/[PAMELA software]/PamelaLevel2/src/PamLevel2.cpp
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Diff of /PamelaLevel2/src/PamLevel2.cpp

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revision 1.1 by pam-fi, Fri Jun 16 16:43:55 2006 UTC revision 1.12 by pam-fi, Wed Dec 13 09:57:29 2006 UTC
# Line 24  PamTrack::PamTrack(TrkTrack* t, CaloTrkV Line 24  PamTrack::PamTrack(TrkTrack* t, CaloTrkV
24      tof_track  = this->ToFTrkVar::GetToFTrkVar();      tof_track  = this->ToFTrkVar::GetToFTrkVar();
25      if(t) *trk_track  = *t;      if(t) *trk_track  = *t;
26      if(c) *calo_track = *c;      if(c) *calo_track = *c;
27      if(o) *tof_track  = *o;      if(o) *tof_track  = *o;    
28  };  };
29    
30  //--------------------------------------  //--------------------------------------
# Line 35  PamTrack::PamTrack(TrkTrack* t, CaloTrkV Line 35  PamTrack::PamTrack(TrkTrack* t, CaloTrkV
35   * Constructor   * Constructor
36   */   */
37  PamLevel2::PamLevel2(){  PamLevel2::PamLevel2(){
38      trk_obj  = this->TrkLevel2::GetTrkLevel2();          
39      calo_obj = this->CaloLevel2::GetCaloLevel2();      trk2_obj  = TrkLevel2::GetTrkLevel2();
40      tof_obj  = this->ToFLevel2::GetToFLevel2();      trk1_obj  = TrkLevel1::GetTrkLevel1();
41      trig_obj = this->TrigLevel2::GetTrigLevel2();      trkh_obj  = TrkHough::GetTrkHough();
42      s4_obj   = this->S4Level2::GetS4Level2();      calo1_obj = CaloLevel1::GetCaloLevel1();
43      nd_obj   = this->NDLevel2::GetNDLevel2();      calo2_obj = CaloLevel2::GetCaloLevel2();
44      ac_obj   = this->AcLevel2::GetAcLevel2();      tof_obj   = ToFLevel2::GetToFLevel2();
45        trig_obj  = TrigLevel2::GetTrigLevel2();
46        s4_obj    = S4Level2::GetS4Level2();
47        nd_obj    = NDLevel2::GetNDLevel2();
48        ac_obj    = AcLevel2::GetAcLevel2();
49        orb_obj   = OrbitalInfo::GetOrbitalInfo();
50    
51        run_obj   = new GL_RUN();
52        
53    //     trk1_clone  = 0;
54    //     trk2_clone  = 0;
55    //     trkh_clone  = 0;
56    //     calo1_clone = 0;
57    //     calo2_clone = 0;
58    //     tof_clone   = 0;
59    //     trig_clone  = 0;
60    //     s4_clone    = 0;
61    //     nd_clone    = 0;
62    //     ac_clone    = 0;
63    //     orb_clone   = 0;
64    
65    //     T_clone  = 0;
66    //     C_clone  = 0;
67    //     O_clone  = 0;
68    //     R_clone  = 0;
69    //     S_clone  = 0;
70    //     N_clone  = 0;
71    //     A_clone  = 0;
72    //     B_clone  = 0;
73    
74        for(Int_t i=0; i<8; i++ )tree_clone[i]=NULL;
75    
76        sorted_tracks = new TRefArray();
77        
78        CAL1 = true;
79        CAL2 = true;
80        TRK2 = true;
81        TRK1 = false;
82        TRKh = false;
83        TRG = true;
84        TOF = true;
85        S4  = true;
86        ND  = true;
87        AC  = true;
88        ORB = true;
89        
90        RUN = true;
91    
92    };
93    /**
94     * Destructor
95     */
96    PamLevel2::~PamLevel2(){                
97        delete run_obj;
98        Clear();
99    };
100    /**
101     * Clear the event
102     */
103    void PamLevel2::Clear(){
104            
105        TrkLevel1::Clear();
106            
107        TrkLevel2::Clear();
108        CaloLevel2::Clear();
109        ToFLevel2::Clear();
110        TrigLevel2::Clear();
111        S4Level2::Clear();
112        NDLevel2::Clear();
113        AcLevel2::Clear();
114        OrbitalInfo::Clear();
115    
116    //     if(trk1_clone)trk1_clone->Clear();
117    //     if(trk2_clone)trk2_clone->Clear();
118    //     if(trkh_clone)trkh_clone->Clear();
119    //     if(calo1_clone)calo1_clone->Clear();
120    //     if(calo2_clone)calo2_clone->Clear();
121    //     if(tof_clone)tof_clone->Clear();
122    //     if(trig_clone)trig_clone->Clear();
123    //     if(s4_clone)s4_clone->Clear();
124    //     if(nd_clone)nd_clone->Clear();
125    //     if(ac_clone)ac_clone->Clear();
126    //     if(orb_clone)orb_clone->Clear();
127        
128        sorted_tracks->Delete(); // clean the reference array
129        
130    };
131    
132    
133    //--------------------------------------
134    //
135    //
136    //--------------------------------------
137    void *PamLevel2::GetPointerTo(const char* c ){
138    
139        TString objname = c;
140        if(!objname.CompareTo("TrkLevel1"))return &trk1_obj;
141        if(!objname.CompareTo("TrkLevel2"))return &trk2_obj;
142        if(!objname.CompareTo("TrkHough"))return &trkh_obj;
143        if(!objname.CompareTo("CaloLevel1"))return &calo1_obj;
144        if(!objname.CompareTo("CaloLevel2"))return &calo2_obj;
145        if(!objname.CompareTo("ToFLevel2"))return &tof_obj;
146        if(!objname.CompareTo("TrigLevel2"))return &trig_obj;
147        if(!objname.CompareTo("S4Level2"))return &s4_obj;
148        if(!objname.CompareTo("NDLevel2"))return &nd_obj;
149        if(!objname.CompareTo("AcLevel2"))return &ac_obj;
150        if(!objname.CompareTo("OrbitalInfo"))return &orb_obj;
151        if(!objname.CompareTo("RunInfo"))return &run_obj;
152        return NULL;
153  };  };
154  //--------------------------------------  //--------------------------------------
155  //  //
156  //  //
157  //--------------------------------------  //--------------------------------------
158  /**  /**
159     * Retrieves the calorimeter track matching the seqno-th tracker stored track.
160     * (If seqno = -1 retrieves the self-trigger calorimeter track)
161     */
162     CaloTrkVar *PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int seqno){
163            
164         if( CaloLevel2::ntrk()==0 ){
165             cout << "PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" but no Calorimeter tracks are stored"<<endl;
166             return NULL;
167         };
168        
169         CaloTrkVar *c = 0;
170         Int_t it_calo=0;
171        
172         do{
173             c = CaloLevel2::GetCaloTrkVar(it_calo);
174             it_calo++;
175         } while( c && seqno != c->trkseqno && it_calo < CaloLevel2::ntrk());      
176        
177         if(!c || seqno != c->trkseqno){
178             c = 0;
179             if(seqno!=-1)cout << "PamLevel2::GetCaloStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" does not match Calorimeter stored tracks"<<endl;
180         };
181         return c;
182        
183     };
184    //--------------------------------------
185     //
186     //
187    //--------------------------------------
188    /**
189      * Retrieves the ToF track matching the seqno-th tracker stored track.
190      * (If seqno = -1 retrieves the tracker-independent tof track)
191     */
192     ToFTrkVar *PamLevel2::GetToFStoredTrack(int seqno){
193            
194         if( ToFLevel2::ntrk()==0 ){
195             cout << "PamLevel2::GetToFStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" but no ToF tracks are stored"<<endl;
196             return NULL;
197         };
198        
199         ToFTrkVar *c = 0;
200         Int_t it_tof=0;
201        
202         do{
203             c = ToFLevel2::GetToFTrkVar(it_tof);
204             it_tof++;
205         } while( c && seqno != c->trkseqno && it_tof < ToFLevel2::ntrk());
206        
207         if(!c || seqno != c->trkseqno){
208             c = 0;
209             if(seqno!=-1)cout << "PamLevel2::GetToFStoredTrack(int) : requested tracker SeqNo "<< seqno <<" does not match ToF stored tracks"<<endl;
210         };
211         return c;
212        
213     };
214    
215    //--------------------------------------
216     //
217     //
218    //--------------------------------------
219    /**
220     * Give the pamela track associated to a tracker track, retrieving related calorimeter and tof track information.
221     */
222     PamTrack* PamLevel2::GetPamTrackAlong(TrkTrack* t){
223            
224         CaloTrkVar *c = 0;
225         ToFTrkVar  *o = 0;
226        
227         if(CAL2) c = GetCaloStoredTrack(t->GetSeqNo());
228         if(TOF) o = GetToFStoredTrack(t->GetSeqNo());
229        
230    //    if(t && c && o)track = new PamTrack(t,c,o);
231         PamTrack *track = new PamTrack(t,c,o);
232        
233         return track;
234    
235     };
236    //--------------------------------------
237    //
238    //
239    //--------------------------------------
240    /**
241   * Retrieves the it-th stored track.   * Retrieves the it-th stored track.
242   * It override TrkLevel2::GetTrack(int it).   * It override TrkLevel2::GetTrack(int it).
243   * @param itrk Track number, ranging from 0 to GetNTracks().   * @param itrk Track number, ranging from 0 to GetNTracks().
# Line 55  PamLevel2::PamLevel2(){ Line 245  PamLevel2::PamLevel2(){
245    
246  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_t itrk){  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_t itrk){
247            
248      // retrieve itrk-th tracker stored track      PamTrack *track = 0;
249      TrkTrack   *t = 0;      
250      CaloTrkVar *c = 0;      if( itrk >=0 && itrk < TrkLevel2::ntrk() ){
251      ToFTrkVar  *o = 0;          
252            TrkTrack *t = TrkLevel2::GetStoredTrack(itrk);
253      if( itrk >=0 && itrk < TrkLevel2::ntrk() ){          track = GetPamTrackAlong(t);
254          t = TrkLevel2::GetStoredTrack(itrk);              
255          c = CaloLevel2::GetCaloTrkVar(t->GetSeqNo());      }else{
256          o = ToFLevel2::GetToFTrkVar(t->GetSeqNo());          cout << "PamLevel2::GetStoredTrack(int) : tracker track SeqNo "<< itrk <<" does not exist (GetNTracks() = "<<TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
257      };      };
     //  retrieve related ToF-track  
258            
     // hence create a "PamTrack" object  
     PamTrack *track = 0;  
     if(t && c && o)track = new PamTrack(t,c,o);  
259      return track;      return track;
260            
261  }  }
# Line 78  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_ Line 264  PamTrack* PamLevel2::GetStoredTrack(Int_
264  //  //
265  //--------------------------------------  //--------------------------------------
266  /**  /**
267   * Sort physical (tracker) tracks and stores them in a TObjectArray (of TrkTrack objects).   * Sort physical (tracker) tracks and stores them in the TRefArray (of TrkTrack objects) which pointer is  PamLevel2::sorted_tracks.
268   * The total number of physical tracks is given by GetNTracks() and the it-th physical track can be retrieved by means of the method GetTrack(int it).   * @param how String to set the sorting cryterium (es: "CAL" or "TRK+CAL+TOF" ecc...).
