
1198          };          if(!Trout)Trout=O;
1199      // Trigger          else Trout->AddFriend("ToF");
1200          if(TRG) {      }else{
1201                  if(!Tout)Tout=O;          cout << "ToF         : missing tree"<<endl;
1202                  else Tout->AddFriend("Trigger");      };
1203          };      // Trigger
1204      // S4      if(R && TRG) {
1205          if(S4) {          R->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
1206                  if(!Tout)Tout=O;          cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;
1207                  else Tout->AddFriend("S4");          if(!Trout)Trout=O;
1208          };          else Trout->AddFriend("Trigger");
1209      // Neutron Detector      }else{
1210          if(ND) {          cout << "Trigger      : missing tree"<<endl;
1211                  if(!Tout)Tout=O;      };
1212                  else Tout->AddFriend("NeutronD");      // S4
1213          };      if(S && S4) {
1214            S->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
1215            cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;
1216            if(!Trout)Trout=O;
1217            else Trout->AddFriend("S4");
1218        }else{
1219            cout << "S4           : missing tree"<<endl;
1220        };
1221        // Neutron Detector
1222        if(N && ND) {
1223            N->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
1224            cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;
1225            if(!Trout)Trout=O;
1226            else Trout->AddFriend("NeutronD");
1227        }else{
1228            cout << "NeutronD     : missing tree"<<endl;
1229        };
1230      // Anticounters      // Anticounters
1231          if(AC) {      if(A && AC) {
1232                  if(!Tout)Tout=O;          A->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
1233                  else Tout->AddFriend("Anticounter");          cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;
1234          };          if(!Trout)Trout=O;
1235      // OrbitalInfo          else Trout->AddFriend("Anticounter");
1236          if(ORB) {      }else{
1237                  if(!Tout)Tout=O;          cout << "Anticounter  : missing tree"<<endl;
1238                  else Tout->AddFriend("OrbitalInfo");      };
1239          };      // Orbital Info
1240                if(B && ORB) {
1241          cout<<endl<<" Number of entries: "<<Tout->GetEntries()<<endl<<endl;          B->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
1242                    cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;
1243          PamLevel2::SetBranchAddress();          if(!Trout)Trout=O;
1244                    else Trout->AddFriend("OrbitalInfo");
1245          return Tout;      }else{
1246            cout << "OrbitalInfo  : missing tree"<<endl;
1247        };
1248    
1249        // Selection List
1250        if(L && SELLI==1) {
1251            cout<<">>> Found selection-list <<<"<<endl;
1252            L->SetBranchAddress("RunEntry",&irun);
1253            cout << "SelectionList: set branch address RunEntry"<<endl;
1254            L->SetBranchAddress("EventEntry",&irunentry);
1255            cout << "SelectionList: set branch address EventEntry"<<endl;
1256            sel_tree = L;
1257    //      if(!Trout)Trout=O;
1258    //      else Trout->AddFriend("SelectionList");
1259        }else{
1260    //      cout << "SelectionList  : missing tree"<<endl;
1261            if(L)L->Delete();
1262        };
1263        
1264    //    cout<<endl<<" Number of entries: "<<Trout->GetEntries()<<endl<<endl;
1265    
1266        pam_tree = Trout;
1267    
1268        return Trout;
1269  }  }
1270    
1271    
1272    
1273  //--------------------------------------  //--------------------------------------
1274  //  //
1275  //  //
# Line 746  TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList *fl, Line 1277  TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList *fl,
1277  /**  /**
1278   * Set branch addresses for Pamela friend trees   * Set branch addresses for Pamela friend trees
1279   */   */
1280  void PamLevel2::SetBranchAddress(){  void PamLevel2::SetBranchAddress(TTree *t){
1281    
1282        TRK2    = TRK2 & t->GetBranchStatus("TrkLevel2");
1283        TRK1    = TRK1 & t->GetBranchStatus("TrkLevel1");
1284        TRKh    = TRKh & t->GetBranchStatus("TrkHough");
1285        CAL2    = CAL2 & t->GetBranchStatus("CaloLevel2");
1286        CAL1    = CAL1 & t->GetBranchStatus("CaloLevel1");
1287        TOF    = TOF & t->GetBranchStatus("ToFLevel2");
1288        TRG    = TRG & t->GetBranchStatus("TrigLevel2");
1289        S4     = S4  & t->GetBranchStatus("S4Level2");
1290        ND     = ND  & t->GetBranchStatus("NDLevel2");
1291        AC     = AC  & t->GetBranchStatus("AcLevel2");
1292        ORB    = ORB & t->GetBranchStatus("OrbitalInfo");
1293    
1294    
1295      // Tracker      // Tracker
1296          if(TRK) {      if(TRK1) {
1297                  if(TRK_L1){          t->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel2"));
1298                          Tout->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerToTrk(1));          cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;
1299                          cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;      };
1300                  };      if(TRK2) {
1301                  Tout->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerToTrk(2));          t->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerTo("TrkLevel1"));
1302                  cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;          cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;
1303          };      };
1304                    if(TRKh) {
1305          // Calorimeter          t->SetBranchAddress("TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
1306          if(CAL) {          cout << "Tracker      : set branch address TrkHough"<<endl;
1307                  Tout->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerToCalo());      };
1308                  cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;      
1309          };      // Calorimeter
1310                if(CAL1) {
1311            t->SetBranchAddress("CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
1312            cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel1"<<endl;
1313        };
1314        if(CAL2) {
1315            t->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
1316            cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;
1317        };
1318        
1319      // ToF          // ToF    
1320          if(TOF) {      if(TOF) {
1321                  Tout->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerToToF());          t->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
1322                  cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;          cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;
1323          };      };
1324      // Trigger      // Trigger
1325          if(TRG) {      if(TRG) {
1326                  Tout->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerToTrig());          t->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
1327                  cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;          cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;
1328          };      };
1329      // S4      // S4
1330          if(S4) {      if(S4) {
1331                  Tout->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerToS4());          t->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
1332                  cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;          cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;
1333          };      };
1334      // Neutron Detector      // Neutron Detector
1335          if(ND) {      if(ND) {
1336                  Tout->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerToND());          t->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
1337                  cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;          cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;
1338          };      };
1339      // Anticounters      // Anticounters
1340          if(AC) {      if(AC) {
1341                  Tout->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerToAc());          t->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
1342                  cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;          cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;
1343          };      };
1344      // OrbitalInfo      // OrbitalInfo
1345          if(ORB) {      if(ORB) {
1346                  Tout->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerToOrb());          t->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
