/[PAMELA software]/PamelaLevel2/src/PamLevel2.cpp
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Diff of /PamelaLevel2/src/PamLevel2.cpp

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revision 1.5 by pam-fi, Mon Oct 9 08:57:42 2006 UTC revision 1.15 by mocchiut, Tue Jan 16 13:00:26 2007 UTC
# Line 7  Line 7 
7   * Default constructor   * Default constructor
8   */   */
9  PamTrack::PamTrack(){  PamTrack::PamTrack(){
10      trk_track  = this->TrkTrack::GetTrkTrack();      trk_track  = 0;
11      calo_track = this->CaloTrkVar::GetCaloTrkVar();      calo_track = 0;
12      tof_track  = this->ToFTrkVar::GetToFTrkVar();      tof_track  = 0;
13        candeleteobj = 0;
14  };  };
15  //--------------------------------------  //--------------------------------------
16  //  //
# Line 19  PamTrack::PamTrack(){ Line 20  PamTrack::PamTrack(){
20   * Constructor   * Constructor
21   */   */
22  PamTrack::PamTrack(TrkTrack* t, CaloTrkVar* c, ToFTrkVar* o){  PamTrack::PamTrack(TrkTrack* t, CaloTrkVar* c, ToFTrkVar* o){
23      trk_track  = this->TrkTrack::GetTrkTrack();  
24      calo_track = this->CaloTrkVar::GetCaloTrkVar();      trk_track  = 0;
25      tof_track  = this->ToFTrkVar::GetToFTrkVar();      calo_track = 0;
26      if(t) *trk_track  = *t;      tof_track  = 0;
27      if(c) *calo_track = *c;  //     if(t)trk_track  = new TrkTrack(*t);
28      if(o) *tof_track  = *o;      //     if(c)calo_track = new CaloTrkVar(*c);
29    //     if(o)tof_track  = new ToFTrkVar(*o);
30        if(t)trk_track  = t;
31        if(c)calo_track = c;
32        if(o)tof_track  = o;
33        candeleteobj = 0;
34    
35  };  };
36    PamTrack::PamTrack(const PamTrack& track){
37    
38        TrkTrack   *t = track.trk_track;
39        CaloTrkVar *c = track.calo_track;
40        ToFTrkVar  *o = track.tof_track;
41    
42        trk_track  = 0;
43        calo_track = 0;
44        tof_track  = 0;
45        if(t)trk_track  = new TrkTrack(*t);
46        if(c)calo_track = new CaloTrkVar(*c);
47        if(o)tof_track  = new ToFTrkVar(*o);
48        candeleteobj = 1;
49        
50    }
51    void PamTrack::Clear(){
52    
53    //    cout << "PamTrack::Clear() "<<candeleteobj<<endl;
54        if(candeleteobj){
55            if(trk_track)  trk_track->TrkTrack::Clear();
56            if(calo_track) calo_track->CaloTrkVar::Clear();//???
57            if(tof_track)  tof_track->ToFTrkVar::Clear();//???
58        }else{
59            trk_track  = 0;
60            calo_track = 0;
61            tof_track  = 0;
62        }
63    }
64    void PamTrack::Delete(){
65    //    cout << "PamTrack::Delete() "<<candeleteobj<<endl;
66        if(candeleteobj){
67            if(trk_track)  {
68                trk_track->TrkTrack::Clear();
69                delete trk_track;
70            }
71            if(calo_track){
72                calo_track->CaloTrkVar::Clear();//???
73                delete calo_track;
74            }
75            if(tof_track){
76                tof_track->ToFTrkVar::Clear();//???
77                delete tof_track;
78            }
79        }else{
80            Clear();
81        }
82    }
83  //--------------------------------------  //--------------------------------------
84  //  //
85  //  //
# Line 36  PamTrack::PamTrack(TrkTrack* t, CaloTrkV Line 89  PamTrack::PamTrack(TrkTrack* t, CaloTrkV
89   */   */
90  PamLevel2::PamLevel2(){  PamLevel2::PamLevel2(){
91                    
92      trk_l1_obj  = this->TrkLevel1::GetTrkLevel1();        //     trk2_obj  = TrkLevel2::GetTrkLevel2();
93          trk_obj     = this->TrkLevel2::GetTrkLevel2();  //     trk1_obj  = TrkLevel1::GetTrkLevel1();
94          calo_obj    = this->CaloLevel2::GetCaloLevel2();  //     trkh_obj  = TrkHough::GetTrkHough();
95      tof_obj     = this->ToFLevel2::GetToFLevel2();  //     calo1_obj = CaloLevel1::GetCaloLevel1();
96      trig_obj    = this->TrigLevel2::GetTrigLevel2();  //     calo2_obj = CaloLevel2::GetCaloLevel2();
97      s4_obj      = this->S4Level2::GetS4Level2();  //     tof_obj   = ToFLevel2::GetToFLevel2();
98      nd_obj      = this->NDLevel2::GetNDLevel2();  //     trig_obj  = TrigLevel2::GetTrigLevel2();
99      ac_obj      = this->AcLevel2::GetAcLevel2();  //     s4_obj    = S4Level2::GetS4Level2();
100          orb_obj     = this->OrbitalInfo::GetOrbitalInfo();  //     nd_obj    = NDLevel2::GetNDLevel2();
101    //     ac_obj    = AcLevel2::GetAcLevel2();
102    //     orb_obj   = OrbitalInfo::GetOrbitalInfo();
103        trk2_obj  = 0;
104        trk1_obj  = 0;
105        trkh_obj  = 0;
106        calo1_obj = 0;
107        calo2_obj = 0;
108        tof_obj   = 0;
109        trig_obj  = 0;
110        s4_obj    = 0;
111        nd_obj    = 0;
112        ac_obj    = 0;
113        orb_obj   = 0;
114    
115          run_obj     = new GL_RUN();      run_obj   = 0;//new GL_RUN();
116                soft_obj   = 0;// Emiliano
117          sorted_tracks = new TRefArray();      
118    
119          CAL = true;      for(Int_t i=0; i<8; i++ )tree_clone[i]=NULL;
         TRK = true;  
         TRG = true;  
         TOF = true;  
         S4  = true;  
         ND  = true;  
         AC  = true;  
         ORB = true;  
120    
121          TRK_L1 = false;  //    sorted_tracks = 0;//new TRefArray();
122        
123        CAL1 = true;
124        CAL2 = true;
125        TRK2 = true;
126        TRK1 = false;
127        TRKh = false;
128        TRG = true;
129        TOF = true;
130        S4  = true;
131        ND  = true;
132        AC  = true;
133        ORB = true;
134        
135        RUN = true;
136    
137        tsorted=0;
138        timage=0;
139    
         Tout  = NULL;  
140  };  };
141  /**  /**
142   * Destructor   * Delete the event (act as Dtor)
143   */   */
144  PamLevel2::~PamLevel2(){  void PamLevel2::Delete(){
                   
         TrkLevel1::Clear();  
           
         TrkLevel2::Clear();  
         CaloLevel2::Clear();  
         ToFLevel2::Clear();  
         TrigLevel2::Clear();  
         S4Level2::Clear();  
         NDLevel2::Clear();  
         AcLevel2::Clear();  
         OrbitalInfo::Clear();  
           
         delete run_obj;  
           
 //      delete sorted_tracks;  
         sorted_tracks->Delete(); // clean the reference array  
           
         if(Tout)Tout->Delete(); // delete loaded tree from memory  
145                    
146        if(run_obj)delete run_obj;
147        if(soft_obj)delete soft_obj; //Emiliano
148    
149    //    cout << "void PamLevel2::Clear()"<<endl;
150        if(trk1_obj) delete trk1_obj;      
151        if(trk2_obj) delete trk2_obj;
152        if(trkh_obj) delete trkh_obj;
153        if(calo1_obj)delete calo1_obj;
154        if(calo2_obj)delete calo2_obj;
155        if(tof_obj)  delete tof_obj;
156        if(trig_obj) delete trig_obj;
157        if(s4_obj)   delete s4_obj;
158        if(nd_obj)   delete nd_obj;
159        if(ac_obj)   delete ac_obj;
160        if(orb_obj)  delete orb_obj;
161        
162        if(tsorted){
163            tsorted->Delete();
164            delete tsorted;
165        }
166        if(timage){
167            timage->Delete();
168            delete timage;
169        }
170  };  };
171    
172  /**  /**
173   * Clear the event   * Clear the event (NB! does not deallocate objects)
174   */   */
175  void PamLevel2::Clear(){  void PamLevel2::Clear(){
176                    
177          TrkLevel1::Clear();  //    cout << "void PamLevel2::Clear()"<<endl;
178            
179          TrkLevel2::Clear();  //
180          CaloLevel2::Clear();  //    if(run_obj)delete run_obj;
181          ToFLevel2::Clear();      if(run_obj) run_obj->Clear();  // Emiliano: Do not deallocate run_obj here, it will give segmentation fault! call clear instead
182          TrigLevel2::Clear();      if(soft_obj) soft_obj->Clear();
183          S4Level2::Clear();  
184          NDLevel2::Clear();      if(trk1_obj) trk1_obj->Clear();    
185          AcLevel2::Clear();      if(trk2_obj) trk2_obj->Clear();
186          OrbitalInfo::Clear();      if(trkh_obj) trkh_obj->Clear();
187                if(calo1_obj)calo1_obj->Clear();
188          sorted_tracks->Delete(); // clean the reference array      if(calo2_obj)calo2_obj->Clear();
189                if(tof_obj)  tof_obj->Clear();
190        if(trig_obj) trig_obj->Clear();
191        if(s4_obj)   s4_obj->Clear();
192        if(nd_obj)   nd_obj->Clear();
193        if(ac_obj)   ac_obj->Clear();
194        if(orb_obj)  orb_obj->Clear();
195        
196    //    if(sorted_tracks)sorted_tracks->Clear();
197    //    sorted_tracks.Clear();
198    
199        if(tsorted){
200            tsorted->Delete();
201        }
202        if(timage){
203            timage->Delete();
204        }
205        
206  };  };
207    
208    
# Line 112  void PamLevel2::Clear(){ Line 210  void PamLevel2::Clear(){
210  //  //
211  //  //
212  //--------------------------------------  //--------------------------------------
213    void *PamLevel2::GetPointerTo(const char* c ){
214    
215        TString objname = c;
216    
217        if(!objname.CompareTo("TrkLevel1"))  {
218            if(!trk1_obj){
219                trk1_obj  = new TrkLevel1();
220                trk1_obj->Set();
221            }
222            return &trk1_obj;
223        };
224        if(!objname.CompareTo("TrkLevel2"))  {
225            if(!trk2_obj){  
226                trk2_obj  = new TrkLevel2();
227                trk2_obj->Set();
228            }
229            return &trk2_obj;
230        };
231        if(!objname.CompareTo("TrkHough"))   {
232            if(!trkh_obj)  trkh_obj  = new TrkHough();
233            return &trkh_obj;
234        };
235        if(!objname.CompareTo("CaloLevel1")) {
236            if(!calo1_obj) calo1_obj = new CaloLevel1();
237            return &calo1_obj;
238        };
239        if(!objname.CompareTo("CaloLevel2")) {
240            if(!calo2_obj){
241                calo2_obj = new CaloLevel2();
242                calo2_obj->Set();
243            };
244            return &calo2_obj;
245        };
246        if(!objname.CompareTo("ToFLevel2"))  {
247            if(!tof_obj){
248                tof_obj   = new ToFLevel2();
249                tof_obj->Set();
250            }
251            return &tof_obj;
252        };
253        if(!objname.CompareTo("TrigLevel2")) {
254            if(!trig_obj)  trig_obj  = new TrigLevel2();
255            return &trig_obj;
256        };
257        if(!objname.CompareTo("S4Level2"))   {
258            if(!s4_obj)    s4_obj    = new S4Level2();
259            return &s4_obj;
260        };
261        if(!objname.CompareTo("NDLevel2"))   {
262            if(!nd_obj)    nd_obj    = new NDLevel2();
263            return &nd_obj;
264        };
265        if(!objname.CompareTo("AcLevel2"))   {
266            if(!ac_obj)    ac_obj    = new AcLevel2();
267            return &ac_obj;
268        };
269        if(!objname.CompareTo("OrbitalInfo")){
270            if(!orb_obj)   orb_obj   = new OrbitalInfo();
271            return &orb_obj;
272        };
273        
274        if(!objname.CompareTo("RunInfo"))return &run_obj;
275    
276        if(!objname.CompareTo("SoftInfo"))return &soft_obj; // Emiliano
277    
278        return NULL;
279    };
280    //--------------------------------------
281    //
282    //
283    //--------------------------------------
284  /**  /**
285   * Retrieves the calorimeter track matching the seqno-th tracker stored track.   * Retrieves the calorimeter track matching the seqno-th tracker stored track.
286   * (If seqno = -1 retrieves the self-trigger calorimeter track)   * (If seqno = -1 retrieves the self-trigger calorimeter track)
287   */   */
288   CaloTrkVar *PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int seqno){   CaloTrkVar *PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int seqno){
289                
290           if( CaloLevel2::ntrk()==0 ){       if( !calo2_obj )return 0;
                  cout << "PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" but no Calorimeter tracks are stored"<<endl;  
                  return NULL;  
          };  
           