269   * This method overrides TrkLevel2::GetTracks(), where sorting is done by decreasing number of fit points and increasing chi^2.   * Sorting cryteria:
270   * PamLevel2::GetTracks() keeps the same track order given by TrkLevel2::GetTracks(), but checks image selection by using calorimeter and ToF tracking information.   * TRK: lower chi**2
271     * CAL: lower Y spatial residual on the first calorimeter plane
272     * TOF: bigger numebr of hit PMTs along the track, on S12 S21 S32 (where paddles are along the Y axis).
273     * The default sorting cryterium is "TOF+CAL".
274     *
275     * The total number of physical tracks is always given by GetNTracks() and the it-th physical track can be retrieved by means of the methods GetTrack(int it) and GetTrack(int it, TString how).
276   */   */
277  TClonesArray *PamLevel2::GetTracks(){  void PamLevel2::SortTracks(TString how){
278    
279      // define new array for sorted tracker tracks  //    cout << "call SortTracs() "<<endl;
280      TClonesArray *aa = new TClonesArray("TrkTrack");    //Save current Object count
281      TClonesArray &sorted = *aa;      Int_t ObjectNumber = TProcessID::GetObjectCount();
282    
283    //    cout << "ObjectNumber  "<<ObjectNumber <<endl;
284        
285        sorted_tracks->Delete(); //temporaneo???
286            
287      // loop over the tracks sorted by the tracker      // loop over the tracks sorted by the tracker
288      for(Int_t i=0; i < TrkLevel2::GetNTracks(); i++){      Bool_t use_TRK = how.Contains("TRK", TString::kIgnoreCase);
289        Bool_t use_CAL = how.Contains("CAL", TString::kIgnoreCase);
290          TrkTrack *ts=0;      Bool_t use_TOF = how.Contains("TOF", TString::kIgnoreCase);
291        
292        if( !CAL2 &&  use_CAL) use_CAL = false;
293        if( !TOF &&  use_TOF) use_TOF = false;
294        
295        if( !TRK2 ){
296    //      cout << "SortTracks() : without tracker does not work!!! (not yet)" << endl;
297            return;
298        };
299    
300        //   cout << "use_CAL "<<use_CAL<<" use_TOF "<<use_TOF<<" use_TRK "<<use_TRK <<endl;
301        
302        for(Int_t i=0; i < TrkLevel2::GetNTracks(); i++){
303            
304            TrkTrack *ts = 0;
305            
306          // get tracker tracks          // get tracker tracks
307          TrkTrack   *tp = TrkLevel2::GetTrack(i);                    //tracker          TrkTrack   *tp = TrkLevel2::GetTrack(i);                    //tracker
308          CaloTrkVar *cp = CaloLevel2::GetCaloTrkVar(tp->GetSeqNo()); //calorimeter          CaloTrkVar *cp = 0;
309          ToFTrkVar  *op = ToFLevel2::GetToFTrkVar(tp->GetSeqNo());   //tof          ToFTrkVar  *op = 0;
310    
311    //      cout << "trk track n. "<<i << " "<<hex<< tp <<dec<< endl;
312          // if track has an image, check image selection          // if track has an image, check image selection
313          if(tp->HasImage()){          if(tp->HasImage()){
314                
315              TrkTrack   *ti = TrkLevel2::GetTrackImage(i);              //tracker (image)              TrkTrack   *ti = TrkLevel2::GetTrackImage(i);              //tracker (image)
316              CaloTrkVar *ci = CaloLevel2::GetCaloTrkVar(ti->GetSeqNo());//calorimeter (image)              CaloTrkVar *ci = 0;
317              ToFTrkVar  *oi = ToFLevel2::GetToFTrkVar(ti->GetSeqNo());  //tof (image)              ToFTrkVar  *oi = 0;
318                
319    //          cout << "its image "<<i << " "<<hex<< ti <<dec<< endl;
320    
321              //assign starting scores              //assign starting scores
322              Int_t tp_score = 1;              Int_t tp_score = 0;  //main track sorted by the tracker
323              Int_t ti_score = 0;              Int_t ti_score = 0;  //image track
324                
325              // ------------------------              // ------------------------
326              // calorimeter check              // calorimeter check
327              // ------------------------              // ------------------------
328                // check the Y spatial residual on the first calorimeter plane
329                // (cut on calorimeter variables from Emiliano)
330              if(              if(
331                        npcfit[1] > 3   &&  //no. of fit planes on Y view                  use_CAL            &&
332  //              varcfit[1] < 50.&&  //fit variance on Y view                  npcfit[1] > 15     &&   //no. of fit planes on Y view
333                        true){                  varcfit[1] < 1000. &&  //fit variance on Y view
334                    true){
335                  Float_t resy_p = cp->tbar[0][1] - cbar[0][1];if(resy_p < 0)resy_p= - resy_p;  
336                  Float_t resy_i = ci->tbar[0][1] - cbar[0][1];if(resy_i < 0)resy_i= - resy_i;                  cp = GetCaloStoredTrack(tp->GetSeqNo());
337                    ci = GetCaloStoredTrack(ti->GetSeqNo());
338                    
339                    Float_t resy_p = cp->tbar[0][1] - cbar[0][1]; if(resy_p < 0)resy_p= - resy_p;
340                    Float_t resy_i = ci->tbar[0][1] - cbar[0][1]; if(resy_i < 0)resy_i= - resy_i;
341                    
342                  if(resy_p <= resy_i) tp_score++;                  if(resy_p <= resy_i) tp_score++;
343                  else                 ti_score++;                  else                 ti_score++;
344                        };  
345    //              cout << "CALO "<<tp_score<<ti_score<<endl;
346    
347                };
348              // ------------------------              // ------------------------
349              // TOF check              // TOF check
350              // ------------------------                  // ------------------------    
351                // check the number of hit pmts along the track
352                // on S12 S21 and S32, where paddles are parallel to Y axis
353                if( use_TOF ){
354                    
355                    Int_t nphit_p =0;
356                    Int_t nphit_i =0;
357                    
358                    op = GetToFStoredTrack(tp->GetSeqNo());
359                    oi = GetToFStoredTrack(ti->GetSeqNo());
360                    
361    /*                              cout << "track: npmtadc "<< op->npmtadc << endl;
362                                    cout << "track: npmttdc "<< op->npmttdc << endl;
363                                    cout << "image: npmtadc "<< oi->npmtadc << endl;
364                                    cout << "image: npmttdc "<< oi->npmttdc << endl;*/
365                    
366                    for (Int_t ih=0; ih < op->npmtadc; ih++){
367                        Int_t pl = GetPlaneIndex( (op->pmtadc).At(ih) );
368                        if(pl == 1 || pl == 2 || pl == 5)nphit_p++;
369                    };
370                    
371                    for (Int_t ih=0; ih < oi->npmtadc; ih++){
372                        Int_t pl = GetPlaneIndex( (oi->pmtadc).At(ih) );
373                        if(pl == 1 || pl == 2 || pl == 5)nphit_i++;
374                    };
375                    
376                    if(
377                        use_TOF            &&
378                        (nphit_p+nphit_i) !=0 &&    
379                        true){
380                        
381                        if( nphit_p >= nphit_i) tp_score++;
382                        else ti_score++;
383                    };
384    //              cout << "TOF "<<tp_score<<ti_score<<endl;
385                };
386                if(tp_score == ti_score) use_TRK = true;
387                // ------------------------
388                // tracker check
389                // ------------------------
390                // chi**2 difference is not always large enough to distinguish among
391                // the real track and its image.
392                // Tracker check will be applied always when calorimeter and tof information is ambiguous.
393                if(use_TRK){
394                    if(      tp->chi2 > 0 && tp->chi2 < ti->chi2 ) tp_score++ ;
395                    else if( ti->chi2 > 0 && ti->chi2 < tp->chi2 ) ti_score++ ;
396    //              cout << "TRK "<<tp_score<<ti_score<<endl;
397                };
398                
399              // ------------------------              // ------------------------
400              // the winner is....              // the winner is....
401              // ------------------------                  // ------------------------    
402                        if(tp_score > ti_score) ts = tp;//the track sorted by the tracker!!              if      (tp_score > ti_score) ts = tp;//the track sorted by the tracker!!
403                        else                    ts = ti;//its image!!              else if (tp_score < ti_score) ts = ti;//its image!!
404                else {
405                    ts = tp;
406    //                              cout << "Warning - track image ambiguity not solved" << endl;
407    //                              cout << ts->GetNtot() << " "<< ts->chi2 << " " << npcfit[1] << " "<< nphit_p << endl;
408                };
409                
410          }else{          }else{
411              ts = tp;              ts = tp;
412          };          };
413                    
414          new(sorted[i]) TrkTrack(*ts); //save the track in the sorted array  //      cout <<" SortTracks() "<<i<<" -- "<<ts<<endl;
415            sorted_tracks->Add(ts);//save the track in the sorted array
416    //      cout << "SortTracks:: sorted_tracks->Add(it) "<<i<<" "<<ts<<endl;
417            
418      };      };
419        //Restore Object count
420      return aa;      //To save space in the table keeping track of all referenced objects
421        //we assume that our events do not address each other. We reset the
422        //object count to what it was at the beginning of the event.
423        TProcessID::SetObjectCount(ObjectNumber);
424        
425  };  };
426  //--------------------------------------  //--------------------------------------
427  //  //
428  //  //
429  //--------------------------------------  //--------------------------------------
430  /**  /**
431     * This method overrides TrkLevel2::GetTracks(), where sorting is done by decreasing number of fit points and increasing chi^2.
432     * PamLevel2::GetTracks() keeps the same track order given by TrkLevel2::GetTracks(), but checks image selection by using calorimeter and ToF tracking information.
433     */
434    TRefArray *PamLevel2::GetTracks(){
435    
436    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
437        SortTracks("+CAL+TOF");
438    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
439    
440        return sorted_tracks;
441     };
442    //--------------------------------------
443     //
444     //
445    //--------------------------------------
446    /**
447   * Retrieves the it-th Pamela "physical" track.   * Retrieves the it-th Pamela "physical" track.
448   * It override TrkLevel2::GetTrack(int it).   * It override TrkLevel2::GetTrack(int it).
449   * @param it Track number, ranging from 0 to GetNTracks().   * @param it Track number, ranging from 0 to GetNTracks().
450   */   */
451  PamTrack *PamLevel2::GetTrack(int it){  PamTrack *PamLevel2::GetTrack(int it){
452            
453      TClonesArray *aa = this->GetTracks();  //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
454      TClonesArray &sorted = *aa;      SortTracks("+CAL+TOF");
455    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
     TrkTrack   *t = 0;  
     CaloTrkVar *c = 0;  
     ToFTrkVar  *o = 0;  
   
     if( it >=0 && it < TrkLevel2::GetNTracks() ){  
         t = (TrkTrack*)sorted[it];  
         c = CaloLevel2::GetCaloTrkVar(t->GetSeqNo());  
         o = ToFLevel2::GetToFTrkVar(t->GetSeqNo());  
     };  
456            
     // hence create a "PamTrack" object  
457      PamTrack *track = 0;      PamTrack *track = 0;
458      if(t && c && o)track = new PamTrack(t,c,o);      
459        if( it >=0 && it < TrkLevel2::GetNTracks() && it<sorted_tracks->GetEntriesFast() ){
460            TrkTrack   *t = (TrkTrack*)sorted_tracks->At(it);
461            track = GetPamTrackAlong(t);
462        }else{
463            cout << "PamLevel2::GetTrack(int) : tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
464        };
465        
466      return track;      return track;
467        
468  };  };
469    
470  //--------------------------------------  //--------------------------------------
471  //  //
472  //  //
473  //--------------------------------------  //--------------------------------------
474  /**  /**
475   * Retrieves (if present) the image of the it-th Pamela "physical" track, sorted by the method PamLevel2::GetTracks().   * Retrieves (if present) the image of the it-th Pamela "physical" track, sorted by the method PamLevel2::SortTracks().
