/[PAMELA software]/PamelaLevel2/src/PamLevel2.cpp
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Diff of /PamelaLevel2/src/PamLevel2.cpp

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revision 1.5 by pam-fi, Mon Oct 9 08:57:42 2006 UTC revision 1.17 by mocchiut, Tue Jan 16 15:26:55 2007 UTC
# Line 7  Line 7 
7   * Default constructor   * Default constructor
8   */   */
9  PamTrack::PamTrack(){  PamTrack::PamTrack(){
10      trk_track  = this->TrkTrack::GetTrkTrack();      trk_track  = 0;
11      calo_track = this->CaloTrkVar::GetCaloTrkVar();      calo_track = 0;
12      tof_track  = this->ToFTrkVar::GetToFTrkVar();      tof_track  = 0;
13        candeleteobj = 0;
14  };  };
15  //--------------------------------------  //--------------------------------------
16  //  //
# Line 19  PamTrack::PamTrack(){ Line 20  PamTrack::PamTrack(){
20   * Constructor   * Constructor
21   */   */
22  PamTrack::PamTrack(TrkTrack* t, CaloTrkVar* c, ToFTrkVar* o){  PamTrack::PamTrack(TrkTrack* t, CaloTrkVar* c, ToFTrkVar* o){
23      trk_track  = this->TrkTrack::GetTrkTrack();  
24      calo_track = this->CaloTrkVar::GetCaloTrkVar();      trk_track  = 0;
25      tof_track  = this->ToFTrkVar::GetToFTrkVar();      calo_track = 0;
26      if(t) *trk_track  = *t;      tof_track  = 0;
27      if(c) *calo_track = *c;  //     if(t)trk_track  = new TrkTrack(*t);
28      if(o) *tof_track  = *o;      //     if(c)calo_track = new CaloTrkVar(*c);
29    //     if(o)tof_track  = new ToFTrkVar(*o);
30        if(t)trk_track  = t;
31        if(c)calo_track = c;
32        if(o)tof_track  = o;
33        candeleteobj = 0;
34    
35  };  };
36    PamTrack::PamTrack(const PamTrack& track){
37    
38        TrkTrack   *t = track.trk_track;
39        CaloTrkVar *c = track.calo_track;
40        ToFTrkVar  *o = track.tof_track;
41    
42        trk_track  = 0;
43        calo_track = 0;
44        tof_track  = 0;
45        if(t)trk_track  = new TrkTrack(*t);
46        if(c)calo_track = new CaloTrkVar(*c);
47        if(o)tof_track  = new ToFTrkVar(*o);
48        candeleteobj = 1;
49        
50    }
51    void PamTrack::Clear(){
52    
53    //    cout << "PamTrack::Clear() "<<candeleteobj<<endl;
54        if(candeleteobj){
55            if(trk_track)  trk_track->TrkTrack::Clear();
56            if(calo_track) calo_track->CaloTrkVar::Clear();//???
57            if(tof_track)  tof_track->ToFTrkVar::Clear();//???
58        }else{
59            trk_track  = 0;
60            calo_track = 0;
61            tof_track  = 0;
62        }
63    }
64    void PamTrack::Delete(){
65    //    cout << "PamTrack::Delete() "<<candeleteobj<<endl;
66        if(candeleteobj){
67            if(trk_track)  {
68                trk_track->TrkTrack::Clear();
69                delete trk_track;
70            }
71            if(calo_track){
72                calo_track->CaloTrkVar::Clear();//???
73                delete calo_track;
74            }
75            if(tof_track){
76                tof_track->ToFTrkVar::Clear();//???
77                delete tof_track;
78            }
79        }else{
80            Clear();
81        }
82    }
83  //--------------------------------------  //--------------------------------------
84  //  //
85  //  //
# Line 36  PamTrack::PamTrack(TrkTrack* t, CaloTrkV Line 89  PamTrack::PamTrack(TrkTrack* t, CaloTrkV
89   */   */
90  PamLevel2::PamLevel2(){  PamLevel2::PamLevel2(){
91                    
92      trk_l1_obj  = this->TrkLevel1::GetTrkLevel1();        //     trk2_obj  = TrkLevel2::GetTrkLevel2();
93          trk_obj     = this->TrkLevel2::GetTrkLevel2();  //     trk1_obj  = TrkLevel1::GetTrkLevel1();
94          calo_obj    = this->CaloLevel2::GetCaloLevel2();  //     trkh_obj  = TrkHough::GetTrkHough();
95      tof_obj     = this->ToFLevel2::GetToFLevel2();  //     calo1_obj = CaloLevel1::GetCaloLevel1();
96      trig_obj    = this->TrigLevel2::GetTrigLevel2();  //     calo2_obj = CaloLevel2::GetCaloLevel2();
97      s4_obj      = this->S4Level2::GetS4Level2();  //     tof_obj   = ToFLevel2::GetToFLevel2();
98      nd_obj      = this->NDLevel2::GetNDLevel2();  //     trig_obj  = TrigLevel2::GetTrigLevel2();
99      ac_obj      = this->AcLevel2::GetAcLevel2();  //     s4_obj    = S4Level2::GetS4Level2();
100          orb_obj     = this->OrbitalInfo::GetOrbitalInfo();  //     nd_obj    = NDLevel2::GetNDLevel2();
101    //     ac_obj    = AcLevel2::GetAcLevel2();
102    //     orb_obj   = OrbitalInfo::GetOrbitalInfo();
103        trk2_obj  = 0;
104        trk1_obj  = 0;
105        trkh_obj  = 0;
106        calo1_obj = 0;
107        calo2_obj = 0;
108        tof_obj   = 0;
109        trig_obj  = 0;
110        s4_obj    = 0;
111        nd_obj    = 0;
112        ac_obj    = 0;
113        orb_obj   = 0;
114    
115        run_obj   = 0;//new GL_RUN();
116        soft_obj   = 0;// Emiliano
117        irun = -1;
118        runfirstentry = 0ULL;
119        runlastentry = 0ULL;
120    
121          run_obj     = new GL_RUN();      for(Int_t i=0; i<8; i++ )tree_clone[i]=NULL;
           
         sorted_tracks = new TRefArray();  
122    
123          CAL = true;  //    sorted_tracks = 0;//new TRefArray();
124          TRK = true;      
125          TRG = true;      CAL1 = true;
126          TOF = true;      CAL2 = true;
127          S4  = true;      TRK2 = true;
128          ND  = true;      TRK1 = false;
129          AC  = true;      TRKh = false;
130          ORB = true;      TRG = true;
131        TOF = true;
132        S4  = true;
133        ND  = true;
134        AC  = true;
135        ORB = true;
136        
137        RUN = true;
138    
139          TRK_L1 = false;      tsorted=0;
140        timage=0;
141    
         Tout  = NULL;  
142  };  };
143  /**  /**
144   * Destructor   * Delete the event (act as Dtor)
145   */   */
146  PamLevel2::~PamLevel2(){  void PamLevel2::Delete(){
                   
         TrkLevel1::Clear();  
           
         TrkLevel2::Clear();  
         CaloLevel2::Clear();  
         ToFLevel2::Clear();  
         TrigLevel2::Clear();  
         S4Level2::Clear();  
         NDLevel2::Clear();  
         AcLevel2::Clear();  
         OrbitalInfo::Clear();  
           
         delete run_obj;  
           
 //      delete sorted_tracks;  
         sorted_tracks->Delete(); // clean the reference array  
           
         if(Tout)Tout->Delete(); // delete loaded tree from memory  
147                    
148        if(run_obj)delete run_obj;
149        if(soft_obj)delete soft_obj; //Emiliano
150    
151    //    cout << "void PamLevel2::Clear()"<<endl;
152        if(trk1_obj) delete trk1_obj;      
153        if(trk2_obj) delete trk2_obj;
154        if(trkh_obj) delete trkh_obj;
155        if(calo1_obj)delete calo1_obj;
156        if(calo2_obj)delete calo2_obj;
157        if(tof_obj)  delete tof_obj;
158        if(trig_obj) delete trig_obj;
159        if(s4_obj)   delete s4_obj;
160        if(nd_obj)   delete nd_obj;
161        if(ac_obj)   delete ac_obj;
162        if(orb_obj)  delete orb_obj;
163        
164        if(tsorted){
165            tsorted->Delete();
166            delete tsorted;
167        }
168        if(timage){
169            timage->Delete();
170            delete timage;
171        }
172  };  };
173    
174  /**  /**
175   * Clear the event   * Clear the event (NB! does not deallocate objects)
176   */   */
177  void PamLevel2::Clear(){  void PamLevel2::Clear(){
178                    
179          TrkLevel1::Clear();  //    cout << "void PamLevel2::Clear()"<<endl;
180            
181          TrkLevel2::Clear();  //
182          CaloLevel2::Clear();  // This method is called once for every entry but RunInfo and SoftInfo do not change until the next run so we cannot clear them here unless we don't
183          ToFLevel2::Clear();  // want to load them for each event even if they are the same...
184          TrigLevel2::Clear();  //
185          S4Level2::Clear();  //    if(run_obj)delete run_obj;
186          NDLevel2::Clear();  //    if(run_obj) run_obj->Clear();  // Emiliano: Do not deallocate run_obj here, it will give segmentation fault! call clear instead
187          AcLevel2::Clear();  //    if(soft_obj) soft_obj->Clear();
188          OrbitalInfo::Clear();  
189                if(trk1_obj) trk1_obj->Clear();    
190          sorted_tracks->Delete(); // clean the reference array      if(trk2_obj) trk2_obj->Clear();
191                if(trkh_obj) trkh_obj->Clear();
192        if(calo1_obj)calo1_obj->Clear();
193        if(calo2_obj)calo2_obj->Clear();
194        if(tof_obj)  tof_obj->Clear();
195        if(trig_obj) trig_obj->Clear();
196        if(s4_obj)   s4_obj->Clear();
197        if(nd_obj)   nd_obj->Clear();
198        if(ac_obj)   ac_obj->Clear();
199        if(orb_obj)  orb_obj->Clear();
200        
201    //    if(sorted_tracks)sorted_tracks->Clear();
202    //    sorted_tracks.Clear();
203    
204        if(tsorted){
205            tsorted->Delete();
206        }
207        if(timage){
208            timage->Delete();
209        }
210        
211  };  };
212    
213    
# Line 112  void PamLevel2::Clear(){ Line 215  void PamLevel2::Clear(){
215  //  //
216  //  //
217  //--------------------------------------  //--------------------------------------
218    void *PamLevel2::GetPointerTo(const char* c ){
219    
220        TString objname = c;
221    
222        if(!objname.CompareTo("TrkLevel1"))  {
223            if(!trk1_obj){
224                trk1_obj  = new TrkLevel1();
225                trk1_obj->Set();
226            }
227            return &trk1_obj;
228        };
229        if(!objname.CompareTo("TrkLevel2"))  {
230            if(!trk2_obj){  
231                trk2_obj  = new TrkLevel2();
232                trk2_obj->Set();
233            }
234            return &trk2_obj;
235        };
236        if(!objname.CompareTo("TrkHough"))   {
237            if(!trkh_obj)  trkh_obj  = new TrkHough();
238            return &trkh_obj;
239        };
240        if(!objname.CompareTo("CaloLevel1")) {
241            if(!calo1_obj) calo1_obj = new CaloLevel1();
242            return &calo1_obj;
243        };
244        if(!objname.CompareTo("CaloLevel2")) {
245            if(!calo2_obj){
246                calo2_obj = new CaloLevel2();
247                calo2_obj->Set();
248            };
249            return &calo2_obj;
250        };
251        if(!objname.CompareTo("ToFLevel2"))  {
252            if(!tof_obj){
253                tof_obj   = new ToFLevel2();
254                tof_obj->Set();
255            }
256            return &tof_obj;
257        };
258        if(!objname.CompareTo("TrigLevel2")) {
259            if(!trig_obj)  trig_obj  = new TrigLevel2();
260            return &trig_obj;
261        };
262        if(!objname.CompareTo("S4Level2"))   {
263            if(!s4_obj)    s4_obj    = new S4Level2();
264            return &s4_obj;
265        };
266        if(!objname.CompareTo("NDLevel2"))   {
267            if(!nd_obj)    nd_obj    = new NDLevel2();
268            return &nd_obj;
269        };
270        if(!objname.CompareTo("AcLevel2"))   {
271            if(!ac_obj)    ac_obj    = new AcLevel2();
272            return &ac_obj;
273        };
274        if(!objname.CompareTo("OrbitalInfo")){
275            if(!orb_obj)   orb_obj   = new OrbitalInfo();
276            return &orb_obj;
277        };
278        
279        if(!objname.CompareTo("RunInfo"))return &run_obj;
280    
281        if(!objname.CompareTo("SoftInfo"))return &soft_obj; // Emiliano
282    
283        return NULL;
284    };
285    //--------------------------------------
286    //
287    //
288    //--------------------------------------
289  /**  /**
290   * Retrieves the calorimeter track matching the seqno-th tracker stored track.   * Retrieves the calorimeter track matching the seqno-th tracker stored track.
291   * (If seqno = -1 retrieves the self-trigger calorimeter track)   * (If seqno = -1 retrieves the self-trigger calorimeter track)
292   */   */
293   CaloTrkVar *PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int seqno){   CaloTrkVar *PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int seqno){
294                
295           if( CaloLevel2::ntrk()==0 ){       if( !calo2_obj )return 0;
                  cout << "PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" but no Calorimeter tracks are stored"<<endl;  
                  return NULL;  
          };  
           