          CaloTrkVar *c = 0;  
          Int_t it_calo=0;  
           
          do{  
                  c = CaloLevel2::GetCaloTrkVar(it_calo);  
                  it_calo++;  
          } while( seqno != c->trkseqno && it_calo < CaloLevel2::ntrk());          
           
          if(seqno != c->trkseqno){  
                  c = 0;  
                  if(seqno!=-1)cout << "PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" does not match Calorimeter stored tracks"<<endl;  
          };  
          return c;  
291    
292         if( calo2_obj->CaloLevel2::ntrk()==0 ){
293             cout << "PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" but no Calorimeter tracks are stored"<<endl;
294             return NULL;
295         };
296        
297         CaloTrkVar *c = 0;
298         Int_t it_calo=0;
299        
300         do{
301             c = calo2_obj->CaloLevel2::GetCaloTrkVar(it_calo);
302             it_calo++;
303         } while( c && seqno != c->trkseqno && it_calo < calo2_obj->CaloLevel2::ntrk());    
304        
305         if(!c || seqno != c->trkseqno){
306             c = 0;
307             if(seqno!=-1)cout << "PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" does not match Calorimeter stored tracks"<<endl;
308         };
309         return c;
310        
311   };   };
312  //--------------------------------------  //--------------------------------------
313   //   //
# Line 148  void PamLevel2::Clear(){ Line 319  void PamLevel2::Clear(){
319   */   */
320   ToFTrkVar *PamLevel2::GetToFStoredTrack(int seqno){   ToFTrkVar *PamLevel2::GetToFStoredTrack(int seqno){
321                    
322           if( ToFLevel2::ntrk()==0 ){       if( !tof_obj )return 0;
                  cout << "PamLevel2::GetToFStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" but no ToF tracks are stored"<<endl;  
                  return NULL;  
          };  
           
          ToFTrkVar *c = 0;  
          Int_t it_tof=0;  
           
          do{  
                  c = ToFLevel2::GetToFTrkVar(it_tof);  
                  it_tof++;  
          } while( seqno != c->trkseqno && it_tof < ToFLevel2::ntrk());    
           
          if(seqno != c->trkseqno){  
                  c = 0;  
                  if(seqno!=-1)cout << "PamLevel2::GetToFStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" does not match ToF stored tracks"<<endl;  
          };  
          return c;  
323    
324         if( tof_obj->ToFLevel2::ntrk()==0 ){
325             cout << "PamLevel2::GetToFStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" but no ToF tracks are stored"<<endl;
326             return NULL;
327         };
328        
329         ToFTrkVar *c = 0;
330         Int_t it_tof=0;
331        
332         do{
333             c = tof_obj->ToFLevel2::GetToFTrkVar(it_tof);
334             it_tof++;
335         } while( c && seqno != c->trkseqno && it_tof < tof_obj->ToFLevel2::ntrk());        
336        
337         if(!c || seqno != c->trkseqno){
338             c = 0;
339             if(seqno!=-1)cout << "PamLevel2::GetToFStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" does not match ToF stored tracks"<<endl;
340         };
341         return c;
342        
343   };   };
344    
345  //--------------------------------------  //--------------------------------------
# Line 177  void PamLevel2::Clear(){ Line 350  void PamLevel2::Clear(){
350   * Give the pamela track associated to a tracker track, retrieving related calorimeter and tof track information.   * Give the pamela track associated to a tracker track, retrieving related calorimeter and tof track information.
351   */   */
352   PamTrack* PamLevel2::GetPamTrackAlong(TrkTrack* t){   PamTrack* PamLevel2::GetPamTrackAlong(TrkTrack* t){
353                
354           CaloTrkVar *c = 0;       cout <<"PamLevel2::GetPamTrackAlong(TrkTrack* t) **obsolete** "<<endl;
355           ToFTrkVar  *o = 0;       cout <<"(if you use it, remember to delete the PamTrack object)"<<endl;
356            
357           if(CAL) c = GetCaloStoredTrack(t->GetSeqNo());       CaloTrkVar *c = 0;
358           if(TOF) o = GetToFStoredTrack(t->GetSeqNo());       ToFTrkVar  *o = 0;
359                
360         if(CAL2) c = GetCaloStoredTrack(t->GetSeqNo());
361         if(TOF) o = GetToFStoredTrack(t->GetSeqNo());
362        
363  //    if(t && c && o)track = new PamTrack(t,c,o);  //    if(t && c && o)track = new PamTrack(t,c,o);
364           PamTrack *track = new PamTrack(t,c,o);       PamTrack *track = new PamTrack(t,c,o);
365                
366           return track;       return track;
367    
368   };   };
369  //--------------------------------------  //--------------------------------------
# Line 202  void PamLevel2::Clear(){ Line 378  void PamLevel2::Clear(){
378    
379  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_t itrk){  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_t itrk){
380            
381          PamTrack *track = 0;      cout <<"PamLevel2::GetStoredTrack(Int_t itrk) **to-be-updated** "<<endl;
382        cout <<"for the moment, better use separately the methods: TrkLevel2::GetStoredTrack(seqno) CaloLevel2::GetCaloTrkVar(Int_t notrack) ToFLevel2::GetToFTrkVar(Int_t notrack)"<<endl;
383          if( itrk >=0 && itrk < TrkLevel2::ntrk() ){      cout <<"(if you use it, remember to delete the PamTrack object)"<<endl;
384                        PamTrack *track = 0;
385                  TrkTrack *t = TrkLevel2::GetStoredTrack(itrk);      
386                  track = GetPamTrackAlong(t);      if( itrk >=0 && itrk < trk2_obj->TrkLevel2::ntrk() ){
387            
388            TrkTrack *t = trk2_obj->TrkLevel2::GetStoredTrack(itrk);
389            track = GetPamTrackAlong(t);
390                    
         }else{  
                 cout << "PamLevel2::GetStoredTrack(int) : tracker track SeqNo "<< itrk <<" does not exist (GetNTracks() = "<<TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;  
         };  
   
         return track;  
391                    
392    
393        }else{
394            cout << "PamLevel2::GetStoredTrack(int) : tracker track SeqNo "<< itrk <<" does not exist (GetNTracks() = "<<trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
395        };
396        
397        return track;
398        
399  }  }
400  //--------------------------------------  //--------------------------------------
401  //  //
# Line 224  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_ Line 405  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_
405   * Sort physical (tracker) tracks and stores them in the TRefArray (of TrkTrack objects) which pointer is  PamLevel2::sorted_tracks.   * Sort physical (tracker) tracks and stores them in the TRefArray (of TrkTrack objects) which pointer is  PamLevel2::sorted_tracks.
406   * @param how String to set the sorting cryterium (es: "CAL" or "TRK+CAL+TOF" ecc...).   * @param how String to set the sorting cryterium (es: "CAL" or "TRK+CAL+TOF" ecc...).
407   * Sorting cryteria:   * Sorting cryteria:
408   * TRK: lower chi**2   * TRK: lower chi**2
409   * CAL: lower Y spatial residual on the first calorimeter plane   * CAL: lower Y spatial residual on the first calorimeter plane
410   * TOF: bigger numebr of hit PMTs along the track, on S12 S21 S32 (where paddles are along the Y axis).   * TOF: bigger numebr of hit PMTs along the track, on S12 S21 S32 (where paddles are along the Y axis).
411   * The default sorting cryterium is "TOF+CAL".   * The default sorting cryterium is "TOF+CAL".
# Line 233  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_ Line 414  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_
414   */   */
415  void PamLevel2::SortTracks(TString how){  void PamLevel2::SortTracks(TString how){
416    
417    //    cout <<" PamLevel2::SortTracks(TString how) "<<endl;
418        if( !trk2_obj ){
419            cout << "void PamLevel2::SortTracks(TString how):  TrkLevel2 not loaded !!!";
420            return;
421        };
422    //    cout << "call SortTracs() "<<endl;
423    //Save current Object count    //Save current Object count
424          Int_t ObjectNumber = TProcessID::GetObjectCount();      Int_t ObjectNumber = TProcessID::GetObjectCount();
425            
426          sorted_tracks->Delete(); //temporaneo???  //    cout << "ObjectNumber  "<<ObjectNumber <<endl;
427            
428    //     if(!sorted_tracks)sorted_tracks = new TRefArray();
429    //     sorted_tracks->Clear();
430    //    sorted_tracks.Clear();
431    
432        if(!tsorted)tsorted = new TClonesArray("PamTrack",trk2_obj->GetNTracks());
433        tsorted->Delete();
434        TClonesArray &ttsorted = *tsorted;
435        if(!timage)timage = new TClonesArray("PamTrack",trk2_obj->GetNTracks());
436        timage->Delete();
437        TClonesArray &ttimage = *timage;
438    
439    
440      // loop over the tracks sorted by the tracker      // loop over the tracks sorted by the tracker
441          Bool_t use_TRK = how.Contains("TRK", TString::kIgnoreCase);      Bool_t use_TRK = how.Contains("TRK", TString::kIgnoreCase);
442          Bool_t use_CAL = how.Contains("CAL", TString::kIgnoreCase);      Bool_t use_CAL = how.Contains("CAL", TString::kIgnoreCase);
443          Bool_t use_TOF = how.Contains("TOF", TString::kIgnoreCase);      Bool_t use_TOF = how.Contains("TOF", TString::kIgnoreCase);
444                
445          if( !CAL &&  use_CAL) use_CAL = false;      if( !CAL2 &&  use_CAL) use_CAL = false;
446          if( !TOF &&  use_TOF) use_TOF = false;      if( !TOF &&  use_TOF) use_TOF = false;
447        
448        if( !TRK2 ){
449    //      cout << "SortTracks() : without tracker does not work!!! (not yet)" << endl;
450            return;
451        };
452    
453        //   cout << "use_CAL "<<use_CAL<<" use_TOF "<<use_TOF<<" use_TRK "<<use_TRK <<endl;
454        
455        for(Int_t i=0; i < trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks(); i++){
456                    
457          if( !TRK ){          TrkTrack   *ts = 0;
458                  cout << "SortTracks() : without tracker does not work!!! (not yet)" << endl;          CaloTrkVar *cs = 0;
459                  return;          ToFTrkVar  *os = 0;
         };  
460                    
         for(Int_t i=0; i < TrkLevel2::GetNTracks(); i++){  
   
                 TrkTrack *ts = 0;  
   