476   * @param it Track number, ranging from 0 to GetNTracks().   * @param it Track number, ranging from 0 to GetNTracks().
477   */   */
478  PamTrack *PamLevel2::GetTrackImage(int it){  PamTrack *PamLevel2::GetTrackImage(int it){
479    
480      TClonesArray *aa = this->GetTracks();  //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
481      TClonesArray &sorted = *aa;      SortTracks("+CAL+TOF");
482    //  *-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
483      TrkTrack   *t = 0;      
484      CaloTrkVar *c = 0;      PamTrack *image = 0;
485      ToFTrkVar  *o = 0;      
   
486      if( it >=0 && it < TrkLevel2::GetNTracks() ){      if( it >=0 && it < TrkLevel2::GetNTracks() ){
487          TrkTrack *temp = (TrkTrack*)sorted[it];          TrkTrack *temp = (TrkTrack*)sorted_tracks->At(it);
488          if( temp->HasImage() ){          if( temp->HasImage() ){
489              t = TrkLevel2::GetStoredTrack(temp->GetImageSeqNo());              TrkTrack   *t = TrkLevel2::GetStoredTrack(temp->GetImageSeqNo());
490              c = CaloLevel2::GetCaloTrkVar(temp->GetImageSeqNo());              image = GetPamTrackAlong(t);
491              o = ToFLevel2::GetToFTrkVar(temp->GetImageSeqNo());          }else{
492                cout <<"PamLevel2::GetTrackImage(int) : Track SeqNo "<<it<<" does not have image"<<endl;
493          };          };
494        }else{
495            cout << "PamLevel2::GetTrackImage(int) : Tracker track SeqNo "<< it <<" does not exist (GetNTracks() = "<<TrkLevel2::GetNTracks()<<")"<<endl;
496      };      };
497            
     // hence create a "PamTrack" object  
     PamTrack *image = 0;  
     if(t && c && o)image = new PamTrack(t,c,o);  
498      return image;      return image;
       
499  }  }
500    
501  //--------------------------------------  //--------------------------------------
# Line 209  PamTrack *PamLevel2::GetTrackImage(int i Line 503  PamTrack *PamLevel2::GetTrackImage(int i
503  //  //
504  //--------------------------------------  //--------------------------------------
505  /**  /**
506   * Get the Pamela detector trees and make them friends.   * Get the Pamela detector trees in a single file and make them friends.
507     * @param f TFile pointer
508     * @param detlist String to select trees to be included
509     * @return Pointer to a TTree
510   */   */
511  TTree *PamLevel2::LoadPamTrees(TFile *f){  TTree *PamLevel2::GetPamTree(TFile *f, TString detlist ){
512        
513      TTree *Tout =0;  //     if( !detlist.IsNull() ) SetWhichTrees(detlist);
514        //     else                    GetWhichTrees(f);
515      // Tracker      SetWhichTrees(detlist);
516    
517        TTree *Trout =0;
518    
519        TString fname = f->GetName();
520        if(!CheckLevel2File(fname))return NULL;
521    
522        UInt_t *found=0;    
523    
524        cout<< "GetPamTree(TFile*,TString): detector list --> ";
525        if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
526        if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
527        if(TRKh)cout<<"TRKH ";
528        if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
529        if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
530        if(TOF)cout<<"TOF ";
531        if(TRG)cout<<"TRG ";
532        if(AC)cout<<"AC ";
533        if(ND)cout<<"ND ";
534        if(S4)cout<<"S4 ";
535        if(ORB)cout<<"ORB ";
536        cout << endl;
537    
538        f->cd();
539    
540    // Tracker
541      TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");      TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");
542      if(T) {      if(T && (TRK2||TRK1||TRKh)) {
543          T->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerToTrk());          if(TRK2)T->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerTo("TrkLevel2"));
544          cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;          else    T->SetBranchStatus("TrkLevel2",0,found);
545          if(!Tout)Tout=T;          if(TRK2)cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;
546            if(TRK1)T->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel1"));
547            else    T->SetBranchStatus("TrkLevel1",0,found);
548            if(TRK1)cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;
549            if(TRKh)T->SetBranchAddress("TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
550            else    T->SetBranchStatus("TrkHough",0,found);
551            if(TRKh)cout << "Tracker      : set branch address TrkHough"<<endl;
552            if(!Trout)Trout=T;
553            else Trout->AddFriend(T);
554      }else{      }else{
555          cout << "Tracker      : missing tree"<<endl;          cout << "Tracker      : missing tree"<<endl;
556      };      };
557      // Calorimeter      // Calorimeter
558      TTree *C = (TTree*)f->Get("Calorimeter");      TTree *C = (TTree*)f->Get("Calorimeter");
559      if(C) {      if(C && (CAL2||CAL1)) {
560          C->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerToCalo());          if(CAL2)C->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
561          cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;          else    C->SetBranchStatus("CaloLevel2",0,found);
562          if(!Tout)Tout=C;          if(CAL2)cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;
563          else Tout->AddFriend(C);          if(CAL1)C->SetBranchAddress("CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
564            else    C->SetBranchStatus("CaloLevel1",0,found);
565            if(CAL1)cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel1"<<endl;
566            if(!Trout)Trout=C;
567            else Trout->AddFriend(C);
568      }else{      }else{
569          cout << "Calorimeter  : missing tree"<<endl;          cout << "Calorimeter  : missing tree"<<endl;
570      };      };
571    
572      // ToF          // ToF    
573      TTree *O = (TTree*)f->Get("ToF");      TTree *O = (TTree*)f->Get("ToF");
574      if(O) {      if(O && TOF) {
575          O->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerToToF());          O->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
576          cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;          cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;
577          if(!Tout)Tout=O;          if(!Trout)Trout=O;
578          else Tout->AddFriend(O);          else Trout->AddFriend(O);
579      }else{      }else{
580          cout << "ToF         : missing tree"<<endl;          cout << "ToF         : missing tree"<<endl;
581      };      };
582      // Trigger      // Trigger
583      TTree *R = (TTree*)f->Get("Trigger");      TTree *R = (TTree*)f->Get("Trigger");
584      if(R) {      if(R && TRG) {
585          R->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerToTrig());          R->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
586          cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;          cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;
587          if(!Tout)Tout=O;          if(!Trout)Trout=O;
588          else Tout->AddFriend(R);          else Trout->AddFriend(R);
589      }else{      }else{
590          cout << "Trigger      : missing tree"<<endl;          cout << "Trigger      : missing tree"<<endl;
591      };      };
592      // S4      // S4
593      TTree *S = (TTree*)f->Get("S4");      TTree *S = (TTree*)f->Get("S4");
594      if(S) {      if(S && S4) {
595          S->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerToS4());          S->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
596          cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;          cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;
597          if(!Tout)Tout=O;          if(!Trout)Trout=O;
598          else Tout->AddFriend(S);          else Trout->AddFriend(S);
599      }else{      }else{
600          cout << "S4           : missing tree"<<endl;          cout << "S4           : missing tree"<<endl;
601      };      };
602      // Neutron Detector      // Neutron Detector
603      TTree *N = (TTree*)f->Get("NeutronD");      TTree *N = (TTree*)f->Get("NeutronD");
604      if(N) {      if(N && ND) {
605          N->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerToND());          N->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
606          cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;          cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;
607          if(!Tout)Tout=O;          if(!Trout)Trout=O;
608          else Tout->AddFriend(N);          else Trout->AddFriend(N);
609      }else{      }else{
610          cout << "NeutronD     : missing tree"<<endl;          cout << "NeutronD     : missing tree"<<endl;
611      };      };
612      // Anticounters      // Anticounters
613      TTree *A = (TTree*)f->Get("Anticounter");      TTree *A = (TTree*)f->Get("Anticounter");
614      if(A) {      if(A && AC) {
615          A->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerToAc());          A->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
616          cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;          cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;
617          if(!Tout)Tout=O;          if(!Trout)Trout=O;
618          else Tout->AddFriend(A);          else Trout->AddFriend(A);
619      }else{      }else{
620          cout << "Anticounter  : missing tree"<<endl;          cout << "Anticounter  : missing tree"<<endl;
621      };      };
622        // Orbital Info
623        TTree *B = (TTree*)f->Get("OrbitalInfo");
624        if(B && ORB) {
625            B->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
626            cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;
627            if(!Trout)Trout=O;
628            else Trout->AddFriend(B);
629        }else{
630            cout << "OrbitalInfo  : missing tree"<<endl;
631        };
632        
633        cout<<endl<<" Number of entries: "<<Trout->GetEntries()<<endl<<endl;
634        
635        return Trout;
636        
637    }
638    //--------------------------------------
639    //
640    //
641    //--------------------------------------
642    /**
643     * Get list of Level2 files.
644     * @param ddir Level2 data directory.
645     * @param flisttxt Name of txt file containing file list.
646     * @return Pointer to a TList of TSystemFiles
647     * If no input file list is given , all the Level2 files inside the directory are processed.