1347                  cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;          cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;
1348          };      };
1349                // SelectionList
1350        if(SELLI==1) {
1351            t->SetBranchAddress("RunEntry", &irun);
1352            cout << "SelectionList: set branch address RunEntry"<<endl;
1353            t->SetBranchAddress("EventEntry", &irunentry);
1354            cout << "SelectionList: set branch address EventEntry"<<endl;
1355        };
1356        
1357  }  }
1358    /**
1359     * Set branch addresses for Pamela friend trees
1360     */
1361    void PamLevel2::SetBranchAddress(TChain *t){
1362    
1363        TRK2    = TRK2 & t->GetBranchStatus("TrkLevel2");
1364        TRK1    = TRK1 & t->GetBranchStatus("TrkLevel1");
1365        TRKh    = TRKh & t->GetBranchStatus("TrkHough");
1366        CAL1    = CAL1 & t->GetBranchStatus("CaloLevel1");
1367        CAL2    = CAL2 & t->GetBranchStatus("CaloLevel2");
1368        TOF    = TOF & t->GetBranchStatus("ToFLevel2");
1369        TRG    = TRG & t->GetBranchStatus("TrigLevel2");
1370        S4     = S4  & t->GetBranchStatus("S4Level2");
1371        ND     = ND  & t->GetBranchStatus("NDLevel2");
1372        AC     = AC  & t->GetBranchStatus("AcLevel2");
1373        ORB    = ORB & t->GetBranchStatus("OrbitalInfo");
1374    
1375        // Tracker
1376         if(TRK2) {
1377            t->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerTo("TrkLevel2"));
1378            cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;
1379        };
1380        if(TRK1) {
1381            t->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel1"));
1382            cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;
1383        };
1384         if(TRKh) {
1385            t->SetBranchAddress("TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
1386            cout << "Tracker      : set branch address TrkHough"<<endl;
1387         };
1388        
1389        // Calorimeter
1390        if(CAL2) {
1391            t->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
1392            cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;
1393        };  
1394        if(CAL1) {
1395            t->SetBranchAddress("CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
1396            cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel1"<<endl;
1397        };
1398        
1399        // ToF    
1400        if(TOF) {
1401            t->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
1402            cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;
1403        };
1404        // Trigger
1405        if(TRG) {
1406            t->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
1407            cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;
1408        };
1409        // S4
1410        if(S4) {
1411            t->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
1412            cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;
1413        };
1414        // Neutron Detector
1415        if(ND) {
1416            t->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
1417            cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;
1418        };
1419        // Anticounters
1420        if(AC) {
1421            t->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
1422            cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;
1423        };
1424        // OrbitalInfo
1425        if(ORB) {
1426            t->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
1427            cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;
1428        };
1429        // SelectionList
1430        if(SELLI==1) {
1431            t->SetBranchAddress("RunEntry", &irun);
1432            cout << "SelectionList: set branch address RunEntry"<<endl;
1433            t->SetBranchAddress("EventEntry", &irunentry);
1434            cout << "SelectionList: set branch address EventEntry"<<endl;
1435        };
1436        
1437    }
1438    
1439    
 //--------------------------------------  
 //  
 //  
 //--------------------------------------  
 void *PamLevel2::GetPointerTo(const char* c ){  
 //      cout << "objname "<< objname << endl;  
         TString objname = c;  
         if(!objname.CompareTo("TrkLevel1"))return &trk_l1_obj;  
         if(!objname.CompareTo("TrkLevel2"))return &trk_obj;  
           
         return NULL;  
 };  
1440  //--------------------------------------  //--------------------------------------
1441  //  //
1442  //  //
# Line 819  void *PamLevel2::GetPointerTo(const char Line 1448  void *PamLevel2::GetPointerTo(const char
1448   */   */
1449  TChain *PamLevel2::GetRunTree(TList *fl){  TChain *PamLevel2::GetRunTree(TList *fl){
1450                    
1451          TChain *R = new TChain("Run");      TChain *R = new TChain("Run");
1452        
1453          // loop over files and create chains          // loop over files and create chains        
1454          TIter next(fl);      TIter next(fl);
1455          TSystemFile *questo = 0;      TSystemFile *questo = 0;
1456          while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {      while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {
1457                  TString name =  questo->GetName();          TString name =  questo->GetName();
1458  //              cout << "File: "<< name << endl;  //              cout << "File: "<< name << endl;
1459                  if( CheckLevel2File(name) ){          if( CheckLevel2File(name) ){
1460                          R->Add(name);              R->Add(name);
1461                  };          };
1462          }      }
1463            
1464          R->SetBranchAddress("RunInfo", GetPointerToRun());      if(R->GetNtrees()){
         cout << "Run         : set branch address RunInfo"<<endl;  
1465            
1466          return R;          R->SetBranchAddress("RunInfo", GetPointerTo("RunInfo"));
1467            cout << "Run         : set branch address RunInfo"<<endl;
1468            R->SetBranchAddress("SoftInfo", GetPointerTo("SoftInfo")); // Emiliano
1469            cout << "Software    : set branch address SoftInfo"<<endl; // Emiliano
1470        }else{
1471            delete R;
1472            R=0;
1473        }
1474    
1475        run_tree = R;
1476    
1477        return R;
1478            
1479  }  }
1480  //--------------------------------------  //--------------------------------------
# Line 849  TChain *PamLevel2::GetRunTree(TList *fl) Line 1488  TChain *PamLevel2::GetRunTree(TList *fl)
1488   */   */
1489  TTree *PamLevel2::GetRunTree(TFile *f){  TTree *PamLevel2::GetRunTree(TFile *f){
1490    
1491        cout << "TTree *PamLevel2::GetRunTree(TFile *f) -- obsolte "<<endl;
1492    
1493          TTree *R = (TTree*)f->Get("Run");      TTree *R = (TTree*)f->Get("Run");
   
         R->SetBranchAddress("RunInfo", GetPointerToRun());  
         cout << "Run         : set branch address RunInfo"<<endl;  
1494            
1495          return R;      if(R){
1496            R->SetBranchAddress("RunInfo", GetPointerTo("RunInfo"));
1497            cout << "Run         : set branch address RunInfo"<<endl;
1498            R->SetBranchAddress("SoftInfo", GetPointerTo("SoftInfo")); // Emiliano
1499            cout << "Software    : set branch address SoftInfo"<<endl; // Emiliano
1500        }
1501        return R;
1502            
1503  }  }
1504    /**
1505     * Update the runinfo informations (to be used to have Run infos event by event basis)
1506     * @param run Pointer to the chain/tree which contains run infos
1507     * @return true if a new run has been read, false if it is still the same run
1508     */
1509    Bool_t PamLevel2::UpdateRunInfo(TChain *run, ULong64_t iev){
1510      //
1511      // check if we have already called once GetEntry, if not call it
1512      //
1513      if ( run->GetEntries() <= 0 ) return(false);
1514      //
1515      
1516      Int_t oldrun = irun;
1517      // --------------------------------------
1518      // if it is a full file (not preselected)
1519      // --------------------------------------
1520      if(SELLI==0){
1521          if ( irun < 0 ){
1522              irun = 0;
1523              run->GetEntry(irun);
1524              runfirstentry = 0ULL;
1525              runlastentry += (ULong64_t)(this->GetRunInfo()->NEVENTS) - 1ULL;
1526              return(true);
1527          };      
1528    
1529          if( !GetOrbitalInfo() ){
1530              cout << "Bool_t PamLevel2::UpdateRunInfo(TChain *run, ULong64_t iev) -- ERROR -- missing OrbitalInfo "<<endl;
1531              return(false);
1532          }
1533          // modificato il controllo sull'aggiornamento del run, per evitare problemi
1534          // dovuti agli eventi annidati (NB! NEVENTS conta anche questi!!)