461          // get tracker tracks          // get tracker tracks
462                  TrkTrack   *tp = TrkLevel2::GetTrack(i);                    //tracker          TrkTrack   *tp = trk2_obj->TrkLevel2::GetTrack(i);                    //tracker
463  //              CaloTrkVar *cp = GetCaloStoredTrack(tp->GetSeqNo());          CaloTrkVar *cp = GetCaloStoredTrack(tp->GetSeqNo());
464  //              ToFTrkVar  *op = GetToFStoredTrack(tp->GetSeqNo());          ToFTrkVar  *op = GetToFStoredTrack(tp->GetSeqNo());
465                  CaloTrkVar *cp = 0;  
466                  ToFTrkVar  *op = 0;          TrkTrack   *ti = 0;              //tracker (image)
467            CaloTrkVar *ci = 0;
468            ToFTrkVar  *oi = 0;
469    //      cout << "trk track n. "<<i << " "<<hex<< tp <<dec<< endl;
470          // if track has an image, check image selection          // if track has an image, check image selection
471                  if(tp->HasImage()){          if(tp->HasImage()){
472                                        
473                          TrkTrack   *ti = TrkLevel2::GetTrackImage(i);              //tracker (image)              ti = trk2_obj->TrkLevel2::GetTrackImage(i);              //tracker (image)
474  //                      CaloTrkVar *ci = GetCaloStoredTrack(ti->GetSeqNo());              ci = GetCaloStoredTrack(ti->GetSeqNo());
475  //                      ToFTrkVar  *oi = GetToFStoredTrack(ti->GetSeqNo());              oi = GetToFStoredTrack(ti->GetSeqNo());
476                          CaloTrkVar *ci = 0;              
477                          ToFTrkVar  *oi = 0;  //          cout << "its image "<<i << " "<<hex<< ti <<dec<< endl;
478    
479              //assign starting scores              //assign starting scores
480                          Int_t tp_score = 0;  //main track sorted by the tracker              Int_t tp_score = 0;  //main track sorted by the tracker
481                          Int_t ti_score = 0;  //image track              Int_t ti_score = 0;  //image track
482                                                                
483              // ------------------------              // ------------------------
484              // calorimeter check              // calorimeter check
485              // ------------------------              // ------------------------
486                  // check the Y spatial residual on the first calorimeter plane              // check the Y spatial residual on the first calorimeter plane
487                  // (cut on calorimeter variables from Emiliano)              // (cut on calorimeter variables from Emiliano)
488                          if(              if( use_CAL && !calo2_obj ){
489                                  use_CAL            &&                  cout << "void PamLevel2::SortTracks(TString how): how= "<<how<<" but CaloLevel2 not loaded !!!";
490                                  npcfit[1] > 15     &&   //no. of fit planes on Y view                  return;
491                                  varcfit[1] < 1000. &&  //fit variance on Y view              };
492                                  true){              if(
493                    use_CAL            &&
494                                  cp = GetCaloStoredTrack(tp->GetSeqNo());                  calo2_obj->npcfit[1] > 15     &&   //no. of fit planes on Y view
495                                  ci = GetCaloStoredTrack(ti->GetSeqNo());                  calo2_obj->varcfit[1] < 1000. &&  //fit variance on Y view
496                                                    true){
497                                  Float_t resy_p = cp->tbar[0][1] - cbar[0][1]; if(resy_p < 0)resy_p= - resy_p;  
498                                  Float_t resy_i = ci->tbar[0][1] - cbar[0][1]; if(resy_i < 0)resy_i= - resy_i;                  
499                    Float_t resy_p = cp->tbar[0][1] - calo2_obj->cbar[0][1]; if(resy_p < 0)resy_p= - resy_p;
500                                  if(resy_p <= resy_i) tp_score++;                  Float_t resy_i = ci->tbar[0][1] - calo2_obj->cbar[0][1]; if(resy_i < 0)resy_i= - resy_i;
501                                  else                 ti_score++;                  
502                          };                  if(resy_p <= resy_i) tp_score++;
503                    else                 ti_score++;
504    
505    //              cout << "CALO "<<tp_score<<ti_score<<endl;
506    
507                };
508              // ------------------------              // ------------------------
509              // TOF check              // TOF check
510              // ------------------------                  // ------------------------    
511                  // check the number of hit pmts along the track              // check the number of hit pmts along the track
512                  // on S12 S21 and S32, where paddles are parallel to Y axis              // on S12 S21 and S32, where paddles are parallel to Y axis
513                          if( use_TOF ){              if( use_TOF && !tof_obj ){
514                                            cout << "void PamLevel2::SortTracks(TString how): how= "<<how<<" but ToFLevel2 not loaded !!!";
515                                  Int_t nphit_p =0;                  return;
516                                  Int_t nphit_i =0;              };
517                                                        if( use_TOF ){
518                                  op = GetToFStoredTrack(tp->GetSeqNo());                  
519                                  oi = GetToFStoredTrack(ti->GetSeqNo());                  Int_t nphit_p =0;
520                                                    Int_t nphit_i =0;
521                    
522                    
523  /*                              cout << "track: npmtadc "<< op->npmtadc << endl;  /*                              cout << "track: npmtadc "<< op->npmtadc << endl;
524                                  cout << "track: npmttdc "<< op->npmttdc << endl;                                  cout << "track: npmttdc "<< op->npmttdc << endl;
525                                  cout << "image: npmtadc "<< oi->npmtadc << endl;                                  cout << "image: npmtadc "<< oi->npmtadc << endl;
526                                  cout << "image: npmttdc "<< oi->npmttdc << endl;*/                                  cout << "image: npmttdc "<< oi->npmttdc << endl;*/
527                                                    
528                                  for (Int_t ih=0; ih < op->npmtadc; ih++){                  for (Int_t ih=0; ih < op->npmtadc; ih++){
529                                          Int_t pl = GetPlaneIndex( (op->pmtadc).At(ih) );                      Int_t pl = tof_obj->GetPlaneIndex( (op->pmtadc).At(ih) );
530                                          if(pl == 1 || pl == 2 || pl == 5)nphit_p++;                      if(pl == 1 || pl == 2 || pl == 5)nphit_p++;
531                                  };                  };
532                                                                            
533                                  for (Int_t ih=0; ih < oi->npmtadc; ih++){                  for (Int_t ih=0; ih < oi->npmtadc; ih++){
534                                          Int_t pl = GetPlaneIndex( (oi->pmtadc).At(ih) );                      Int_t pl = tof_obj->GetPlaneIndex( (oi->pmtadc).At(ih) );
535                                          if(pl == 1 || pl == 2 || pl == 5)nphit_i++;                          if(pl == 1 || pl == 2 || pl == 5)nphit_i++;
536                                  };                  };
537                                                    
538                                  if(                  if(
539                                          use_TOF            &&                      use_TOF            &&
540                                          (nphit_p+nphit_i) !=0 &&                              (nphit_p+nphit_i) !=0 &&    
541                                          true){                      true){
542                                                                
543                                          if( nphit_p >= nphit_i) tp_score++;                      if( nphit_p >= nphit_i) tp_score++;
544                                          else                                              ti_score++;                      else ti_score++;
545                                  };                  };
546                          };  //              cout << "TOF "<<tp_score<<ti_score<<endl;
547                          if(tp_score == ti_score) use_TRK = true;              };
548                  // ------------------------              if(tp_score == ti_score) use_TRK = true;
549                // ------------------------
550              // tracker check              // tracker check
551              // ------------------------              // ------------------------
552                  // chi**2 difference is not always large enough to distinguish among              // chi**2 difference is not always large enough to distinguish among
553                  // the real track and its image.              // the real track and its image.
554                  // Tracker check will be applied always when calorimeter and tof information is ambiguous.              // Tracker check will be applied always when calorimeter and tof information is ambiguous.
555                          if(use_TRK){              if(use_TRK){
556                                  if(      tp->chi2 > 0 && tp->chi2 < ti->chi2 ) tp_score++ ;                  if(      tp->chi2 > 0 && tp->chi2 < ti->chi2 ) tp_score++ ;
557                                  else if( ti->chi2 > 0 && ti->chi2 < tp->chi2 ) ti_score++ ;                  else if( ti->chi2 > 0 && ti->chi2 < tp->chi2 ) ti_score++ ;
558                          };  //              cout << "TRK "<<tp_score<<ti_score<<endl;
559                };
560                
561              // ------------------------              // ------------------------
562              // the winner is....              // the winner is....
563              // ------------------------                  // ------------------------    
564                          if      (tp_score > ti_score) ts = tp;//the track sorted by the tracker!!              if      (tp_score > ti_score) {
565                          else if (tp_score < ti_score) ts = ti;//its image!!  //              ts = tp;//the track sorted by the tracker!!
566                          else {  //              cs = cp;
567                                  ts = tp;  //              os = op;
568  //                              cout << "Warning - track image ambiguity not solved" << endl;              }else if (tp_score < ti_score) {
569  //                              cout << ts->GetNtot() << " "<< ts->chi2 << " " << npcfit[1] << " "<< nphit_p << endl;                  ts = ti;//its image!!
570                          };                  cs = ci;
571                    os = oi;
572    
573                    ti = tp;//its image!!
574                    ci = cp;
575                    oi = op;
576    
577                    tp = ts;//its image!!
578                    cp = cs;
579                    op = os;
580    
                 }else{  
                         ts = tp;  
                 };  
                   
 //              cout <<" SortTracks() "<<i<<" -- "<<ts<<endl;  
                 sorted_tracks->Add(ts);//save the track in the sorted array  
 //              cout << "SortTracks:: sorted_tracks->Add(it) "<<i<<" "<<ts<<endl;  
581                                    
582                }else {
583    //              ts = tp;
584    //              cs = cp;
585    //              os = op;
586    //                              cout << "Warning - track image ambiguity not solved" << endl;
587    //                              cout << ts->GetNtot() << " "<< ts->chi2 << " " << npcfit[1] << " "<< nphit_p << endl;
588                };
589                
590            }else{
591    //          ts = tp;
592    //          cs = cp;
593    //          os = op;
594          };          };
595    //Restore Object count          
596    //To save space in the table keeping track of all referenced objects  //      cout <<" SortTracks() "<<i<<" -- "<<ts<<endl;
597    //we assume that our events do not address each other. We reset the  //      sorted_tracks->Add(ts);//save the track in the sorted array
598    //object count to what it was at the beginning of the event.  //      sorted_tracks.Add(ts);//save the track in the sorted array
599          TProcessID::SetObjectCount(ObjectNumber);  //      sorted_tracks.Add(tp);//save the track in the sorted array
600    //      cout << "SortTracks:: sorted_tracks->Add(it) "<<i<<" "<<ts<<endl;
601    //      cout<<"o "<<tp<<endl;
602    //      cout<<"o "<<cp<<endl;
603    //      cout<<"o "<<op<<endl;
604            new(ttsorted[i]) PamTrack(tp,cp,op);
605            new(ttimage[i])  PamTrack(ti,ci,oi);
606        };
607    
608        if( tsorted->GetEntries() != trk2_obj->GetNTracks() ){
609            cout << "void PamLevel2::SortTracks(TString how): tsorted->GetEntries() "<<tsorted->GetEntries()<<" != trk2_obj->GetNTracks() = "<<trk2_obj->GetNTracks() <<endl;
610            tsorted->Delete(); tsorted=0;
611            timage->Delete(); timage=0;    
612        }
613    
614        //Restore Object count
615        //To save space in the table keeping track of all referenced objects
616        //We reset the object count to what it was at the beginning of the event.
617        TProcessID::SetObjectCount(ObjectNumber);
618        
619  };  };
620  //--------------------------------------  //--------------------------------------
621  //  //
# Line 379  void PamLevel2::SortTracks(TString how){ Line 625  void PamLevel2::SortTracks(TString how){
625   * This method overrides TrkLevel2::GetTracks(), where sorting is done by decreasing number of fit points and increasing chi^2.   * This method overrides TrkLevel2::GetTracks(), where sorting is done by decreasing number of fit points and increasing chi^2.
626   * PamLevel2::GetTracks() keeps the same track order given by TrkLevel2::GetTracks(), but checks image selection by using calorimeter and ToF tracking information.   * PamLevel2::GetTracks() keeps the same track order given by TrkLevel2::GetTracks(), but checks image selection by using calorimeter and ToF tracking information.
627   */   */
628   TRefArray *PamLevel2::GetTracks(){  // TRefArray *PamLevel2::GetTracks(){
629           //  
630  //      SortTracks("+CAL+TOF");  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
631           SortTracks("+CAL+TRK");//TEMP!!!!!!!!!!!!!  //     SortTracks("+CAL+TOF");
632          //  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
633          return sorted_tracks;  
634    // //   return  sorted_tracks;
635    //     return &sorted_tracks;
636        
637    //  };
638    TClonesArray *PamLevel2::GetTracks(){
639    
640    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
641        SortTracks("+CAL+TOF");
642    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
643    
644        return tsorted;
645        
646   };   };
647  //--------------------------------------  //--------------------------------------
648   //   //
# Line 396  void PamLevel2::SortTracks(TString how){ Line 654  void PamLevel2::SortTracks(TString how){
654   * @param it Track number, ranging from 0 to GetNTracks().   * @param it Track number, ranging from 0 to GetNTracks().
655   */   */
656  PamTrack *PamLevel2::GetTrack(int it){  PamTrack *PamLevel2::GetTrack(int it){
657    
658    //    if(!trk2_obj) return 0;
659                    
660  //  *-*-*-*-*-*-*  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
661  //      SortTracks("+CAL+TOF");  //     SortTracks("+CAL+TOF");
662          SortTracks("+CAL+TRK");//TEMP!!!!!!!!!!!!!  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
663  //  *-*-*-*-*-*-*  // //    if(!sorted_tracks)return 0;
664    //     if(sorted_tracks.IsEmpty())return 0;
665          PamTrack *track = 0;  
666            //     PamTrack *track = 0;
667          if( it >=0 && it < TrkLevel2::GetNTracks() ){      
668                  TrkTrack   *t = (TrkTrack*)sorted_tracks->At(it);  //     if( it >=0 && it < trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks() && it<sorted_tracks.GetEntriesFast() ){    
669  //              cout << "GetTrack(int it):: sorted_tracks->At(it) "<<it<<" "<<t<<endl;  //      TrkTrack   *t = (TrkTrack*)sorted_tracks.At(it);
670                  track = GetPamTrackAlong(t);  //      track = GetPamTrackAlong(t);
671          }else{  //     }else{
672                  cout << "PamLevel2::GetTrack(int) : tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;  //      cout << "PamLevel2::GetTrack(int) : tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
673          };  //     };
674                
675          return track;  //     return track;
676    
677    //    cout << "PamLevel2::GetTrack(int it) "<<endl;
678    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
679        SortTracks("+CAL+TOF");
680    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
681        if(!tsorted)return 0;
682        if(!tsorted->GetEntries())return 0;
683    
684        PamTrack *track = 0;
685        
686        if( it >=0 && it < trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()){
687    //      TrkTrack   *t = (TrkTrack*)sorted_tracks.At(it);
688    //      track = GetPamTrackAlong(t);
689            TClonesArray &t = *(tsorted);
690            track = (PamTrack*)t[it];
691            
692        }else{
693            cout << "PamLevel2::GetTrack(int) : tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
694        };
695        
696        return track;
697        
698  };  };
699    
700  //--------------------------------------  //--------------------------------------
# Line 426  PamTrack *PamLevel2::GetTrack(int it){ Line 707  PamTrack *PamLevel2::GetTrack(int it){
707   */   */
708  PamTrack *PamLevel2::GetTrackImage(int it){  PamTrack *PamLevel2::GetTrackImage(int it){
709    
710  //      SortTracks("+CAL+TOF");  //     if(!trk2_obj) return 0;
         SortTracks("+CAL+TRK");//TEMP!!!!!!!!!!!!!  
           
         PamTrack *image = 0;  
711    
712          if( it >=0 && it < TrkLevel2::GetNTracks() ){  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
713                  TrkTrack *temp = (TrkTrack*)sorted_tracks->At(it);  //     SortTracks("+CAL+TOF");
714                  if( temp->HasImage() ){  // //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
715                          TrkTrack   *t = TrkLevel2::GetStoredTrack(temp->GetImageSeqNo());  // //    if(!sorted_tracks)return 0;
716                          image = GetPamTrackAlong(t);  //     if(sorted_tracks.IsEmpty())return 0;
717                  }else{      
718                          cout <<"PamLevel2::GetTrackImage(int) : Track SeqNo "<<it<<" does not have image"<<endl;  //     PamTrack *image = 0;
719                  };      
720    //     if( it >=0 && it < trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks() ){
721    //      TrkTrack *temp = (TrkTrack*)sorted_tracks.At(it);
722    //      if( temp->HasImage() ){
723    //          TrkTrack   *t = trk2_obj->TrkLevel2::GetStoredTrack(temp->GetImageSeqNo());
724    //          image = GetPamTrackAlong(t);
725    //      }else{
726    //          cout <<"PamLevel2::GetTrackImage(int) : Track SeqNo "<<it<<" does not have image"<<endl;
727    //      };
728    //     }else{
729    //      cout << "PamLevel2::GetTrackImage(int) : Tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
730    //     };
731        
732    //     return image;
733    
734    
735    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
736        SortTracks("+CAL+TOF");
737    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
738        if(!timage)return 0;
739        if(!timage->GetEntries())return 0;
740        
741        PamTrack *image = 0;
742        
743        if( it >=0 && it < trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks() ){
744            TClonesArray &t = *(tsorted);
745            PamTrack *temp = (PamTrack*)t[it];
746            if( temp->GetTrkTrack()->HasImage() ){
747                TClonesArray &t = *(timage);
748                image = (PamTrack*)t[it];
749          }else{          }else{
750                  cout << "PamLevel2::GetTrackImage(int) : Tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;  //          cout <<"PamLevel2::GetTrackImage(int) : Track SeqNo "<<it<<" does not have image"<<endl;
751          };          };
752        }else{
753            cout << "PamLevel2::GetTrackImage(int) : Tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<trk2_obj->TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
754        };
755            
756          return image;      return image;
757  }  }
758    
759  //--------------------------------------  //--------------------------------------
# Line 456  PamTrack *PamLevel2::GetTrackImage(int i Line 766  PamTrack *PamLevel2::GetTrackImage(int i
766   * @param detlist String to select trees to be included   * @param detlist String to select trees to be included
767   * @return Pointer to a TTree   * @return Pointer to a TTree
768   */   */
769  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, TString detlist="+ALL"){  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, TString detlist ){
770    
771    //     if( !detlist.IsNull() ) SetWhichTrees(detlist);
772    //     else                    GetWhichTrees(f);
773        SetWhichTrees(detlist);
774    
775        TTree *Trout =0;
776    
777        TString fname = f->GetName();
778        if(!CheckLevel2File(fname))return NULL;
779    
780        UInt_t *found=0;    
781    
782        cout<< "GetPamTree(TFile*,TString): detector list --> ";
783        if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
784        if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
785        if(TRKh)cout<<"TRKH ";
786        if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
787        if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
788        if(TOF)cout<<"TOF ";
789        if(TRG)cout<<"TRG ";
790        if(AC)cout<<"AC ";
791        if(ND)cout<<"ND ";
792        if(S4)cout<<"S4 ";
793        if(ORB)cout<<"ORB ";
794        cout << endl;
795    
796        f->cd();
797    
 //      cout << "WARNING!!! -- obsolete method -- \n";  
 //      cout << "better use TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList*, TString) \n";  
           