648     */
649    TList*  PamLevel2::GetListOfLevel2Files(TString ddir, TString flisttxt = ""){
650            
651        TString wdir = gSystem->WorkingDirectory();
652        
653        if(ddir=="")ddir = wdir;
654    //      TSystemDirectory *datadir = new TSystemDirectory(gSystem->BaseName(ddir),ddir);
655        cout << "Level2 data directory : "<<  ddir << endl;
656        
657        TList *contents  = new TList; // create output list
658        contents->SetOwner();
659        
660        char *fullpath;
661        
662        // if no input file list is given:  
663        if ( flisttxt != "" ){
664            
665            if( !gSystem->IsFileInIncludePath(flisttxt,&fullpath) ){
666                cout <<"File "<<flisttxt<<" not found"<<endl;
667                return 0;
668            }      
669    //              flisttxt = gSystem->ConcatFileName(gSystem->DirName(flisttxt),gSystem->BaseName(flisttxt));
670            flisttxt = fullpath;
671            
672            if( !gSystem->ChangeDirectory(ddir) ){
673                cout << "Cannot change directory : "<<ddir<<endl;
674                return 0;
675            }
676            
677            cout <<"Input file list : " << flisttxt <<endl;
678            ifstream in;
679            in.open(flisttxt, ios::in); //open input file list
680            int line=0;
681            while (1) {
682                TString file;
683                in >> file;
684                if (!in.good()) break;
685                line++;
686    //          cout <<"(1) " << file << endl;
687                if(file.IsNull()){
688                    cout << "-- list interrupted at line "<<line <<endl;
689                    break;
690                }
691                if(file.Contains("#"))file = file(0,file.First("#"));
692    //          cout <<"(2) " << file << endl;
693                if( gSystem->IsFileInIncludePath(file,&fullpath) ){
694    
695                    contents->Add(new TSystemFile(fullpath,gSystem->DirName(fullpath)));// add file to the list
696    
697                }else{
698    //              if(file.Data()!="")cout << "File: "<<file<<" ---> missing "<< endl;
699                };
700            };
701            in.close();
702            
703        }else{
704            
705            cout << "No input file list given."<<endl;
706            cout << "Check for existing root files."<<endl;
707    //              cout << "Warking directory: "<< gSystem->WorkingDirectory()<< endl;
708            
709            TSystemDirectory *datadir = new TSystemDirectory(gSystem->BaseName(ddir),ddir);
710            TList *temp = datadir->GetListOfFiles();
711    //              temp->Print();
712    //              cout << "*************************************" << endl;
713            
714            TIter next(temp);
715            TSystemFile *questo = 0;
716            
717            
718            while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {
719                TString name =  questo-> GetName();
720                if( name.EndsWith(".root") ){
721                    char *fullpath;
722                    gSystem->IsFileInIncludePath(name,&fullpath);
723                    contents->Add(new TSystemFile(fullpath,gSystem->DirName(fullpath)));
724                };
725            }
726            delete temp;
727            delete datadir;
728            
729        };
730        gSystem->ChangeDirectory(wdir); // back to the working directory
731    //      cout << endl << "Selected files:" << endl;
732    //      contents->Print();
733        cout << contents->GetEntries()<<" files selected\n";
734    //      cout << endl;
735    //      cout << "Working directory: "<< gSystem->WorkingDirectory()<< endl;
736        return contents;
737    };
738    //--------------------------------------
739    //
740    //
741    //--------------------------------------
742    /**
743     * Get the Pamela detector chains from a list of files and make them friends.
744     * @param fl Pointer to a TList of TSystemFiles
745     * @param detlist String to select trees to be included
746     * @return Pointer to a TChain
747     */
748    TChain *PamLevel2::GetPamTree(TList *fl, TString detlist ){
749        
750        TChain *Trout =0;
751    
752    //    if( !detlist.IsNull() )SetWhichTrees(detlist);
753        SetWhichTrees(detlist);
754        
755        cout<< "GetPamTree(TList*,TString): detector list --> ";
756        if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
757        if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
758        if(TRKh)cout<<"TRKH ";
759        if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
760        if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
761        if(TOF)cout<<"TOF ";
762        if(TRG)cout<<"TRG ";
763        if(AC)cout<<"AC ";
764        if(ND)cout<<"ND ";
765        if(S4)cout<<"S4 ";
766        if(ORB)cout<<"ORB ";
767        cout << endl;
768    
769    
770        
771        TChain *T = 0;      
772        TChain *C = 0;
773        TChain *O = 0;
774        TChain *R = 0;
775        TChain *S = 0;
776        TChain *N = 0;
777        TChain *A = 0;
778        TChain *B = 0;
779        
780        if(TRK2||TRK1||TRKh) T = new TChain("Tracker");    
781        if(CAL2||CAL1)       C = new TChain("Calorimeter");
782        if(TOF)              O = new TChain("ToF");
783        if(TRG)              R = new TChain("Trigger");
784        if(S4)               S = new TChain("S4");
785        if(ND)               N = new TChain("NeutronD");
786        if(AC)               A = new TChain("Anticounter");
787        if(ORB)              B = new TChain("OrbitalInfo");
788        
789        // loop over files and create chains        
790        TIter next(fl);
791        TSystemFile *questo = 0;
792        while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {
793            TString name =  questo->GetName();
794    //      cout << "File: "<< name << endl;
795            if( CheckLevel2File(name) ){
796                if(TRK2||TRK1||TRKh) T->Add(name);
797                if(CAL1||CAL2)       C->Add(name);
798                if(TOF)              O->Add(name);
799                if(TRG)              R->Add(name);
800                if(S4)               S->Add(name);
801                if(ND)               N->Add(name);
802                if(AC)               A->Add(name);
803                if(ORB)              B->Add(name);
804            };
805        }
806        
807        cout << "done chain \n";
808    
809        UInt_t *found=0;
810    // Tracker
811        if(T && (TRK2||TRK1||TRKh)) {
812            if(TRK2)T->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerTo("TrkLevel2"));
813            else    T->SetBranchStatus("TrkLevel2",0,found);
814            if(TRK2)cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;
815            if(TRK1)T->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel1"));
816            else    T->SetBranchStatus("TrkLevel1",0,found);
817            if(TRK1)cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;
818            if(TRKh)T->SetBranchAddress("TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
819            else    T->SetBranchStatus("TrkHough",0,found);
820            if(TRKh)cout << "Tracker      : set branch address TrkHough"<<endl;
821            if(!Trout)Trout=T;
822            else Trout->AddFriend("Tracker");
823        }else{
824            cout << "Tracker      : missing tree"<<endl;
825        };
826        // Calorimeter
827        if(C && (CAL2||CAL1)) {
828            if(CAL2)C->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
829            else    C->SetBranchStatus("CaloLevel2",0,found);
830            if(CAL2)cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;
831            if(CAL1)C->SetBranchAddress("CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
832            else    C->SetBranchStatus("CaloLevel1",0,found);
833            if(CAL1)cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel1"<<endl;
834            if(!Trout)Trout=C;
835            else Trout->AddFriend("Calorimeter");
836        }else{
837            cout << "Calorimeter  : missing tree"<<endl;
838        };
839        // ToF    
840        if(O && TOF) {
841            O->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
842            cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;
843            if(!Trout)Trout=O;
844            else Trout->AddFriend("ToF");
845        }else{
846            cout << "ToF         : missing tree"<<endl;
847        };
848        // Trigger
849        if(R && TRG) {
850            R->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
851            cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;
852            if(!Trout)Trout=O;
853            else Trout->AddFriend("Trigger");
854        }else{
855            cout << "Trigger      : missing tree"<<endl;
856        };
857        // S4
858        if(S && S4) {
859            S->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
860            cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;
861            if(!Trout)Trout=O;
862            else Trout->AddFriend("S4");
863        }else{
864            cout << "S4           : missing tree"<<endl;
865        };
866        // Neutron Detector
867        if(N && ND) {
868            N->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
869            cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;
870            if(!Trout)Trout=O;
871            else Trout->AddFriend("NeutronD");
872        }else{
873            cout << "NeutronD     : missing tree"<<endl;
874        };
875        // Anticounters
876        if(A && AC) {
877            A->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
878            cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;
879            if(!Trout)Trout=O;
880            else Trout->AddFriend("Anticounter");
881        }else{
882            cout << "Anticounter  : missing tree"<<endl;
883        };
884        // Orbital Info
885        if(B && ORB) {
886            B->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
887            cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;
888            if(!Trout)Trout=O;
889            else Trout->AddFriend("OrbitalInfo");
890        }else{
891            cout << "OrbitalInfo  : missing tree"<<endl;
892        };
893        
894    //    cout<<endl<<" Number of entries: "<<Trout->GetEntries()<<endl<<endl;
895    
896        
897    //     // Tracker
898    //     if(TRK2||TRK1||TRKh){
899    //      if(!Tout)Tout=T;
900    //      else Tout->AddFriend("Tracker");
901    //     }
902    //     // Calorimeter
903    //     if(CAL2||CAL1) {        
904    //      if(!Tout)Tout=C;
905    //      else Tout->AddFriend("Calorimeter");
906    //     };
907    //     // ToF    
908    //     if(TOF) {
909    //      if(!Tout)Tout=O;
910    //      else Tout->AddFriend("ToF");
911    //     };
912    //     // Trigger
913    //     if(TRG) {
914    //      if(!Tout)Tout=R;
915    //      else Tout->AddFriend("Trigger");
916    //     };
917    //     // S4
918    //     if(S4) {
919    //      if(!Tout)Tout=S;
920    //      else Tout->AddFriend("S4");
921    //     };
922    //     // Neutron Detector
923    //     if(ND) {
924    //      if(!Tout)Tout=N;
925    //      else Tout->AddFriend("NeutronD");
926    //     };
927    //     // Anticounters
928    //     if(AC) {
929    //      if(!Tout)Tout=A;
930    //      else Tout->AddFriend("Anticounter");
931    //     };
932    //     // OrbitalInfo
933    //     if(ORB) {
934    //      if(!Tout)Tout=B;
935    //      else Tout->AddFriend("OrbitalInfo");
936    //     };
937        
938    //    cout<<endl<<" Number of entries: "<<Tout->GetEntries()<<endl<<endl;
939        
940    //    if( Tout->GetEntries() )PamLevel2::SetBranchAddress( Tout );
941        
942        return Trout;
943    }
944    
945    
946    
947    //--------------------------------------
948    //
949    //
950    //--------------------------------------
951    /**
952     * Set branch addresses for Pamela friend trees
953     */
954    void PamLevel2::SetBranchAddress(TTree *t){
955    
956        TRK2    = TRK2 & t->GetBranchStatus("TrkLevel2");
957        TRK1    = TRK1 & t->GetBranchStatus("TrkLevel1");
958        TRKh    = TRKh & t->GetBranchStatus("TrkHough");
959        CAL2    = CAL2 & t->GetBranchStatus("CaloLevel2");
960        CAL1    = CAL1 & t->GetBranchStatus("CaloLevel1");
961        TOF    = TOF & t->GetBranchStatus("ToFLevel2");
962        TRG    = TRG & t->GetBranchStatus("TrigLevel2");
963        S4     = S4  & t->GetBranchStatus("S4Level2");
964        ND     = ND  & t->GetBranchStatus("NDLevel2");
965        AC     = AC  & t->GetBranchStatus("AcLevel2");
966        ORB    = ORB & t->GetBranchStatus("OrbitalInfo");
967    
968    
969        // Tracker
970        if(TRK1) {
971            t->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel2"));
972            cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;
973        };
974        if(TRK2) {
975            t->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerTo("TrkLevel1"));
976            cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;
977        };
978        if(TRKh) {
979            t->SetBranchAddress("TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
980            cout << "Tracker      : set branch address TrkHough"<<endl;
981        };
982        
983        // Calorimeter
984        if(CAL1) {
985            t->SetBranchAddress("CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
986            cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel1"<<endl;
987        };
988        if(CAL2) {
989            t->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
990            cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;
991        };
992        
993        // ToF    
994        if(TOF) {
995            t->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
996            cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;
997        };
998        // Trigger
999        if(TRG) {
1000            t->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
1001            cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;
1002        };
1003        // S4
1004        if(S4) {
1005            t->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
1006            cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;
1007        };
1008        // Neutron Detector
1009        if(ND) {
1010            t->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
1011            cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;
1012        };
1013        // Anticounters
1014        if(AC) {
1015            t->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
1016            cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;
1017        };
1018        // OrbitalInfo
1019        if(ORB) {
1020            t->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
1021            cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;
1022        };
1023        
1024    }
1025    /**
1026     * Set branch addresses for Pamela friend trees
1027     */
1028    void PamLevel2::SetBranchAddress(TChain *t){
1029    
1030        TRK2    = TRK2 & t->GetBranchStatus("TrkLevel2");
1031        TRK1    = TRK1 & t->GetBranchStatus("TrkLevel1");
1032        TRKh    = TRKh & t->GetBranchStatus("TrkHough");
1033        CAL1    = CAL1 & t->GetBranchStatus("CaloLevel1");
1034        CAL2    = CAL2 & t->GetBranchStatus("CaloLevel2");
1035        TOF    = TOF & t->GetBranchStatus("ToFLevel2");
1036        TRG    = TRG & t->GetBranchStatus("TrigLevel2");
1037        S4     = S4  & t->GetBranchStatus("S4Level2");
1038        ND     = ND  & t->GetBranchStatus("NDLevel2");
1039        AC     = AC  & t->GetBranchStatus("AcLevel2");
1040        ORB    = ORB & t->GetBranchStatus("OrbitalInfo");
1041    
1042        // Tracker
1043         if(TRK2) {
1044            t->SetBranchAddress("TrkLevel2", GetPointerTo("TrkLevel2"));
1045            cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel2"<<endl;
1046        };
1047        if(TRK1) {
1048            t->SetBranchAddress("TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel1"));
1049            cout << "Tracker      : set branch address TrkLevel1"<<endl;
1050        };
1051         if(TRKh) {
1052            t->SetBranchAddress("TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
1053            cout << "Tracker      : set branch address TrkHough"<<endl;
1054         };
1055        
1056        // Calorimeter
1057        if(CAL2) {
1058            t->SetBranchAddress("CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
1059            cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel2"<<endl;
1060        };  
1061        if(CAL1) {
1062            t->SetBranchAddress("CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
1063            cout << "Calorimeter  : set branch address CaloLevel1"<<endl;
1064        };
1065        
1066        // ToF    
1067        if(TOF) {
1068            t->SetBranchAddress("ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
1069            cout << "ToF          : set branch address ToFLevel2"<<endl;
1070        };
1071        // Trigger
1072        if(TRG) {
1073            t->SetBranchAddress("TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
1074            cout << "Trigger      : set branch address TrigLevel2"<<endl;
1075        };
1076        // S4
1077        if(S4) {
1078            t->SetBranchAddress("S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
1079            cout << "S4           : set branch address S4Level2"<<endl;
1080        };
1081        // Neutron Detector
1082        if(ND) {
1083            t->SetBranchAddress("NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
1084            cout << "NeutronD     : set branch address NDLevel2"<<endl;
1085        };
1086        // Anticounters
1087        if(AC) {
1088            t->SetBranchAddress("AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
1089            cout << "Anticounter  : set branch address AcLevel2"<<endl;
1090        };
1091        // OrbitalInfo
1092        if(ORB) {
1093            t->SetBranchAddress("OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
1094            cout << "OrbitalInfo  : set branch address OrbitalInfo"<<endl;
1095        };
1096        
1097    }
1098    
1099    
1100    //--------------------------------------
1101    //
1102    //
1103    //--------------------------------------
1104    /**
1105     * Get the Run tree chain from a list of files.