          CaloTrkVar *c = 0;  
          Int_t it_calo=0;  
           
          do{  
                  c = CaloLevel2::GetCaloTrkVar(it_calo);  
                  it_calo++;  
          } while( seqno != c->trkseqno && it_calo < CaloLevel2::ntrk());          
           
          if(seqno != c->trkseqno){  
                  c = 0;  
                  if(seqno!=-1)cout << "PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" does not match Calorimeter stored tracks"<<endl;  
          };  
          return c;  
296    
297         if( calo2_obj->CaloLevel2::ntrk()==0 ){
298             cout << "PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" but no Calorimeter tracks are stored"<<endl;
299             return NULL;
300         };
301        
302         CaloTrkVar *c = 0;
303         Int_t it_calo=0;
304        
305         do{
306             c = calo2_obj->CaloLevel2::GetCaloTrkVar(it_calo);
307             it_calo++;
308         } while( c && seqno != c->trkseqno && it_calo < calo2_obj->CaloLevel2::ntrk());    
309        
310         if(!c || seqno != c->trkseqno){
311             c = 0;
312             if(seqno!=-1)cout << "PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" does not match Calorimeter stored tracks"<<endl;
313         };
314         return c;
315        
316   };   };
317  //--------------------------------------  //--------------------------------------
318   //   //
# Line 148  void PamLevel2::Clear(){ Line 324  void PamLevel2::Clear(){
324   */   */
325   ToFTrkVar *PamLevel2::GetToFStoredTrack(int seqno){   ToFTrkVar *PamLevel2::GetToFStoredTrack(int seqno){
326                    
327           if( ToFLevel2::ntrk()==0 ){       if( !tof_obj )return 0;
                  cout << "PamLevel2::GetToFStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" but no ToF tracks are stored"<<endl;  
                  return NULL;  
          };  
           
          ToFTrkVar *c = 0;  
          Int_t it_tof=0;  
           
          do{  
                  c = ToFLevel2::GetToFTrkVar(it_tof);  
                  it_tof++;  
          } while( seqno != c->trkseqno && it_tof < ToFLevel2::ntrk());    
           
          if(seqno != c->trkseqno){  
                  c = 0;  
                  if(seqno!=-1)cout << "PamLevel2::GetToFStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" does not match ToF stored tracks"<<endl;  
          };  
          return c;  
328    
329         if( tof_obj->ToFLevel2::ntrk()==0 ){
330             cout << "PamLevel2::GetToFStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" but no ToF tracks are stored"<<endl;
331             return NULL;
332         };
333        
334         ToFTrkVar *c = 0;
335         Int_t it_tof=0;
336        
337         do{
338             c = tof_obj->ToFLevel2::GetToFTrkVar(it_tof);
339             it_tof++;
340         } while( c && seqno != c->trkseqno && it_tof < tof_obj->ToFLevel2::ntrk());        
341        
342         if(!c || seqno != c->trkseqno){
343             c = 0;
344             if(seqno!=-1)cout << "PamLevel2::GetToFStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" does not match ToF stored tracks"<<endl;
345         };
346         return c;
347        
348   };   };
349    
350  //--------------------------------------  //--------------------------------------
# Line 177  void PamLevel2::Clear(){ Line 355  void PamLevel2::Clear(){
355   * Give the pamela track associated to a tracker track, retrieving related calorimeter and tof track information.   * Give the pamela track associated to a tracker track, retrieving related calorimeter and tof track information.
356   */   */
357   PamTrack* PamLevel2::GetPamTrackAlong(TrkTrack* t){   PamTrack* PamLevel2::GetPamTrackAlong(TrkTrack* t){
358                
359           CaloTrkVar *c = 0;       cout <<"PamLevel2::GetPamTrackAlong(TrkTrack* t) **obsolete** "<<endl;
360           ToFTrkVar  *o = 0;       cout <<"(if you use it, remember to delete the PamTrack object)"<<endl;
361            
362           if(CAL) c = GetCaloStoredTrack(t->GetSeqNo());       CaloTrkVar *c = 0;
363           if(TOF) o = GetToFStoredTrack(t->GetSeqNo());       ToFTrkVar  *o = 0;
364                
365         if(CAL2) c = GetCaloStoredTrack(t->GetSeqNo());
366         if(TOF) o = GetToFStoredTrack(t->GetSeqNo());
367        
368  //    if(t && c && o)track = new PamTrack(t,c,o);  //    if(t && c && o)track = new PamTrack(t,c,o);
369           PamTrack *track = new PamTrack(t,c,o);       PamTrack *track = new PamTrack(t,c,o);
370                
371           return track;       return track;
372    
373   };   };
374  //--------------------------------------  //--------------------------------------
# Line 202  void PamLevel2::Clear(){ Line 383  void PamLevel2::Clear(){
383    
384  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_t itrk){  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_t itrk){
385            
386          PamTrack *track = 0;      cout <<"PamLevel2::GetStoredTrack(Int_t itrk) **to-be-updated** "<<endl;
387        cout <<"for the moment, better use separately the methods: TrkLevel2::GetStoredTrack(seqno) CaloLevel2::GetCaloTrkVar(Int_t notrack) ToFLevel2::GetToFTrkVar(Int_t notrack)"<<endl;
388          if( itrk >=0 && itrk < TrkLevel2::ntrk() ){      cout <<"(if you use it, remember to delete the PamTrack object)"<<endl;
389                        PamTrack *track = 0;
390                  TrkTrack *t = TrkLevel2::GetStoredTrack(itrk);      
391                  track = GetPamTrackAlong(t);      if( itrk >=0 && itrk < trk2_obj->TrkLevel2::ntrk() ){
392                    
393          }else{          TrkTrack *t = trk2_obj->TrkLevel2::GetStoredTrack(itrk);
394                  cout << "PamLevel2::GetStoredTrack(int) : tracker track SeqNo "<< itrk <<" does not exist (GetNTracks() = "<<TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;          track = GetPamTrackAlong(t);
         };  
   
         return track;  
395                    
396            
397    
398        }else{
399            cout << "PamLevel2::GetStoredTrack(int) : tracker track SeqNo "<< itrk <<" does not exist (GetNTracks() = "<<trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
400        };
401        
402        return track;
403        
404  }  }
405  //--------------------------------------  //--------------------------------------
406  //  //
# Line 224  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_ Line 410  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_
410   * Sort physical (tracker) tracks and stores them in the TRefArray (of TrkTrack objects) which pointer is  PamLevel2::sorted_tracks.   * Sort physical (tracker) tracks and stores them in the TRefArray (of TrkTrack objects) which pointer is  PamLevel2::sorted_tracks.
411   * @param how String to set the sorting cryterium (es: "CAL" or "TRK+CAL+TOF" ecc...).   * @param how String to set the sorting cryterium (es: "CAL" or "TRK+CAL+TOF" ecc...).
412   * Sorting cryteria:   * Sorting cryteria:
413   * TRK: lower chi**2   * TRK: lower chi**2
414   * CAL: lower Y spatial residual on the first calorimeter plane   * CAL: lower Y spatial residual on the first calorimeter plane
415   * TOF: bigger numebr of hit PMTs along the track, on S12 S21 S32 (where paddles are along the Y axis).   * TOF: bigger numebr of hit PMTs along the track, on S12 S21 S32 (where paddles are along the Y axis).
416   * The default sorting cryterium is "TOF+CAL".   * The default sorting cryterium is "TOF+CAL".
# Line 233  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_ Line 419  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_
419   */   */
420  void PamLevel2::SortTracks(TString how){  void PamLevel2::SortTracks(TString how){
421    
422    //    cout <<" PamLevel2::SortTracks(TString how) "<<endl;
423        if( !trk2_obj ){
424            cout << "void PamLevel2::SortTracks(TString how):  TrkLevel2 not loaded !!!";
425            return;
426        };
427    //    cout << "call SortTracs() "<<endl;
428    //Save current Object count    //Save current Object count
429          Int_t ObjectNumber = TProcessID::GetObjectCount();      Int_t ObjectNumber = TProcessID::GetObjectCount();
430            
431          sorted_tracks->Delete(); //temporaneo???  //    cout << "ObjectNumber  "<<ObjectNumber <<endl;
432            
433    //     if(!sorted_tracks)sorted_tracks = new TRefArray();
434    //     sorted_tracks->Clear();
435    //    sorted_tracks.Clear();
436    
437        if(!tsorted)tsorted = new TClonesArray("PamTrack",trk2_obj->GetNTracks());
438        tsorted->Delete();
439        TClonesArray &ttsorted = *tsorted;
440        if(!timage)timage = new TClonesArray("PamTrack",trk2_obj->GetNTracks());
441        timage->Delete();
442        TClonesArray &ttimage = *timage;
443    
444    
445      // loop over the tracks sorted by the tracker      // loop over the tracks sorted by the tracker
446          Bool_t use_TRK = how.Contains("TRK", TString::kIgnoreCase);      Bool_t use_TRK = how.Contains("TRK", TString::kIgnoreCase);
447          Bool_t use_CAL = how.Contains("CAL", TString::kIgnoreCase);      Bool_t use_CAL = how.Contains("CAL", TString::kIgnoreCase);
448          Bool_t use_TOF = how.Contains("TOF", TString::kIgnoreCase);      Bool_t use_TOF = how.Contains("TOF", TString::kIgnoreCase);
449                
450          if( !CAL &&  use_CAL) use_CAL = false;      if( !CAL2 &&  use_CAL) use_CAL = false;
451          if( !TOF &&  use_TOF) use_TOF = false;      if( !TOF &&  use_TOF) use_TOF = false;
452        
453        if( !TRK2 ){
454    //      cout << "SortTracks() : without tracker does not work!!! (not yet)" << endl;
455            return;
456        };
457    
458        //   cout << "use_CAL "<<use_CAL<<" use_TOF "<<use_TOF<<" use_TRK "<<use_TRK <<endl;
459        
460        for(Int_t i=0; i < trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks(); i++){
461                    
462          if( !TRK ){          TrkTrack   *ts = 0;
463                  cout << "SortTracks() : without tracker does not work!!! (not yet)" << endl;          CaloTrkVar *cs = 0;
464                  return;          ToFTrkVar  *os = 0;
         };  
465                    
         for(Int_t i=0; i < TrkLevel2::GetNTracks(); i++){  
   
                 TrkTrack *ts = 0;  
   
466          // get tracker tracks          // get tracker tracks
467                  TrkTrack   *tp = TrkLevel2::GetTrack(i);                    //tracker          TrkTrack   *tp = trk2_obj->TrkLevel2::GetTrack(i);                    //tracker
468  //              CaloTrkVar *cp = GetCaloStoredTrack(tp->GetSeqNo());          CaloTrkVar *cp = GetCaloStoredTrack(tp->GetSeqNo());
469  //              ToFTrkVar  *op = GetToFStoredTrack(tp->GetSeqNo());          ToFTrkVar  *op = GetToFStoredTrack(tp->GetSeqNo());
470                  CaloTrkVar *cp = 0;  
471                  ToFTrkVar  *op = 0;          TrkTrack   *ti = 0;              //tracker (image)
472            CaloTrkVar *ci = 0;
473            ToFTrkVar  *oi = 0;
474    //      cout << "trk track n. "<<i << " "<<hex<< tp <<dec<< endl;
475          // if track has an image, check image selection          // if track has an image, check image selection
476                  if(tp->HasImage()){          if(tp->HasImage()){
477                                        
478                          TrkTrack   *ti = TrkLevel2::GetTrackImage(i);              //tracker (image)              ti = trk2_obj->TrkLevel2::GetTrackImage(i);              //tracker (image)
479  //                      CaloTrkVar *ci = GetCaloStoredTrack(ti->GetSeqNo());              ci = GetCaloStoredTrack(ti->GetSeqNo());
480  //                      ToFTrkVar  *oi = GetToFStoredTrack(ti->GetSeqNo());              oi = GetToFStoredTrack(ti->GetSeqNo());
481                          CaloTrkVar *ci = 0;              
482                          ToFTrkVar  *oi = 0;  //          cout << "its image "<<i << " "<<hex<< ti <<dec<< endl;
483    
484              //assign starting scores              //assign starting scores
485                          Int_t tp_score = 0;  //main track sorted by the tracker              Int_t tp_score = 0;  //main track sorted by the tracker
486                          Int_t ti_score = 0;  //image track              Int_t ti_score = 0;  //image track
487                                                                
488              // ------------------------              // ------------------------
489              // calorimeter check              // calorimeter check
490              // ------------------------              // ------------------------
491                  // check the Y spatial residual on the first calorimeter plane              // check the Y spatial residual on the first calorimeter plane
492                  // (cut on calorimeter variables from Emiliano)              // (cut on calorimeter variables from Emiliano)
493                          if(              if( use_CAL && !calo2_obj ){
494                                  use_CAL            &&                  cout << "void PamLevel2::SortTracks(TString how): how= "<<how<<" but CaloLevel2 not loaded !!!";
495                                  npcfit[1] > 15     &&   //no. of fit planes on Y view                  return;
496                                  varcfit[1] < 1000. &&  //fit variance on Y view              };
497                                  true){              if(
498                    use_CAL            &&
499                                  cp = GetCaloStoredTrack(tp->GetSeqNo());                  calo2_obj->npcfit[1] > 15     &&   //no. of fit planes on Y view
500                                  ci = GetCaloStoredTrack(ti->GetSeqNo());                  calo2_obj->varcfit[1] < 1000. &&  //fit variance on Y view
501                                                    true){
502                                  Float_t resy_p = cp->tbar[0][1] - cbar[0][1]; if(resy_p < 0)resy_p= - resy_p;  
503                                  Float_t resy_i = ci->tbar[0][1] - cbar[0][1]; if(resy_i < 0)resy_i= - resy_i;                  
504                    Float_t resy_p = cp->tbar[0][1] - calo2_obj->cbar[0][1]; if(resy_p < 0)resy_p= - resy_p;
505                                  if(resy_p <= resy_i) tp_score++;                  Float_t resy_i = ci->tbar[0][1] - calo2_obj->cbar[0][1]; if(resy_i < 0)resy_i= - resy_i;
506                                  else                 ti_score++;                  
507                          };                  if(resy_p <= resy_i) tp_score++;
508                    else                 ti_score++;
509    
510    //              cout << "CALO "<<tp_score<<ti_score<<endl;
511    
512                };
513              // ------------------------              // ------------------------
514              // TOF check              // TOF check
515              // ------------------------                  // ------------------------    
516                  // check the number of hit pmts along the track              // check the number of hit pmts along the track
517                  // on S12 S21 and S32, where paddles are parallel to Y axis              // on S12 S21 and S32, where paddles are parallel to Y axis
518                          if( use_TOF ){              if( use_TOF && !tof_obj ){
519                                            cout << "void PamLevel2::SortTracks(TString how): how= "<<how<<" but ToFLevel2 not loaded !!!";
520                                  Int_t nphit_p =0;                  return;
521                                  Int_t nphit_i =0;              };
522                                                        if( use_TOF ){
523                                  op = GetToFStoredTrack(tp->GetSeqNo());                  
524                                  oi = GetToFStoredTrack(ti->GetSeqNo());                  Int_t nphit_p =0;
525                                                    Int_t nphit_i =0;
526                    
527                    
528  /*                              cout << "track: npmtadc "<< op->npmtadc << endl;  /*                              cout << "track: npmtadc "<< op->npmtadc << endl;
529                                  cout << "track: npmttdc "<< op->npmttdc << endl;                                  cout << "track: npmttdc "<< op->npmttdc << endl;
530                                  cout << "image: npmtadc "<< oi->npmtadc << endl;                                  cout << "image: npmtadc "<< oi->npmtadc << endl;
531                                  cout << "image: npmttdc "<< oi->npmttdc << endl;*/                                  cout << "image: npmttdc "<< oi->npmttdc << endl;*/
532                                                    
533                                  for (Int_t ih=0; ih < op->npmtadc; ih++){                  for (Int_t ih=0; ih < op->npmtadc; ih++){
534                                          Int_t pl = GetPlaneIndex( (op->pmtadc).At(ih) );                      Int_t pl = tof_obj->GetPlaneIndex( (op->pmtadc).At(ih) );
535                                          if(pl == 1 || pl == 2 || pl == 5)nphit_p++;                      if(pl == 1 || pl == 2 || pl == 5)nphit_p++;
536                                  };                  };
537                                                                            
538                                  for (Int_t ih=0; ih < oi->npmtadc; ih++){                  for (Int_t ih=0; ih < oi->npmtadc; ih++){
539                                          Int_t pl = GetPlaneIndex( (oi->pmtadc).At(ih) );                      Int_t pl = tof_obj->GetPlaneIndex( (oi->pmtadc).At(ih) );
540                                          if(pl == 1 || pl == 2 || pl == 5)nphit_i++;                          if(pl == 1 || pl == 2 || pl == 5)nphit_i++;
541                                  };                  };
542                                                    
543                                  if(                  if(
544                                          use_TOF            &&                      use_TOF            &&
545                                          (nphit_p+nphit_i) !=0 &&                              (nphit_p+nphit_i) !=0 &&    
546                                          true){                      true){
547                                                                
548                                          if( nphit_p >= nphit_i) tp_score++;                      if( nphit_p >= nphit_i) tp_score++;
549                                          else                                              ti_score++;                      else ti_score++;
550                                  };                  };
551                          };  //              cout << "TOF "<<tp_score<<ti_score<<endl;
552                          if(tp_score == ti_score) use_TRK = true;              };
553                  // ------------------------              if(tp_score == ti_score) use_TRK = true;
554                // ------------------------
555              // tracker check              // tracker check
556              // ------------------------              // ------------------------
557                  // chi**2 difference is not always large enough to distinguish among              // chi**2 difference is not always large enough to distinguish among
558                  // the real track and its image.              // the real track and its image.
559                  // Tracker check will be applied always when calorimeter and tof information is ambiguous.              // Tracker check will be applied always when calorimeter and tof information is ambiguous.
560                          if(use_TRK){              if(use_TRK){
561                                  if(      tp->chi2 > 0 && tp->chi2 < ti->chi2 ) tp_score++ ;                  if(      tp->chi2 > 0 && tp->chi2 < ti->chi2 ) tp_score++ ;
562                                  else if( ti->chi2 > 0 && ti->chi2 < tp->chi2 ) ti_score++ ;                  else if( ti->chi2 > 0 && ti->chi2 < tp->chi2 ) ti_score++ ;
563                          };  //              cout << "TRK "<<tp_score<<ti_score<<endl;
564                };
565                
566              // ------------------------              // ------------------------
567              // the winner is....              // the winner is....
568              // ------------------------                  // ------------------------    
569                          if      (tp_score > ti_score) ts = tp;//the track sorted by the tracker!!              if      (tp_score > ti_score) {
570                          else if (tp_score < ti_score) ts = ti;//its image!!  //              ts = tp;//the track sorted by the tracker!!
571                          else {  //              cs = cp;
572                                  ts = tp;  //              os = op;
573  //                              cout << "Warning - track image ambiguity not solved" << endl;              }else if (tp_score < ti_score) {
574  //                              cout << ts->GetNtot() << " "<< ts->chi2 << " " << npcfit[1] << " "<< nphit_p << endl;                  ts = ti;//its image!!
575                          };                  cs = ci;
576                    os = oi;
577    
578                    ti = tp;//its image!!
579                    ci = cp;
580                    oi = op;
581    
582                    tp = ts;//its image!!
583                    cp = cs;
584                    op = os;
585    
                 }else{  
                         ts = tp;  
                 };  
                   