         TTree *Trout =0;  
           
         SetWhichTrees(detlist);  
798  // Tracker  // Tracker
799      TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");      TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");
800      if(T && TRK) {      if(T && (TRK2||TRK1||TRKh)) {
801                  if(TRK_L1){          if(TRK2)T->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerTo("TrkLevel2"));
802                          T->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerToTrk(1));          else    T->SetBranchStatus("TrkLevel2",0,found);
803                          cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;          if(TRK2)cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;
804                  };          if(TRK1)T->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel1"));
805                  T->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerToTrk(2));          else    T->SetBranchStatus("TrkLevel1",0,found);
806                  cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;          if(TRK1)cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;
807                  Trout=T;          if(TRKh)T->SetBranchAddress("TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
808            else    T->SetBranchStatus("TrkHough",0,found);
809            if(TRKh)cout << "Tracker      : set branch address TrkHough"<<endl;
810            if(!Trout)Trout=T;
811            else Trout->AddFriend(T);
812      }else{      }else{
813          cout << "Tracker      : missing tree"<<endl;          cout << "Tracker      : missing tree"<<endl;
814      };      };
815      // Calorimeter      // Calorimeter
816      TTree *C = (TTree*)f->Get("Calorimeter");      TTree *C = (TTree*)f->Get("Calorimeter");
817      if(C && CAL) {      if(C && (CAL2||CAL1)) {
818          C->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerToCalo());          if(CAL2)C->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
819          cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;          else    C->SetBranchStatus("CaloLevel2",0,found);
820            if(CAL2)cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;
821            if(CAL1)C->SetBranchAddress("CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
822            else    C->SetBranchStatus("CaloLevel1",0,found);
823            if(CAL1)cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel1"<<endl;
824          if(!Trout)Trout=C;          if(!Trout)Trout=C;
825          else Trout->AddFriend(C);          else Trout->AddFriend(C);
826      }else{      }else{
827          cout << "Calorimeter  : missing tree"<<endl;          cout << "Calorimeter  : missing tree"<<endl;
828      };      };
829    
830      // ToF          // ToF    
831      TTree *O = (TTree*)f->Get("ToF");      TTree *O = (TTree*)f->Get("ToF");
832      if(O && TOF) {      if(O && TOF) {
833          O->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerToToF());          O->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
834          cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;          cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;
835          if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
836          else Trout->AddFriend(O);          else Trout->AddFriend(O);
# Line 500  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 840  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
840      // Trigger      // Trigger
841      TTree *R = (TTree*)f->Get("Trigger");      TTree *R = (TTree*)f->Get("Trigger");
842      if(R && TRG) {      if(R && TRG) {
843          R->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerToTrig());          R->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
844          cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;          cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;
845          if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
846          else Trout->AddFriend(R);          else Trout->AddFriend(R);
# Line 510  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 850  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
850      // S4      // S4
851      TTree *S = (TTree*)f->Get("S4");      TTree *S = (TTree*)f->Get("S4");
852      if(S && S4) {      if(S && S4) {
853          S->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerToS4());          S->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
854          cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;          cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;
855          if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
856          else Trout->AddFriend(S);          else Trout->AddFriend(S);
# Line 520  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 860  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
860      // Neutron Detector      // Neutron Detector
861      TTree *N = (TTree*)f->Get("NeutronD");      TTree *N = (TTree*)f->Get("NeutronD");
862      if(N && ND) {      if(N && ND) {
863          N->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerToND());          N->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
864          cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;          cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;
865          if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
866          else Trout->AddFriend(N);          else Trout->AddFriend(N);
# Line 530  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 870  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
870      // Anticounters      // Anticounters
871      TTree *A = (TTree*)f->Get("Anticounter");      TTree *A = (TTree*)f->Get("Anticounter");
872      if(A && AC) {      if(A && AC) {
873          A->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerToAc());          A->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
874          cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;          cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;
875          if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
876          else Trout->AddFriend(A);          else Trout->AddFriend(A);
# Line 538  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 878  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
878          cout << "Anticounter  : missing tree"<<endl;          cout << "Anticounter  : missing tree"<<endl;
879      };      };
880      // Orbital Info      // Orbital Info
881          TTree *B = (TTree*)f->Get("OrbitalInfo");      TTree *B = (TTree*)f->Get("OrbitalInfo");
882          if(B && ORB) {      if(B && ORB) {
883                  B->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerToOrb());          B->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
884                  cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;          cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;
885                  if(!Trout)Trout=O;          if(!Trout)Trout=O;
886                  else Trout->AddFriend(B);          else Trout->AddFriend(B);
887          }else{      }else{
888                  cout << "OrbitalInfo  : missing tree"<<endl;          cout << "OrbitalInfo  : missing tree"<<endl;
889          };      };
890            
891          cout<<endl<<" Number of entries: "<<Trout->GetEntries()<<endl<<endl;      cout<<endl<<" Number of entries: "<<Trout->GetEntries()<<endl<<endl;
892                
893          return Trout;      return Trout;
894            
895  }  }
896  //--------------------------------------  //--------------------------------------
# Line 566  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T Line 906  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, T
906   */   */
907  TList*  PamLevel2::GetListOfLevel2Files(TString ddir, TString flisttxt = ""){  TList*  PamLevel2::GetListOfLevel2Files(TString ddir, TString flisttxt = ""){
908                    
909          TString wdir = gSystem->WorkingDirectory();          TString wdir = gSystem->WorkingDirectory();
910                
911          if(ddir=="")ddir = wdir;      if(ddir=="")ddir = wdir;
912  //      TSystemDirectory *datadir = new TSystemDirectory(gSystem->BaseName(ddir),ddir);  //      TSystemDirectory *datadir = new TSystemDirectory(gSystem->BaseName(ddir),ddir);
913          cout << "Level2 data directory : "<<  ddir << endl;      cout << "Level2 data directory : "<<  ddir << endl;
914                        
915          TList *contents  = new TList; // create output list      TList *contents  = new TList; // create output list
916          contents->SetOwner();      contents->SetOwner();
917        
918        char *fullpath;
919        
920        // if no input file list is given:  
921        if ( flisttxt != "" ){
922                    
923          char *fullpath;          if( !gSystem->IsFileInIncludePath(flisttxt,&fullpath) ){
924                                cout <<"File "<<flisttxt<<" not found"<<endl;
925          // if no input file list is given:                    return 0;
926          if ( flisttxt != "" ){          }      
                                   
                 if( !gSystem->IsFileInIncludePath(flisttxt,&fullpath) )return 0;  
                   
927  //              flisttxt = gSystem->ConcatFileName(gSystem->DirName(flisttxt),gSystem->BaseName(flisttxt));  //              flisttxt = gSystem->ConcatFileName(gSystem->DirName(flisttxt),gSystem->BaseName(flisttxt));
928                  flisttxt = fullpath;          flisttxt = fullpath;
                   
                 if( !gSystem->ChangeDirectory(ddir) )return 0;  
929                    
930                  cout <<"Input file list : " << flisttxt <<endl;          if( !gSystem->ChangeDirectory(ddir) ){
931                  ifstream in;              cout << "Cannot change directory : "<<ddir<<endl;
932                  in.open(flisttxt, ios::in); //open input file list              return 0;
933                  while (1) {          }
934                          TString file;          
935                          in >> file;          cout <<"Input file list : " << flisttxt <<endl;
936                          if (!in.good()) break;          ifstream in;
937                          if( gSystem->IsFileInIncludePath(file,&fullpath) ){          in.open(flisttxt, ios::in); //open input file list
938  //                              contents->Add(new TSystemDirectory(fullpath,ddir)); // add file to the list          int line=0;
939  //                              contents->Add(new TSystemFile(fullpath,ddir)); // add file to the list          while (1) {
940                                  contents->Add(new TSystemFile(fullpath,gSystem->DirName(fullpath)));// add file to the list              TString file;
941                          }else{              in >> file;
942                                  cout << "warning! --- File "<<file<<" does not exists"<< endl;              if (!in.good()) break;
943                          };              line++;
944                  };  //          cout <<"(1) " << file << endl;
945                  in.close();              if(file.IsNull()){
946                                    cout << "-- list interrupted at line "<<line <<endl;
947          }else{                  break;
948                }
949                if(file.Contains("#"))file = file(0,file.First("#"));
950    //          cout <<"(2) " << file << endl;
951                if( gSystem->IsFileInIncludePath(file,&fullpath) ){
952    
953                    contents->Add(new TSystemFile(fullpath,gSystem->DirName(fullpath)));// add file to the list
954    
955                }else{
956    //              if(file.Data()!="")cout << "File: "<<file<<" ---> missing "<< endl;
957                };
958            };
959            in.close();
960            
961        }else{
962                    
963                  cout << "No input file list given."<<endl;          cout << "No input file list given."<<endl;
964                  cout << "Check for existing root files."<<endl;          cout << "Check for existing root files."<<endl;
965  //              cout << "Warking directory: "<< gSystem->WorkingDirectory()<< endl;  //              cout << "Warking directory: "<< gSystem->WorkingDirectory()<< endl;
966                            
967                  TSystemDirectory *datadir = new TSystemDirectory(gSystem->BaseName(ddir),ddir);          TSystemDirectory *datadir = new TSystemDirectory(gSystem->BaseName(ddir),ddir);
968                  TList *temp = datadir->GetListOfFiles();          TList *temp = datadir->GetListOfFiles();
969  //              temp->Print();  //              temp->Print();
970  //              cout << "*************************************" << endl;  //              cout << "*************************************" << endl;
                   
                 TIter next(temp);  
                 TSystemFile *questo = 0;  
                   