1535          while ( GetOrbitalInfo()->absTime > GetRunInfo()->RUNTRAILER_TIME && irun < run->GetEntries() ){
1536    //      while ( iev > (runfirstentry+(ULong64_t)(this->GetRunInfo()->NEVENTS-1)) && irun < run->GetEntries() ){
1537              //    printf(" iev %llu %u %llu \n",iev,this->GetRunInfo()->NEVENTS,(ULong64_t)(runfirstentry+(ULong64_t)(this->GetRunInfo()->NEVENTS)));
1538              irun++;
1539              run->GetEntry(irun);
1540              runfirstentry = runlastentry+1ULL;
1541              runlastentry += (ULong64_t)(this->GetRunInfo()->NEVENTS);
1542          };
1543          
1544          //
1545          if
1546     ( irun == oldrun || irun >= run->GetEntries() ) return(false);
1547          //
1548          //  printf(" iev %llu irun %i nevents %u 1st %llu last %llu \n",iev,irun,this->GetRunInfo()->NEVENTS,(ULong64_t)runfirstentry,(ULong64_t)runlastentry);
1549          //
1550          return(true);    
1551      };
1552      // ----------------------------------------------------
1553      // if it is a preselected file (there is SelectionList)
1554      // NBNB - the event tree MUST be read first
1555      // ----------------------------------------------------
1556      if(SELLI==1){      
1557          sel_tree->GetEntry(iev);
1558          if(irun != oldrun){
1559              run->GetEntry(irun);
1560              return true;
1561          }
1562          return false;
1563      }
1564    
1565      return false;
1566      //
1567    };
1568    /**
1569     * Update the runinfo informations (to be used to have Run infos event by event basis)
1570     * @param run Pointer to the chain/tree which contains run infos
1571     * @return true if a new run has been read, false if it is still the same run
1572     */
1573    Bool_t PamLevel2::UpdateRunInfo(TTree *run, ULong64_t iev){
1574      return(UpdateRunInfo((TChain*)run,iev));
1575    };
1576    
1577  //--------------------------------------  //--------------------------------------
1578  //  //
1579  //  //
1580  //--------------------------------------  //--------------------------------------
1581  /**  /**
1582   * Set which trees should be analysed   * Set which trees shoul be analysed
1583   * @param detlist TString containing the sequence of trees required   * @param detlist TString containing the sequence of trees required
1584  */  */
1585  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString detlist){  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString detlist){
1586                    
1587          if(detlist.Contains("+ALL", TString::kIgnoreCase)){      if(detlist.IsNull() || detlist.Contains("+ALL", TString::kIgnoreCase)){
1588                  CAL = true;          CAL0 = false;
1589                  TRK = true;          CAL1 = true;
1590                  TRK_L1 = false;          CAL2 = true;
1591                  TRG = true;          TRK2 = true;
1592                  TOF = true;          TRK1 = false;
1593                  S4  = true;          TRKh = false;
1594                  ND  = true;          TRK0 = false;
1595                  AC  = true;          TRG = true;
1596                  ORB = true;          TOF = true;
1597          }else if( detlist.Contains("-ALL", TString::kIgnoreCase) ){          TOF0 = false;
1598                  CAL = false;          S4  = true;
1599                  TRK = false;          ND  = true;
1600                  TRK_L1 = false;          AC  = true;
1601                  TRG = false;          ORB = true;
1602                  TOF = false;      }else if( detlist.Contains("-ALL", TString::kIgnoreCase) ){
1603                  S4  = false;          CAL0 = false;
1604                  ND  = false;          CAL1 = false;
1605                  AC  = false;          CAL2 = false;
1606                  ORB = false;          TRK2 = false;
1607          };          TRK1 = false;
1608                    TRKh = false;
1609          if( detlist.Contains("-CAL", TString::kIgnoreCase) )CAL = false;          TRK0 = false;
1610          else if( detlist.Contains("+CAL", TString::kIgnoreCase) )CAL = true;          TRG = false;
1611                    TOF = false;
1612          if( detlist.Contains("-TRK", TString::kIgnoreCase) )TRK = false;          TOF0 = false;
1613          else if( detlist.Contains("+TRK", TString::kIgnoreCase) )TRK = true;          S4  = false;
1614                    ND  = false;
1615          if( detlist.Contains("-TRK1", TString::kIgnoreCase) )TRK_L1 = false;          AC  = false;
1616          else if( detlist.Contains("+TRK1", TString::kIgnoreCase) )TRK_L1 = true;          ORB = false;
1617                };
1618          if( detlist.Contains("-TRG", TString::kIgnoreCase) )TRG = false;      
1619          else if( detlist.Contains("+TRG", TString::kIgnoreCase) )TRG = true;  //  -------------------------------------------------------------------------
1620                if( detlist.Contains("CAL1", TString::kIgnoreCase) ){
1621          if( detlist.Contains("-TOF", TString::kIgnoreCase) )TOF = false;          if ( detlist.Contains("-CAL1", TString::kIgnoreCase) )CAL1=false;
1622          else if( detlist.Contains("+TOF", TString::kIgnoreCase) )TOF = true;          if ( detlist.Contains("+CAL1", TString::kIgnoreCase) )CAL1=true;
1623        };
1624    
1625        if( detlist.Contains("CAL0", TString::kIgnoreCase) ){
1626            if ( detlist.Contains("-CAL0", TString::kIgnoreCase) )CAL0=false;
1627            if ( detlist.Contains("+CAL0", TString::kIgnoreCase) )CAL0=true;
1628        };
1629                    
1630          if( detlist.Contains("-S4",  TString::kIgnoreCase) )S4  = false;      if( detlist.Contains("CAL2", TString::kIgnoreCase)){
1631          else if( detlist.Contains("+S4",  TString::kIgnoreCase) )S4  = true;          if ( detlist.Contains("-CAL2", TString::kIgnoreCase) )CAL2=false;
1632            if ( detlist.Contains("+CAL2", TString::kIgnoreCase) )CAL2=true;
1633        };
1634                    
1635          if( detlist.Contains("-ND",  TString::kIgnoreCase) )ND  = false;      if( detlist.Contains("+CAL", TString::kIgnoreCase) && !CAL1 && !CAL2 )CAL2=true;
1636          else if( detlist.Contains("+ND",  TString::kIgnoreCase) )ND  = true;      if( detlist.Contains("-CAL", TString::kIgnoreCase) && CAL1 && CAL2 ){
1637            CAL2=false;
1638            CAL1=false;
1639        }
1640    //  -------------------------------------------------------------------------
1641        if( detlist.Contains("TRK0", TString::kIgnoreCase) ){
1642            if ( detlist.Contains("-TRK0", TString::kIgnoreCase) )TRK0=false;
1643            if ( detlist.Contains("+TRK0", TString::kIgnoreCase) )TRK0=true;
1644        };
1645    
1646        if( detlist.Contains("TRK1", TString::kIgnoreCase) ){
1647            if ( detlist.Contains("-TRK1", TString::kIgnoreCase) )TRK1=false;
1648            if ( detlist.Contains("+TRK1", TString::kIgnoreCase) )TRK1=true;
1649        };
1650                    
1651          if( detlist.Contains("-AC",  TString::kIgnoreCase) )AC  = false;      if( detlist.Contains("TRK2", TString::kIgnoreCase)){
1652          else if( detlist.Contains("+AC",  TString::kIgnoreCase) )AC  = true;          if ( detlist.Contains("-TRK2", TString::kIgnoreCase) )TRK2=false;
1653            if ( detlist.Contains("+TRK2", TString::kIgnoreCase) )TRK2=true;
1654        };
1655    
1656        if( detlist.Contains("TRKh", TString::kIgnoreCase)){
1657            if ( detlist.Contains("-TRKh", TString::kIgnoreCase) )TRKh=false;
1658            if ( detlist.Contains("+TRKh", TString::kIgnoreCase) )TRKh=true;
1659        };
1660                    
1661          if( detlist.Contains("-ORB", TString::kIgnoreCase) )ORB = false;      if( detlist.Contains("+TRK", TString::kIgnoreCase) && !TRK1 && !TRK2 && !TRKh )TRK2=true;
1662          else if( detlist.Contains("+ORB", TString::kIgnoreCase) )ORB = true;      if( detlist.Contains("-TRK", TString::kIgnoreCase) && TRK1 && TRK2 && TRKh){
1663            TRK2=false;
1664            TRK1=false;
1665            TRKh=false;
1666        }
1667    //  -------------------------------------------------------------------------
1668        
1669        if( detlist.Contains("-TRG", TString::kIgnoreCase) )TRG = false;
1670        else if( detlist.Contains("+TRG", TString::kIgnoreCase) )TRG = true;
1671        
1672        if( detlist.Contains("-TOF", TString::kIgnoreCase) )TOF = false;
1673        else if( detlist.Contains("+TOF", TString::kIgnoreCase) )TOF = true;
1674    
1675        if( detlist.Contains("-TOF0", TString::kIgnoreCase) )TOF0 = false;
1676        else if( detlist.Contains("+TOF0", TString::kIgnoreCase) )TOF0 = true;
1677        
1678        if( detlist.Contains("-S4",  TString::kIgnoreCase) )S4  = false;
1679        else if( detlist.Contains("+S4",  TString::kIgnoreCase) )S4  = true;
1680        
1681        if( detlist.Contains("-ND",  TString::kIgnoreCase) )ND  = false;
1682        else if( detlist.Contains("+ND",  TString::kIgnoreCase) )ND  = true;
1683        
1684        if( detlist.Contains("-AC",  TString::kIgnoreCase) )AC  = false;
1685        else if( detlist.Contains("+AC",  TString::kIgnoreCase) )AC  = true;
1686        
1687        if( detlist.Contains("-ORB", TString::kIgnoreCase) )ORB = false;
1688        else if( detlist.Contains("+ORB", TString::kIgnoreCase) )ORB = true;
1689    
1690    //     cout<< "Set detector list --> ";
1691    //     if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
1692    //     if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
1693    //     if(TRKh)cout<<"TRKH ";
1694    //     if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
1695    //     if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