1106     * @param fl Pointer to a TList of TSystemFiles
1107     * @return Pointer to a TChain
1108     */
1109    TChain *PamLevel2::GetRunTree(TList *fl){
1110            
1111        TChain *R = new TChain("Run");
1112            
1113      return Tout;      // loop over files and create chains        
1114        TIter next(fl);
1115        TSystemFile *questo = 0;
1116        while ( (questo = (TSystemFile*) next()) ) {
1117            TString name =  questo->GetName();
1118    //              cout << "File: "<< name << endl;
1119            if( CheckLevel2File(name) ){
1120                R->Add(name);
1121            };
1122        }
1123        
1124        R->SetBranchAddress("RunInfo", GetPointerTo("RunInfo"));
1125        cout << "Run         : set branch address RunInfo"<<endl;
1126        
1127        return R;
1128            
1129  }  }
1130    //--------------------------------------
1131    //
1132    //
1133    //--------------------------------------
1134    /**
1135     * Get the Run tree  from a file.
1136     * @param f Pointer to a TFile
1137     * @return Pointer to a TTree
1138     */
1139    TTree *PamLevel2::GetRunTree(TFile *f){
1140    
1141    
1142        TTree *R = (TTree*)f->Get("Run");
1143        
1144        R->SetBranchAddress("RunInfo", GetPointerTo("RunInfo"));
1145        cout << "Run         : set branch address RunInfo"<<endl;
1146        
1147        return R;
1148        
1149    }
1150    //--------------------------------------
1151    //
1152    //
1153    //--------------------------------------
1154    /**
1155     * Set which trees shoul be analysed
1156     * @param detlist TString containing the sequence of trees required
1157    */
1158    void PamLevel2::SetWhichTrees(TString detlist){
1159            
1160        if(detlist.IsNull() || detlist.Contains("+ALL", TString::kIgnoreCase)){
1161            CAL1 = true;
1162            CAL2 = true;
1163            TRK2 = true;
1164            TRK1 = false;
1165            TRKh = false;
1166            TRG = true;
1167            TOF = true;
1168            S4  = true;
1169            ND  = true;
1170            AC  = true;
1171            ORB = true;
1172        }else if( detlist.Contains("-ALL", TString::kIgnoreCase) ){
1173            CAL1 = false;
1174            CAL2 = false;
1175            TRK2 = false;
1176            TRK1 = false;
1177            TRKh = false;
1178            TRG = false;
1179            TOF = false;
1180            S4  = false;
1181            ND  = false;
1182            AC  = false;
1183            ORB = false;
1184        };
1185        
1186    //  -------------------------------------------------------------------------
1187        if( detlist.Contains("CAL1", TString::kIgnoreCase) ){
1188            if ( detlist.Contains("-CAL1", TString::kIgnoreCase) )CAL1=false;
1189            if ( detlist.Contains("+CAL1", TString::kIgnoreCase) )CAL1=true;
1190        };
1191            
1192        if( detlist.Contains("CAL2", TString::kIgnoreCase)){
1193            if ( detlist.Contains("-CAL2", TString::kIgnoreCase) )CAL2=false;
1194            if ( detlist.Contains("+CAL2", TString::kIgnoreCase) )CAL2=true;
1195        };
1196            
1197        if( detlist.Contains("+CAL", TString::kIgnoreCase) && !CAL1 && !CAL2 )CAL2=true;
1198        if( detlist.Contains("-CAL", TString::kIgnoreCase) && CAL1 && CAL2 ){
1199            CAL2=false;
1200            CAL1=false;
1201        }
1202    //  -------------------------------------------------------------------------
1203        if( detlist.Contains("TRK1", TString::kIgnoreCase) ){
1204            if ( detlist.Contains("-TRK1", TString::kIgnoreCase) )TRK1=false;
1205            if ( detlist.Contains("+TRK1", TString::kIgnoreCase) )TRK1=true;
1206        };
1207            
1208        if( detlist.Contains("TRK2", TString::kIgnoreCase)){
1209            if ( detlist.Contains("-TRK2", TString::kIgnoreCase) )TRK2=false;
1210            if ( detlist.Contains("+TRK2", TString::kIgnoreCase) )TRK2=true;
1211        };
1212    
1213        if( detlist.Contains("TRKh", TString::kIgnoreCase)){
1214            if ( detlist.Contains("-TRKh", TString::kIgnoreCase) )TRKh=false;
1215            if ( detlist.Contains("+TRKh", TString::kIgnoreCase) )TRKh=true;
1216        };
1217            
1218        if( detlist.Contains("+TRK", TString::kIgnoreCase) && !TRK1 && !TRK2 && !TRKh )TRK2=true;
1219        if( detlist.Contains("-TRK", TString::kIgnoreCase) && TRK1 && TRK2 && TRKh){
1220            TRK2=false;
1221            TRK1=false;
1222            TRKh=false;
1223        }
1224    //  -------------------------------------------------------------------------
1225        
1226        if( detlist.Contains("-TRG", TString::kIgnoreCase) )TRG = false;
1227        else if( detlist.Contains("+TRG", TString::kIgnoreCase) )TRG = true;
1228        
1229        if( detlist.Contains("-TOF", TString::kIgnoreCase) )TOF = false;
1230        else if( detlist.Contains("+TOF", TString::kIgnoreCase) )TOF = true;
1231        
1232        if( detlist.Contains("-S4",  TString::kIgnoreCase) )S4  = false;
1233        else if( detlist.Contains("+S4",  TString::kIgnoreCase) )S4  = true;
1234        
1235        if( detlist.Contains("-ND",  TString::kIgnoreCase) )ND  = false;
1236        else if( detlist.Contains("+ND",  TString::kIgnoreCase) )ND  = true;
1237        
1238        if( detlist.Contains("-AC",  TString::kIgnoreCase) )AC  = false;
1239        else if( detlist.Contains("+AC",  TString::kIgnoreCase) )AC  = true;
1240        
1241        if( detlist.Contains("-ORB", TString::kIgnoreCase) )ORB = false;
1242        else if( detlist.Contains("+ORB", TString::kIgnoreCase) )ORB = true;
1243    
1244    //     cout<< "Set detector list --> ";
1245    //     if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
1246    //     if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
1247    //     if(TRKh)cout<<"TRKH ";
1248    //     if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
1249    //     if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
1250    //     if(TOF)cout<<"TOF ";
1251    //     if(TRG)cout<<"TRG ";
1252    //     if(AC)cout<<"AC ";
1253    //     if(ND)cout<<"ND ";
1254    //     if(S4)cout<<"S4 ";
1255    //     if(ORB)cout<<"ORB ";
1256    //     cout << endl;
1257        
1258    };
1259    
1260    
1261    /**
1262     * Set tree/branch detector flags from the content of a tree
1263     */
1264    void  PamLevel2::GetWhichTrees(TFile* f){
1265            
1266    
1267        // -----------
1268        // reset flags
1269        // -----------
1270        CAL1   = false;    
1271        CAL2   = false;    
1272        TRK2   = false;    
1273        TRK1   = false;    
1274        TRKh   = false;    
1275        TRG    = false;    
1276        TOF    = false;    
1277        S4     = false;    
1278        ND     = false;    
1279        AC     = false;    
1280        ORB    = false;    
1281        
1282        RUN    = false;
1283            
1284        cout << "Checking file: "<<f->GetName()<<endl;
1285        if( !f || f->IsZombie() ){
1286            cout << "File: "<< f->GetName() <<" Non valid root file"<< endl;
1287            return;
1288        }
1289    
1290        TList *lk = f->GetListOfKeys();
1291        TIter next(lk);
1292        TKey *key =0;
1293    
1294        Int_t nev = 0;
1295    
1296        while( (key = (TKey*)next()) ){
1297            
1298            if( !strcmp(key->GetName(),"Run"        ) )RUN = true;
1299    
1300            //=========================================================    
1301            if( !strcmp(key->GetName(),"Trigger"    ) ){
1302                TRG = true;
1303                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("Trigger"))->GetEntries();
1304                if( nev && nevt!=nev){
1305                    cout << "File: "<< f->GetName() <<" Trigger tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1306                    TRG = false;
1307                }else nev=nevt;
1308            }
1309            //=========================================================    
1310            if( !strcmp(key->GetName(),"ToF"        ) ){
1311                TOF = true;
1312                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("ToF"))->GetEntries();
1313                if( nev && nevt!=nev){
1314                    cout << "File: "<< f->GetName() <<"     ToF tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1315                    TOF = false;
1316                }else nev=nevt;
1317            }
1318            //=========================================================  
1319            if( !strcmp(key->GetName(),"S4"         ) ){
1320                S4 = true;
1321                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("S4"))->GetEntries();
1322                if( nev && nevt!=nev){
1323                    cout << "File: "<< f->GetName() <<"      S4 tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1324                    S4 = false;
1325                }else nev=nevt;
1326            }
1327            //=========================================================  
1328    
1329            if( !strcmp(key->GetName(),"NeutronD"   ) ){
1330                ND = true;
1331                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("NeutronD"))->GetEntries();
1332                if( nev && nevt!=nev){
1333                    cout << "File: "<< f->GetName() <<"NeutronD tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1334                    ND =false;
1335                }else nev=nevt;
1336            }      
1337            //=========================================================  
1338            if( !strcmp(key->GetName(),"Anticounter") ){
1339                AC = true;
1340                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("Anticounter"))->GetEntries();
1341                if( nev && nevt!=nev){
1342                    cout << "File: "<< f->GetName() <<" Anticounter tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1343                    AC =false;
1344                }else nev=nevt;
1345            }
1346            //=========================================================  
1347            if( !strcmp(key->GetName(),"OrbitalInfo") ){
1348                ORB = true;
1349                Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("OrbitalInfo"))->GetEntries();
1350                if( nev && nevt!=nev){
1351                    cout << "File: "<< f->GetName() <<" OrbitalInfo tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1352                    ORB = false;
1353                }else nev=nevt;
1354            }
1355            //=========================================================  
1356            if( !strcmp(key->GetName(),"Tracker"    ) ){