 //              cout <<" SortTracks() "<<i<<" -- "<<ts<<endl;  
                 sorted_tracks->Add(ts);//save the track in the sorted array  
 //              cout << "SortTracks:: sorted_tracks->Add(it) "<<i<<" "<<ts<<endl;  
586                                    
587                }else {
588    //              ts = tp;
589    //              cs = cp;
590    //              os = op;
591    //                              cout << "Warning - track image ambiguity not solved" << endl;
592    //                              cout << ts->GetNtot() << " "<< ts->chi2 << " " << npcfit[1] << " "<< nphit_p << endl;
593                };
594                
595            }else{
596    //          ts = tp;
597    //          cs = cp;
598    //          os = op;
599          };          };
600    //Restore Object count          
601    //To save space in the table keeping track of all referenced objects  //      cout <<" SortTracks() "<<i<<" -- "<<ts<<endl;
602    //we assume that our events do not address each other. We reset the  //      sorted_tracks->Add(ts);//save the track in the sorted array
603    //object count to what it was at the beginning of the event.  //      sorted_tracks.Add(ts);//save the track in the sorted array
604          TProcessID::SetObjectCount(ObjectNumber);  //      sorted_tracks.Add(tp);//save the track in the sorted array
605    //      cout << "SortTracks:: sorted_tracks->Add(it) "<<i<<" "<<ts<<endl;
606    //      cout<<"o "<<tp<<endl;
607    //      cout<<"o "<<cp<<endl;
608    //      cout<<"o "<<op<<endl;
609            new(ttsorted[i]) PamTrack(tp,cp,op);
610            new(ttimage[i])  PamTrack(ti,ci,oi);
611        };
612    
613        if( tsorted->GetEntries() != trk2_obj->GetNTracks() ){
614            cout << "void PamLevel2::SortTracks(TString how): tsorted->GetEntries() "<<tsorted->GetEntries()<<" != trk2_obj->GetNTracks() = "<<trk2_obj->GetNTracks() <<endl;
615            tsorted->Delete(); tsorted=0;
616            timage->Delete(); timage=0;    
617        }
618    
619        //Restore Object count
620        //To save space in the table keeping track of all referenced objects
621        //We reset the object count to what it was at the beginning of the event.
622        TProcessID::SetObjectCount(ObjectNumber);
623        
624  };  };
625  //--------------------------------------  //--------------------------------------
626  //  //
# Line 379  void PamLevel2::SortTracks(TString how){ Line 630  void PamLevel2::SortTracks(TString how){
630   * This method overrides TrkLevel2::GetTracks(), where sorting is done by decreasing number of fit points and increasing chi^2.   * This method overrides TrkLevel2::GetTracks(), where sorting is done by decreasing number of fit points and increasing chi^2.
631   * PamLevel2::GetTracks() keeps the same track order given by TrkLevel2::GetTracks(), but checks image selection by using calorimeter and ToF tracking information.   * PamLevel2::GetTracks() keeps the same track order given by TrkLevel2::GetTracks(), but checks image selection by using calorimeter and ToF tracking information.
632   */   */
633   TRefArray *PamLevel2::GetTracks(){  // TRefArray *PamLevel2::GetTracks(){
634           //  
635  //      SortTracks("+CAL+TOF");  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
636           SortTracks("+CAL+TRK");//TEMP!!!!!!!!!!!!!  //     SortTracks("+CAL+TOF");
637          //  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
638          return sorted_tracks;  
639    // //   return  sorted_tracks;
640    //     return &sorted_tracks;
641        
642    //  };
643    TClonesArray *PamLevel2::GetTracks(){
644    
645    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
646        SortTracks("+CAL+TOF");
647    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
648    
649        return tsorted;
650        
651   };   };
652  //--------------------------------------  //--------------------------------------
653   //   //
# Line 396  void PamLevel2::SortTracks(TString how){ Line 659  void PamLevel2::SortTracks(TString how){
659   * @param it Track number, ranging from 0 to GetNTracks().   * @param it Track number, ranging from 0 to GetNTracks().
660   */   */
661  PamTrack *PamLevel2::GetTrack(int it){  PamTrack *PamLevel2::GetTrack(int it){
662    
663    //    if(!trk2_obj) return 0;
664                    
665  //  *-*-*-*-*-*-*  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
666  //      SortTracks("+CAL+TOF");  //     SortTracks("+CAL+TOF");
667          SortTracks("+CAL+TRK");//TEMP!!!!!!!!!!!!!  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
668  //  *-*-*-*-*-*-*  // //    if(!sorted_tracks)return 0;
669    //     if(sorted_tracks.IsEmpty())return 0;
670          PamTrack *track = 0;  
671            //     PamTrack *track = 0;
672          if( it >=0 && it < TrkLevel2::GetNTracks() ){      
673                  TrkTrack   *t = (TrkTrack*)sorted_tracks->At(it);  //     if( it >=0 && it < trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks() && it<sorted_tracks.GetEntriesFast() ){    
674  //              cout << "GetTrack(int it):: sorted_tracks->At(it) "<<it<<" "<<t<<endl;  //      TrkTrack   *t = (TrkTrack*)sorted_tracks.At(it);
675                  track = GetPamTrackAlong(t);  //      track = GetPamTrackAlong(t);
676          }else{  //     }else{
677                  cout << "PamLevel2::GetTrack(int) : tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;  //      cout << "PamLevel2::GetTrack(int) : tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
678          };  //     };
679                
680          return track;  //     return track;
681    
682    //    cout << "PamLevel2::GetTrack(int it) "<<endl;
683    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
684        SortTracks("+CAL+TOF");
685    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
686        if(!tsorted)return 0;
687        if(!tsorted->GetEntries())return 0;
688    
689        PamTrack *track = 0;
690        
691        if( it >=0 && it < trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()){
692    //      TrkTrack   *t = (TrkTrack*)sorted_tracks.At(it);
693    //      track = GetPamTrackAlong(t);
694            TClonesArray &t = *(tsorted);
695            track = (PamTrack*)t[it];
696            
697        }else{
698            cout << "PamLevel2::GetTrack(int) : tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
699        };
700        
701        return track;
702        
703  };  };
704    
705  //--------------------------------------  //--------------------------------------
# Line 426  PamTrack *PamLevel2::GetTrack(int it){ Line 712  PamTrack *PamLevel2::GetTrack(int it){
712   */   */
713  PamTrack *PamLevel2::GetTrackImage(int it){  PamTrack *PamLevel2::GetTrackImage(int it){
714    
715  //      SortTracks("+CAL+TOF");  //     if(!trk2_obj) return 0;
         SortTracks("+CAL+TRK");//TEMP!!!!!!!!!!!!!  
           
         PamTrack *image = 0;  
716    
717          if( it >=0 && it < TrkLevel2::GetNTracks() ){  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
718                  TrkTrack *temp = (TrkTrack*)sorted_tracks->At(it);  //     SortTracks("+CAL+TOF");
719                  if( temp->HasImage() ){  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
720                          TrkTrack   *t = TrkLevel2::GetStoredTrack(temp->GetImageSeqNo());  // //    if(!sorted_tracks)return 0;
721                          image = GetPamTrackAlong(t);  //     if(sorted_tracks.IsEmpty())return 0;
722                  }else{      
723                          cout <<"PamLevel2::GetTrackImage(int) : Track SeqNo "<<it<<" does not have image"<<endl;  //     PamTrack *image = 0;
724                  };      
725    //     if( it >=0 && it < trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks() ){
726    //      TrkTrack *temp = (TrkTrack*)sorted_tracks.At(it);
727    //      if( temp->HasImage() ){
728    //          TrkTrack   *t = trk2_obj->TrkLevel2::GetStoredTrack(temp->GetImageSeqNo());
729    //          image = GetPamTrackAlong(t);
730    //      }else{
731    //          cout <<"PamLevel2::GetTrackImage(int) : Track SeqNo "<<it<<" does not have image"<<endl;
732    //      };
733    //     }else{
734    //      cout << "PamLevel2::GetTrackImage(int) : Tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
735    //     };
736        
737    //     return image;
738    
739    
740    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
741        SortTracks("+CAL+TOF");
742    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
743        if(!timage)return 0;
744        if(!timage->GetEntries())return 0;
745        
746        PamTrack *image = 0;
747        
748        if( it >=0 && it < trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks() ){
749            TClonesArray &t = *(tsorted);
750            PamTrack *temp = (PamTrack*)t[it];
751            if( temp->GetTrkTrack()->HasImage() ){
752                TClonesArray &t = *(timage);
753                image = (PamTrack*)t[it];
754          }else{          }else{
755                  cout << "PamLevel2::GetTrackImage(int) : Tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;  //          cout <<"PamLevel2::GetTrackImage(int) : Track SeqNo "<<it<<" does not have image"<<endl;
756          };          };
757        }else{
758            cout << "PamLevel2::GetTrackImage(int) : Tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
759        };
760            
761          return image;      return image;
762  }  }
763    
764  //--------------------------------------  //--------------------------------------
# Line 456  PamTrack *PamLevel2::GetTrackImage(int i Line 771  PamTrack *PamLevel2::GetTrackImage(int i
771   * @param detlist String to select trees to be included   * @param detlist String to select trees to be included
772   * @return Pointer to a TTree   * @return Pointer to a TTree
773   */   */
774  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, TString detlist="+ALL"){  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, TString detlist ){
775    
776    //     if( !detlist.IsNull() ) SetWhichTrees(detlist);
777    //     else                    GetWhichTrees(f);
778        SetWhichTrees(detlist);
779    
780        TTree *Trout =0;
781    
782        TString fname = f->GetName();
783        if(!CheckLevel2File(fname))return NULL;
784    
785        UInt_t *found=0;    
786    
787        cout<< "GetPamTree(TFile*,TString): detector list --> ";
788        if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
789        if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
790        if(TRKh)cout<<"TRKH ";
791        if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
792        if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
793        if(TOF)cout<<"TOF ";
794        if(TRG)cout<<"TRG ";
795        if(AC)cout<<"AC ";
796        if(ND)cout<<"ND ";
797        if(S4)cout<<"S4 ";
798        if(ORB)cout<<"ORB ";
799        cout << endl;
800    
801        f->cd();
802    
 //      cout << "WARNING!!! -- obsolete method -- \n";  
 //      cout << "better use TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList*, TString) \n";  
           