1696    //     if(TOF)cout<<"TOF ";
1697    //     if(TRG)cout<<"TRG ";
1698    //     if(AC)cout<<"AC ";
1699    //     if(ND)cout<<"ND ";
1700    //     if(S4)cout<<"S4 ";
1701    //     if(ORB)cout<<"ORB ";
1702    //     cout << endl;
1703        
1704    };
1705    
1706    
1707    /**
1708     * Set tree/branch detector flags from the content of a tree
1709     */
1710    void  PamLevel2::GetWhichTrees(TFile* f){
1711        
1712    
1713    
1714        cout << "void  PamLevel2::GetWhichTrees(TFile* f) --- WARNING!! --- ...potrebbe non funzionare "<<endl;
1715        // -----------
1716        // reset flags
1717        // -----------
1718        CAL1   = false;    
1719        CAL2   = false;    
1720        TRK2   = false;    
1721        TRK1   = false;    
1722        TRKh   = false;    
1723        TRG    = false;    
1724        TOF    = false;    
1725        S4     = false;    
1726        ND     = false;    
1727        AC     = false;    
1728        ORB    = false;    
1729        
1730        RUN    = false;
1731            
1732        cout << "Checking file: "<<f->GetName()<<endl;
1733        if( !f || f->IsZombie() ){
1734            cout << "File: "<< f->GetName() <<" Non valid root file"<< endl;
1735            return;
1736        }
1737    
1738        TList *lk = f->GetListOfKeys();
1739        TIter next(lk);
1740        TKey *key =0;
1741    
1742        Int_t nev = 0;
1743    
1744        while( (key = (TKey*)next()) ){
1745            
1746            if( !strcmp(key->GetName(),"Run"        ) )RUN = true;
1747    
1748            //=========================================================    
1749            if( !strcmp(key->GetName(),"Trigger"    ) ){
1750                TRG = true;
1751                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("Trigger"))->GetEntries();
1752                if( nev && nevt!=nev){
1753                    cout << "File: "<< f->GetName() <<" Trigger tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1754                    TRG = false;
1755                }else nev=nevt;
1756            }
1757            //=========================================================    
1758            if( !strcmp(key->GetName(),"ToF"        ) ){
1759                TOF = true;
1760                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("ToF"))->GetEntries();
1761                if( nev && nevt!=nev){
1762                    cout << "File: "<< f->GetName() <<"     ToF tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1763                    TOF = false;
1764                }else nev=nevt;
1765            }
1766            //=========================================================  
1767            if( !strcmp(key->GetName(),"S4"         ) ){
1768                S4 = true;
1769                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("S4"))->GetEntries();
1770                if( nev && nevt!=nev){
1771                    cout << "File: "<< f->GetName() <<"      S4 tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1772                    S4 = false;
1773                }else nev=nevt;
1774            }
1775            //=========================================================  
1776    
1777            if( !strcmp(key->GetName(),"NeutronD"   ) ){
1778                ND = true;
1779                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("NeutronD"))->GetEntries();
1780                if( nev && nevt!=nev){
1781                    cout << "File: "<< f->GetName() <<"NeutronD tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1782                    ND =false;
1783                }else nev=nevt;
1784            }      
1785            //=========================================================  
1786            if( !strcmp(key->GetName(),"Anticounter") ){
1787                AC = true;
1788                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("Anticounter"))->GetEntries();
1789                if( nev && nevt!=nev){
1790                    cout << "File: "<< f->GetName() <<" Anticounter tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1791                    AC =false;
1792                }else nev=nevt;
1793            }
1794            //=========================================================  
1795            if( !strcmp(key->GetName(),"OrbitalInfo") ){
1796                ORB = true;
1797                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("OrbitalInfo"))->GetEntries();
1798                if( nev && nevt!=nev){
1799                    cout << "File: "<< f->GetName() <<" OrbitalInfo tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1800                    ORB = false;
1801                }else nev=nevt;
1802            }
1803            //=========================================================  
1804            if( !strcmp(key->GetName(),"Tracker"    ) ){
1805                TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");
1806                for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){
1807                    TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();
1808                    if( !name.CompareTo("TrkLevel1") )TRK1=true;
1809                    if( !name.CompareTo("TrkLevel2") )TRK2=true;
1810                    if( !name.CompareTo("TrkHough") )TRKh=true;
1811                };      
1812                Int_t nevt = T->GetEntries();
1813                if( nev && nevt!=nev){
1814                    cout << "File: "<< f->GetName() <<" Tracker tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1815                    TRK1 = false;
1816                    TRK2 = false;
1817                    TRKh = false;
1818                }else nev=nevt;
1819                T->Delete();
1820            };
1821            //=========================================================  
1822            if( !strcmp(key->GetName(),"Calorimeter"    ) ){
1823                TTree *T = (TTree*)f->Get("Calorimeter");
1824                for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){
1825                    TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();
1826                    if( !name.CompareTo("CaloLevel1") )CAL1=true;
1827                    if( !name.CompareTo("CaloLevel2") )CAL2=true;
1828                };    
1829                Int_t nevt = T->GetEntries();
1830                if( nev && nevt!=nev){
1831                    cout << "File: "<< f->GetName() <<"  Calorimeter tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1832                    CAL1 = false;
1833                    CAL2 = false;
1834                }else nev=nevt;
1835                T->Delete();
1836            };      
1837    
1838        };
1839        
1840        delete lk;
1841    
1842    //     cout<< "Get detector list from input file --> ";
1843    //     if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
1844    //     if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
1845    //     if(TRKh)cout<<"TRKH ";
1846    //     if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
1847    //     if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
1848    //     if(TOF)cout<<"TOF ";
1849    //     if(TRG)cout<<"TRG ";
1850    //     if(AC)cout<<"AC ";
1851    //     if(ND)cout<<"ND ";
1852    //     if(S4)cout<<"S4 ";
1853    //     if(ORB)cout<<"ORB ";
1854    //     cout << endl;
1855          
1856        return ;
1857                    
1858  };  };
1859    
1860    
1861  //--------------------------------------  //--------------------------------------
1862  //  //
1863  //  //
# Line 929  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString de Line 1869  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString de
1869   */   */
1870  Bool_t  PamLevel2::CheckLevel2File(TString name){  Bool_t  PamLevel2::CheckLevel2File(TString name){
1871                    
1872          Bool_t CAL__ok = false;      Bool_t CAL1__ok   = false;    
1873          Bool_t TRK__ok = false;      Bool_t CAL2__ok   = false;    
1874          Bool_t TRK_L1__ok = false;      Bool_t TRK2__ok   = false;    
1875          Bool_t TRG__ok = false;      Bool_t TRK1__ok   = false;    
1876          Bool_t TOF__ok = false;      Bool_t TRKh__ok   = false;    
1877          Bool_t S4__ok  = false;      Bool_t TRG__ok    = false;    
1878          Bool_t ND__ok  = false;      Bool_t TOF__ok    = false;    
1879          Bool_t AC__ok  = false;      Bool_t S4__ok     = false;    
1880          Bool_t ORB__ok = false;      Bool_t ND__ok     = false;    
1881                Bool_t AC__ok     = false;    
1882          Bool_t RUN__ok = false;      Bool_t ORB__ok    = false;    
1883                
1884          TFile *f = new TFile(name.Data());      Bool_t RUN__ok    = false;
1885          TList *lk = f->GetListOfKeys();      
1886  //      lk->Print();      Bool_t SELLI__ok  = false;
         TIter next(lk);  
         TKey *key =0;  
         while( (key = (TKey*)next()) ){  
 //              cout << key->GetName() << endl;  
                 if( !strcmp(key->GetName(),"Calorimeter") )CAL__ok = true;  
 //              if( !strcmp(key->GetName(),"Tracker"    ) )TRK__ok = true;  
                 if( !strcmp(key->GetName(),"Trigger"    ) )TRG__ok = true;  
                 if( !strcmp(key->GetName(),"ToF"        ) )TOF__ok = true;  
                 if( !strcmp(key->GetName(),"S4"         ) )S4__ok = true;  
                 if( !strcmp(key->GetName(),"NeutronD"   ) )ND__ok = true;  
                 if( !strcmp(key->GetName(),"Anticounter") )AC__ok = true;  
                 if( !strcmp(key->GetName(),"OrbitalInfo") )ORB__ok = true;  
                 if( !strcmp(key->GetName(),"Run"        ) )RUN__ok = true;  
                   