1357                TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");
1358                for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){
1359                    TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();
1360                    if( !name.CompareTo("TrkLevel1") )TRK1=true;
1361                    if( !name.CompareTo("TrkLevel2") )TRK2=true;
1362                    if( !name.CompareTo("TrkHough") )TRKh=true;
1363                };      
1364                Int_t nevt = T->GetEntries();
1365                if( nev && nevt!=nev){
1366                    cout << "File: "<< f->GetName() <<" Tracker tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1367                    TRK1 = false;
1368                    TRK2 = false;
1369                    TRKh = false;
1370                }else nev=nevt;
1371                T->Delete();
1372            };
1373            //=========================================================  
1374            if( !strcmp(key->GetName(),"Calorimeter"    ) ){
1375                TTree *T = (TTree*)f->Get("Calorimeter");
1376                for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){
1377                    TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();
1378                    if( !name.CompareTo("CaloLevel1") )CAL1=true;
1379                    if( !name.CompareTo("CaloLevel2") )CAL2=true;
1380                };    
1381                Int_t nevt = T->GetEntries();
1382                if( nev && nevt!=nev){
1383                    cout << "File: "<< f->GetName() <<"  Calorimeter tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1384                    CAL1 = false;
1385                    CAL2 = false;
1386                }else nev=nevt;
1387                T->Delete();
1388            };      
1389    
1390        };
1391        
1392        lk->Delete();
1393    
1394    //     cout<< "Get detector list from input file --> ";
1395    //     if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
1396    //     if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
1397    //     if(TRKh)cout<<"TRKH ";
1398    //     if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
1399    //     if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
1400    //     if(TOF)cout<<"TOF ";
1401    //     if(TRG)cout<<"TRG ";
1402    //     if(AC)cout<<"AC ";
1403    //     if(ND)cout<<"ND ";
1404    //     if(S4)cout<<"S4 ";
1405    //     if(ORB)cout<<"ORB ";
1406    //     cout << endl;
1407          
1408        return ;
1409            
1410    };
1411    
1412    
1413    //--------------------------------------
1414    //
1415    //
1416    //--------------------------------------
1417    /**
1418     * Check if a file contains selected Pamela Level2 trees.
1419     * @param name File name
1420     * @return true if the file is ok.
1421     */
1422    Bool_t  PamLevel2::CheckLevel2File(TString name){
1423            
1424        Bool_t CAL1__ok   = false;    
1425        Bool_t CAL2__ok   = false;    
1426        Bool_t TRK2__ok   = false;    
1427        Bool_t TRK1__ok   = false;    
1428        Bool_t TRKh__ok   = false;    
1429        Bool_t TRG__ok    = false;    
1430        Bool_t TOF__ok    = false;    
1431        Bool_t S4__ok     = false;    
1432        Bool_t ND__ok     = false;    
1433        Bool_t AC__ok     = false;    
1434        Bool_t ORB__ok    = false;    
1435        
1436        Bool_t RUN__ok    = false;
1437        
1438        
1439    
1440        cout << "Checking file: "<<name<<endl;
1441        TFile *f = new TFile(name.Data());
1442        if( !f || f->IsZombie() ){
1443            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Non valid root file"<< endl; return false;
1444        }
1445    //    cout << "Get list of keys: "<<f<<endl;
1446        TList *lk = f->GetListOfKeys();
1447    //    lk->Print();
1448        TIter next(lk);
1449        TKey *key =0;
1450    
1451        Int_t nev = 0;
1452    
1453        while( (key = (TKey*)next()) ){
1454            
1455    //      cout << key->GetName() << ""<<key->GetClassName()<<endl;
1456    //              cout << " Get tree: " << f->Get(key->GetName())<<endl;
1457    //      nev_previous = nev;
1458    //      cout << " n.entries  "<< nev <<endl;
1459    //      if( key->GetClassName()=="TTree" && nev_previous && nev != nev_previous ){
1460    //          nev = ((TTree*)f->Get(key->GetName()))->GetEntries();
1461    //          cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- "<< key->GetName() << " tree: n.entries does not match "<<nev<<" "<<nev_previous<< endl;
1462    //          return false;
1463    //      };
1464    
1465            if( !strcmp(key->GetName(),"Run"        ) )RUN__ok = true;      
1466    
1467            //=========================================================    
1468            if( !strcmp(key->GetName(),"Trigger"    ) ){
1469                TRG__ok = true;
1470                if(TRG){
1471                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("Trigger"))->GetEntries();
1472                    if( nev && nevt!=nev){
1473                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Trigger tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1474                        return false;
1475                    }
1476                    nev=nevt;
1477                }
1478            }
1479            //=========================================================    
1480            if( !strcmp(key->GetName(),"ToF"        ) ){
1481                TOF__ok = true;
1482                if(TOF){
1483                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("ToF"))->GetEntries();
1484                    if( nev && nevt!=nev){
1485                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- ToF tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1486                        return false;
1487                    }
1488                    nev=nevt;
1489                }
1490            }
1491            //=========================================================  
1492            if( !strcmp(key->GetName(),"S4"         ) ){
1493                S4__ok = true;
1494                if(S4){
1495                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("S4"))->GetEntries();
1496                    if( nev && nevt!=nev){
1497                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- S4 tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1498                        return false;
1499                    }
1500                    nev=nevt;
1501                }
1502            }
1503            //=========================================================  
1504    
1505            if( !strcmp(key->GetName(),"NeutronD"   ) ){
1506                ND__ok = true;
1507                if(ND){
1508                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("NeutronD"))->GetEntries();
1509                    if( nev && nevt!=nev){
1510                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- NeutronD tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1511                        return false;
1512                    }
1513                    nev=nevt;
1514                }
1515            }      
1516            //=========================================================  
1517            if( !strcmp(key->GetName(),"Anticounter") ){
1518                AC__ok = true;
1519                if(AC){
1520                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("Anticounter"))->GetEntries();
1521                    if( nev && nevt!=nev){
1522                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Anticounter tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1523                        return false;
1524                    }
1525                    nev=nevt;
1526                }
1527            }
1528            //=========================================================  
1529            if( !strcmp(key->GetName(),"OrbitalInfo") ){
1530                ORB__ok = true;
1531                if(ORB){
1532                    Int_t nevt = ((TTree*)f->Get("OrbitalInfo"))->GetEntries();
1533                    if( nev && nevt!=nev){
1534                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- OrbitalInfo tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1535                        return false;
1536                    }
1537                    nev=nevt;
1538                }
1539            }
1540            //=========================================================  
1541            if( !strcmp(key->GetName(),"Tracker"    ) ){
1542                TTree *T = (TTree*)f->Get("Tracker");
1543                if(TRK1||TRK2||TRKh){
1544                    Int_t nevt = T->GetEntries();
1545                    if( nev && nevt!=nev){
1546                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Tracker tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1547                        return false;
1548                    }
1549                    nev=nevt;
1550                }
1551                for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){
1552                    TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();
1553                    if( !name.CompareTo("TrkLevel1") )TRK1__ok=true;
1554                    if( !name.CompareTo("TrkLevel2") )TRK2__ok=true;
1555                    if( !name.CompareTo("TrkHough") )TRKh__ok=true;
1556                };      
1557                T->Delete();
1558            };
1559            //=========================================================  
1560            if( !strcmp(key->GetName(),"Calorimeter"    ) ){
1561                TTree *T = (TTree*)f->Get("Calorimeter");
1562                if(CAL1||CAL2){
1563                    Int_t nevt = T->GetEntries();
1564                    if( nev && nevt!=nev){
1565                        cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Calorimeter tree has "<<nevt<<" events instead of "<<nev<< endl;
1566                        return false;
1567                    }
1568                    nev=nevt;
1569                }
1570                for(Int_t i=0; i<T->GetListOfBranches()->GetEntries(); i++){
1571                    TString name = T->GetListOfBranches()->At(i)->GetName();
1572                    if( !name.CompareTo("CaloLevel1") )CAL1__ok=true;
1573                    if( !name.CompareTo("CaloLevel2") )CAL2__ok=true;
1574                };    
1575                T->Delete();
1576            };      
1577    
1578        };
1579        
1580    //     cout<< "CheckLevel2File(TString): detector list --> ";
1581    //     if(TRK1__ok)cout<<"TRK1 ";
1582    //     if(TRK2__ok)cout<<"TRK2 ";
1583    //     if(TRKh__ok)cout<<"TRKH ";