         TTree *Trout =0;  
           
         SetWhichTrees(detlist);  
803  // Tracker  // Tracker
804      TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");      TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");
805      if(T && TRK) {      if(T && (TRK2||TRK1||TRKh)) {
806                  if(TRK_L1){          if(TRK2)T->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerTo("TrkLevel2"));
807                          T->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerToTrk(1));          else    T->SetBranchStatus("TrkLevel2",0,found);
808                          cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;          if(TRK2)cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;
809                  };          if(TRK1)T->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel1"));
810                  T->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerToTrk(2));          else    T->SetBranchStatus("TrkLevel1",0,found);
811                  cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;          if(TRK1)cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;
812                  Trout=T;          if(TRKh)T->SetBranchAddress("TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
813            else    T->SetBranchStatus("TrkHough",0,found);
814            if(TRKh)cout << "Tracker      : set branch address TrkHough"<<endl;
815            if(!Trout)Trout=T;
816            else Trout->AddFriend(T);
817      }else{      }else{
818          cout << "Tracker      : missing tree"<<endl;          cout << "Tracker      : missing tree"<<endl;
819      };      };
820      // Calorimeter      // Calorimeter
821      TTree *C = (TTree*)f->Get("Calorimeter");      TTree *C = (TTree*)f->Get("Calorimeter");
822      if(C && CAL) {      if(C && (CAL2||CAL1)) {
823          C->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerToCalo());          if(CAL2)C->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
824          cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;          else    C->SetBranchStatus("CaloLevel2",0,found);
825            if(CAL2)cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;
826            if(CAL1)C->SetBranchAddress("CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
827            else    C->SetBranchStatus("CaloLevel1",0,found);
828            if(CAL1)cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel1"<<endl;
829          if(!Trout)Trout=C;          if(!Trout)Trout=C;
830          else Trout->AddFriend(C);          else Trout->AddFriend(C);
831      }else{      }else{
832          cout << "Calorimeter  : missing tree"<<endl;          cout << "Calorimeter  : missing tree"<<endl;
833      };      };
834    
835      // ToF          // ToF    
836      TTree *O = (TTree*)f->Get("ToF");      TTree *O = (TTree*)f->Get("ToF");
837      if(O && TOF) {      if(O && TOF) {
838          O->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerToToF());          O->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
839          cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;          cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;
840          if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
841          else Trout->AddFriend(O);          else Trout->AddFriend(O);
# Line 500  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 845  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
845      // Trigger      // Trigger
846      TTree *R = (TTree*)f->Get("Trigger");      TTree *R = (TTree*)f->Get("Trigger");
847      if(R && TRG) {      if(R && TRG) {
848          R->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerToTrig());          R->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
849          cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;          cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;
850          if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
851          else Trout->AddFriend(R);          else Trout->AddFriend(R);
# Line 510  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 855  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
855      // S4      // S4
856      TTree *S = (TTree*)f->Get("S4");      TTree *S = (TTree*)f->Get("S4");
857      if(S && S4) {      if(S && S4) {
858          S->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerToS4());          S->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
859          cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;          cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;
860          if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
861          else Trout->AddFriend(S);          else Trout->AddFriend(S);
# Line 520  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 865  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
865      // Neutron Detector      // Neutron Detector
866      TTree *N = (TTree*)f->Get("NeutronD");      TTree *N = (TTree*)f->Get("NeutronD");
867      if(N && ND) {      if(N && ND) {
868          N->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerToND());          N->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
869          cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;          cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;
870          if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
871          else Trout->AddFriend(N);          else Trout->AddFriend(N);
# Line 530  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 875  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
875      // Anticounters      // Anticounters
876      TTree *A = (TTree*)f->Get("Anticounter");      TTree *A = (TTree*)f->Get("Anticounter");
877      if(A && AC) {      if(A && AC) {
878          A->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerToAc());          A->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
879          cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;          cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;
880          if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
881          else Trout->AddFriend(A);          else Trout->AddFriend(A);
# Line 538  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 883  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
883          cout << "Anticounter  : missing tree"<<endl;          cout << "Anticounter  : missing tree"<<endl;
884      };      };
885      // Orbital Info      // Orbital Info
886          TTree *B = (TTree*)f->Get("OrbitalInfo");      TTree *B = (TTree*)f->Get("OrbitalInfo");
887          if(B && ORB) {      if(B && ORB) {
888                  B->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerToOrb());          B->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
889                  cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;          cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;
890                  if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
891                  else Trout->AddFriend(B);          else Trout->AddFriend(B);
892          }else{      }else{
893                  cout << "OrbitalInfo  : missing tree"<<endl;          cout << "OrbitalInfo  : missing tree"<<endl;
894          };      };
895            
896          cout<<endl<<" Number of entries: "<<Trout->GetEntries()<<endl<<endl;      cout<<endl<<" Number of entries: "<<Trout->GetEntries()<<endl<<endl;
897                
898          return Trout;      return Trout;
899            
900  }  }
901  //--------------------------------------  //--------------------------------------
# Line 566  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 911  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
911   */   */
912  TList*  PamLevel2::GetListOfLevel2Files(TString ddir, TString flisttxt = ""){  TList*  PamLevel2::GetListOfLevel2Files(TString ddir, TString flisttxt = ""){
913                    
914          TString wdir = gSystem->WorkingDirectory();          TString wdir = gSystem->WorkingDirectory();
915                
916          if(ddir=="")ddir = wdir;      if(ddir=="")ddir = wdir;
917  //      TSystemDirectory *datadir = new TSystemDirectory(gSystem->BaseName(ddir),ddir);  //      TSystemDirectory *datadir = new TSystemDirectory(gSystem->BaseName(ddir),ddir);
918          cout << "Level2 data directory : "<<  ddir << endl;      cout << "Level2 data directory : "<<  ddir << endl;
919                        
920          TList *contents  = new TList; // create output list      TList *contents  = new TList; // create output list
921          contents->SetOwner();      contents->SetOwner();
922        
923    //    char *fullpath;
924        const char *fullpath;
925        
926        // if no input file list is given:  
927        if ( flisttxt != "" ){
928                    
929          char *fullpath;  //      if( !gSystem->IsFileInIncludePath(flisttxt,&fullpath) ){        
930                            if( !(fullpath = gSystem->FindFile("./",flisttxt)) ){
931          // if no input file list is given:                    cout <<"File "<<flisttxt<<" not found"<<endl;
932          if ( flisttxt != "" ){              return 0;
933                                            }      
                 if( !gSystem->IsFileInIncludePath(flisttxt,&fullpath) )return 0;  
                   
934  //              flisttxt = gSystem->ConcatFileName(gSystem->DirName(flisttxt),gSystem->BaseName(flisttxt));  //              flisttxt = gSystem->ConcatFileName(gSystem->DirName(flisttxt),gSystem->BaseName(flisttxt));
935                  flisttxt = fullpath;          flisttxt = fullpath;
936                    
937                  if( !gSystem->ChangeDirectory(ddir) )return 0;          if( !gSystem->ChangeDirectory(ddir) ){
938                cout << "Cannot change directory : "<<ddir<<endl;
939                return 0;
940            }
941                    
942                  cout <<"Input file list : " << flisttxt <<endl;          cout <<"Input file list : " << flisttxt <<endl;
943                  ifstream in;          ifstream in;
944                  in.open(flisttxt, ios::in); //open input file list          in.open(flisttxt, ios::in); //open input file list
945                  while (1) {          int line=0;
946                          TString file;          while (1) {
947                          in >> file;              TString file;
948                          if (!in.good()) break;              in >> file;
949                          if( gSystem->IsFileInIncludePath(file,&fullpath) ){              if (!in.good()) break;
950  //                              contents->Add(new TSystemDirectory(fullpath,ddir)); // add file to the list              line++;
951  //                              contents->Add(new TSystemFile(fullpath,ddir)); // add file to the list  //          cout <<"(1) " << file << endl;
952                                  contents->Add(new TSystemFile(fullpath,gSystem->DirName(fullpath)));// add file to the list              if(file.IsNull()){
953                          }else{                  cout << "-- list interrupted at line "<<line <<endl;
954                                  cout << "warning! --- File "<<file<<" does not exists"<< endl;                  break;
955                          };              }
956                  };              if(file.Contains("#"))file = file(0,file.First("#"));
957                  in.close();  //          cout <<"(2) " << file << endl;
958                    //          if( gSystem->IsFileInIncludePath(file,&fullpath) ){
959          }else{              if( (fullpath = gSystem->FindFile(ddir,file)) ){
960    
961                    contents->Add(new TSystemFile(fullpath,gSystem->DirName(fullpath)));// add file to the list
962    
963                }else{
964    //              if(file.Data()!="")cout << "File: "<<file<<" ---> missing "<< endl;
965                };
966            };
967            in.close();
968                    
969                  cout << "No input file list given."<<endl;      }else{
970                  cout << "Check for existing root files."<<endl;          
971            cout << "No input file list given."<<endl;
972            cout << "Check for existing root files."<<endl;
973  //              cout << "Warking directory: "<< gSystem->WorkingDirectory()<< endl;  //              cout << "Warking directory: "<< gSystem->WorkingDirectory()<< endl;
974                            
975                  TSystemDirectory *datadir = new TSystemDirectory(gSystem->BaseName(ddir),ddir);          TSystemDirectory *datadir = new TSystemDirectory(gSystem->BaseName(ddir),ddir);
976                  TList *temp = datadir->GetListOfFiles();          TList *temp = datadir->GetListOfFiles();
977  //              temp->Print();  //              temp->Print();
978  //              cout << "*************************************" << endl;  //              cout << "*************************************" << endl;
                   
                 TIter next(temp);  
                 TSystemFile *questo = 0;  
                   