                 if( !strcmp(key->GetName(),"Tracker"    ) ){  
                         TRK__ok = true;  
                         TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");  
                         for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){  
                                 TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();  
                                 if( !name.CompareTo("TrkLevel1") )TRK_L1__ok=true;  
                         };  
                 };  
1887    
1888          };      cout << "Checking file: "<<name<<endl;
1889                        TFile *f = new TFile(name.Data());
1890          lk->Delete();      if( !f || f->IsZombie() ){
1891          f->Close();          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Non valid root file"<< endl; return false;
1892        }
1893    //    cout << "Get list of keys: "<<f<<endl;
1894        TList *lk = f->GetListOfKeys();
1895    //    lk->Print();
1896        TIter next(lk);
1897        TKey *key =0;
1898    
1899        Int_t nev = 0;
1900    
1901        while( (key = (TKey*)next()) ){
1902            
1903    //      cout << key->GetName() << endl;
1904    //      cout << key->GetName() << ""<<key->GetClassName()<<endl;
1905    //              cout << " Get tree: " << f->Get(key->GetName())<<endl;
1906    //      nev_previous = nev;
1907    //      cout << " n.entries  "<< nev <<endl;
1908    //      if( key->GetClassName()=="TTree" && nev_previous && nev != nev_previous ){
1909    //          nev = ((TTree*)f->Get(key->GetName()))->GetEntries();
1910    //          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- "<< key->GetName() << " tree: n.entries does not match "<<nev<<" "<<nev_previous<< endl;
1911    //          return false;
1912    //      };
1913    
1914    
1915            if( !strcmp(key->GetName(),"Run"        ) )RUN__ok = true;      
1916    
1917            //=========================================================    
1918            if( !strcmp(key->GetName(),"SelectionList"    ) ){
1919                SELLI__ok = true;
1920                if(SELLI==1){
1921                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("SelectionList"))->GetEntries();
1922                    if( nev && nevt!=nev){
1923                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- SelectionList tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1924                        return false;
1925                    }
1926                    nev=nevt;
1927                }
1928            }
1929    
1930            //=========================================================    
1931            if( !strcmp(key->GetName(),"Trigger"    ) ){
1932                TRG__ok = true;
1933                if(TRG){
1934                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("Trigger"))->GetEntries();
1935                    if( nev && nevt!=nev){
1936                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Trigger tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1937                        return false;
1938                    }
1939                    nev=nevt;
1940                }
1941            }
1942            //=========================================================    
1943            if( !strcmp(key->GetName(),"ToF"        ) ){
1944                TOF__ok = true;
1945                if(TOF){
1946                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("ToF"))->GetEntries();
1947                    if( nev && nevt!=nev){
1948                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- ToF tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1949                        return false;
1950                    }
1951                    nev=nevt;
1952                }
1953            }
1954            //=========================================================  
1955            if( !strcmp(key->GetName(),"S4"         ) ){
1956                S4__ok = true;
1957                if(S4){
1958                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("S4"))->GetEntries();
1959                    if( nev && nevt!=nev){
1960                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- S4 tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1961                        return false;
1962                    }
1963                    nev=nevt;
1964                }
1965            }
1966            //=========================================================  
1967    
1968            if( !strcmp(key->GetName(),"NeutronD"   ) ){
1969                ND__ok = true;
1970                if(ND){
1971                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("NeutronD"))->GetEntries();
1972                    if( nev && nevt!=nev){
1973                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- NeutronD tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1974                        return false;
1975                    }
1976                    nev=nevt;
1977                }
1978            }      
1979            //=========================================================  
1980            if( !strcmp(key->GetName(),"Anticounter") ){
1981                AC__ok = true;
1982                if(AC){
1983                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("Anticounter"))->GetEntries();
1984                    if( nev && nevt!=nev){
1985                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Anticounter tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1986                        return false;
1987                    }
1988                    nev=nevt;
1989                }
1990            }
1991            //=========================================================  
1992            if( !strcmp(key->GetName(),"OrbitalInfo") ){
1993                ORB__ok = true;
1994                if(ORB){
1995                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("OrbitalInfo"))->GetEntries();
1996                    if( nev && nevt!=nev){
1997                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- OrbitalInfo tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1998                        return false;
1999                    }
2000                    nev=nevt;
2001                }
2002            }
2003            //=========================================================  
2004            if( !strcmp(key->GetName(),"Tracker"    ) ){
2005                TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");
2006                if(TRK1||TRK2||TRKh){
2007                    Int_t nevt = T->GetEntries();
2008                    if( nev && nevt!=nev){
2009                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Tracker tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
2010                        return false;
2011                    }
2012                    nev=nevt;
2013                }
2014                for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){
2015                    TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();
2016                    if( !name.CompareTo("TrkLevel1") )TRK1__ok=true;
2017                    if( !name.CompareTo("TrkLevel2") )TRK2__ok=true;
2018                    if( !name.CompareTo("TrkHough") )TRKh__ok=true;
2019                };      
2020                T->Delete();
2021            };
2022            //=========================================================  
2023            if( !strcmp(key->GetName(),"Calorimeter"    ) ){
2024                TTree *T = (TTree*)f->Get("Calorimeter");
2025                if(CAL1||CAL2){
2026                    Int_t nevt = T->GetEntries();
2027                    if( nev && nevt!=nev){
2028                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Calorimeter tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
2029                        return false;
2030                    }
2031                    nev=nevt;
2032                }
2033                for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){
2034                    TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();
2035                    if( !name.CompareTo("CaloLevel1") )CAL1__ok=true;
2036                    if( !name.CompareTo("CaloLevel2") )CAL2__ok=true;
2037                };    
2038                T->Delete();
2039            };      
2040    
2041        };
2042    
2043        if( SELLI==-1 )SELLI = (Int_t)SELLI__ok;
2044        if( SELLI==0 && SELLI__ok ){
2045            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- found SelectionList (it is not a full-event file)" << endl;
2046            return false;  
2047        }
2048        if( SELLI==1 && !SELLI__ok ){
2049            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- SelectionList missing" << endl;
2050            return false;
2051        }
2052        
2053    //    cout << "SELLI "<<SELLI<<endl;
2054    
2055    //     cout<< "CheckLevel2File(TString): detector list --> ";
2056    //     if(TRK1__ok)cout<<"TRK1 ";
2057    //     if(TRK2__ok)cout<<"TRK2 ";
2058    //     if(TRKh__ok)cout<<"TRKH ";
2059    //     if(CAL1__ok)cout<<"CAL1 ";
2060    //     if(CAL2__ok)cout<<"CAL2 ";
2061    //     if(TOF__ok)cout<<"TOF ";
2062    //     if(TRG__ok)cout<<"TRG ";
2063    //     if(AC__ok)cout<<"AC ";
2064    //     if(ND__ok)cout<<"ND ";
2065    //     if(S4__ok)cout<<"S4 ";
2066    //     if(ORB__ok)cout<<"ORB ";
2067    //     cout << endl;
2068    
2069    
2070        if(TRK2 && TRK1__ok)TRK1=1;
2071    // ----------------------------------------------------------------------------
2072    // NOTA
2073    // se c'e` il level1, lo devo necessarimente leggere.