                   
                 while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {  
                         TString name =  questo-> GetName();  
                         if( name.EndsWith(".root") ){  
                                 char *fullpath;  
                                 gSystem->IsFileInIncludePath(name,&fullpath);  
                                 contents->Add(new TSystemFile(fullpath,gSystem->DirName(fullpath)));  
                         };  
                 }  
                 delete temp;  
                 delete datadir;  
971                    
972          };          TIter next(temp);
973          gSystem->ChangeDirectory(wdir); // back to the working directory          TSystemFile *questo = 0;
974            
975            
976            while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {
977                TString name =  questo-> GetName();
978                if( name.EndsWith(".root") ){
979                    char *fullpath;
980                    gSystem->IsFileInIncludePath(name,&fullpath);
981                    contents->Add(new TSystemFile(fullpath,gSystem->DirName(fullpath)));
982                };
983            }
984            delete temp;
985            delete datadir;
986            
987        };
988        gSystem->ChangeDirectory(wdir); // back to the working directory
989  //      cout << endl << "Selected files:" << endl;  //      cout << endl << "Selected files:" << endl;
990  //      contents->Print();  //      contents->Print();
991          cout << contents->GetEntries()<<" files selected\n";      cout << contents->GetEntries()<<" files selected\n";
992  //      cout << endl;  //      cout << endl;
993  //      cout << "Working directory: "<< gSystem->WorkingDirectory()<< endl;  //      cout << "Working directory: "<< gSystem->WorkingDirectory()<< endl;
994          return contents;      return contents;
995  };  };
996  //--------------------------------------  //--------------------------------------
997  //  //
# Line 649  TList*  PamLevel2::GetListOfLevel2Files( Line 1003  TList*  PamLevel2::GetListOfLevel2Files(
1003   * @param detlist String to select trees to be included   * @param detlist String to select trees to be included
1004   * @return Pointer to a TChain   * @return Pointer to a TChain
1005   */   */
1006  TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList *fl, TString detlist="+ALL"){  TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList *fl, TString detlist ){
1007        
1008        TChain *Trout =0;
1009    
1010  //      TChain *Tout=0;  //    if( !detlist.IsNull() )SetWhichTrees(detlist);
1011          if(Tout)Tout->Delete();      SetWhichTrees(detlist);
1012          Tout = NULL;      
1013                cout<< "GetPamTree(TList*,TString): input detector list --> ";
1014          SetWhichTrees(detlist);      if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
1015                if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
1016          TChain *T = 0;        if(TRKh)cout<<"TRKH ";
1017          TChain *C = 0;      if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
1018          TChain *O = 0;      if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
1019          TChain *R = 0;      if(TOF)cout<<"TOF ";
1020          TChain *S = 0;      if(TRG)cout<<"TRG ";
1021          TChain *N = 0;      if(AC)cout<<"AC ";
1022          TChain *A = 0;      if(ND)cout<<"ND ";
1023          TChain *B = 0;      if(S4)cout<<"S4 ";
1024                if(ORB)cout<<"ORB ";
1025          if(TRK) T = new TChain("Tracker");            cout << endl;
1026          if(CAL) C = new TChain("Calorimeter");  
1027          if(TOF) O = new TChain("ToF");      TChain *T = 0;      
1028          if(TRG) R = new TChain("Trigger");      TChain *C = 0;
1029          if(S4)  S = new TChain("S4");      TChain *O = 0;
1030          if(ND)  N = new TChain("NeutronD");      TChain *R = 0;
1031          if(AC)  A = new TChain("Anticounter");      TChain *S = 0;
1032          if(ORB) B = new TChain("OrbitalInfo");      TChain *N = 0;
1033                TChain *A = 0;
1034          // loop over files and create chains          TChain *B = 0;
1035          TIter next(fl);      
1036          TSystemFile *questo = 0;      if(TRK2||TRK1||TRKh) T = new TChain("Tracker");    
1037          while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {      if(CAL2||CAL1)       C = new TChain("Calorimeter");
1038                  TString name =  questo->GetName();      if(TOF)              O = new TChain("ToF");
1039  //              cout << "File: "<< name << endl;      if(TRG)              R = new TChain("Trigger");
1040                  if( CheckLevel2File(name) ){      if(S4)               S = new TChain("S4");
1041                          if(TRK) T->Add(name);      if(ND)               N = new TChain("NeutronD");
1042                          if(CAL) C->Add(name);      if(AC)               A = new TChain("Anticounter");
1043                          if(TOF) O->Add(name);      if(ORB)              B = new TChain("OrbitalInfo");
1044                          if(TRG) R->Add(name);      
1045                          if(S4)  S->Add(name);      // loop over files and create chains        
1046                          if(ND)  N->Add(name);      TIter next(fl);
1047                          if(AC)  A->Add(name);      TSystemFile *questo = 0;
1048                          if(ORB) B->Add(name);      while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {
1049                  };          TString name =  questo->GetName();
1050          }          cout << "File: "<< name << endl;
1051                            if( CheckLevel2File(name) ){
1052              // Tracker              if(TRK2||TRK1||TRKh) T->Add(name);
1053          if(TRK) if(!Tout)Tout=T;              if(CAL1||CAL2)       C->Add(name);
1054                            if(TOF)              O->Add(name);
1055          // Calorimeter              if(TRG)              R->Add(name);
1056          if(CAL) {                            if(S4)               S->Add(name);
1057                  if(!Tout)Tout=C;              if(ND)               N->Add(name);
1058                  else Tout->AddFriend("Calorimeter");              if(AC)               A->Add(name);
1059                if(ORB)              B->Add(name);
1060          };          };
1061                }
1062        
1063        cout << "done chain \n";
1064    
1065        UInt_t *found=0;
1066    // Tracker
1067        if(T && (TRK2||TRK1||TRKh)) {
1068            if(TRK2)T->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerTo("TrkLevel2"));
1069            else    T->SetBranchStatus("TrkLevel2",0,found);
1070            if(TRK2)cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;
1071            if(TRK1)T->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel1"));
1072            else    T->SetBranchStatus("TrkLevel1",0,found);
1073            if(TRK1)cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;
1074            if(TRKh)T->SetBranchAddress("TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
1075            else    T->SetBranchStatus("TrkHough",0,found);
1076            if(TRKh)cout << "Tracker      : set branch address TrkHough"<<endl;
1077            if(!Trout)Trout=T;
1078            else Trout->AddFriend("Tracker");
1079        }else{
1080            cout << "Tracker      : missing tree"<<endl;
1081        };
1082        // Calorimeter
1083        if(C && (CAL2||CAL1)) {
1084            if(CAL2)C->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
1085            else    C->SetBranchStatus("CaloLevel2",0,found);
1086            if(CAL2)cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;
1087            if(CAL1)C->SetBranchAddress("CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
1088            else    C->SetBranchStatus("CaloLevel1",0,found);
1089            if(CAL1)cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel1"<<endl;
1090            if(!Trout)Trout=C;
1091            else Trout->AddFriend("Calorimeter");
1092        }else{
1093            cout << "Calorimeter  : missing tree"<<endl;
1094        };
1095      // ToF          // ToF    
1096          if(TOF) {      if(O && TOF) {
1097                  if(!Tout)Tout=O;          O->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
1098                  else Tout->AddFriend("ToF");          cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;
1099          };          if(!Trout)Trout=O;
1100            else Trout->AddFriend("ToF");
1101        }else{
1102            cout << "ToF         : missing tree"<<endl;
1103        };
1104      // Trigger      // Trigger
1105          if(TRG) {      if(R && TRG) {
1106                  if(!Tout)Tout=O;          R->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
1107                  else Tout->AddFriend("Trigger");          cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;
1108          };          if(!Trout)Trout=O;
1109            else Trout->AddFriend("Trigger");
1110        }else{
1111            cout << "Trigger      : missing tree"<<endl;
1112        };
1113      // S4      // S4
1114          if(S4) {      if(S && S4) {
1115                  if(!Tout)Tout=O;          S->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
1116                  else Tout->AddFriend("S4");          cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;
1117          };          if(!Trout)Trout=O;
1118            else Trout->AddFriend("S4");
1119        }else{
1120            cout << "S4           : missing tree"<<endl;
1121        };
1122      // Neutron Detector      // Neutron Detector
1123          if(ND) {      if(N && ND) {
1124                  if(!Tout)Tout=O;          N->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
1125                  else Tout->AddFriend("NeutronD");          cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;
1126          };          if(!Trout)Trout=O;
1127            else Trout->AddFriend("NeutronD");
1128        }else{
1129            cout << "NeutronD     : missing tree"<<endl;
1130        };
1131      // Anticounters      // Anticounters
1132          if(AC) {      if(A && AC) {
1133                  if(!Tout)Tout=O;          A->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
1134                  else Tout->AddFriend("Anticounter");          cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;
1135          };          if(!Trout)Trout=O;
1136      // OrbitalInfo          else Trout->AddFriend("Anticounter");
1137          if(ORB) {      }else{
1138                  if(!Tout)Tout=O;          cout << "Anticounter  : missing tree"<<endl;
1139                  else Tout->AddFriend("OrbitalInfo");      };
1140          };      // Orbital Info
1141                if(B && ORB) {
1142          cout<<endl<<" Number of entries: "<<Tout->GetEntries()<<endl<<endl;          B->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
1143                    cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;
1144          PamLevel2::SetBranchAddress();          if(!Trout)Trout=O;
1145                    else Trout->AddFriend("OrbitalInfo");
1146          return Tout;      }else{
1147            cout << "OrbitalInfo  : missing tree"<<endl;
1148        };
1149        
1150    //    cout<<endl<<" Number of entries: "<<Trout->GetEntries()<<endl<<endl;
1151    
1152        
1153    //     // Tracker
1154    //     if(TRK2||TRK1||TRKh){
1155    //      if(!Tout)Tout=T;
1156    //      else Tout->AddFriend("Tracker");
1157    //     }
1158    //     // Calorimeter
1159    //     if(CAL2||CAL1) {        
1160    //      if(!Tout)Tout=C;
1161    //      else Tout->AddFriend("Calorimeter");
1162    //     };
1163    //     // ToF    
1164    //     if(TOF) {
1165    //      if(!Tout)Tout=O;
1166    //      else Tout->AddFriend("ToF");
1167    //     };
1168    //     // Trigger
1169    //     if(TRG) {
1170    //      if(!Tout)Tout=R;
1171    //      else Tout->AddFriend("Trigger");
1172    //     };
1173    //     // S4
1174    //     if(S4) {
1175    //      if(!Tout)Tout=S;
1176    //      else Tout->AddFriend("S4");
1177    //     };
1178    //     // Neutron Detector
1179    //     if(ND) {
1180    //      if(!Tout)Tout=N;
1181    //      else Tout->AddFriend("NeutronD");
1182    //     };
1183    //     // Anticounters
1184    //     if(AC) {
1185    //      if(!Tout)Tout=A;
1186    //      else Tout->AddFriend("Anticounter");
1187    //     };
1188    //     // OrbitalInfo
1189    //     if(ORB) {
1190    //      if(!Tout)Tout=B;
1191    //      else Tout->AddFriend("OrbitalInfo");
1192    //     };
1193        
1194    //    cout<<endl<<" Number of entries: "<<Tout->GetEntries()<<endl<<endl;
1195        
1196    //    if( Tout->GetEntries() )PamLevel2::SetBranchAddress( Tout );
1197        
1198        return Trout;
1199  }  }
1200    
1201    
1202    
1203  //--------------------------------------  //--------------------------------------
1204  //  //
1205  //  //
# Line 746  TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList *fl, Line 1207  TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList *fl,
1207  /**  /**
1208   * Set branch addresses for Pamela friend trees   * Set branch addresses for Pamela friend trees
1209   */   */
1210  void PamLevel2::SetBranchAddress(){  void PamLevel2::SetBranchAddress(TTree *t){
1211    
1212        TRK2    = TRK2 & t->GetBranchStatus("TrkLevel2");
1213        TRK1    = TRK1 & t->GetBranchStatus("TrkLevel1");
1214        TRKh    = TRKh & t->GetBranchStatus("TrkHough");
1215        CAL2    = CAL2 & t->GetBranchStatus("CaloLevel2");
1216        CAL1    = CAL1 & t->GetBranchStatus("CaloLevel1");
1217        TOF    = TOF & t->GetBranchStatus("ToFLevel2");
1218        TRG    = TRG & t->GetBranchStatus("TrigLevel2");
1219        S4     = S4  & t->GetBranchStatus("S4Level2");
1220        ND     = ND  & t->GetBranchStatus("NDLevel2");
1221        AC     = AC  & t->GetBranchStatus("AcLevel2");
1222        ORB    = ORB & t->GetBranchStatus("OrbitalInfo");
1223    
1224    
1225      // Tracker      // Tracker
1226          if(TRK) {      if(TRK1) {
1227                  if(TRK_L1){          t->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel2"));
1228                          Tout->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerToTrk(1));          cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;
1229                          cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;      };
1230                  };      if(TRK2) {
1231                  Tout->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerToTrk(2));          t->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerTo("TrkLevel1"));
1232                  cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;          cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;
1233          };      };
1234                    if(TRKh) {
1235          // Calorimeter          t->SetBranchAddress("TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
1236          if(CAL) {          cout << "Tracker      : set branch address TrkHough"<<endl;
1237                  Tout->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerToCalo());      };
1238                  cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;      
1239          };      // Calorimeter
1240                if(CAL1) {
1241            t->SetBranchAddress("CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
1242            cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel1"<<endl;
1243        };
1244        if(CAL2) {
1245            t->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
1246            cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;
1247        };
1248        
1249      // ToF          // ToF    
1250          if(TOF) {      if(TOF) {
1251                  Tout->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerToToF());          t->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
1252                  cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;          cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;
1253          };      };
1254      // Trigger      // Trigger
1255          if(TRG) {      if(TRG) {
1256                  Tout->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerToTrig());          t->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
1257                  cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;          cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;
1258          };      };
1259      // S4      // S4
1260          if(S4) {      if(S4) {
1261                  Tout->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerToS4());          t->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
1262                  cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;          cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;
1263          };      };
1264      // Neutron Detector      // Neutron Detector
1265          if(ND) {      if(ND) {
1266                  Tout->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerToND());          t->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
1267                  cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;          cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;
1268          };      };
1269      // Anticounters      // Anticounters
1270          if(AC) {      if(AC) {
1271                  Tout->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerToAc());          t->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
1272                  cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;          cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;
1273          };      };
1274      // OrbitalInfo      // OrbitalInfo
1275          if(ORB) {      if(ORB) {
1276                  Tout->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerToOrb());          t->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
1277                  cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;          cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;
1278          };      };
1279                
1280  }  }
1281    /**
1282     * Set branch addresses for Pamela friend trees
1283     */
1284    void PamLevel2::SetBranchAddress(TChain *t){
1285    
1286        TRK2    = TRK2 & t->GetBranchStatus("TrkLevel2");
1287        TRK1    = TRK1 & t->GetBranchStatus("TrkLevel1");
1288        TRKh    = TRKh & t->GetBranchStatus("TrkHough");
1289        CAL1    = CAL1 & t->GetBranchStatus("CaloLevel1");
1290        CAL2    = CAL2 & t->GetBranchStatus("CaloLevel2");
1291        TOF    = TOF & t->GetBranchStatus("ToFLevel2");
1292        TRG    = TRG & t->GetBranchStatus("TrigLevel2");
1293        S4     = S4  & t->GetBranchStatus("S4Level2");
1294        ND     = ND  & t->GetBranchStatus("NDLevel2");
1295        AC     = AC  & t->GetBranchStatus("AcLevel2");
1296        ORB    = ORB & t->GetBranchStatus("OrbitalInfo");
1297    
1298        // Tracker
1299         if(TRK2) {
1300            t->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerTo("TrkLevel2"));
1301            cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;
1302        };
1303        if(TRK1) {
1304            t->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel1"));
1305            cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;
1306        };
1307         if(TRKh) {
1308            t->SetBranchAddress("TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
1309            cout << "Tracker      : set branch address TrkHough"<<endl;
1310         };
1311        
1312        // Calorimeter
1313        if(CAL2) {
1314            t->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
1315            cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;
1316        };  
1317        if(CAL1) {
1318            t->SetBranchAddress("CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
1319            cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel1"<<endl;
1320        };
1321        
1322        // ToF    
1323        if(TOF) {
1324            t->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
1325            cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;
1326        };
1327        // Trigger
1328        if(TRG) {
1329            t->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
1330            cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;
1331        };
1332        // S4
1333        if(S4) {
1334            t->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
1335            cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;
1336        };
1337        // Neutron Detector
1338        if(ND) {
1339            t->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
1340            cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;
1341        };
1342        // Anticounters
1343        if(AC) {
1344            t->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
1345            cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;
1346        };
1347        // OrbitalInfo
1348        if(ORB) {
1349            t->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
1350            cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;
1351        };
1352        
1353    }
1354    
1355    
 //--------------------------------------  
 //  
 //  
 //--------------------------------------  
 void *PamLevel2::GetPointerTo(const char* c ){  
 //      cout << "objname "<< objname << endl;  
         TString objname = c;  
         if(!objname.CompareTo("TrkLevel1"))return &trk_l1_obj;  
         if(!objname.CompareTo("TrkLevel2"))return &trk_obj;  
           