                   
                 while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {  
                         TString name =  questo-> GetName();  
                         if( name.EndsWith(".root") ){  
                                 char *fullpath;  
                                 gSystem->IsFileInIncludePath(name,&fullpath);  
                                 contents->Add(new TSystemFile(fullpath,gSystem->DirName(fullpath)));  
                         };  
                 }  
                 delete temp;  
                 delete datadir;  
979                    
980          };          TIter next(temp);
981          gSystem->ChangeDirectory(wdir); // back to the working directory          TSystemFile *questo = 0;
982            
983            
984            while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {
985                TString name =  questo-> GetName();
986                if( name.EndsWith(".root") ){
987                    const char *fullpath = gSystem->FindFile(ddir,name);
988    //              char *fullpath;
989    //              gSystem->IsFileInIncludePath(name,&fullpath);
990                    contents->Add(new TSystemFile(fullpath,gSystem->DirName(fullpath)));
991                };
992            }
993            delete temp;
994            delete datadir;
995            
996        };
997        gSystem->ChangeDirectory(wdir); // back to the working directory
998  //      cout << endl << "Selected files:" << endl;  //      cout << endl << "Selected files:" << endl;
999  //      contents->Print();  //      contents->Print();
1000          cout << contents->GetEntries()<<" files selected\n";      cout << contents->GetEntries()<<" files selected\n";
1001  //      cout << endl;  //      cout << endl;
1002  //      cout << "Working directory: "<< gSystem->WorkingDirectory()<< endl;  //      cout << "Working directory: "<< gSystem->WorkingDirectory()<< endl;
1003          return contents;      return contents;
1004  };  };
1005  //--------------------------------------  //--------------------------------------
1006  //  //
# Line 649  TList*  PamLevel2::GetListOfLevel2Files( Line 1012  TList*  PamLevel2::GetListOfLevel2Files(
1012   * @param detlist String to select trees to be included   * @param detlist String to select trees to be included
1013   * @return Pointer to a TChain   * @return Pointer to a TChain
1014   */   */
1015  TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList *fl, TString detlist="+ALL"){  TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList *fl, TString detlist ){
1016        
1017        TChain *Trout =0;
1018    
1019  //      TChain *Tout=0;  //    if( !detlist.IsNull() )SetWhichTrees(detlist);
1020          if(Tout)Tout->Delete();      SetWhichTrees(detlist);
1021          Tout = NULL;      
1022                cout<< "GetPamTree(TList*,TString): input detector list --> ";
1023          SetWhichTrees(detlist);      if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
1024                if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
1025          TChain *T = 0;        if(TRKh)cout<<"TRKH ";
1026          TChain *C = 0;      if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
1027          TChain *O = 0;      if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
1028          TChain *R = 0;      if(TOF)cout<<"TOF ";
1029          TChain *S = 0;      if(TRG)cout<<"TRG ";
1030          TChain *N = 0;      if(AC)cout<<"AC ";
1031          TChain *A = 0;      if(ND)cout<<"ND ";
1032          TChain *B = 0;      if(S4)cout<<"S4 ";
1033                if(ORB)cout<<"ORB ";
1034          if(TRK) T = new TChain("Tracker");            cout << endl;
1035          if(CAL) C = new TChain("Calorimeter");  
1036          if(TOF) O = new TChain("ToF");      TChain *T = 0;      
1037          if(TRG) R = new TChain("Trigger");      TChain *C = 0;
1038          if(S4)  S = new TChain("S4");      TChain *O = 0;
1039          if(ND)  N = new TChain("NeutronD");      TChain *R = 0;
1040          if(AC)  A = new TChain("Anticounter");      TChain *S = 0;
1041          if(ORB) B = new TChain("OrbitalInfo");      TChain *N = 0;
1042                TChain *A = 0;
1043          // loop over files and create chains          TChain *B = 0;
1044          TIter next(fl);      
1045          TSystemFile *questo = 0;      if(TRK2||TRK1||TRKh) T = new TChain("Tracker");    
1046          while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {      if(CAL2||CAL1)       C = new TChain("Calorimeter");
1047                  TString name =  questo->GetName();      if(TOF)              O = new TChain("ToF");
1048  //              cout << "File: "<< name << endl;      if(TRG)              R = new TChain("Trigger");
1049                  if( CheckLevel2File(name) ){      if(S4)               S = new TChain("S4");
1050                          if(TRK) T->Add(name);      if(ND)               N = new TChain("NeutronD");
1051                          if(CAL) C->Add(name);      if(AC)               A = new TChain("Anticounter");
1052                          if(TOF) O->Add(name);      if(ORB)              B = new TChain("OrbitalInfo");
1053                          if(TRG) R->Add(name);      
1054                          if(S4)  S->Add(name);      // loop over files and create chains        
1055                          if(ND)  N->Add(name);      TIter next(fl);
1056                          if(AC)  A->Add(name);      TSystemFile *questo = 0;
1057                          if(ORB) B->Add(name);      while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {
1058                  };          TString name =  questo->GetName();
1059          }          cout << "File: "<< name << endl;
1060                            if( CheckLevel2File(name) ){
1061              // Tracker              if(TRK2||TRK1||TRKh) T->Add(name);
1062          if(TRK) if(!Tout)Tout=T;              if(CAL1||CAL2)       C->Add(name);
1063                            if(TOF)              O->Add(name);
1064          // Calorimeter              if(TRG)              R->Add(name);
1065          if(CAL) {                            if(S4)               S->Add(name);
1066                  if(!Tout)Tout=C;              if(ND)               N->Add(name);
1067                  else Tout->AddFriend("Calorimeter");              if(AC)               A->Add(name);
1068                if(ORB)              B->Add(name);
1069          };          };
1070                }
1071        
1072        cout << "done chain \n";
1073    
1074        UInt_t *found=0;
1075    // Tracker
1076        if(T && (TRK2||TRK1||TRKh)) {
1077            if(TRK2)T->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerTo("TrkLevel2"));
1078            else    T->SetBranchStatus("TrkLevel2",0,found);
1079            if(TRK2)cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;
1080            if(TRK1)T->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel1"));
1081            else    T->SetBranchStatus("TrkLevel1",0,found);
1082            if(TRK1)cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;
1083            if(TRKh)T->SetBranchAddress("TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
1084            else    T->SetBranchStatus("TrkHough",0,found);
1085            if(TRKh)cout << "Tracker      : set branch address TrkHough"<<endl;
1086            if(!Trout)Trout=T;
1087            else Trout->AddFriend("Tracker");
1088        }else{
1089            cout << "Tracker      : missing tree"<<endl;
1090        };
1091        // Calorimeter
1092        if(C && (CAL2||CAL1)) {
1093            if(CAL2)C->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
1094            else    C->SetBranchStatus("CaloLevel2",0,found);
1095            if(CAL2)cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;
1096            if(CAL1)C->SetBranchAddress("CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
1097            else    C->SetBranchStatus("CaloLevel1",0,found);
1098            if(CAL1)cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel1"<<endl;
1099            if(!Trout)Trout=C;
1100            else Trout->AddFriend("Calorimeter");
1101        }else{
1102            cout << "Calorimeter  : missing tree"<<endl;
1103        };
1104      // ToF          // ToF    
1105          if(TOF) {      if(O && TOF) {
1106                  if(!Tout)Tout=O;          O->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
1107                  else Tout->AddFriend("ToF");          cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;
1108          };          if(!Trout)Trout=O;
1109            else Trout->AddFriend("ToF");
1110        }else{
1111            cout << "ToF         : missing tree"<<endl;
1112        };
1113      // Trigger      // Trigger
1114          if(TRG) {      if(R && TRG) {
1115                  if(!Tout)Tout=O;          R->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
1116                  else Tout->AddFriend("Trigger");          cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;
1117          };          if(!Trout)Trout=O;
1118            else Trout->AddFriend("Trigger");
1119        }else{
1120            cout << "Trigger      : missing tree"<<endl;
1121        };
1122      // S4      // S4
1123          if(S4) {      if(S && S4) {
1124                  if(!Tout)Tout=O;          S->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
1125                  else Tout->AddFriend("S4");          cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;
1126          };          if(!Trout)Trout=O;
1127            else Trout->AddFriend("S4");
1128        }else{
1129            cout << "S4           : missing tree"<<endl;
1130        };
1131      // Neutron Detector      // Neutron Detector
1132          if(ND) {      if(N && ND) {
1133                  if(!Tout)Tout=O;          N->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
1134                  else Tout->AddFriend("NeutronD");          cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;
1135          };          if(!Trout)Trout=O;
1136      // Anticounters          else Trout->AddFriend("NeutronD");
1137          if(AC) {      }else{
1138                  if(!Tout)Tout=O;          cout << "NeutronD     : missing tree"<<endl;
1139                  else Tout->AddFriend("Anticounter");      };
1140          };      // Anticounters
1141      // OrbitalInfo      if(A && AC) {
1142          if(ORB) {          A->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
1143                  if(!Tout)Tout=O;          cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;
1144                  else Tout->AddFriend("OrbitalInfo");          if(!Trout)Trout=O;
1145          };          else Trout->AddFriend("Anticounter");
1146                }else{
1147          cout<<endl<<" Number of entries: "<<Tout->GetEntries()<<endl<<endl;          cout << "Anticounter  : missing tree"<<endl;
1148                };
1149          PamLevel2::SetBranchAddress();      // Orbital Info
1150                if(B && ORB) {
1151          return Tout;          B->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
1152            cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;
1153            if(!Trout)Trout=O;
1154            else Trout->AddFriend("OrbitalInfo");
1155        }else{
1156            cout << "OrbitalInfo  : missing tree"<<endl;
1157        };
1158        
1159    //    cout<<endl<<" Number of entries: "<<Trout->GetEntries()<<endl<<endl;
1160    
1161        
1162    //     // Tracker
1163    //     if(TRK2||TRK1||TRKh){
1164    //      if(!Tout)Tout=T;
1165    //      else Tout->AddFriend("Tracker");
1166    //     }
1167    //     // Calorimeter
1168    //     if(CAL2||CAL1) {        
1169    //      if(!Tout)Tout=C;
1170    //      else Tout->AddFriend("Calorimeter");
1171    //     };
1172    //     // ToF    
1173    //     if(TOF) {
1174    //      if(!Tout)Tout=O;
1175    //      else Tout->AddFriend("ToF");
1176    //     };
1177    //     // Trigger
1178    //     if(TRG) {
1179    //      if(!Tout)Tout=R;
1180    //      else Tout->AddFriend("Trigger");
1181    //     };
1182    //     // S4
1183    //     if(S4) {
1184    //      if(!Tout)Tout=S;
1185    //      else Tout->AddFriend("S4");
1186    //     };
1187    //     // Neutron Detector
1188    //     if(ND) {
1189    //      if(!Tout)Tout=N;
1190    //      else Tout->AddFriend("NeutronD");
1191    //     };
1192    //     // Anticounters
1193    //     if(AC) {
1194    //      if(!Tout)Tout=A;
1195    //      else Tout->AddFriend("Anticounter");
1196    //     };
1197    //     // OrbitalInfo
1198    //     if(ORB) {
1199    //      if(!Tout)Tout=B;
1200    //      else Tout->AddFriend("OrbitalInfo");
1201    //     };
1202        
1203    //    cout<<endl<<" Number of entries: "<<Tout->GetEntries()<<endl<<endl;
1204        
1205    //    if( Tout->GetEntries() )PamLevel2::SetBranchAddress( Tout );
1206        
1207        return Trout;
1208  }  }
1209    
1210    
1211    
1212  //--------------------------------------  //--------------------------------------
1213  //  //
1214  //  //
# Line 746  TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList *fl, Line 1216  TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList *fl,
1216  /**  /**
1217   * Set branch addresses for Pamela friend trees   * Set branch addresses for Pamela friend trees
1218   */   */
1219  void PamLevel2::SetBranchAddress(){  void PamLevel2::SetBranchAddress(TTree *t){
1220    
1221        TRK2    = TRK2 & t->GetBranchStatus("TrkLevel2");
1222        TRK1    = TRK1 & t->GetBranchStatus("TrkLevel1");
1223        TRKh    = TRKh & t->GetBranchStatus("TrkHough");
1224        CAL2    = CAL2 & t->GetBranchStatus("CaloLevel2");
1225        CAL1    = CAL1 & t->GetBranchStatus("CaloLevel1");
1226        TOF    = TOF & t->GetBranchStatus("ToFLevel2");
1227        TRG    = TRG & t->GetBranchStatus("TrigLevel2");
1228        S4     = S4  & t->GetBranchStatus("S4Level2");
1229        ND     = ND  & t->GetBranchStatus("NDLevel2");
1230        AC     = AC  & t->GetBranchStatus("AcLevel2");
1231        ORB    = ORB & t->GetBranchStatus("OrbitalInfo");
1232    
1233    
1234      // Tracker      // Tracker
1235          if(TRK) {      if(TRK1) {
1236                  if(TRK_L1){          t->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel2"));
1237                          Tout->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerToTrk(1));          cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;
1238                          cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;      };
1239                  };      if(TRK2) {
1240                  Tout->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerToTrk(2));          t->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerTo("TrkLevel1"));
1241                  cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;          cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;
1242          };      };
1243                    if(TRKh) {
1244          // Calorimeter          t->SetBranchAddress("TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
1245          if(CAL) {          cout << "Tracker      : set branch address TrkHough"<<endl;
1246                  Tout->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerToCalo());      };
1247                  cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;      
1248          };      // Calorimeter
1249                if(CAL1) {
1250            t->SetBranchAddress("CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
1251            cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel1"<<endl;
1252        };
1253        if(CAL2) {
1254            t->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
1255            cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;
1256        };
1257        
1258      // ToF          // ToF    
1259          if(TOF) {      if(TOF) {
1260                  Tout->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerToToF());          t->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
1261                  cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;          cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;
1262          };      };
1263      // Trigger      // Trigger
1264          if(TRG) {      if(TRG) {
1265                  Tout->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerToTrig());          t->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
1266                  cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;          cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;
1267          };      };
1268      // S4      // S4
1269          if(S4) {      if(S4) {
1270                  Tout->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerToS4());          t->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
1271                  cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;          cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;
1272          };      };
1273      // Neutron Detector      // Neutron Detector
1274          if(ND) {      if(ND) {
1275                  Tout->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerToND());          t->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
1276                  cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;          cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;
1277          };      };
1278      // Anticounters      // Anticounters
1279          if(AC) {      if(AC) {
1280                  Tout->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerToAc());          t->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
1281                  cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;          cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;
1282          };      };
1283      // OrbitalInfo      // OrbitalInfo
1284          if(ORB) {      if(ORB) {
1285                  Tout->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerToOrb());          t->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
1286                  cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;          cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;
1287          };      };
1288                
1289  }  }
1290    /**
1291     * Set branch addresses for Pamela friend trees
1292     */
1293    void PamLevel2::SetBranchAddress(TChain *t){
1294    
1295        TRK2    = TRK2 & t->GetBranchStatus("TrkLevel2");
1296        TRK1    = TRK1 & t->GetBranchStatus("TrkLevel1");
1297        TRKh    = TRKh & t->GetBranchStatus("TrkHough");
1298        CAL1    = CAL1 & t->GetBranchStatus("CaloLevel1");
1299        CAL2    = CAL2 & t->GetBranchStatus("CaloLevel2");
1300        TOF    = TOF & t->GetBranchStatus("ToFLevel2");
1301        TRG    = TRG & t->GetBranchStatus("TrigLevel2");
1302        S4     = S4  & t->GetBranchStatus("S4Level2");
1303        ND     = ND  & t->GetBranchStatus("NDLevel2");
1304        AC     = AC  & t->GetBranchStatus("AcLevel2");
1305        ORB    = ORB & t->GetBranchStatus("OrbitalInfo");
1306    
1307        // Tracker
1308         if(TRK2) {
1309            t->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerTo("TrkLevel2"));
1310            cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;
1311        };
1312        if(TRK1) {
1313            t->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel1"));
1314            cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;
1315        };
1316         if(TRKh) {
1317            t->SetBranchAddress("TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
1318            cout << "Tracker      : set branch address TrkHough"<<endl;
1319         };
1320        
1321        // Calorimeter
1322        if(CAL2) {
1323            t->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
1324            cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;
1325        };  
1326        if(CAL1) {
1327            t->SetBranchAddress("CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
1328            cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel1"<<endl;
1329        };
1330        
1331        // ToF    
1332        if(TOF) {
1333            t->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
1334            cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;
1335        };
1336        // Trigger
1337        if(TRG) {
1338            t->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
1339            cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;
1340        };
1341        // S4
1342        if(S4) {
1343            t->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
1344            cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;
1345        };
1346        // Neutron Detector
1347        if(ND) {
1348            t->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
1349            cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;
1350        };
1351        // Anticounters
1352        if(AC) {
1353            t->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
1354            cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;
1355        };
1356        // OrbitalInfo
1357        if(ORB) {
1358            t->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
1359            cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;
1360        };
1361        
1362    }
1363    
1364    
 //--------------------------------------  
 //  
 //  
 //--------------------------------------  
 void *PamLevel2::GetPointerTo(const char* c ){  
 //      cout << "objname "<< objname << endl;  
         TString objname = c;  
         if(!objname.CompareTo("TrkLevel1"))return &trk_l1_obj;  
         if(!objname.CompareTo("TrkLevel2"))return &trk_obj;  
           
         return NULL;  
 };  
1365  //--------------------------------------  //--------------------------------------
1366  //  //
1367  //  //
# Line 819  void *PamLevel2::GetPointerTo(const char Line 1373  void *PamLevel2::GetPointerTo(const char
1373   */   */
1374  TChain *PamLevel2::GetRunTree(TList *fl){  TChain *PamLevel2::GetRunTree(TList *fl){
1375                    
1376          TChain *R = new TChain("Run");      TChain *R = new TChain("Run");
1377        
1378          // loop over files and create chains          // loop over files and create chains        
1379          TIter next(fl);      TIter next(fl);
1380          TSystemFile *questo = 0;      TSystemFile *questo = 0;
1381          while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {      while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {
1382                  TString name =  questo->GetName();          TString name =  questo->GetName();
1383  //              cout << "File: "<< name << endl;  //              cout << "File: "<< name << endl;
1384                  if( CheckLevel2File(name) ){          if( CheckLevel2File(name) ){
1385                          R->Add(name);              R->Add(name);
1386                  };          };
1387          }      }
           