2074    // infatti (non ho capito perche`) i cluster vengono letti e allocati in memoria
2075    // comunque, ma non vengono disallocati da PamLevel2::Clear()
2076    // ----------------------------------------------------------------------------
2077    
2078    
2079        if(!RUN__ok) {
2080            cout << "File: "<< f->GetName() <<" *WARNING* ---- Missing RunInfo tree"<< endl;
2081    //      return false;
2082        };
2083    
2084        if(CAL1 && !CAL1__ok){
2085            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing CaloLevel1 branch"<< endl;
2086            return false;
2087        };
2088        if(CAL2 && !CAL2__ok){
2089            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing CaloLevel2 branch"<< endl;
2090            return false;
2091        };
2092        if(TRK2 && !TRK2__ok){
2093            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing TrkLevel2 branch"<< endl;
2094            return false;
2095        };
2096        if(TRK1 && !TRK1__ok){
2097            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing TrkLevel1 branch"<< endl;
2098            return false;
2099        };
2100        if(TRKh && !TRKh__ok){
2101            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing TrkHough branch"<< endl;
2102            return false;
2103        };
2104        if(ORB && !ORB__ok){
2105            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ORB tree"<< endl;
2106            return false;
2107        };
2108        if(AC && !AC__ok){
2109            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing AC tree"<< endl;
2110            return false;
2111        };
2112        if(S4 && !S4__ok){
2113            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing S4 tree"<< endl;
2114            return false;
2115        };
2116        if(TOF && !TOF__ok){
2117            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ToF tree"<< endl;
2118            return false;
2119        };
2120    
2121        if(ND && !ND__ok){
2122            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ND tree"<< endl;
2123            return false;
2124        };
2125        if(TRG && !TRG__ok){
2126            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing Trigger tree"<< endl;
2127            return false;
2128        };
2129        
2130    
2131    //    lk->Delete();
2132    //    delete lk;
2133        f->Close();
2134    
2135    //     cout<< "CheckLevel2File(TString): detector list --> ";
2136    //     if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
2137    //     if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
2138    //     if(TRKh)cout<<"TRKH ";
2139    //     if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
2140    //     if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
2141    //     if(TOF)cout<<"TOF ";
2142    //     if(TRG)cout<<"TRG ";
2143    //     if(AC)cout<<"AC ";
2144    //     if(ND)cout<<"ND ";
2145    //     if(S4)cout<<"S4 ";
2146    //     if(ORB)cout<<"ORB ";
2147    //     cout << endl;
2148          
2149        return true;
2150                    
2151          Bool_t FLAG = true;  };
2152          if(!RUN__ok) {  
2153                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing RunInfo tree"<< endl;  
2154                  FLAG = false;  /**
2155          };   * Create clone-trees
2156          if(CAL && !CAL__ok){   */
2157                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing Calorimeter tree"<< endl;  void PamLevel2::CreateCloneTrees0( TChain *fChain, TFile *ofile ){
2158                  FLAG = false;  
2159          };      cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2160          if(TRK && !TRK__ok){      cout << "Create clones of PAMELA trees "<<endl;
2161                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing Tracker tree"<< endl;      
2162                  FLAG = false;      Int_t i=0;
2163          };      pam_tree_clone[i] = fChain->GetTree()->CloneTree(0);
2164          if(TRK_L1 && !TRK_L1__ok){      TString name =  pam_tree_clone[i]->GetName();
2165                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing Tracker Level1 Branch"<< endl;      name.Append("_clone");
2166                  FLAG = false;  //    pam_tree_clone[i]->SetName(name.Data());
2167          };      cout << pam_tree_clone[i]->GetName() <<endl;
2168          if(TRG && !TRG__ok){      i++;
2169                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing Trigger tree"<< endl;  
2170                  FLAG = false;      TList *li = fChain->GetListOfFriends();
2171          };      TIter next(li);
2172          if(TOF && !TOF__ok){      TFriendElement* T_friend=0;
2173                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ToF tree"<< endl;      ofile->cd();
2174                  FLAG = false;      while( (T_friend = (TFriendElement*)next()) ){
2175          };  //      cout<<T_friend->IsA()->GetName()<<" "<<T_friend->GetName()<<hex << T_friend->GetTree() << dec<<endl;
2176          if(S4 && !S4__ok){  //      cout<<T_friend->GetTree()->GetName()<< endl;
2177                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing S4 tree"<< endl;          pam_tree_clone[i] = T_friend->GetTree()->CloneTree(0);
2178                  FLAG = false;          pam_tree_clone[i]->SetAutoSave(1000000);
2179          };          name =  pam_tree_clone[i]->GetName();
2180          if(ND && !ND__ok){          name.Append("_clone");
2181                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ND tree"<< endl;  //      pam_tree_clone[i]->SetName(name.Data());
2182                  FLAG = false;          cout << pam_tree_clone[i]->GetName() << endl;
2183            i++;
2184        }
2185        
2186        delete li;
2187    
2188        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2189    
2190    }
2191    
2192    /**
2193     * Create clone-trees
2194     */
2195    void PamLevel2::CreateCloneTrees(TFile *ofile){
2196    
2197        ofile->cd();
2198    
2199        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2200        cout << "Create new PAMELA trees "<<endl;
2201            
2202    
2203        run_tree_clone = new TTree("Run","PAMELA Level2 data from the GL_RUN table ");
2204        run_tree_clone->Branch("RunInfo","GL_RUN",GetPointerTo("RunInfo"));
2205        cout << "Run          : branch RunInfo"<<endl;
2206        run_tree_clone->Branch("SoftInfo","SoftInfo",GetPointerTo("SoftInfo"));
2207        cout << "Run          : branch SoftInfo"<<endl;
2208                
2209    
2210    
2211        sel_tree_clone = new TTree("SelectionList","List of selected events ");
2212        sel_tree_clone->Branch("RunEntry",&irun,"runentry/I");
2213        sel_tree_clone->Branch("EventEntry",&irunentry,"eventry/I");
2214        
2215    
2216        Int_t i=0;
2217        if(TRK1||TRK2||TRKh){
2218            pam_tree_clone[i] = new TTree("Tracker","PAMELA tracker level2 data ");
2219            if(TRK1) {
2220                pam_tree_clone[i]->Branch("TrkLevel1","TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel1"));