1584    //     if(CAL1__ok)cout<<"CAL1 ";
1585    //     if(CAL2__ok)cout<<"CAL2 ";
1586    //     if(TOF__ok)cout<<"TOF ";
1587    //     if(TRG__ok)cout<<"TRG ";
1588    //     if(AC__ok)cout<<"AC ";
1589    //     if(ND__ok)cout<<"ND ";
1590    //     if(S4__ok)cout<<"S4 ";
1591    //     if(ORB__ok)cout<<"ORB ";
1592    //     cout << endl;
1593    
1594    
1595        if(!RUN__ok) {
1596            cout << "File: "<< f->GetName() <<" *WARNING* ---- Missing RunInfo tree"<< endl;
1597    //      return false;
1598        };
1599    
1600        if(CAL1 && !CAL1__ok){
1601            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing CaloLevel1 branch"<< endl;
1602            return false;
1603        };
1604        if(CAL2 && !CAL2__ok){
1605            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing CaloLevel2 branch"<< endl;
1606            return false;
1607        };
1608        if(TRK2 && !TRK2__ok){
1609            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing TrkLevel2 branch"<< endl;
1610            return false;
1611        };
1612        if(TRK1 && !TRK1__ok){
1613            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing TrkLevel1 branch"<< endl;
1614            return false;
1615        };
1616        if(TRKh && !TRKh__ok){
1617            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing TrkHough branch"<< endl;
1618            return false;
1619        };
1620        if(ORB && !ORB__ok){
1621            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ORB tree"<< endl;
1622            return false;
1623        };
1624        if(AC && !AC__ok){
1625            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing AC tree"<< endl;
1626            return false;
1627        };
1628        if(S4 && !S4__ok){
1629            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing S4 tree"<< endl;
1630            return false;
1631        };
1632        if(TOF && !TOF__ok){
1633            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ToF tree"<< endl;
1634            return false;
1635        };
1636    
1637        if(ND && !ND__ok){
1638            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing ND tree"<< endl;
1639            return false;
1640        };
1641        if(TRG && !TRG__ok){
1642            cout << "File: "<< f->GetName() <<" discarded ---- Missing Trigger tree"<< endl;
1643            return false;
1644        };
1645        
1646    
1647        lk->Delete();
1648        f->Close();
1649    
1650    //     cout<< "CheckLevel2File(TString): detector list --> ";
1651    //     if(TRK1)cout<<"TRK1 ";
1652    //     if(TRK2)cout<<"TRK2 ";
1653    //     if(TRKh)cout<<"TRKH ";
1654    //     if(CAL1)cout<<"CAL1 ";
1655    //     if(CAL2)cout<<"CAL2 ";
1656    //     if(TOF)cout<<"TOF ";
1657    //     if(TRG)cout<<"TRG ";
1658    //     if(AC)cout<<"AC ";
1659    //     if(ND)cout<<"ND ";
1660    //     if(S4)cout<<"S4 ";
1661    //     if(ORB)cout<<"ORB ";
1662    //     cout << endl;
1663          
1664        return true;
1665            
1666    };
1667    
1668    
1669    /**
1670     * Create clone-trees
1671     */
1672    void PamLevel2::CreateCloneTrees0( TChain *fChain, TFile *ofile ){
1673    
1674        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
1675        cout << "Create clones of PAMELA trees "<<endl;
1676        
1677        Int_t i=0;
1678        tree_clone[i] = fChain->GetTree()->CloneTree(0);
1679        TString name =  tree_clone[i]->GetName();
1680        name.Append("_clone");
1681    //    tree_clone[i]->SetName(name.Data());
1682        cout << tree_clone[i]->GetName() <<endl;
1683        i++;
1684    
1685        TList *li = fChain->GetListOfFriends();
1686        TIter next(li);
1687        TFriendElement* T_friend=0;
1688        ofile->cd();
1689        while( (T_friend = (TFriendElement*)next()) ){
1690    //      cout<<T_friend->IsA()->GetName()<<" "<<T_friend->GetName()<<hex << T_friend->GetTree() << dec<<endl;
1691    //      cout<<T_friend->GetTree()->GetName()<< endl;
1692            tree_clone[i] = T_friend->GetTree()->CloneTree(0);
1693            tree_clone[i]->SetAutoSave(1000000);
1694            name =  tree_clone[i]->GetName();
1695            name.Append("_clone");
1696    //      tree_clone[i]->SetName(name.Data());
1697            cout << tree_clone[i]->GetName() << endl;
1698            i++;
1699        }
1700    
1701        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
1702    
1703    }
1704    
1705    /**
1706     * Create clone-trees
1707     */
1708    void PamLevel2::CreateCloneTrees(TFile *ofile){
1709    
1710        ofile->cd();
1711    
1712        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
1713        cout << "Create new PAMELA trees "<<endl;
1714            
1715        Int_t i=0;
1716    
1717        if(TRK1||TRK2||TRKh){
1718            tree_clone[i] = new TTree("Tracker","PAMELA tracker level2 data ");    
1719            if(TRK1) {
1720                tree_clone[i]->Branch("TrkLevel1","TrkLevel1", GetPointerTo("TrkLevel1"));
1721                tree_clone[i]->BranchRef();
1722                cout << "Tracker      : branch TrkLevel1"<<endl;
1723            };
1724            if(TRK2) {
1725                tree_clone[i]->Branch("TrkLevel2", "TrkLevel2",GetPointerTo("TrkLevel2"));
1726                cout << "Tracker      : branch TrkLevel2"<<endl;        
1727            };
1728            if(TRKh) {
1729                tree_clone[i]->Branch("TrkHough","TrkHough", GetPointerTo("TrkHough"));
1730                cout << "Tracker      : branch TrkHough"<<endl;
1731            };
1732            i++;
1733        }
1734    
1735        // Calorimeter
1736        if(CAL1||CAL2){
1737            tree_clone[i] = new TTree("Calorimeter","PAMELA calorimeter level2 data ");    
1738            if(CAL1) {
1739                tree_clone[i]->Branch("CaloLevel1", "CaloLevel1", GetPointerTo("CaloLevel1"));
1740                cout << "Calorimeter  : branch CaloLevel1"<<endl;
1741            };
1742            if(CAL2) {
1743                tree_clone[i]->Branch("CaloLevel2","CaloLevel2", GetPointerTo("CaloLevel2"));
1744                cout << "Calorimeter  : branch CaloLevel2"<<endl;
1745            };
1746            i++;
1747        }    
1748    
1749        // ToF    
1750        if(TOF) {
1751            tree_clone[i] = new TTree("ToF","PAMELA ToF level2 data ");    
1752            tree_clone[i]->Branch("ToFLevel2","ToFLevel2", GetPointerTo("ToFLevel2"));
1753            cout << "ToF          : branch ToFLevel2"<<endl;
1754            i++;
1755        };
1756        // Trigger
1757        if(TRG) {
1758            tree_clone[i] = new TTree("Trigger","PAMELA trigger level2 data ");    
1759            tree_clone[i]->Branch("TrigLevel2","TrigLevel2", GetPointerTo("TrigLevel2"));
1760            cout << "Trigger      : branch TrigLevel2"<<endl;
1761            i++;
1762        };
1763        // S4
1764        if(S4) {
1765            tree_clone[i] = new TTree("S4","PAMELA S4 level2 data ");      
1766            tree_clone[i]->Branch("S4Level2","S4Level2", GetPointerTo("S4Level2"));
1767            cout << "S4           : branch S4Level2"<<endl;
1768            i++;
1769        };
1770        // Neutron Detector
1771        if(ND) {
1772            tree_clone[i] = new TTree("NeutronD","PAMELA neutron detector level2 data ");  
1773            tree_clone[i]->Branch("NDLevel2","NDLevel2", GetPointerTo("NDLevel2"));
1774            cout << "NeutronD     : branch NDLevel2"<<endl;
1775            i++;
1776        };
1777        // Anticounters
1778        if(AC) {
1779            tree_clone[i] = new TTree("Anticounter","PAMELA anticounter detector level2 data ");    
1780            tree_clone[i]->Branch("AcLevel2","AcLevel2", GetPointerTo("AcLevel2"));
1781            cout << "Anticounter  : branch AcLevel2"<<endl;
1782            i++;
1783        };
1784        // OrbitalInfo
1785        if(ORB) {
1786            tree_clone[i] = new TTree("OrbitalInfo","PAMELA oribital info  ");      
1787            tree_clone[i]->Branch("OrbitalInfo","OrbitalInfo", GetPointerTo("OrbitalInfo"));
1788            cout << "OrbitalInfo  : branch OrbitalInfo"<<endl;
1789            i++;
1790        };
1791        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
1792    
1793    }
1794    
1795    // /**
1796    //  * Create clone-trees
1797    //  */
1798    // void PamLevel2::CreateCloneTrees(){
1799    
1800    //     cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
1801    //     cout << "Create new PAMELA trees "<<endl;
1802            
1803    //     if(TRK1||TRK2||TRKh){
1804    //      T_clone = new TTree("Tracker_clone","PAMELA tracker level2 data ");    
1805    //      if(TRK1) {
1806    //          trk1_clone = new TrkLevel1();
1807    //          T_clone->Branch("TrkLevel1","TrkLevel1", &trk1_clone);
1808    //          T_clone->BranchRef();
1809    //          cout << "Tracker      : branch TrkLevel1"<<endl;
1810    //      };
1811    //      if(TRK2) {
1812    //          trk2_clone = new TrkLevel2();
1813    //          T_clone->Branch("TrkLevel2", "TrkLevel2",&trk2_clone);
1814    //          cout << "Tracker      : branch TrkLevel2"<<endl;        
1815    //      };
1816    //      if(TRKh) {
1817    //          trkh_clone = new TrkHough();
1818    //          T_clone->Branch("TrkHough","TrkHough", &trkh_clone);
1819    //          cout << "Tracker      : branch TrkHough"<<endl;
1820    //      };
1821    //      cout << hex << T_clone << dec << endl;
1822    //     }
1823    
1824    //     // Calorimeter
1825    //     if(CAL1||CAL2){
1826    //      C_clone = new TTree("Calorimeter_clone","PAMELA calorimeter level2 data ");    
1827    //      if(CAL1) {
1828    //          calo1_clone = new CaloLevel1();
1829    //          C_clone->Branch("CaloLevel1", "CaloLevel1", &calo1_clone);
1830    //          cout << "Calorimeter  : branch CaloLevel1"<<endl;
1831    //      };
1832    //      if(CAL2) {
1833    //          calo2_clone = new CaloLevel2();
1834    //          C_clone->Branch("CaloLevel2","CaloLevel2", &calo2_clone);
1835    //          cout << "Calorimeter  : branch CaloLevel2"<<endl;
1836    //      };
1837    //     }    
1838    
1839    //     // ToF    
1840    //     if(TOF) {
1841    //      O_clone = new TTree("ToF_clone","PAMELA ToF level2 data ");    
1842    //      tof_clone = new ToFLevel2();
1843    //      O_clone->Branch("ToFLevel2","ToFLevel2", &tof_clone);
1844    //      cout << "ToF          : branch ToFLevel2"<<endl;
1845    //     };
1846    //     // Trigger
1847    //     if(TRG) {
1848    //      R_clone = new TTree("Trigger_clone","PAMELA trigger level2 data ");    
1849    //      trig_clone = new TrigLevel2();
1850    //      R_clone->Branch("TrigLevel2","TrigLevel2", &trig_clone);