         return NULL;  
 };  
1356  //--------------------------------------  //--------------------------------------
1357  //  //
1358  //  //
# Line 819  void *PamLevel2::GetPointerTo(const char Line 1364  void *PamLevel2::GetPointerTo(const char
1364   */   */
1365  TChain *PamLevel2::GetRunTree(TList *fl){  TChain *PamLevel2::GetRunTree(TList *fl){
1366                    
1367          TChain *R = new TChain("Run");      TChain *R = new TChain("Run");
1368        
1369          // loop over files and create chains          // loop over files and create chains        
1370          TIter next(fl);      TIter next(fl);
1371          TSystemFile *questo = 0;      TSystemFile *questo = 0;
1372          while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {      while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {
1373                  TString name =  questo->GetName();          TString name =  questo->GetName();
1374  //              cout << "File: "<< name << endl;  //              cout << "File: "<< name << endl;
1375                  if( CheckLevel2File(name) ){          if( CheckLevel2File(name) ){
1376                          R->Add(name);              R->Add(name);
1377                  };          };
1378          }      }
1379                
1380          R->SetBranchAddress("RunInfo", GetPointerToRun());      R->SetBranchAddress("RunInfo", GetPointerTo("RunInfo"));
1381          cout << "Run         : set branch address RunInfo"<<endl;      cout << "Run         : set branch address RunInfo"<<endl;
1382        R->SetBranchAddress("SoftInfo", GetPointerTo("SoftInfo")); // Emiliano
1383        cout << "Software    : set branch address SoftInfo"<<endl; // Emiliano
1384            
1385          return R;      return R;
1386            
1387  }  }
1388  //--------------------------------------  //--------------------------------------
# Line 850  TChain *PamLevel2::GetRunTree(TList *fl) Line 1397  TChain *PamLevel2::GetRunTree(TList *fl)
1397  TTree *PamLevel2::GetRunTree(TFile *f){  TTree *PamLevel2::GetRunTree(TFile *f){
1398    
1399    
1400          TTree *R = (TTree*)f->Get("Run");      TTree *R = (TTree*)f->Get("Run");
1401        
1402          R->SetBranchAddress("RunInfo", GetPointerToRun());      R->SetBranchAddress("RunInfo", GetPointerTo("RunInfo"));
1403          cout << "Run         : set branch address RunInfo"<<endl;      cout << "Run         : set branch address RunInfo"<<endl;
1404        R->SetBranchAddress("SoftInfo", GetPointerTo("SoftInfo")); // Emiliano
1405        cout << "Software    : set branch address SoftInfo"<<endl; // Emiliano
1406            
1407          return R;      return R;
1408            
1409  }  }
1410  //--------------------------------------  //--------------------------------------
# Line 863  TTree *PamLevel2::GetRunTree(TFile *f){ Line 1412  TTree *PamLevel2::GetRunTree(TFile *f){
1412  //  //
1413  //--------------------------------------  //--------------------------------------
1414  /**  /**
1415   * Set which trees should be analysed   * Set which trees shoul be analysed
1416   * @param detlist TString containing the sequence of trees required   * @param detlist TString containing the sequence of trees required
1417  */  */
1418  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString detlist){  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString detlist){
1419                    
1420          if(detlist.Contains("+ALL", TString::kIgnoreCase)){      if(detlist.IsNull() || detlist.Contains("+ALL", TString::kIgnoreCase)){
1421                  CAL = true;          CAL1 = true;
1422                  TRK = true;          CAL2 = true;
1423                  TRK_L1 = false;          TRK2 = true;
1424                  TRG = true;          TRK1 = false;
1425                  TOF = true;          TRKh = false;
1426                  S4  = true;          TRG = true;
1427                  ND  = true;          TOF = true;
1428                  AC  = true;          S4  = true;
1429                  ORB = true;          ND  = true;
1430          }else if( detlist.Contains("-ALL", TString::kIgnoreCase) ){          AC  = true;
1431                  CAL = false;          ORB = true;
1432                  TRK = false;      }else if( detlist.Contains("-ALL", TString::kIgnoreCase) ){
1433                  TRK_L1 = false;          CAL1 = false;
1434                  TRG = false;          CAL2 = false;
1435                  TOF = false;          TRK2 = false;
1436                  S4  = false;          TRK1 = false;
1437                  ND  = false;          TRKh = false;
1438                  AC  = false;          TRG = false;
1439                  ORB = false;          TOF = false;
1440          };          S4  = false;
1441                    ND  = false;
1442          if( detlist.Contains("-CAL", TString::kIgnoreCase) )CAL = false;          AC  = false;
1443          else if( detlist.Contains("+CAL", TString::kIgnoreCase) )CAL = true;          ORB = false;
1444                };
1445          if( detlist.Contains("-TRK", TString::kIgnoreCase) )TRK = false;      
1446          else if( detlist.Contains("+TRK", TString::kIgnoreCase) )TRK = true;  //  -------------------------------------------------------------------------
1447                if( detlist.Contains("CAL1", TString::kIgnoreCase) ){
1448          if( detlist.Contains("-TRK1", TString::kIgnoreCase) )TRK_L1 = false;          if ( detlist.Contains("-CAL1", TString::kIgnoreCase) )CAL1=false;
1449          else if( detlist.Contains("+TRK1", TString::kIgnoreCase) )TRK_L1 = true;          if ( detlist.Contains("+CAL1", TString::kIgnoreCase) )CAL1=true;
1450                };
         if( detlist.Contains("-TRG", TString::kIgnoreCase) )TRG = false;  
         else if( detlist.Contains("+TRG", TString::kIgnoreCase) )TRG = true;  
1451                    
1452          if( detlist.Contains("-TOF", TString::kIgnoreCase) )TOF = false;      if( detlist.Contains("CAL2", TString::kIgnoreCase)){
1453          else if( detlist.Contains("+TOF", TString::kIgnoreCase) )TOF = true;          if ( detlist.Contains("-CAL2", TString::kIgnoreCase) )CAL2=false;
1454            if ( detlist.Contains("+CAL2", TString::kIgnoreCase) )CAL2=true;
1455        };
1456                    
1457          if( detlist.Contains("-S4",  TString::kIgnoreCase) )S4  = false;      if( detlist.Contains("+CAL", TString::kIgnoreCase) && !CAL1 && !CAL2 )CAL2=true;
1458          else if( detlist.Contains("+S4",  TString::kIgnoreCase) )S4  = true;      if( detlist.Contains("-CAL", TString::kIgnoreCase) && CAL1 && CAL2 ){
1459            CAL2=false;
1460            CAL1=false;
1461        }
1462    //  -------------------------------------------------------------------------
1463        if( detlist.Contains("TRK1", TString::kIgnoreCase) ){
1464            if ( detlist.Contains("-TRK1", TString::kIgnoreCase) )TRK1=false;
1465            if ( detlist.Contains("+TRK1", TString::kIgnoreCase) )TRK1=true;
1466        };
1467                    
1468          if( detlist.Contains("-ND",  TString::kIgnoreCase) )ND  = false;      if( detlist.Contains("TRK2", TString::kIgnoreCase)){
1469          else if( detlist.Contains("+ND",  TString::kIgnoreCase) )ND  = true;          if ( detlist.Contains("-TRK2", TString::kIgnoreCase) )TRK2=false;
1470            if ( detlist.Contains("+TRK2", TString::kIgnoreCase) )TRK2=true;
1471        };
1472    
1473        if( detlist.Contains("TRKh", TString::kIgnoreCase)){
1474            if ( detlist.Contains("-TRKh", TString::kIgnoreCase) )TRKh=false;
1475            if ( detlist.Contains("+TRKh", TString::kIgnoreCase) )TRKh=true;
1476        };
1477                    
1478          if( detlist.Contains("-AC",  TString::kIgnoreCase) )AC  = false;      if( detlist.Contains("+TRK", TString::kIgnoreCase) && !TRK1 && !TRK2 && !TRKh )TRK2=true;
1479          else if( detlist.Contains("+AC",  TString::kIgnoreCase) )AC  = true;      if( detlist.Contains("-TRK", TString::kIgnoreCase) && TRK1 && TRK2 && TRKh){
1480            TRK2=false;
1481            TRK1=false;
1482            TRKh=false;
1483        }
1484    //  -------------------------------------------------------------------------
1485        
1486        if( detlist.Contains("-TRG", TString::kIgnoreCase) )TRG = false;
1487        else if( detlist.Contains("+TRG", TString::kIgnoreCase) )TRG = true;
1488        
1489        if( detlist.Contains("-TOF", TString::kIgnoreCase) )TOF = false;
1490        else if( detlist.Contains("+TOF", TString::kIgnoreCase) )TOF = true;
1491        
1492        if( detlist.Contains("-S4",  TString::kIgnoreCase) )S4  = false;
1493        else if( detlist.Contains("+S4",  TString::kIgnoreCase) )S4  = true;
1494        
1495        if( detlist.Contains("-ND",  TString::kIgnoreCase) )ND  = false;
1496        else if( detlist.Contains("+ND",  TString::kIgnoreCase) )ND  = true;
1497        
1498        if( detlist.Contains("-AC",  TString::kIgnoreCase) )AC  = false;
1499        else if( detlist.Contains("+AC",  TString::kIgnoreCase) )AC  = true;
1500        
1501        if( detlist.Contains("-ORB", TString::kIgnoreCase) )ORB = false;
1502        else if( detlist.Contains("+ORB", TString::kIgnoreCase) )ORB = true;
1503    
1504    //     cout<< "Set detector list --> ";
1505    //     if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
1506    //     if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
1507    //     if(TRKh)cout<<"TRKH ";
1508    //     if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
1509    //     if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
1510    //     if(TOF)cout<<"TOF ";
1511    //     if(TRG)cout<<"TRG ";
1512    //     if(AC)cout<<"AC ";
1513    //     if(ND)cout<<"ND ";
1514    //     if(S4)cout<<"S4 ";
1515    //     if(ORB)cout<<"ORB ";
1516    //     cout << endl;
1517        
1518    };
1519    
1520    
1521    /**
1522     * Set tree/branch detector flags from the content of a tree
1523     */
1524    void  PamLevel2::GetWhichTrees(TFile* f){
1525                    
1526          if( detlist.Contains("-ORB", TString::kIgnoreCase) )ORB = false;      // -----------
1527          else if( detlist.Contains("+ORB", TString::kIgnoreCase) )ORB = true;      // reset flags
1528        // -----------
1529        CAL1   = false;    
1530        CAL2   = false;    
1531        TRK2   = false;    
1532        TRK1   = false;    
1533        TRKh   = false;    
1534        TRG    = false;    
1535        TOF    = false;    
1536        S4     = false;    
1537        ND     = false;    
1538        AC     = false;    
1539        ORB    = false;    
1540        
1541        RUN    = false;
1542            
1543        cout << "Checking file: "<<f->GetName()<<endl;
1544        if( !f || f->IsZombie() ){
1545            cout << "File: "<< f->GetName() <<" Non valid root file"<< endl;
1546            return;
1547        }
1548    
1549        TList *lk = f->GetListOfKeys();
1550        TIter next(lk);
1551        TKey *key =0;
1552    
1553        Int_t nev = 0;
1554    
1555        while( (key = (TKey*)next()) ){
1556            
1557            if( !strcmp(key->GetName(),"Run"        ) )RUN = true;
1558    
1559            //=========================================================    
1560            if( !strcmp(key->GetName(),"Trigger"    ) ){
1561                TRG = true;
1562                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("Trigger"))->GetEntries();
1563                if( nev && nevt!=nev){
1564                    cout << "File: "<< f->GetName() <<" Trigger tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1565                    TRG = false;
1566                }else nev=nevt;
1567            }
1568            //=========================================================    
1569            if( !strcmp(key->GetName(),"ToF"        ) ){
1570                TOF = true;
1571                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("ToF"))->GetEntries();
1572                if( nev && nevt!=nev){
1573                    cout << "File: "<< f->GetName() <<"     ToF tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1574                    TOF = false;
1575                }else nev=nevt;
1576            }
1577            //=========================================================  
1578            if( !strcmp(key->GetName(),"S4"         ) ){
1579                S4 = true;
1580                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("S4"))->GetEntries();
1581                if( nev && nevt!=nev){
1582                    cout << "File: "<< f->GetName() <<"      S4 tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1583                    S4 = false;
1584                }else nev=nevt;
1585            }
1586            //=========================================================  
1587    
1588            if( !strcmp(key->GetName(),"NeutronD"   ) ){
1589                ND = true;
1590                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("NeutronD"))->GetEntries();
1591                if( nev && nevt!=nev){
1592                    cout << "File: "<< f->GetName() <<"NeutronD tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1593                    ND =false;
1594                }else nev=nevt;
1595            }      
1596            //=========================================================  
1597            if( !strcmp(key->GetName(),"Anticounter") ){
1598                AC = true;
1599                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("Anticounter"))->GetEntries();
1600                if( nev && nevt!=nev){
1601                    cout << "File: "<< f->GetName() <<" Anticounter tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1602                    AC =false;
1603                }else nev=nevt;
1604            }
1605            //=========================================================  
1606            if( !strcmp(key->GetName(),"OrbitalInfo") ){
1607                ORB = true;
1608                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("OrbitalInfo"))->GetEntries();
1609                if( nev && nevt!=nev){
1610                    cout << "File: "<< f->GetName() <<" OrbitalInfo tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1611                    ORB = false;
1612                }else nev=nevt;
1613            }
1614            //=========================================================  
1615            if( !strcmp(key->GetName(),"Tracker"    ) ){
1616                TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");
1617                for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){
1618                    TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();
1619                    if( !name.CompareTo("TrkLevel1") )TRK1=true;
1620                    if( !name.CompareTo("TrkLevel2") )TRK2=true;
1621                    if( !name.CompareTo("TrkHough") )TRKh=true;
1622                };      
1623                Int_t nevt = T->GetEntries();
1624                if( nev && nevt!=nev){
1625                    cout << "File: "<< f->GetName() <<" Tracker tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1626                    TRK1 = false;
1627                    TRK2 = false;
1628                    TRKh = false;
1629                }else nev=nevt;
1630                T->Delete();
1631            };
1632            //=========================================================  
1633            if( !strcmp(key->GetName(),"Calorimeter"    ) ){
1634                TTree *T = (TTree*)f->Get("Calorimeter");
1635                for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){
1636                    TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();
1637                    if( !name.CompareTo("CaloLevel1") )CAL1=true;
1638                    if( !name.CompareTo("CaloLevel2") )CAL2=true;
1639                };    
1640                Int_t nevt = T->GetEntries();
1641                if( nev && nevt!=nev){
1642                    cout << "File: "<< f->GetName() <<"  Calorimeter tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1643                    CAL1 = false;
1644                    CAL2 = false;
1645                }else nev=nevt;
1646                T->Delete();
1647            };      
1648    
1649        };
1650        
1651        delete lk;
1652    
1653    //     cout<< "Get detector list from input file --> ";
1654    //     if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
1655    //     if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
1656    //     if(TRKh)cout<<"TRKH ";
1657    //     if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
1658    //     if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
1659    //     if(TOF)cout<<"TOF ";
1660    //     if(TRG)cout<<"TRG ";
1661    //     if(AC)cout<<"AC ";
1662    //     if(ND)cout<<"ND ";
1663    //     if(S4)cout<<"S4 ";
1664    //     if(ORB)cout<<"ORB ";
1665    //     cout << endl;
1666          
1667        return ;
1668                    
1669  };  };
1670    
1671    
1672  //--------------------------------------  //--------------------------------------
1673  //  //
1674  //  //
# Line 929  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString de Line 1680  void PamLevel2::SetWhichTrees(TString de
1680   */   */
1681  Bool_t  PamLevel2::CheckLevel2File(TString name){  Bool_t  PamLevel2::CheckLevel2File(TString name){
1682                    
1683          Bool_t CAL__ok = false;      Bool_t CAL1__ok   = false;    
1684          Bool_t TRK__ok = false;      Bool_t CAL2__ok   = false;    
1685          Bool_t TRK_L1__ok = false;      Bool_t TRK2__ok   = false;    
1686          Bool_t TRG__ok = false;      Bool_t TRK1__ok   = false;    
1687          Bool_t TOF__ok = false;      Bool_t TRKh__ok   = false;    
1688          Bool_t S4__ok  = false;      Bool_t TRG__ok    = false;    
1689          Bool_t ND__ok  = false;      Bool_t TOF__ok    = false;    
1690          Bool_t AC__ok  = false;      Bool_t S4__ok     = false;    
1691          Bool_t ORB__ok = false;      Bool_t ND__ok     = false;    
1692                Bool_t AC__ok     = false;    
1693          Bool_t RUN__ok = false;      Bool_t ORB__ok    = false;    
1694                
1695          TFile *f = new TFile(name.Data());      Bool_t RUN__ok    = false;
1696          TList *lk = f->GetListOfKeys();      
1697  //      lk->Print();      
         TIter next(lk);  
         TKey *key =0;  
         while( (key = (TKey*)next()) ){  
 //              cout << key->GetName() << endl;  
                 if( !strcmp(key->GetName(),"Calorimeter") )CAL__ok = true;  
 //              if( !strcmp(key->GetName(),"Tracker"    ) )TRK__ok = true;  
                 if( !strcmp(key->GetName(),"Trigger"    ) )TRG__ok = true;  
                 if( !strcmp(key->GetName(),"ToF"        ) )TOF__ok = true;  
                 if( !strcmp(key->GetName(),"S4"         ) )S4__ok = true;  
                 if( !strcmp(key->GetName(),"NeutronD"   ) )ND__ok = true;  
                 if( !strcmp(key->GetName(),"Anticounter") )AC__ok = true;  
                 if( !strcmp(key->GetName(),"OrbitalInfo") )ORB__ok = true;  
                 if( !strcmp(key->GetName(),"Run"        ) )RUN__ok = true;  
                   