         R->SetBranchAddress("RunInfo", GetPointerToRun());  
         cout << "Run         : set branch address RunInfo"<<endl;  
1388            
1389          return R;      R->SetBranchAddress("RunInfo", GetPointerTo("RunInfo"));
1390        cout << "Run         : set branch address RunInfo"<<endl;
1391        R->SetBranchAddress("SoftInfo", GetPointerTo("SoftInfo")); // Emiliano
1392        cout << "Software    : set branch address SoftInfo"<<endl; // Emiliano
1393        
1394        return R;
1395            
1396  }  }
1397  //--------------------------------------  //--------------------------------------
# Line 850  TChain *PamLevel2::GetRunTree(TList *fl) Line 1406  TChain *PamLevel2::GetRunTree(TList *fl)
1406  TTree *PamLevel2::GetRunTree(TFile *f){  TTree *PamLevel2::GetRunTree(TFile *f){
1407    
1408    
1409          TTree *R = (TTree*)f->Get("Run");      TTree *R = (TTree*)f->Get("Run");
   
         R->SetBranchAddress("RunInfo", GetPointerToRun());  
         cout << "Run         : set branch address RunInfo"<<endl;  
1410            
1411          return R;      R->SetBranchAddress("RunInfo", GetPointerTo("RunInfo"));
1412        cout << "Run         : set branch address RunInfo"<<endl;
1413        R->SetBranchAddress("SoftInfo", GetPointerTo("SoftInfo")); // Emiliano
1414        cout << "Software    : set branch address SoftInfo"<<endl; // Emiliano
1415        
1416        return R;
1417            
1418  }  }
1419    /**
1420     * Update the runinfo informations (to be used to have Run infos event by event basis)
1421     * @param run Pointer to the chain/tree which contains run infos
1422     * @return true if a new run has been read, false if it is still the same run
1423     */
1424    Bool_t PamLevel2::UpdateRunInfo(TChain *run, ULong64_t iev){
1425      //
1426      // check if we have already called once GetEntry, if not call it
1427      //
1428      if ( run->GetEntries() <= 0 ) return(false);
1429      //
1430      Int_t oldrun = irun;
1431      if ( irun < 0 ){
1432        irun = 0;
1433        run->GetEntry(0);
1434        runfirstentry = 0ULL;
1435        runlastentry += (ULong64_t)(this->GetRunInfo()->NEVENTS) - 1ULL;
1436      };
1437      while ( iev > (runfirstentry+(ULong64_t)(this->GetRunInfo()->NEVENTS-1)) && irun < run->GetEntries() ){
1438        //    printf(" iev %llu %u %llu \n",iev,this->GetRunInfo()->NEVENTS,(ULong64_t)(runfirstentry+(ULong64_t)(this->GetRunInfo()->NEVENTS)));
1439        irun++;
1440        run->GetEntry(irun);
1441        runfirstentry = runlastentry+1ULL;
1442        runlastentry += (ULong64_t)(this->GetRunInfo()->NEVENTS);
1443      };
1444      //
1445      if ( irun == oldrun || irun >= run->GetEntries() ) return(false);
1446      //
1447      //  printf(" iev %llu irun %i nevents %u 1st %llu last %llu \n",iev,irun,this->GetRunInfo()->NEVENTS,(ULong64_t)runfirstentry,(ULong64_t)runlastentry);
1448      //
1449      return(true);    
1450      //
1451    };
1452    /**
1453     * Update the runinfo informations (to be used to have Run infos event by event basis)
1454     * @param run Pointer to the chain/tree which contains run infos
1455     * @return true if a new run has been read, false if it is still the same run
1456     */
1457    Bool_t PamLevel2::UpdateRunInfo(TTree *run, ULong64_t iev){
1458      return(UpdateRunInfo((TChain*)run,iev));
1459    };
1460    
1461  //--------------------------------------  //--------------------------------------
1462  //  //
1463  //  //
1464  //--------------------------------------  //--------------------------------------
1465  /**  /**
1466   * Set which trees should be analysed   * Set which trees shoul be analysed
1467   * @param detlist TString containing the sequence of trees required   * @param detlist TString containing the sequence of trees required
1468  */  */
1469  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString detlist){  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString detlist){
1470                    
1471          if(detlist.Contains("+ALL", TString::kIgnoreCase)){      if(detlist.IsNull() || detlist.Contains("+ALL", TString::kIgnoreCase)){
1472                  CAL = true;          CAL1 = true;
1473                  TRK = true;          CAL2 = true;
1474                  TRK_L1 = false;          TRK2 = true;
1475                  TRG = true;          TRK1 = false;
1476                  TOF = true;          TRKh = false;
1477                  S4  = true;          TRG = true;
1478                  ND  = true;          TOF = true;
1479                  AC  = true;          S4  = true;
1480                  ORB = true;          ND  = true;
1481          }else if( detlist.Contains("-ALL", TString::kIgnoreCase) ){          AC  = true;
1482                  CAL = false;          ORB = true;
1483                  TRK = false;      }else if( detlist.Contains("-ALL", TString::kIgnoreCase) ){
1484                  TRK_L1 = false;          CAL1 = false;
1485                  TRG = false;          CAL2 = false;
1486                  TOF = false;          TRK2 = false;
1487                  S4  = false;          TRK1 = false;
1488                  ND  = false;          TRKh = false;
1489                  AC  = false;          TRG = false;
1490                  ORB = false;          TOF = false;
1491          };          S4  = false;
1492                    ND  = false;
1493          if( detlist.Contains("-CAL", TString::kIgnoreCase) )CAL = false;          AC  = false;
1494          else if( detlist.Contains("+CAL", TString::kIgnoreCase) )CAL = true;          ORB = false;
1495                };
1496          if( detlist.Contains("-TRK", TString::kIgnoreCase) )TRK = false;      
1497          else if( detlist.Contains("+TRK", TString::kIgnoreCase) )TRK = true;  //  -------------------------------------------------------------------------
1498                if( detlist.Contains("CAL1", TString::kIgnoreCase) ){
1499          if( detlist.Contains("-TRK1", TString::kIgnoreCase) )TRK_L1 = false;          if ( detlist.Contains("-CAL1", TString::kIgnoreCase) )CAL1=false;
1500          else if( detlist.Contains("+TRK1", TString::kIgnoreCase) )TRK_L1 = true;          if ( detlist.Contains("+CAL1", TString::kIgnoreCase) )CAL1=true;
1501                };
         if( detlist.Contains("-TRG", TString::kIgnoreCase) )TRG = false;  
         else if( detlist.Contains("+TRG", TString::kIgnoreCase) )TRG = true;  
1502                    
1503          if( detlist.Contains("-TOF", TString::kIgnoreCase) )TOF = false;      if( detlist.Contains("CAL2", TString::kIgnoreCase)){
1504          else if( detlist.Contains("+TOF", TString::kIgnoreCase) )TOF = true;          if ( detlist.Contains("-CAL2", TString::kIgnoreCase) )CAL2=false;
1505            if ( detlist.Contains("+CAL2", TString::kIgnoreCase) )CAL2=true;
1506        };
1507                    
1508          if( detlist.Contains("-S4",  TString::kIgnoreCase) )S4  = false;      if( detlist.Contains("+CAL", TString::kIgnoreCase) && !CAL1 && !CAL2 )CAL2=true;
1509          else if( detlist.Contains("+S4",  TString::kIgnoreCase) )S4  = true;      if( detlist.Contains("-CAL", TString::kIgnoreCase) && CAL1 && CAL2 ){
1510            CAL2=false;
1511            CAL1=false;
1512        }
1513    //  -------------------------------------------------------------------------
1514        if( detlist.Contains("TRK1", TString::kIgnoreCase) ){
1515            if ( detlist.Contains("-TRK1", TString::kIgnoreCase) )TRK1=false;
1516            if ( detlist.Contains("+TRK1", TString::kIgnoreCase) )TRK1=true;
1517        };
1518                    
1519          if( detlist.Contains("-ND",  TString::kIgnoreCase) )ND  = false;      if( detlist.Contains("TRK2", TString::kIgnoreCase)){
1520          else if( detlist.Contains("+ND",  TString::kIgnoreCase) )ND  = true;          if ( detlist.Contains("-TRK2", TString::kIgnoreCase) )TRK2=false;
1521            if ( detlist.Contains("+TRK2", TString::kIgnoreCase) )TRK2=true;
1522        };
1523    
1524        if( detlist.Contains("TRKh", TString::kIgnoreCase)){
1525            if ( detlist.Contains("-TRKh", TString::kIgnoreCase) )TRKh=false;
1526            if ( detlist.Contains("+TRKh", TString::kIgnoreCase) )TRKh=true;
1527        };
1528                    
1529          if( detlist.Contains("-AC",  TString::kIgnoreCase) )AC  = false;      if( detlist.Contains("+TRK", TString::kIgnoreCase) && !TRK1 && !TRK2 && !TRKh )TRK2=true;
1530          else if( detlist.Contains("+AC",  TString::kIgnoreCase) )AC  = true;      if( detlist.Contains("-TRK", TString::kIgnoreCase) && TRK1 && TRK2 && TRKh){
1531            TRK2=false;
1532            TRK1=false;
1533            TRKh=false;
1534        }
1535    //  -------------------------------------------------------------------------
1536        
1537        if( detlist.Contains("-TRG", TString::kIgnoreCase) )TRG = false;
1538        else if( detlist.Contains("+TRG", TString::kIgnoreCase) )TRG = true;
1539        
1540        if( detlist.Contains("-TOF", TString::kIgnoreCase) )TOF = false;
1541        else if( detlist.Contains("+TOF", TString::kIgnoreCase) )TOF = true;
1542        
1543        if( detlist.Contains("-S4",  TString::kIgnoreCase) )S4  = false;
1544        else if( detlist.Contains("+S4",  TString::kIgnoreCase) )S4  = true;
1545        
1546        if( detlist.Contains("-ND",  TString::kIgnoreCase) )ND  = false;
1547        else if( detlist.Contains("+ND",  TString::kIgnoreCase) )ND  = true;
1548        
1549        if( detlist.Contains("-AC",  TString::kIgnoreCase) )AC  = false;
1550        else if( detlist.Contains("+AC",  TString::kIgnoreCase) )AC  = true;
1551        
1552        if( detlist.Contains("-ORB", TString::kIgnoreCase) )ORB = false;
1553        else if( detlist.Contains("+ORB", TString::kIgnoreCase) )ORB = true;
1554    
1555    //     cout<< "Set detector list --> ";
1556    //     if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
1557    //     if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
1558    //     if(TRKh)cout<<"TRKH ";
1559    //     if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
1560    //     if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
1561    //     if(TOF)cout<<"TOF ";
1562    //     if(TRG)cout<<"TRG ";
1563    //     if(AC)cout<<"AC ";
1564    //     if(ND)cout<<"ND ";
1565    //     if(S4)cout<<"S4 ";
1566    //     if(ORB)cout<<"ORB ";
1567    //     cout << endl;
1568        
1569    };
1570    
1571    
1572    /**
1573     * Set tree/branch detector flags from the content of a tree
1574     */
1575    void  PamLevel2::GetWhichTrees(TFile* f){
1576                    
1577          if( detlist.Contains("-ORB", TString::kIgnoreCase) )ORB = false;      // -----------
1578          else if( detlist.Contains("+ORB", TString::kIgnoreCase) )ORB = true;      // reset flags
1579        // -----------
1580        CAL1   = false;    
1581        CAL2   = false;    
1582        TRK2   = false;    
1583        TRK1   = false;    
1584        TRKh   = false;    
1585        TRG    = false;    
1586        TOF    = false;    
1587        S4     = false;    
1588        ND     = false;    
1589        AC     = false;    
1590        ORB    = false;    
1591        
1592        RUN    = false;
1593            
1594        cout << "Checking file: "<<f->GetName()<<endl;
1595        if( !f || f->IsZombie() ){
1596            cout << "File: "<< f->GetName() <<" Non valid root file"<< endl;
1597            return;
1598        }
1599    
1600        TList *lk = f->GetListOfKeys();
1601        TIter next(lk);
1602        TKey *key =0;
1603    
1604        Int_t nev = 0;
1605    
1606        while( (key = (TKey*)next()) ){
1607            
1608            if( !strcmp(key->GetName(),"Run"        ) )RUN = true;
1609    
1610            //=========================================================    
1611            if( !strcmp(key->GetName(),"Trigger"    ) ){
1612                TRG = true;
1613                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("Trigger"))->GetEntries();
1614                if( nev && nevt!=nev){
1615                    cout << "File: "<< f->GetName() <<" Trigger tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1616                    TRG = false;
1617                }else nev=nevt;
1618            }
1619            //=========================================================    
1620            if( !strcmp(key->GetName(),"ToF"        ) ){
1621                TOF = true;
1622                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("ToF"))->GetEntries();
1623                if( nev && nevt!=nev){
1624                    cout << "File: "<< f->GetName() <<"     ToF tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1625                    TOF = false;
1626                }else nev=nevt;
1627            }
1628            //=========================================================  
1629            if( !strcmp(key->GetName(),"S4"         ) ){
1630                S4 = true;
1631                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("S4"))->GetEntries();
1632                if( nev && nevt!=nev){
1633                    cout << "File: "<< f->GetName() <<"      S4 tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1634                    S4 = false;
1635                }else nev=nevt;
1636            }
1637            //=========================================================  
1638    
1639            if( !strcmp(key->GetName(),"NeutronD"   ) ){
1640                ND = true;
1641                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("NeutronD"))->GetEntries();
1642                if( nev && nevt!=nev){
1643                    cout << "File: "<< f->GetName() <<"NeutronD tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1644                    ND =false;
1645                }else nev=nevt;
1646            }      
1647            //=========================================================  
1648            if( !strcmp(key->GetName(),"Anticounter") ){
1649                AC = true;
1650                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("Anticounter"))->GetEntries();
1651                if( nev && nevt!=nev){
1652                    cout << "File: "<< f->GetName() <<" Anticounter tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1653                    AC =false;
1654                }else nev=nevt;
1655            }
1656            //=========================================================  
1657            if( !strcmp(key->GetName(),"OrbitalInfo") ){
1658                ORB = true;
1659                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("OrbitalInfo"))->GetEntries();
1660                if( nev && nevt!=nev){
1661                    cout << "File: "<< f->GetName() <<" OrbitalInfo tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1662                    ORB = false;
1663                }else nev=nevt;
1664            }
1665            //=========================================================  
1666            if( !strcmp(key->GetName(),"Tracker"    ) ){
1667                TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");
1668                for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){
1669                    TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();
1670                    if( !name.CompareTo("TrkLevel1") )TRK1=true;
1671                    if( !name.CompareTo("TrkLevel2") )TRK2=true;
1672                    if( !name.CompareTo("TrkHough") )TRKh=true;
1673                };      
1674                Int_t nevt = T->GetEntries();
1675                if( nev && nevt!=nev){
1676                    cout << "File: "<< f->GetName() <<" Tracker tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1677                    TRK1 = false;
1678                    TRK2 = false;
1679                    TRKh = false;
1680                }else nev=nevt;
1681                T->Delete();
1682            };
1683            //=========================================================  
1684            if( !strcmp(key->GetName(),"Calorimeter"    ) ){
1685                TTree *T = (TTree*)f->Get("Calorimeter");
1686                for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){
1687                    TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();
1688                    if( !name.CompareTo("CaloLevel1") )CAL1=true;
1689                    if( !name.CompareTo("CaloLevel2") )CAL2=true;
1690                };    
1691                Int_t nevt = T->GetEntries();
1692                if( nev && nevt!=nev){
1693                    cout << "File: "<< f->GetName() <<"  Calorimeter tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1694                    CAL1 = false;
1695                    CAL2 = false;
1696                }else nev=nevt;
1697                T->Delete();
1698            };      
1699    
1700        };
1701        
1702        delete lk;
1703    
1704    //     cout<< "Get detector list from input file --> ";
1705    //     if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
1706    //     if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
1707    //     if(TRKh)cout<<"TRKH ";
1708    //     if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
1709    //     if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
1710    //     if(TOF)cout<<"TOF ";
1711    //     if(TRG)cout<<"TRG ";
1712    //     if(AC)cout<<"AC ";
1713    //     if(ND)cout<<"ND ";
1714    //     if(S4)cout<<"S4 ";
1715    //     if(ORB)cout<<"ORB ";
1716    //     cout << endl;
1717          
1718        return ;
1719                    
1720  };  };
1721    
1722    
1723  //--------------------------------------  //--------------------------------------
1724  //  //
1725  //  //
# Line 929  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString de Line 1731  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString de
1731   */   */
1732  Bool_t  PamLevel2::CheckLevel2File(TString name){  Bool_t  PamLevel2::CheckLevel2File(TString name){
1733                    
1734          Bool_t CAL__ok = false;      Bool_t CAL1__ok   = false;    
1735          Bool_t TRK__ok = false;      Bool_t CAL2__ok   = false;    
1736          Bool_t TRK_L1__ok = false;      Bool_t TRK2__ok   = false;    
1737          Bool_t TRG__ok = false;      Bool_t TRK1__ok   = false;    
1738          Bool_t TOF__ok = false;      Bool_t TRKh__ok   = false;    
1739          Bool_t S4__ok  = false;      Bool_t TRG__ok    = false;    
1740          Bool_t ND__ok  = false;      Bool_t TOF__ok    = false;    
1741          Bool_t AC__ok  = false;      Bool_t S4__ok     = false;    
1742          Bool_t ORB__ok = false;      Bool_t ND__ok     = false;    
1743                Bool_t AC__ok     = false;    
1744          Bool_t RUN__ok = false;      Bool_t ORB__ok    = false;    
1745                
1746          TFile *f = new TFile(name.Data());      Bool_t RUN__ok    = false;
1747          TList *lk = f->GetListOfKeys();      
1748  //      lk->Print();      
         TIter next(lk);  
         TKey *key =0;  
         while( (key = (TKey*)next()) ){  
 //              cout << key->GetName() << endl;  
                 if( !strcmp(key->GetName(),"Calorimeter") )CAL__ok = true;  
 //              if( !strcmp(key->GetName(),"Tracker"    ) )TRK__ok = true;  
                 if( !strcmp(key->GetName(),"Trigger"    ) )TRG__ok = true;  
                 if( !strcmp(key->GetName(),"ToF"        ) )TOF__ok = true;  
                 if( !strcmp(key->GetName(),"S4"         ) )S4__ok = true;  
                 if( !strcmp(key->GetName(),"NeutronD"   ) )ND__ok = true;  
                 if( !strcmp(key->GetName(),"Anticounter") )AC__ok = true;  
                 if( !strcmp(key->GetName(),"OrbitalInfo") )ORB__ok = true;  
                 if( !strcmp(key->GetName(),"Run"        ) )RUN__ok = true;  
                   