2221                pam_tree_clone[i]->BranchRef();
2222                cout << "Tracker      : branch TrkLevel1"<<endl;
2223                cout << "CreateCloneTrees " << GetTrkLevel1()<<endl;
2224            };
2225            if(TRK2) {
2226                pam_tree_clone[i]->Branch("TrkLevel2", "TrkLevel2",GetPointerTo("TrkLevel2"));
2227                cout << "Tracker      : branch TrkLevel2"<<endl;        
2228            };
2229            if(TRKh) {
2230                pam_tree_clone[i]->Branch("TrkHough","TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
2231                cout << "Tracker      : branch TrkHough"<<endl;
2232          };          };
2233          if(AC && !AC__ok){          i++;
2234                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing AC tree"<< endl;      }
2235                  FLAG = false;  
2236        // Calorimeter
2237        if(CAL1||CAL2){
2238            pam_tree_clone[i] = new TTree("Calorimeter","PAMELA calorimeter level2 data ");
2239            if(CAL1) {
2240                pam_tree_clone[i]->Branch("CaloLevel1", "CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
2241                cout << "Calorimeter  : branch CaloLevel1"<<endl;
2242            };
2243            if(CAL2) {
2244                pam_tree_clone[i]->Branch("CaloLevel2","CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
2245                cout << "Calorimeter  : branch CaloLevel2"<<endl;
2246          };          };
2247          if(ORB && !ORB__ok){          i++;
2248                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ORB tree"<< endl;      }    
2249                  FLAG = false;  
2250        // ToF    
2251        if(TOF) {
2252            pam_tree_clone[i] = new TTree("ToF","PAMELA ToF level2 data ");
2253            pam_tree_clone[i]->Branch("ToFLevel2","ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
2254            cout << "ToF          : branch ToFLevel2"<<endl;
2255            i++;
2256        };
2257        // Trigger
2258        if(TRG) {
2259            pam_tree_clone[i] = new TTree("Trigger","PAMELA trigger level2 data ");
2260            pam_tree_clone[i]->Branch("TrigLevel2","TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
2261            cout << "Trigger      : branch TrigLevel2"<<endl;
2262            i++;
2263        };
2264        // S4
2265        if(S4) {
2266            pam_tree_clone[i] = new TTree("S4","PAMELA S4 level2 data ");  
2267            pam_tree_clone[i]->Branch("S4Level2","S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
2268            cout << "S4           : branch S4Level2"<<endl;
2269            i++;
2270        };
2271        // Neutron Detector
2272        if(ND) {
2273            pam_tree_clone[i] = new TTree("NeutronD","PAMELA neutron detector level2 data ");      
2274            pam_tree_clone[i]->Branch("NDLevel2","NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
2275            cout << "NeutronD     : branch NDLevel2"<<endl;
2276            i++;
2277        };
2278        // Anticounters
2279        if(AC) {
2280            pam_tree_clone[i] = new TTree("Anticounter","PAMELA anticounter detector level2 data ");        
2281            pam_tree_clone[i]->Branch("AcLevel2","AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
2282            cout << "Anticounter  : branch AcLevel2"<<endl;
2283            i++;
2284        };
2285        // OrbitalInfo
2286        if(ORB) {
2287            pam_tree_clone[i] = new TTree("OrbitalInfo","PAMELA oribital info  ");  
2288            pam_tree_clone[i]->Branch("OrbitalInfo","OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
2289            cout << "OrbitalInfo  : branch OrbitalInfo"<<endl;
2290            i++;
2291        };
2292        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2293    
2294    }
2295    
2296    
2297    /**
2298     * Fill tree (created with CreateCloneTrees)
2299     *
2300     */
2301    //void PamLevel2::FillNewPamTree(TTree *T){
2302    void PamLevel2::FillCloneTrees(){
2303        
2304    //    cout << "PamLevel2::FillCloneTrees()" << irunentry << endl;
2305    
2306        for(Int_t i=0; i<NCLONES; i++){
2307            if(pam_tree_clone[i])pam_tree_clone[i]->Fill();
2308        }
2309        if(sel_tree_clone)sel_tree_clone->Fill();    
2310    
2311    }
2312    
2313    
2314    TTree* PamLevel2::GetCloneTree(TString name){
2315    
2316        for(Int_t i=0; i<NCLONES; i++){    
2317            if(pam_tree_clone[i]){
2318                TString na = pam_tree_clone[i]->GetName();
2319                if(!name.CompareTo(na))return pam_tree_clone[i];
2320            };
2321        }
2322        if(run_tree_clone){
2323            TString na = run_tree_clone->GetName();
2324            if(!name.CompareTo(na))return run_tree_clone;
2325        }
2326        if(sel_tree_clone){
2327            TString na = sel_tree_clone->GetName();
2328            if(!name.CompareTo(na))return sel_tree_clone;
2329        }
2330        return NULL;
2331    
2332    }
2333    void PamLevel2::WriteCloneTrees(){
2334        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2335        cout << "Write clones of PAMELA trees "<<endl;
2336        cout << run_tree_clone->GetName()<<endl;    
2337        run_tree_clone->Write();
2338        cout << sel_tree_clone->GetName()<<endl;    
2339        sel_tree_clone->Write();
2340        for(Int_t i=0; i<NCLONES; i++){    
2341            if(pam_tree_clone[i]){
2342                cout << pam_tree_clone[i]->GetName()<<endl;
2343                pam_tree_clone[i]->Write();
2344          };          };
2345                }
2346          return FLAG;      cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
           
 };  
2347    
2348    }
2349    
2350    /**
2351     * Method to get level2-trees entry, the corresponding run entry and (if required) the level0 entry.
2352     */
2353    Int_t PamLevel2::GetEntry(Int_t iee){
2354        
2355        if(!pam_tree){
2356            cout << " Int_t PamLevel2::GetEntry(Int_t) -- ERROR -- level2 trees not loeaded"<<endl;
2357            return 0;
2358        }
2359        if(!run_tree ){
2360            cout << " Int_t PamLevel2::GetEntry(Int_t) -- ERROR -- run tree not loeaded"<<endl;
2361            return 0;
2362        }
2363    
2364        Int_t ii=0;
2365        //-------------------------------
2366        ii = iee;
2367        if( !pam_tree->GetEntry(ii) ) return 0;
2368        //-------------------------------
2369        ii = iee;
2370        Bool_t UPDATED = UpdateRunInfo(run_tree,ii);
2371        if(SELLI==0)irunentry = iee-runfirstentry;
2372        if(UPDATED && run_tree_clone)run_tree_clone->Fill();
2373    
2374    //    cout << "PamLevel2::GetEntry("<<iee<<") "<<irun<<" "<<runfirstentry<<" "<<irunentry<<endl;
2375    
2376        if( TRK0 || CAL0 || TOF0 )GetYodaEntry( );
2377    
2378        return 1;
2379    
2380    }
2381    
2382    /**
2383     * Method to retrieve the level0 tree (YODA tree) that contains the current event.
2384     * Given the run ID (...), if needed it query the DB and load the proper file.