                 if( !strcmp(key->GetName(),"Tracker"    ) ){  
                         TRK__ok = true;  
                         TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");  
                         for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){  
                                 TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();  
                                 if( !name.CompareTo("TrkLevel1") )TRK_L1__ok=true;  
                         };  
                 };  
1698    
1699          };      cout << "Checking file: "<<name<<endl;
1700                        TFile *f = new TFile(name.Data());
1701          lk->Delete();      if( !f || f->IsZombie() ){
1702          f->Close();          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Non valid root file"<< endl; return false;
1703        }
1704    //    cout << "Get list of keys: "<<f<<endl;
1705        TList *lk = f->GetListOfKeys();
1706    //    lk->Print();
1707        TIter next(lk);
1708        TKey *key =0;
1709    
1710        Int_t nev = 0;
1711    
1712        while( (key = (TKey*)next()) ){
1713            
1714    //      cout << key->GetName() << ""<<key->GetClassName()<<endl;
1715    //              cout << " Get tree: " << f->Get(key->GetName())<<endl;
1716    //      nev_previous = nev;
1717    //      cout << " n.entries  "<< nev <<endl;
1718    //      if( key->GetClassName()=="TTree" && nev_previous && nev != nev_previous ){
1719    //          nev = ((TTree*)f->Get(key->GetName()))->GetEntries();
1720    //          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- "<< key->GetName() << " tree: n.entries does not match "<<nev<<" "<<nev_previous<< endl;
1721    //          return false;
1722    //      };
1723    
1724            if( !strcmp(key->GetName(),"Run"        ) )RUN__ok = true;      
1725    
1726            //=========================================================    
1727            if( !strcmp(key->GetName(),"Trigger"    ) ){
1728                TRG__ok = true;
1729                if(TRG){
1730                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("Trigger"))->GetEntries();
1731                    if( nev && nevt!=nev){
1732                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Trigger tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1733                        return false;
1734                    }
1735                    nev=nevt;
1736                }
1737            }
1738            //=========================================================    
1739            if( !strcmp(key->GetName(),"ToF"        ) ){
1740                TOF__ok = true;
1741                if(TOF){
1742                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("ToF"))->GetEntries();
1743                    if( nev && nevt!=nev){
1744                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- ToF tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1745                        return false;
1746                    }
1747                    nev=nevt;
1748                }
1749            }
1750            //=========================================================  
1751            if( !strcmp(key->GetName(),"S4"         ) ){
1752                S4__ok = true;
1753                if(S4){
1754                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("S4"))->GetEntries();
1755                    if( nev && nevt!=nev){
1756                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- S4 tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1757                        return false;
1758                    }
1759                    nev=nevt;
1760                }
1761            }
1762            //=========================================================  
1763    
1764            if( !strcmp(key->GetName(),"NeutronD"   ) ){
1765                ND__ok = true;
1766                if(ND){
1767                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("NeutronD"))->GetEntries();
1768                    if( nev && nevt!=nev){
1769                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- NeutronD tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1770                        return false;
1771                    }
1772                    nev=nevt;
1773                }
1774            }      
1775            //=========================================================  
1776            if( !strcmp(key->GetName(),"Anticounter") ){
1777                AC__ok = true;
1778                if(AC){
1779                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("Anticounter"))->GetEntries();
1780                    if( nev && nevt!=nev){
1781                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Anticounter tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1782                        return false;
1783                    }
1784                    nev=nevt;
1785                }
1786            }
1787            //=========================================================  
1788            if( !strcmp(key->GetName(),"OrbitalInfo") ){
1789                ORB__ok = true;
1790                if(ORB){
1791                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("OrbitalInfo"))->GetEntries();
1792                    if( nev && nevt!=nev){
1793                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- OrbitalInfo tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1794                        return false;
1795                    }
1796                    nev=nevt;
1797                }
1798            }
1799            //=========================================================  
1800            if( !strcmp(key->GetName(),"Tracker"    ) ){
1801                TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");
1802                if(TRK1||TRK2||TRKh){
1803                    Int_t nevt = T->GetEntries();
1804                    if( nev && nevt!=nev){
1805                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Tracker tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1806                        return false;
1807                    }
1808                    nev=nevt;
1809                }
1810                for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){
1811                    TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();
1812                    if( !name.CompareTo("TrkLevel1") )TRK1__ok=true;
1813                    if( !name.CompareTo("TrkLevel2") )TRK2__ok=true;
1814                    if( !name.CompareTo("TrkHough") )TRKh__ok=true;
1815                };      
1816                T->Delete();
1817            };
1818            //=========================================================  
1819            if( !strcmp(key->GetName(),"Calorimeter"    ) ){
1820                TTree *T = (TTree*)f->Get("Calorimeter");
1821                if(CAL1||CAL2){
1822                    Int_t nevt = T->GetEntries();
1823                    if( nev && nevt!=nev){
1824                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Calorimeter tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1825                        return false;
1826                    }
1827                    nev=nevt;
1828                }
1829                for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){
1830                    TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();
1831                    if( !name.CompareTo("CaloLevel1") )CAL1__ok=true;
1832                    if( !name.CompareTo("CaloLevel2") )CAL2__ok=true;
1833                };    
1834                T->Delete();
1835            };      
1836    
1837        };
1838        
1839    //     cout<< "CheckLevel2File(TString): detector list --> ";
1840    //     if(TRK1__ok)cout<<"TRK1 ";
1841    //     if(TRK2__ok)cout<<"TRK2 ";
1842    //     if(TRKh__ok)cout<<"TRKH ";
1843    //     if(CAL1__ok)cout<<"CAL1 ";
1844    //     if(CAL2__ok)cout<<"CAL2 ";
1845    //     if(TOF__ok)cout<<"TOF ";
1846    //     if(TRG__ok)cout<<"TRG ";
1847    //     if(AC__ok)cout<<"AC ";
1848    //     if(ND__ok)cout<<"ND ";
1849    //     if(S4__ok)cout<<"S4 ";
1850    //     if(ORB__ok)cout<<"ORB ";
1851    //     cout << endl;
1852    
1853    
1854        if(TRK2 && TRK1__ok)TRK1=1;
1855    // ----------------------------------------------------------------------------
1856    // NOTA
1857    // se c'e` il level1, lo devo necessarimente leggere.
1858    // infatti (non ho capito perche`) i cluster vengono letti e allocati in memoria
1859    // comunque, ma non vengono disallocati da PamLevel2::Clear()
1860    // ----------------------------------------------------------------------------
1861    
1862    
1863        if(!RUN__ok) {
1864            cout << "File: "<< f->GetName() <<" *WARNING* ---- Missing RunInfo tree"<< endl;
1865    //      return false;
1866        };
1867    
1868        if(CAL1 && !CAL1__ok){
1869            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing CaloLevel1 branch"<< endl;
1870            return false;
1871        };
1872        if(CAL2 && !CAL2__ok){
1873            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing CaloLevel2 branch"<< endl;
1874            return false;
1875        };
1876        if(TRK2 && !TRK2__ok){
1877            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing TrkLevel2 branch"<< endl;
1878            return false;
1879        };
1880        if(TRK1 && !TRK1__ok){
1881            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing TrkLevel1 branch"<< endl;
1882            return false;
1883        };
1884        if(TRKh && !TRKh__ok){
1885            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing TrkHough branch"<< endl;
1886            return false;
1887        };
1888        if(ORB && !ORB__ok){
1889            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ORB tree"<< endl;
1890            return false;
1891        };
1892        if(AC && !AC__ok){
1893            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing AC tree"<< endl;
1894            return false;
1895        };
1896        if(S4 && !S4__ok){
1897            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing S4 tree"<< endl;
1898            return false;
1899        };
1900        if(TOF && !TOF__ok){
1901            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ToF tree"<< endl;
1902            return false;
1903        };
1904    
1905        if(ND && !ND__ok){
1906            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ND tree"<< endl;
1907            return false;
1908        };
1909        if(TRG && !TRG__ok){
1910            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing Trigger tree"<< endl;
1911            return false;
1912        };
1913        
1914    
1915    //    lk->Delete();
1916    //    delete lk;
1917        f->Close();
1918    
1919    //     cout<< "CheckLevel2File(TString): detector list --> ";
1920    //     if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
1921    //     if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
1922    //     if(TRKh)cout<<"TRKH ";
1923    //     if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
1924    //     if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
1925    //     if(TOF)cout<<"TOF ";
1926    //     if(TRG)cout<<"TRG ";
1927    //     if(AC)cout<<"AC ";
1928    //     if(ND)cout<<"ND ";
1929    //     if(S4)cout<<"S4 ";
1930    //     if(ORB)cout<<"ORB ";
1931    //     cout << endl;
1932          
1933        return true;
1934                    
1935          Bool_t FLAG = true;  };
1936          if(!RUN__ok) {  
1937                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing RunInfo tree"<< endl;  
1938                  FLAG = false;  /**
1939          };   * Create clone-trees
1940          if(CAL && !CAL__ok){   */
1941                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing Calorimeter tree"<< endl;  void PamLevel2::CreateCloneTrees0( TChain *fChain, TFile *ofile ){
1942                  FLAG = false;  
1943          };      cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
1944          if(TRK && !TRK__ok){      cout << "Create clones of PAMELA trees "<<endl;
1945                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing Tracker tree"<< endl;      
1946                  FLAG = false;      Int_t i=0;
1947          };      tree_clone[i] = fChain->GetTree()->CloneTree(0);
1948          if(TRK_L1 && !TRK_L1__ok){      TString name =  tree_clone[i]->GetName();
1949                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing Tracker Level1 Branch"<< endl;      name.Append("_clone");
1950                  FLAG = false;  //    tree_clone[i]->SetName(name.Data());
1951          };      cout << tree_clone[i]->GetName() <<endl;
1952          if(TRG && !TRG__ok){      i++;
1953                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing Trigger tree"<< endl;  
1954                  FLAG = false;      TList *li = fChain->GetListOfFriends();
1955          };      TIter next(li);
1956          if(TOF && !TOF__ok){      TFriendElement* T_friend=0;