                 if( !strcmp(key->GetName(),"Tracker"    ) ){  
                         TRK__ok = true;  
                         TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");  
                         for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){  
                                 TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();  
                                 if( !name.CompareTo("TrkLevel1") )TRK_L1__ok=true;  
                         };  
                 };  
1749    
1750          };      cout << "Checking file: "<<name<<endl;
1751                        TFile *f = new TFile(name.Data());
1752          lk->Delete();      if( !f || f->IsZombie() ){
1753          f->Close();          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Non valid root file"<< endl; return false;
1754        }
1755    //    cout << "Get list of keys: "<<f<<endl;
1756        TList *lk = f->GetListOfKeys();
1757    //    lk->Print();
1758        TIter next(lk);
1759        TKey *key =0;
1760    
1761        Int_t nev = 0;
1762    
1763        while( (key = (TKey*)next()) ){
1764            
1765    //      cout << key->GetName() << ""<<key->GetClassName()<<endl;
1766    //              cout << " Get tree: " << f->Get(key->GetName())<<endl;
1767    //      nev_previous = nev;
1768    //      cout << " n.entries  "<< nev <<endl;
1769    //      if( key->GetClassName()=="TTree" && nev_previous && nev != nev_previous ){
1770    //          nev = ((TTree*)f->Get(key->GetName()))->GetEntries();
1771    //          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- "<< key->GetName() << " tree: n.entries does not match "<<nev<<" "<<nev_previous<< endl;
1772    //          return false;
1773    //      };
1774    
1775            if( !strcmp(key->GetName(),"Run"        ) )RUN__ok = true;      
1776    
1777            //=========================================================    
1778            if( !strcmp(key->GetName(),"Trigger"    ) ){
1779                TRG__ok = true;
1780                if(TRG){
1781                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("Trigger"))->GetEntries();
1782                    if( nev && nevt!=nev){
1783                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Trigger tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1784                        return false;
1785                    }
1786                    nev=nevt;
1787                }
1788            }
1789            //=========================================================    
1790            if( !strcmp(key->GetName(),"ToF"        ) ){
1791                TOF__ok = true;
1792                if(TOF){
1793                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("ToF"))->GetEntries();
1794                    if( nev && nevt!=nev){
1795                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- ToF tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1796                        return false;
1797                    }
1798                    nev=nevt;
1799                }
1800            }
1801            //=========================================================  
1802            if( !strcmp(key->GetName(),"S4"         ) ){
1803                S4__ok = true;
1804                if(S4){
1805                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("S4"))->GetEntries();
1806                    if( nev && nevt!=nev){
1807                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- S4 tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1808                        return false;
1809                    }
1810                    nev=nevt;
1811                }
1812            }
1813            //=========================================================  
1814    
1815            if( !strcmp(key->GetName(),"NeutronD"   ) ){
1816                ND__ok = true;
1817                if(ND){
1818                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("NeutronD"))->GetEntries();
1819                    if( nev && nevt!=nev){
1820                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- NeutronD tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1821                        return false;
1822                    }
1823                    nev=nevt;
1824                }
1825            }      
1826            //=========================================================  
1827            if( !strcmp(key->GetName(),"Anticounter") ){
1828                AC__ok = true;
1829                if(AC){
1830                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("Anticounter"))->GetEntries();
1831                    if( nev && nevt!=nev){
1832                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Anticounter tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1833                        return false;
1834                    }
1835                    nev=nevt;
1836                }
1837            }
1838            //=========================================================  
1839            if( !strcmp(key->GetName(),"OrbitalInfo") ){
1840                ORB__ok = true;
1841                if(ORB){
1842                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("OrbitalInfo"))->GetEntries();
1843                    if( nev && nevt!=nev){
1844                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- OrbitalInfo tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1845                        return false;
1846                    }
1847                    nev=nevt;
1848                }
1849            }
1850            //=========================================================  
1851            if( !strcmp(key->GetName(),"Tracker"    ) ){
1852                TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");
1853                if(TRK1||TRK2||TRKh){
1854                    Int_t nevt = T->GetEntries();
1855                    if( nev && nevt!=nev){
1856                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Tracker tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1857                        return false;
1858                    }
1859                    nev=nevt;
1860                }
1861                for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){
1862                    TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();
1863                    if( !name.CompareTo("TrkLevel1") )TRK1__ok=true;
1864                    if( !name.CompareTo("TrkLevel2") )TRK2__ok=true;
1865                    if( !name.CompareTo("TrkHough") )TRKh__ok=true;
1866                };      
1867                T->Delete();
1868            };
1869            //=========================================================  
1870            if( !strcmp(key->GetName(),"Calorimeter"    ) ){
1871                TTree *T = (TTree*)f->Get("Calorimeter");
1872                if(CAL1||CAL2){
1873                    Int_t nevt = T->GetEntries();
1874                    if( nev && nevt!=nev){
1875                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Calorimeter tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1876                        return false;
1877                    }
1878                    nev=nevt;
1879                }
1880                for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){
1881                    TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();
1882                    if( !name.CompareTo("CaloLevel1") )CAL1__ok=true;
1883                    if( !name.CompareTo("CaloLevel2") )CAL2__ok=true;
1884                };    
1885                T->Delete();
1886            };      
1887    
1888        };
1889        
1890    //     cout<< "CheckLevel2File(TString): detector list --> ";
1891    //     if(TRK1__ok)cout<<"TRK1 ";
1892    //     if(TRK2__ok)cout<<"TRK2 ";
1893    //     if(TRKh__ok)cout<<"TRKH ";
1894    //     if(CAL1__ok)cout<<"CAL1 ";
1895    //     if(CAL2__ok)cout<<"CAL2 ";
1896    //     if(TOF__ok)cout<<"TOF ";
1897    //     if(TRG__ok)cout<<"TRG ";
1898    //     if(AC__ok)cout<<"AC ";
1899    //     if(ND__ok)cout<<"ND ";
1900    //     if(S4__ok)cout<<"S4 ";
1901    //     if(ORB__ok)cout<<"ORB ";
1902    //     cout << endl;
1903    
1904    
1905        if(TRK2 && TRK1__ok)TRK1=1;
1906    // ----------------------------------------------------------------------------
1907    // NOTA
1908    // se c'e` il level1, lo devo necessarimente leggere.
1909    // infatti (non ho capito perche`) i cluster vengono letti e allocati in memoria
1910    // comunque, ma non vengono disallocati da PamLevel2::Clear()
1911    // ----------------------------------------------------------------------------
1912    
1913    
1914        if(!RUN__ok) {
1915            cout << "File: "<< f->GetName() <<" *WARNING* ---- Missing RunInfo tree"<< endl;
1916    //      return false;
1917        };
1918    
1919        if(CAL1 && !CAL1__ok){
1920            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing CaloLevel1 branch"<< endl;
1921            return false;
1922        };
1923        if(CAL2 && !CAL2__ok){
1924            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing CaloLevel2 branch"<< endl;
1925            return false;
1926        };
1927        if(TRK2 && !TRK2__ok){
1928            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing TrkLevel2 branch"<< endl;
1929            return false;
1930        };
1931        if(TRK1 && !TRK1__ok){
1932            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing TrkLevel1 branch"<< endl;
1933            return false;
1934        };
1935        if(TRKh && !TRKh__ok){
1936            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing TrkHough branch"<< endl;
1937            return false;
1938        };
1939        if(ORB && !ORB__ok){
1940            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ORB tree"<< endl;
1941            return false;
1942        };
1943        if(AC && !AC__ok){
1944            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing AC tree"<< endl;
1945            return false;
1946        };
1947        if(S4 && !S4__ok){
1948            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing S4 tree"<< endl;
1949            return false;
1950        };
1951        if(TOF && !TOF__ok){
1952            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ToF tree"<< endl;
1953            return false;
1954        };
1955    
1956        if(ND && !ND__ok){
1957            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ND tree"<< endl;
1958            return false;
1959        };
1960        if(TRG && !TRG__ok){
1961            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing Trigger tree"<< endl;
1962            return false;
1963        };
1964        
1965    
1966    //    lk->Delete();
1967    //    delete lk;
1968        f->Close();
1969    
1970    //     cout<< "CheckLevel2File(TString): detector list --> ";
1971    //     if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
1972    //     if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
1973    //     if(TRKh)cout<<"TRKH ";
1974    //     if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
1975    //     if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
1976    //     if(TOF)cout<<"TOF ";
1977    //     if(TRG)cout<<"TRG ";
1978    //     if(AC)cout<<"AC ";
1979    //     if(ND)cout<<"ND ";
1980    //     if(S4)cout<<"S4 ";
1981    //     if(ORB)cout<<"ORB ";
1982    //     cout << endl;
1983          
1984        return true;
1985                    
1986          Bool_t FLAG = true;  };
1987          if(!RUN__ok) {  
1988                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing RunInfo tree"<< endl;  
1989                  FLAG = false;  /**
1990          };   * Create clone-trees
1991          if(CAL && !CAL__ok){   */
1992                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing Calorimeter tree"<< endl;  void PamLevel2::CreateCloneTrees0( TChain *fChain, TFile *ofile ){
1993                  FLAG = false;  
1994          };      cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
1995          if(TRK && !TRK__ok){      cout << "Create clones of PAMELA trees "<<endl;
1996                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing Tracker tree"<< endl;      
1997                  FLAG = false;      Int_t i=0;
1998          };      tree_clone[i] = fChain->GetTree()->CloneTree(0);
1999          if(TRK_L1 && !TRK_L1__ok){      TString name =  tree_clone[i]->GetName();
2000                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing Tracker Level1 Branch"<< endl;      name.Append("_clone");
2001                  FLAG = false;  //    tree_clone[i]->SetName(name.Data());
2002          };      cout << tree_clone[i]->GetName() <<endl;
2003          if(TRG && !TRG__ok){      i++;
2004                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing Trigger tree"<< endl;  
2005                  FLAG = false;      TList *li = fChain->GetListOfFriends();
2006          };      TIter next(li);
2007          if(TOF && !TOF__ok){      TFriendElement* T_friend=0;