2385     * @return Pointer to the tree
2386     */
2387    
2388    
2389    TTree* PamLevel2::GetYodaTree( ){
2390        
2391    //    cout << "TTree* PamLevel2::GetYodaTree( )"<<endl;
2392        //===================================
2393        // check if iroot has changed
2394        //===================================
2395        if( irun<0 ){
2396            cout << "PamLevel2::GetYodaTree() -- ERROR "<<endl;
2397            cout << "In order to use this method you have to load the RunInfo tree "<<endl;
2398            cout << "with the method TChain* PamLevel2::GetRunTree(TString, TString)"<<endl;
2399    //      cout << " - read the event with PamLevel2::GetEntry(Int_t)"<<endl;
2400            return NULL;
2401        }    
2402        Int_t irootnew = run_obj->ID_ROOT_L0;
2403    //     cout << "iroot    "<<iroot<<endl;
2404    //     cout << "irootnew "<<irootnew<<endl;
2405    
2406        //===================================
2407        // load the level0 file
2408        // (if not already loaded)
2409        //===================================
2410        if( iroot != irootnew || !l0_tree){
2411            iroot = irootnew;
2412            //===================================
2413            // open the DB connection
2414            // (if not already opened)
2415            //===================================
2416            if(!dbc || (dbc && !dbc->IsConnected())){
2417                cout<<"~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~"<<endl;
2418                cout<<"Connecting to DB"<<endl;
2419                cout<<"HOST "<<host<<endl;
2420                cout<<"USER "<<user<<endl;
2421                cout<<"PSW  "<<psw<<endl;
2422                dbc = TSQLServer::Connect(host.Data(),user.Data(),psw.Data());
2423                if( !dbc )return NULL;
2424                if( !dbc->IsConnected() )return NULL;    
2425    //          cout<<"...done"<<endl;
2426                cout<<"~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~"<<endl;
2427            }else{
2428    //          cout<<"DB already connected"<<endl;
2429            }
2430            GL_ROOT glroot = GL_ROOT();
2431            if( glroot.Query_GL_ROOT(iroot,dbc) ){
2432                cout << "TTree* PamLevel2::GetYodaTree( ) -- ERROR -- level0 file iroot = "<<iroot<< " does not exists"<<endl;
2433                return NULL;
2434            };
2435            TString filename = glroot.PATH + glroot.NAME;
2436            if(l0_file){
2437                l0_file->Close();
2438                l0_file->Delete();
2439            }
2440            cout << "Opening LEVEL0 file: "<< filename << endl;
2441            FileStat_t t;
2442            if( gSystem->GetPathInfo(filename.Data(),t) ){
2443                cout << " PamLevel2::GetYodaTree() -- ERROR opening file "<<endl;
2444                return NULL;
2445            }
2446            l0_file = new TFile(filename);
2447            if( !l0_file )return NULL;
2448            l0_tree = (TTree*)l0_file->Get("Physics");
2449            if(!h0_obj)h0_obj = new EventHeader();
2450            l0_tree->SetBranchAddress("Header" ,&h0_obj);
2451            //---------------------------------------------------
2452            // TRACKER:
2453            if(TRK0){
2454                if(!trk0_obj){
2455                    trk0_obj = new TrkLevel0();
2456                    trk0_obj->Set();
2457                };
2458                l0_tree->SetBranchAddress("Tracker" ,trk0_obj->GetPointerToTrackerEvent());
2459            }
2460            //---------------------------------------------------
2461            // CALORIMETER:
2462            if(CAL0){
2463                cout << "PamLevel2::GetYodaTree() --- level0 calorimeter not implemented "<<endl;
2464            }
2465            //---------------------------------------------------
2466            // TOF:
2467            if(TOF0){
2468                cout << "PamLevel2::GetYodaTree() --- level0 TOF not implemented "<<endl;
2469            }
2470    
2471        };
2472    
2473        if(!dbc || (dbc && !dbc->IsConnected())){
2474            cout << " TTree* PamLevel2::GetYodaTree( ) -- no DB connected... hai fatto qualche cazzata "<<endl;
2475        }
2476    
2477        TrkParams::SetCalib(run_obj,dbc);
2478    
2479    
2480    //    cout << l0_tree << endl;
2481        
2482        return l0_tree;
2483    
2484    }
2485    
2486    /**
2487     * Method to retrieve the level0 tree (YODA tree) that contains the current event.
2488     */
2489    Int_t PamLevel2::GetYodaEntry(){
2490    
2491    //    cout << "Int_t PamLevel2::GetYodaEntry()"<<endl;
2492        if(!GetYodaTree())return 0;
2493        
2494        // patch
2495        if( (Int_t)irunentry < 0){
2496            cout << "Int_t PamLevel2::GetYodaEntry() -- ATTENZIONE -- irunentry negativo?!?! "<<(Int_t)irunentry<<endl;
2497            irunentry=0;
2498        }
2499        //  ---------------------------------
2500        //  if file is NOT a preselected file
2501        //  ---------------------------------
2502        UInt_t quellagiusta = irunentry + run_obj->EV_FROM;
2503        
2504    
2505    //     cout << " irun "<< irun << " irunentry "<< irunentry<<" run_obj->EV_FROM "<<run_obj->EV_FROM <<" quella giusta "<<quellagiusta << endl;
2506    //     cout << " iroot "<<iroot<<" run_obj->ID_ROOT_L0 "<<run_obj->ID_ROOT_L0<<endl;
2507    //     cout << " time "<< GetOrbitalInfo()->absTime << endl;
2508    //     cout << " trk_calib_used "<<run_obj->TRK_CALIB_USED<< endl;
2509        
2510        if( !GetOrbitalInfo() ){
2511            cout << "Int_t PamLevel2::GetYodaEntry() -- ERROR -- missing OrbitalInfo "<<endl;
2512            return 0;
2513        }
2514    
2515        // ---------------------------------------------------------------------
2516        // ATTENTION!!!
2517        // If data are not pre-processed with cleaner, the level0 tree may contain
2518        // spurious nested physics packets.
2519        // The GL_RUN variables EV_FROM, EV_TO and NEVENTS counts also these entries
2520        // while level2 tree DOES NOT!!
2521        // This means that "quellagiusta" in these cases is not correct.
2522        // In order to retrieve the correct level0 event, I implemented a check
2523        // of the OBT and pkt-number. In case of mismatch, the level0 entry number
2524        // is shift forward until when the packets match.
2525        // ---------------------------------------------------------------------
2526        Int_t answer = 0;
2527        Int_t shift =0;
2528        do{
2529            if(shift>0){
2530                cout << " level0 <--> level2 mismatch ( irun "<<irun<<" irunentry "<<irunentry<<" shift "<<shift<<" )"<<endl;
2531            }
2532            answer = l0_tree->GetEntry(quellagiusta+shift);
2533            shift++;
2534            if( !GetEventHeader() ){
2535                cout << "Int_t PamLevel2::GetYodaEntry() -- ERROR -- missing EventHeader "<<endl;
2536                return 0;
2537            }
2538    //      if( (quellagiusta+shift) == l0_tree->GetEntries()+1 )cout << ">>> end of level0 tree <<<"<<endl;
2539    //      cout << " GetOrbitalInfo()->OBT "<< GetOrbitalInfo()->OBT << endl;
2540    //      cout << " GetEventHeader()->GetPscuHeader()->GetOrbitalTime() "<< GetEventHeader()->GetPscuHeader()->GetOrbitalTime() << endl;
2541    //      cout << " GetOrbitalInfo()->pkt_num "<< GetOrbitalInfo()->pkt_num << endl;
2542    //      cout << " GetEventHeader()->GetPscuHeader()->GetCounter() "<< GetEventHeader()->GetPscuHeader()->GetCounter() << endl;
2543    
2544        }while( ( GetOrbitalInfo()->OBT != (UInt_t)(GetEventHeader()->GetPscuHeader()->GetOrbitalTime()) || GetOrbitalInfo()->pkt_num != (UInt_t)(GetEventHeader()->GetPscuHeader()->GetCounter())) && (quellagiusta+shift) < GetYodaTree()->GetEntries() );
2545    
2546    //    cout << "LA ENTRY GIUSTA E`: "<<quellagiusta<<" (spero...)"<<endl;
2547    //    return GetYodaTree()->GetEntry(quellagiusta);
2548        
2549        return answer;
2550        
2551    }

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