1851    //      cout << "Trigger      : branch TrigLevel2"<<endl;
1852    //     };
1853    //     // S4
1854    //     if(S4) {
1855    //      S_clone = new TTree("S4_clone","PAMELA S4 level2 data ");      
1856    //      s4_clone = new S4Level2();
1857    //      S_clone->Branch("S4Level2","S4Level2", &s4_clone);
1858    //      cout << "S4           : branch S4Level2"<<endl;
1859    //     };
1860    //     // Neutron Detector
1861    //     if(ND) {
1862    //      N_clone = new TTree("NeutronD_clone","PAMELA neutron detector level2 data ");  
1863    //      nd_clone = new NDLevel2();
1864    //      N_clone->Branch("NDLevel2","NDLevel2", &nd_clone);
1865    //      cout << "NeutronD     : branch NDLevel2"<<endl;
1866    //     };
1867    //     // Anticounters
1868    //     if(AC) {
1869    //      A_clone = new TTree("Anticounter_clone","PAMELA anticounter detector level2 data ");    
1870    //      ac_clone = new AcLevel2();
1871    //      A_clone->Branch("AcLevel2","AcLevel2", &ac_clone);
1872    //      cout << "Anticounter  : branch AcLevel2"<<endl;
1873    //     };
1874    //     // OrbitalInfo
1875    //     if(ORB) {
1876    //      B_clone = new TTree("OrbitalInfo_clone","PAMELA oribital info  ");      
1877    //      orb_clone = new OrbitalInfo();
1878    //      B_clone->Branch("OrbitalInfo","OrbitalInfo", &orb_clone);
1879    //      cout << "OrbitalInfo  : branch OrbitalInfo"<<endl;
1880    //     };
1881    //     cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
1882    
1883    // }
1884    
1885    /**
1886     * Fill tree (created with CreateCloneTrees)
1887     *
1888     */
1889    //void PamLevel2::FillNewPamTree(TTree *T){
1890    void PamLevel2::FillCloneTrees(){
1891            
1892    // //  --------------------------------------
1893    // //  copy the event
1894    // //  --------------------------------------
1895    //     if(trk1_clone)  *trk1_clone = *trk1_obj;
1896    //     if(trk2_clone){
1897    //      trk2_clone->Clear();
1898    //      trk2_obj->Copy(*trk2_clone);
1899    // //   *trk2_clone = *trk2_obj;
1900    //     }
1901    //     if(trkh_clone)  *trkh_clone = *trkh_obj;
1902    //     if(calo1_clone){
1903    // //   *calo1_clone = *calo1_obj;
1904    //      calo1_clone->Clear();
1905    //      calo1_obj->Copy(*calo1_clone);
1906    //     }
1907    //     if(calo2_clone){
1908    // //   *calo2_clone = *calo2_obj;
1909    //      calo2_clone->Clear();
1910    //      calo2_obj->Copy(*calo2_clone);
1911    //     }
1912    //     if(tof_clone)   *tof_clone  = *tof_obj;
1913    //     if(trig_clone)  *trig_clone = *trig_obj;
1914    //     if(s4_clone)    *s4_clone   = *s4_obj;
1915    //     if(nd_clone)    *nd_clone   = *nd_obj;
1916    //     if(ac_clone)    *ac_clone   = *ac_obj;
1917    //     if(orb_clone)   *orb_clone  = *orb_obj;
1918    
1919    //     if(T_clone)T_clone->Fill();
1920    //     if(C_clone)C_clone->Fill();
1921    //     if(O_clone)O_clone->Fill();
1922    //     if(R_clone)R_clone->Fill();
1923    //     if(S_clone)S_clone->Fill();
1924    //     if(N_clone)N_clone->Fill();
1925    //     if(A_clone)A_clone->Fill();
1926    //     if(O_clone)O_clone->Fill();
1927    
1928        for(Int_t i=0; i<8; i++){
1929            if(tree_clone[i])tree_clone[i]->Fill();
1930        }
1931    }
1932    
1933    
1934    TTree* PamLevel2::GetCloneTree(TString name){
1935    
1936        for(Int_t i=0; i<8; i++){  
1937            if(tree_clone[i]){
1938                TString na = tree_clone[i]->GetName();
1939                if(!name.CompareTo(na))return tree_clone[i];
1940            };
1941        }
1942        return NULL;
1943    
1944    }
1945    void PamLevel2::WriteCloneTrees(){
1946        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
1947        cout << "Write clones of PAMELA trees "<<endl;
1948        for(Int_t i=0; i<8; i++){  
1949            if(tree_clone[i]){
1950                cout << tree_clone[i]->GetName()<<endl;
1951                tree_clone[i]->Write();
1952            };
1953        }
1954        cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
1955    
1956    }
1957    
1958    /**
1959     * Create a new (empty) Pamela trees
1960     */
1961    // TTree* PamLevel2::GetNewPamTree(){
1962    
1963    //     if(tree_clone)return tree_clone;
1964    
1965    //     TTree *Tout = 0;
1966        
1967    //     cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
1968    //     cout << "Create new PAMELA trees "<<endl;
1969        
1970        
1971    //     if(TRK1||TRK2||TRKh){
1972    //      TTree *T = new TTree("Tracker_clone","PAMELA tracker level2 data ");    
1973    //      if(TRK1) {
1974    //          trk1_clone = new TrkLevel1();
1975    //          T->Branch("TrkLevel1","TrkLevel1", &trk1_clone);
1976    //          T->BranchRef();
1977    //          cout << "Tracker      : branch TrkLevel1"<<endl;
1978    //      };
1979    //      if(TRK2) {
1980    //          trk2_clone = new TrkLevel2();
1981    //          T->Branch("TrkLevel2", "TrkLevel2",&trk2_clone);
1982    //          cout << "Tracker      : branch TrkLevel2"<<endl;        
1983    //      };
1984    //      if(TRKh) {
1985    //          trkh_clone = new TrkHough();
1986    //          T->Branch("TrkHough","TrkHough", &trkh_clone);
1987    //          cout << "Tracker      : branch TrkHough"<<endl;
1988    //      };
1989    //      if(!Tout)Tout=T;
1990    //      else Tout->AddFriend("Tracker_clone");
1991    //     }
1992    
1993    //     // Calorimeter
1994    //     if(CAL1||CAL2){
1995    //      TTree *C = new TTree("Calorimeter_clone","PAMELA calorimeter level2 data ");    
1996    //      if(CAL1) {
1997    //          calo1_clone = new CaloLevel1();
1998    //          C->Branch("CaloLevel1", "CaloLevel1", &calo1_clone);
1999    //          cout << "Calorimeter  : branch CaloLevel1"<<endl;
2000    //      };
2001    //      if(CAL2) {
2002    //          calo2_clone = new CaloLevel2();
2003    //          C->Branch("CaloLevel2","CaloLevel2", &calo2_clone);
2004    //          cout << "Calorimeter  : branch CaloLevel2"<<endl;
2005    //      };
2006    //      if(!Tout)Tout=C;
2007    //      else Tout->AddFriend("Calorimeter_clone");
2008    //     }    
2009    
2010    //     // ToF    
2011    //     if(TOF) {
2012    //      TTree *O = new TTree("ToF_clone","PAMELA ToF level2 data ");    
2013    //      tof_clone = new ToFLevel2();
2014    //      O->Branch("ToFLevel2","ToFLevel2", &tof_clone);
2015    //      cout << "ToF          : branch ToFLevel2"<<endl;
2016    //      if(!Tout)Tout=O;
2017    //      else Tout->AddFriend("ToF_clone");
2018    //     };
2019    //     // Trigger
2020    //     if(TRG) {
2021    //      TTree *R = new TTree("Trigger_clone","PAMELA trigger level2 data ");    
2022    //      trig_clone = new TrigLevel2();
2023    //      R->Branch("TrigLevel2","TrigLevel2", &trig_clone);
2024    //      cout << "Trigger      : branch TrigLevel2"<<endl;
2025    //      if(!Tout)Tout=R;
2026    //      else Tout->AddFriend("Trigger_clone");
2027    //     };
2028    //     // S4
2029    //     if(S4) {
2030    //      TTree *S = new TTree("S4_clone","PAMELA S4 level2 data ");      
2031    //      s4_clone = new S4Level2();
2032    //      S->Branch("S4Level2","S4Level2", &s4_clone);
2033    //      cout << "S4           : branch S4Level2"<<endl;
2034    //      if(!Tout)Tout=S;
2035    //      else Tout->AddFriend("S4_clone");
2036    //     };
2037    //     // Neutron Detector
2038    //     if(ND) {
2039    //      TTree *N = new TTree("NeutronD_clone","PAMELA neutron detector level2 data ");  
2040    //      nd_clone = new NDLevel2();
2041    //      N->Branch("NDLevel2","NDLevel2", &nd_clone);
2042    //      cout << "NeutronD     : branch NDLevel2"<<endl;
2043    //      if(!Tout)Tout=N;
2044    //      else Tout->AddFriend("NeutronD_clone");
2045    //     };
2046    //     // Anticounters
2047    //     if(AC) {
2048    //      TTree *A = new TTree("Anticounter_clone","PAMELA anticounter detector level2 data ");  
2049    //      ac_clone = new AcLevel2();
2050    //      A->Branch("AcLevel2","AcLevel2", &ac_clone);
2051    //      cout << "Anticounter  : branch AcLevel2"<<endl;
2052    //      if(!Tout)Tout=A;
2053    //      else Tout->AddFriend("Anticounter_clone");
2054    //     };
2055    //     // OrbitalInfo
2056    //     if(ORB) {
2057    //      TTree *B = new TTree("OrbitalInfo_clone","PAMELA oribital info  ");    
2058    //      orb_clone = new OrbitalInfo();
2059    //      B->Branch("OrbitalInfo","OrbitalInfo", &orb_clone);
2060    //      cout << "OrbitalInfo  : branch OrbitalInfo"<<endl;
2061    //      if(!Tout)Tout=B;
2062    //      else Tout->AddFriend("OrbitalInfo_clone");
2063    //     };
2064    //     cout << "+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+--+" <<endl;
2065    
2066    //     tree_clone = Tout;
2067    //     tree_clone->SetDirectory(0);
2068    
2069    //     return Tout;
2070    // }
2071    // /**
2072    //  * Fill a tree (created with GetNewPamTree)
2073    //  *
2074    //  */
2075    // //void PamLevel2::FillNewPamTree(TTree *T){
2076    // void PamLevel2::FillNewPamTree(){
2077            
2078    
2079    //     if(trk1_clone)  *trk1_clone = *trk1_obj;
2080    //     if(trk2_clone){
2081    //      trk2_clone->Clear();
2082    //      trk2_obj->Copy(*trk2_clone);
2083    // //   *trk2_clone = *trk2_obj;
2084    //     }
2085    //     if(trkh_clone)  *trkh_clone = *trkh_obj;
2086    //     if(calo1_clone){
2087    // //   *calo1_clone = *calo1_obj;
2088    //      calo1_clone->Clear();
2089    //      calo1_obj->Copy(*calo1_clone);
2090    //     }
2091    //     if(calo2_clone){
2092    // //   *calo2_clone = *calo2_obj;
2093    //      calo2_clone->Clear();
2094    //      calo2_obj->Copy(*calo2_clone);
2095    //     }
2096    //     if(tof_clone)   *tof_clone  = *tof_obj;
2097    //     if(trig_clone)  *trig_clone = *trig_obj;
2098    //     if(s4_clone)    *s4_clone   = *s4_obj;
2099    //     if(nd_clone)    *nd_clone   = *nd_obj;
2100    //     if(ac_clone)    *ac_clone   = *ac_obj;
2101    //     if(orb_clone)   *orb_clone  = *orb_obj;
2102    
2103    //     TTree *T = tree_clone;
2104    
2105    //     T->Fill(); //fill main tree
2106    // //    cout<<T->IsA()->GetName()<<" "<<T->GetName()<<endl;
2107    //     TList *li = T->GetListOfFriends();
2108    //     TIter next(li);
2109    //     TFriendElement* T_friend=0;
2110    //     while( (T_friend = (TFriendElement*)next()) ){
2111    // //   cout<<T_friend->IsA()->GetName()<<" "<<T_friend->GetName()<<hex << T_friend->GetTree() << dec<<endl;
2112    //      T_friend->GetTree()->Fill();//fill friends
2113    //     }
2114    
2115    // }
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