2008                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ToF tree"<< endl;      ofile->cd();
2009                  FLAG = false;      while( (T_friend = (TFriendElement*)next()) ){
2010          };  //      cout<<T_friend->IsA()->GetName()<<" "<<T_friend->GetName()<<hex << T_friend->GetTree() << dec<<endl;
2011          if(S4 && !S4__ok){  //      cout<<T_friend->GetTree()->GetName()<< endl;
2012                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing S4 tree"<< endl;          tree_clone[i] = T_friend->GetTree()->CloneTree(0);
2013                  FLAG = false;          tree_clone[i]->SetAutoSave(1000000);
2014            name =  tree_clone[i]->GetName();
2015            name.Append("_clone");
2016    //      tree_clone[i]->SetName(name.Data());
2017            cout << tree_clone[i]->GetName() << endl;
2018            i++;
2019        }
2020        
2021        delete li;
2022    
2023        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2024    
2025    }
2026    
2027    /**
2028     * Create clone-trees
2029     */
2030    void PamLevel2::CreateCloneTrees(TFile *ofile){
2031    
2032        ofile->cd();
2033    
2034        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2035        cout << "Create new PAMELA trees "<<endl;
2036            
2037        Int_t i=0;
2038    
2039        if(TRK1||TRK2||TRKh){
2040            tree_clone[i] = new TTree("Tracker","PAMELA tracker level2 data ");    
2041            if(TRK1) {
2042                tree_clone[i]->Branch("TrkLevel1","TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel1"));
2043                tree_clone[i]->BranchRef();
2044                cout << "Tracker      : branch TrkLevel1"<<endl;
2045            };
2046            if(TRK2) {
2047                tree_clone[i]->Branch("TrkLevel2", "TrkLevel2",GetPointerTo("TrkLevel2"));
2048                cout << "Tracker      : branch TrkLevel2"<<endl;        
2049            };
2050            if(TRKh) {
2051                tree_clone[i]->Branch("TrkHough","TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
2052                cout << "Tracker      : branch TrkHough"<<endl;
2053          };          };
2054          if(ND && !ND__ok){          i++;
2055                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ND tree"<< endl;      }
2056                  FLAG = false;  
2057        // Calorimeter
2058        if(CAL1||CAL2){
2059            tree_clone[i] = new TTree("Calorimeter","PAMELA calorimeter level2 data ");    
2060            if(CAL1) {
2061                tree_clone[i]->Branch("CaloLevel1", "CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
2062                cout << "Calorimeter  : branch CaloLevel1"<<endl;
2063            };
2064            if(CAL2) {
2065                tree_clone[i]->Branch("CaloLevel2","CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
2066                cout << "Calorimeter  : branch CaloLevel2"<<endl;
2067          };          };
2068          if(AC && !AC__ok){          i++;
2069                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing AC tree"<< endl;      }    
2070                  FLAG = false;  
2071        // ToF    
2072        if(TOF) {
2073            tree_clone[i] = new TTree("ToF","PAMELA ToF level2 data ");    
2074            tree_clone[i]->Branch("ToFLevel2","ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
2075            cout << "ToF          : branch ToFLevel2"<<endl;
2076            i++;
2077        };
2078        // Trigger
2079        if(TRG) {
2080            tree_clone[i] = new TTree("Trigger","PAMELA trigger level2 data ");    
2081            tree_clone[i]->Branch("TrigLevel2","TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
2082            cout << "Trigger      : branch TrigLevel2"<<endl;
2083            i++;
2084        };
2085        // S4
2086        if(S4) {
2087            tree_clone[i] = new TTree("S4","PAMELA S4 level2 data ");      
2088            tree_clone[i]->Branch("S4Level2","S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
2089            cout << "S4           : branch S4Level2"<<endl;
2090            i++;
2091        };
2092        // Neutron Detector
2093        if(ND) {
2094            tree_clone[i] = new TTree("NeutronD","PAMELA neutron detector level2 data ");  
2095            tree_clone[i]->Branch("NDLevel2","NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
2096            cout << "NeutronD     : branch NDLevel2"<<endl;
2097            i++;
2098        };
2099        // Anticounters
2100        if(AC) {
2101            tree_clone[i] = new TTree("Anticounter","PAMELA anticounter detector level2 data ");    
2102            tree_clone[i]->Branch("AcLevel2","AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
2103            cout << "Anticounter  : branch AcLevel2"<<endl;
2104            i++;
2105        };
2106        // OrbitalInfo
2107        if(ORB) {
2108            tree_clone[i] = new TTree("OrbitalInfo","PAMELA oribital info  ");      
2109            tree_clone[i]->Branch("OrbitalInfo","OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
2110            cout << "OrbitalInfo  : branch OrbitalInfo"<<endl;
2111            i++;
2112        };
2113        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2114    
2115    }
2116    
2117    
2118    /**
2119     * Fill tree (created with CreateCloneTrees)
2120     *
2121     */
2122    //void PamLevel2::FillNewPamTree(TTree *T){
2123    void PamLevel2::FillCloneTrees(){
2124            
2125        for(Int_t i=0; i<8; i++){
2126            if(tree_clone[i])tree_clone[i]->Fill();
2127        }
2128    }
2129    
2130    
2131    TTree* PamLevel2::GetCloneTree(TString name){
2132    
2133        for(Int_t i=0; i<8; i++){  
2134            if(tree_clone[i]){
2135                TString na = tree_clone[i]->GetName();
2136                if(!name.CompareTo(na))return tree_clone[i];
2137          };          };
2138          if(ORB && !ORB__ok){      }
2139                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ORB tree"<< endl;      return NULL;
2140                  FLAG = false;  
2141    }
2142    void PamLevel2::WriteCloneTrees(){
2143        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2144        cout << "Write clones of PAMELA trees "<<endl;
2145        for(Int_t i=0; i<8; i++){  
2146            if(tree_clone[i]){
2147                cout << tree_clone[i]->GetName()<<endl;
2148                tree_clone[i]->Write();
2149          };          };
2150                }
2151          return FLAG;      cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2152            
2153  };  }
2154    
2155    /**
2156     * Create a new (empty) Pamela trees
2157     */
2158    // TTree* PamLevel2::GetNewPamTree(){
2159    
2160    //     if(tree_clone)return tree_clone;
2161    
2162    //     TTree *Tout = 0;
2163        
2164    //     cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2165    //     cout << "Create new PAMELA trees "<<endl;
2166        
2167        
2168    //     if(TRK1||TRK2||TRKh){
2169    //      TTree *T = new TTree("Tracker_clone","PAMELA tracker level2 data ");    
2170    //      if(TRK1) {
2171    //          trk1_clone = new TrkLevel1();
2172    //          T->Branch("TrkLevel1","TrkLevel1", &trk1_clone);
2173    //          T->BranchRef();
2174    //          cout << "Tracker      : branch TrkLevel1"<<endl;
2175    //      };
2176    //      if(TRK2) {
2177    //          trk2_clone = new TrkLevel2();
2178    //          T->Branch("TrkLevel2", "TrkLevel2",&trk2_clone);
2179    //          cout << "Tracker      : branch TrkLevel2"<<endl;        
2180    //      };
2181    //      if(TRKh) {
2182    //          trkh_clone = new TrkHough();
2183    //          T->Branch("TrkHough","TrkHough", &trkh_clone);
2184    //          cout << "Tracker      : branch TrkHough"<<endl;
2185    //      };
2186    //      if(!Tout)Tout=T;
2187    //      else Tout->AddFriend("Tracker_clone");
2188    //     }
2189    
2190    //     // Calorimeter
2191    //     if(CAL1||CAL2){
2192    //      TTree *C = new TTree("Calorimeter_clone","PAMELA calorimeter level2 data ");    
2193    //      if(CAL1) {
2194    //          calo1_clone = new CaloLevel1();
2195    //          C->Branch("CaloLevel1", "CaloLevel1", &calo1_clone);
2196    //          cout << "Calorimeter  : branch CaloLevel1"<<endl;
2197    //      };
2198    //      if(CAL2) {
2199    //          calo2_clone = new CaloLevel2();
2200    //          C->Branch("CaloLevel2","CaloLevel2", &calo2_clone);
2201    //          cout << "Calorimeter  : branch CaloLevel2"<<endl;
2202    //      };
2203    //      if(!Tout)Tout=C;
2204    //      else Tout->AddFriend("Calorimeter_clone");
2205    //     }    
2206    
2207    //     // ToF    
2208    //     if(TOF) {
2209    //      TTree *O = new TTree("ToF_clone","PAMELA ToF level2 data ");    
2210    //      tof_clone = new ToFLevel2();
2211    //      O->Branch("ToFLevel2","ToFLevel2", &tof_clone);
2212    //      cout << "ToF          : branch ToFLevel2"<<endl;
2213    //      if(!Tout)Tout=O;
2214    //      else Tout->AddFriend("ToF_clone");
2215    //     };
2216    //     // Trigger
2217    //     if(TRG) {
2218    //      TTree *R = new TTree("Trigger_clone","PAMELA trigger level2 data ");    
2219    //      trig_clone = new TrigLevel2();
2220    //      R->Branch("TrigLevel2","TrigLevel2", &trig_clone);
2221    //      cout << "Trigger      : branch TrigLevel2"<<endl;
2222    //      if(!Tout)Tout=R;
2223    //      else Tout->AddFriend("Trigger_clone");
2224    //     };
2225    //     // S4
2226    //     if(S4) {
2227    //      TTree *S = new TTree("S4_clone","PAMELA S4 level2 data ");      
2228    //      s4_clone = new S4Level2();
2229    //      S->Branch("S4Level2","S4Level2", &s4_clone);
2230    //      cout << "S4           : branch S4Level2"<<endl;
2231    //      if(!Tout)Tout=S;
2232    //      else Tout->AddFriend("S4_clone");
2233    //     };
2234    //     // Neutron Detector
2235    //     if(ND) {
2236    //      TTree *N = new TTree("NeutronD_clone","PAMELA neutron detector level2 data ");  
2237    //      nd_clone = new NDLevel2();
2238    //      N->Branch("NDLevel2","NDLevel2", &nd_clone);
2239    //      cout << "NeutronD     : branch NDLevel2"<<endl;
2240    //      if(!Tout)Tout=N;
2241    //      else Tout->AddFriend("NeutronD_clone");
2242    //     };
2243    //     // Anticounters
2244    //     if(AC) {
2245    //      TTree *A = new TTree("Anticounter_clone","PAMELA anticounter detector level2 data ");  
2246    //      ac_clone = new AcLevel2();
2247    //      A->Branch("AcLevel2","AcLevel2", &ac_clone);
2248    //      cout << "Anticounter  : branch AcLevel2"<<endl;
2249    //      if(!Tout)Tout=A;
2250    //      else Tout->AddFriend("Anticounter_clone");
2251    //     };
2252    //     // OrbitalInfo
2253    //     if(ORB) {
2254    //      TTree *B = new TTree("OrbitalInfo_clone","PAMELA oribital info  ");    
2255    //      orb_clone = new OrbitalInfo();
2256    //      B->Branch("OrbitalInfo","OrbitalInfo", &orb_clone);
2257    //      cout << "OrbitalInfo  : branch OrbitalInfo"<<endl;
2258    //      if(!Tout)Tout=B;
2259    //      else Tout->AddFriend("OrbitalInfo_clone");
2260    //     };
2261    //     cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2262    
2263    //     tree_clone = Tout;
2264    //     tree_clone->SetDirectory(0);
2265    
2266    //     return Tout;
2267    // }
2268    // /**
2269    //  * Fill a tree (created with GetNewPamTree)
2270    //  *
2271    //  */
2272    // //void PamLevel2::FillNewPamTree(TTree *T){
2273    // void PamLevel2::FillNewPamTree(){
2274            
2275    
2276    //     if(trk1_clone)  *trk1_clone = *trk1_obj;
2277    //     if(trk2_clone){
2278    //      trk2_clone->Clear();
2279    //      trk2_obj->Copy(*trk2_clone);
2280    // //   *trk2_clone = *trk2_obj;
2281    //     }
2282    //     if(trkh_clone)  *trkh_clone = *trkh_obj;
2283    //     if(calo1_clone){
2284    // //   *calo1_clone = *calo1_obj;
2285    //      calo1_clone->Clear();
2286    //      calo1_obj->Copy(*calo1_clone);
2287    //     }
2288    //     if(calo2_clone){
2289    // //   *calo2_clone = *calo2_obj;
2290    //      calo2_clone->Clear();
2291    //      calo2_obj->Copy(*calo2_clone);
2292    //     }
2293    //     if(tof_clone)   *tof_clone  = *tof_obj;
2294    //     if(trig_clone)  *trig_clone = *trig_obj;
2295    //     if(s4_clone)    *s4_clone   = *s4_obj;
2296    //     if(nd_clone)    *nd_clone   = *nd_obj;
2297    //     if(ac_clone)    *ac_clone   = *ac_obj;
2298    //     if(orb_clone)   *orb_clone  = *orb_obj;
2299    
2300    //     TTree *T = tree_clone;
2301    
2302    //     T->Fill(); //fill main tree
2303    // //    cout<<T->IsA()->GetName()<<" "<<T->GetName()<<endl;
2304    //     TList *li = T->GetListOfFriends();
2305    //     TIter next(li);
2306    //     TFriendElement* T_friend=0;
2307    //     while( (T_friend = (TFriendElement*)next()) ){
2308    // //   cout<<T_friend->IsA()->GetName()<<" "<<T_friend->GetName()<<hex << T_friend->GetTree() << dec<<endl;
2309    //      T_friend->GetTree()->Fill();//fill friends
2310    //     }
2311    
2312    // }

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