1957                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ToF tree"<< endl;      ofile->cd();
1958                  FLAG = false;      while( (T_friend = (TFriendElement*)next()) ){
1959          };  //      cout<<T_friend->IsA()->GetName()<<" "<<T_friend->GetName()<<hex << T_friend->GetTree() << dec<<endl;
1960          if(S4 && !S4__ok){  //      cout<<T_friend->GetTree()->GetName()<< endl;
1961                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing S4 tree"<< endl;          tree_clone[i] = T_friend->GetTree()->CloneTree(0);
1962                  FLAG = false;          tree_clone[i]->SetAutoSave(1000000);
1963            name =  tree_clone[i]->GetName();
1964            name.Append("_clone");
1965    //      tree_clone[i]->SetName(name.Data());
1966            cout << tree_clone[i]->GetName() << endl;
1967            i++;
1968        }
1969        
1970        delete li;
1971    
1972        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
1973    
1974    }
1975    
1976    /**
1977     * Create clone-trees
1978     */
1979    void PamLevel2::CreateCloneTrees(TFile *ofile){
1980    
1981        ofile->cd();
1982    
1983        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
1984        cout << "Create new PAMELA trees "<<endl;
1985            
1986        Int_t i=0;
1987    
1988        if(TRK1||TRK2||TRKh){
1989            tree_clone[i] = new TTree("Tracker","PAMELA tracker level2 data ");    
1990            if(TRK1) {
1991                tree_clone[i]->Branch("TrkLevel1","TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel1"));
1992                tree_clone[i]->BranchRef();
1993                cout << "Tracker      : branch TrkLevel1"<<endl;
1994            };
1995            if(TRK2) {
1996                tree_clone[i]->Branch("TrkLevel2", "TrkLevel2",GetPointerTo("TrkLevel2"));
1997                cout << "Tracker      : branch TrkLevel2"<<endl;        
1998            };
1999            if(TRKh) {
2000                tree_clone[i]->Branch("TrkHough","TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
2001                cout << "Tracker      : branch TrkHough"<<endl;
2002          };          };
2003          if(ND && !ND__ok){          i++;
2004                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ND tree"<< endl;      }
2005                  FLAG = false;  
2006        // Calorimeter
2007        if(CAL1||CAL2){
2008            tree_clone[i] = new TTree("Calorimeter","PAMELA calorimeter level2 data ");    
2009            if(CAL1) {
2010                tree_clone[i]->Branch("CaloLevel1", "CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
2011                cout << "Calorimeter  : branch CaloLevel1"<<endl;
2012            };
2013            if(CAL2) {
2014                tree_clone[i]->Branch("CaloLevel2","CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
2015                cout << "Calorimeter  : branch CaloLevel2"<<endl;
2016          };          };
2017          if(AC && !AC__ok){          i++;
2018                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing AC tree"<< endl;      }    
2019                  FLAG = false;  
2020        // ToF    
2021        if(TOF) {
2022            tree_clone[i] = new TTree("ToF","PAMELA ToF level2 data ");    
2023            tree_clone[i]->Branch("ToFLevel2","ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
2024            cout << "ToF          : branch ToFLevel2"<<endl;
2025            i++;
2026        };
2027        // Trigger
2028        if(TRG) {
2029            tree_clone[i] = new TTree("Trigger","PAMELA trigger level2 data ");    
2030            tree_clone[i]->Branch("TrigLevel2","TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
2031            cout << "Trigger      : branch TrigLevel2"<<endl;
2032            i++;
2033        };
2034        // S4
2035        if(S4) {
2036            tree_clone[i] = new TTree("S4","PAMELA S4 level2 data ");      
2037            tree_clone[i]->Branch("S4Level2","S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
2038            cout << "S4           : branch S4Level2"<<endl;
2039            i++;
2040        };
2041        // Neutron Detector
2042        if(ND) {
2043            tree_clone[i] = new TTree("NeutronD","PAMELA neutron detector level2 data ");  
2044            tree_clone[i]->Branch("NDLevel2","NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
2045            cout << "NeutronD     : branch NDLevel2"<<endl;
2046            i++;
2047        };
2048        // Anticounters
2049        if(AC) {
2050            tree_clone[i] = new TTree("Anticounter","PAMELA anticounter detector level2 data ");    
2051            tree_clone[i]->Branch("AcLevel2","AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
2052            cout << "Anticounter  : branch AcLevel2"<<endl;
2053            i++;
2054        };
2055        // OrbitalInfo
2056        if(ORB) {
2057            tree_clone[i] = new TTree("OrbitalInfo","PAMELA oribital info  ");      
2058            tree_clone[i]->Branch("OrbitalInfo","OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
2059            cout << "OrbitalInfo  : branch OrbitalInfo"<<endl;
2060            i++;
2061        };
2062        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2063    
2064    }
2065    
2066    
2067    /**
2068     * Fill tree (created with CreateCloneTrees)
2069     *
2070     */
2071    //void PamLevel2::FillNewPamTree(TTree *T){
2072    void PamLevel2::FillCloneTrees(){
2073            
2074        for(Int_t i=0; i<8; i++){
2075            if(tree_clone[i])tree_clone[i]->Fill();
2076        }
2077    }
2078    
2079    
2080    TTree* PamLevel2::GetCloneTree(TString name){
2081    
2082        for(Int_t i=0; i<8; i++){  
2083            if(tree_clone[i]){
2084                TString na = tree_clone[i]->GetName();
2085                if(!name.CompareTo(na))return tree_clone[i];
2086          };          };
2087          if(ORB && !ORB__ok){      }
2088                  cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ORB tree"<< endl;      return NULL;
2089                  FLAG = false;  
2090    }
2091    void PamLevel2::WriteCloneTrees(){
2092        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2093        cout << "Write clones of PAMELA trees "<<endl;
2094        for(Int_t i=0; i<8; i++){  
2095            if(tree_clone[i]){
2096                cout << tree_clone[i]->GetName()<<endl;
2097                tree_clone[i]->Write();
2098          };          };
2099                }
2100          return FLAG;      cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2101            
2102  };  }
2103    
2104    /**
2105     * Create a new (empty) Pamela trees
2106     */
2107    // TTree* PamLevel2::GetNewPamTree(){
2108    
2109    //     if(tree_clone)return tree_clone;
2110    
2111    //     TTree *Tout = 0;
2112        
2113    //     cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2114    //     cout << "Create new PAMELA trees "<<endl;
2115        
2116        
2117    //     if(TRK1||TRK2||TRKh){
2118    //      TTree *T = new TTree("Tracker_clone","PAMELA tracker level2 data ");    
2119    //      if(TRK1) {
2120    //          trk1_clone = new TrkLevel1();
2121    //          T->Branch("TrkLevel1","TrkLevel1", &trk1_clone);
2122    //          T->BranchRef();
2123    //          cout << "Tracker      : branch TrkLevel1"<<endl;
2124    //      };
2125    //      if(TRK2) {
2126    //          trk2_clone = new TrkLevel2();
2127    //          T->Branch("TrkLevel2", "TrkLevel2",&trk2_clone);
2128    //          cout << "Tracker      : branch TrkLevel2"<<endl;        
2129    //      };
2130    //      if(TRKh) {
2131    //          trkh_clone = new TrkHough();
2132    //          T->Branch("TrkHough","TrkHough", &trkh_clone);
2133    //          cout << "Tracker      : branch TrkHough"<<endl;
2134    //      };
2135    //      if(!Tout)Tout=T;
2136    //      else Tout->AddFriend("Tracker_clone");
2137    //     }
2138    
2139    //     // Calorimeter
2140    //     if(CAL1||CAL2){
2141    //      TTree *C = new TTree("Calorimeter_clone","PAMELA calorimeter level2 data ");    
2142    //      if(CAL1) {
2143    //          calo1_clone = new CaloLevel1();
2144    //          C->Branch("CaloLevel1", "CaloLevel1", &calo1_clone);
2145    //          cout << "Calorimeter  : branch CaloLevel1"<<endl;
2146    //      };
2147    //      if(CAL2) {
2148    //          calo2_clone = new CaloLevel2();
2149    //          C->Branch("CaloLevel2","CaloLevel2", &calo2_clone);
2150    //          cout << "Calorimeter  : branch CaloLevel2"<<endl;
2151    //      };
2152    //      if(!Tout)Tout=C;
2153    //      else Tout->AddFriend("Calorimeter_clone");
2154    //     }    
2155    
2156    //     // ToF    
2157    //     if(TOF) {
2158    //      TTree *O = new TTree("ToF_clone","PAMELA ToF level2 data ");    
2159    //      tof_clone = new ToFLevel2();
2160    //      O->Branch("ToFLevel2","ToFLevel2", &tof_clone);
2161    //      cout << "ToF          : branch ToFLevel2"<<endl;
2162    //      if(!Tout)Tout=O;
2163    //      else Tout->AddFriend("ToF_clone");
2164    //     };
2165    //     // Trigger
2166    //     if(TRG) {
2167    //      TTree *R = new TTree("Trigger_clone","PAMELA trigger level2 data ");    
2168    //      trig_clone = new TrigLevel2();
2169    //      R->Branch("TrigLevel2","TrigLevel2", &trig_clone);
2170    //      cout << "Trigger      : branch TrigLevel2"<<endl;
2171    //      if(!Tout)Tout=R;
2172    //      else Tout->AddFriend("Trigger_clone");
2173    //     };
2174    //     // S4
2175    //     if(S4) {
2176    //      TTree *S = new TTree("S4_clone","PAMELA S4 level2 data ");      
2177    //      s4_clone = new S4Level2();
2178    //      S->Branch("S4Level2","S4Level2", &s4_clone);
2179    //      cout << "S4           : branch S4Level2"<<endl;
2180    //      if(!Tout)Tout=S;
2181    //      else Tout->AddFriend("S4_clone");
2182    //     };
2183    //     // Neutron Detector
2184    //     if(ND) {
2185    //      TTree *N = new TTree("NeutronD_clone","PAMELA neutron detector level2 data ");  
2186    //      nd_clone = new NDLevel2();
2187    //      N->Branch("NDLevel2","NDLevel2", &nd_clone);
2188    //      cout << "NeutronD     : branch NDLevel2"<<endl;
2189    //      if(!Tout)Tout=N;
2190    //      else Tout->AddFriend("NeutronD_clone");
2191    //     };
2192    //     // Anticounters
2193    //     if(AC) {
2194    //      TTree *A = new TTree("Anticounter_clone","PAMELA anticounter detector level2 data ");  
2195    //      ac_clone = new AcLevel2();
2196    //      A->Branch("AcLevel2","AcLevel2", &ac_clone);
2197    //      cout << "Anticounter  : branch AcLevel2"<<endl;
2198    //      if(!Tout)Tout=A;
2199    //      else Tout->AddFriend("Anticounter_clone");
2200    //     };
2201    //     // OrbitalInfo
2202    //     if(ORB) {
2203    //      TTree *B = new TTree("OrbitalInfo_clone","PAMELA oribital info  ");    
2204    //      orb_clone = new OrbitalInfo();
2205    //      B->Branch("OrbitalInfo","OrbitalInfo", &orb_clone);
2206    //      cout << "OrbitalInfo  : branch OrbitalInfo"<<endl;
2207    //      if(!Tout)Tout=B;
2208    //      else Tout->AddFriend("OrbitalInfo_clone");
2209    //     };
2210    //     cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2211    
2212    //     tree_clone = Tout;
2213    //     tree_clone->SetDirectory(0);
2214    
2215    //     return Tout;
2216    // }
2217    // /**
2218    //  * Fill a tree (created with GetNewPamTree)
2219    //  *
2220    //  */
2221    // //void PamLevel2::FillNewPamTree(TTree *T){
2222    // void PamLevel2::FillNewPamTree(){
2223            
2224    
2225    //     if(trk1_clone)  *trk1_clone = *trk1_obj;
2226    //     if(trk2_clone){
2227    //      trk2_clone->Clear();
2228    //      trk2_obj->Copy(*trk2_clone);
2229    // //   *trk2_clone = *trk2_obj;
2230    //     }
2231    //     if(trkh_clone)  *trkh_clone = *trkh_obj;
2232    //     if(calo1_clone){
2233    // //   *calo1_clone = *calo1_obj;
2234    //      calo1_clone->Clear();
2235    //      calo1_obj->Copy(*calo1_clone);
2236    //     }
2237    //     if(calo2_clone){
2238    // //   *calo2_clone = *calo2_obj;
2239    //      calo2_clone->Clear();
2240    //      calo2_obj->Copy(*calo2_clone);
2241    //     }
2242    //     if(tof_clone)   *tof_clone  = *tof_obj;
2243    //     if(trig_clone)  *trig_clone = *trig_obj;
2244    //     if(s4_clone)    *s4_clone   = *s4_obj;
2245    //     if(nd_clone)    *nd_clone   = *nd_obj;
2246    //     if(ac_clone)    *ac_clone   = *ac_obj;
2247    //     if(orb_clone)   *orb_clone  = *orb_obj;
2248    
2249    //     TTree *T = tree_clone;
2250    
2251    //     T->Fill(); //fill main tree
2252    // //    cout<<T->IsA()->GetName()<<" "<<T->GetName()<<endl;
2253    //     TList *li = T->GetListOfFriends();
2254    //     TIter next(li);
2255    //     TFriendElement* T_friend=0;
2256    //     while( (T_friend = (TFriendElement*)next()) ){
2257    // //   cout<<T_friend->IsA()->GetName()<<" "<<T_friend->GetName()<<hex << T_friend->GetTree() << dec<<endl;
2258    //      T_friend->GetTree()->Fill();//fill friends
2259    //     }
2260    
2261    // }

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