/[PAMELA software]/DarthVader/OrbitalInfo/src/OrbitalInfoCore.cpp
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Diff of /DarthVader/OrbitalInfo/src/OrbitalInfoCore.cpp

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revision 1.10 by mocchiut, Wed Jan 24 13:16:26 2007 UTC revision 1.44 by mocchiut, Fri Jan 29 17:27:57 2010 UTC
# Line 1  Line 1 
 //  
1  // C/C++ headers  // C/C++ headers
2  //  //
3  #include <fstream>  #include <fstream>
# Line 9  Line 8 
8  //  //
9  // ROOT headers  // ROOT headers
10  //  //
11    //#include <TCanvas.h>
12    //#include <TH2F.h> //for test only. Vitaly.
13    //#include <TF1.h>
14    
15  #include <TTree.h>  #include <TTree.h>
16  #include <TClassEdit.h>  #include <TClassEdit.h>
17  #include <TObject.h>  #include <TObject.h>
# Line 34  Line 37 
37  #include <PscuHeader.h>  #include <PscuHeader.h>
38  #include <PscuEvent.h>  #include <PscuEvent.h>
39  #include <EventHeader.h>  #include <EventHeader.h>
40    #include <mcmd/McmdEvent.h>
41    #include <mcmd/McmdRecord.h>
42  //  //
43  // This program headers  // This program headers
44  //  //
45  #include <OrbitalInfo.h>  #include <OrbitalInfo.h>
46  #include <OrbitalInfoVerl2.h>  #include <OrbitalInfoVerl2.h>
47  #include <OrbitalInfoCore.h>  #include <OrbitalInfoCore.h>
48    #include <InclinationInfo.h>
49    
50    
51  using namespace std;  using namespace std;
52    
# Line 47  using namespace std; Line 54  using namespace std;
54  // CORE ROUTINE  // CORE ROUTINE
55  //  //
56  //  //
57  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *file, TSQLServer *dbc, Int_t OrbitalInfoargc, char *OrbitalInfoargv[]){  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *file, GL_TABLES *glt, Int_t OrbitalInfoargc, char *OrbitalInfoargv[]){
58      //
 //   // Temporary check to use igrf routines.  We need dat files in the  
 //   // current directory.  
 //   fstream igrfdat1("igrf05.dat");  
 //   fstream igrfdat2("igrf05s.dat");  
 //   if( (!igrfdat1) && (!igrfdat2)) {  
 //     cerr<<"\n**************************************\n"  
 //      <<"igrf05.dat or igrf05s.dat not in the current directory.  Exiting.\n"  
 //      <<"**************************************\n";  
 //     exit(EXIT_FAILURE);  
 //   }  
 //   igrfdat1.close();  
 //   igrfdat2.close();  
 //   // end of temporary code  
 //   //  
   
59    Int_t i = 0;    Int_t i = 0;
60      TString host = glt->CGetHost();
61      TString user = glt->CGetUser();
62      TString psw = glt->CGetPsw();
63      TSQLServer *dbc = TSQLServer::Connect(host.Data(),user.Data(),psw.Data());
64      //
65      stringstream myquery;
66      myquery.str("");
67      myquery << "SET time_zone='+0:00'";
68      dbc->Query(myquery.str().c_str());
69    //    //
70    TString processFolder = "OrbitalInfoFolder";    TString processFolder = Form("OrbitalInfoFolder_%u",run);
71    //    //
72    // Set these to true to have a very verbose output.    // Set these to true to have a very verbose output.
73    //    //
74    Bool_t debug = false;    Bool_t debug = false;
75    //    //
76    Bool_t verbose = false;    Bool_t verbose = false;
77      //
78      Bool_t standalone = false;
79      //
80    if ( OrbitalInfoargc > 0 ){    if ( OrbitalInfoargc > 0 ){
81      i = 0;      i = 0;
82      while ( i < OrbitalInfoargc ){      while ( i < OrbitalInfoargc ){
# Line 86  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f Line 89  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f
89        };        };
90        if ( (!strcmp(OrbitalInfoargv[i],"--debug")) || (!strcmp(OrbitalInfoargv[i],"-g")) ) {        if ( (!strcmp(OrbitalInfoargv[i],"--debug")) || (!strcmp(OrbitalInfoargv[i],"-g")) ) {
91          verbose = true;          verbose = true;
92            debug = true;
93        };        };
94        if ( (!strcmp(OrbitalInfoargv[i],"--verbose")) || (!strcmp(OrbitalInfoargv[i],"-v")) ) {        if ( (!strcmp(OrbitalInfoargv[i],"--verbose")) || (!strcmp(OrbitalInfoargv[i],"-v")) ) {
95          verbose = true;          verbose = true;
96        };        };
97          if ( (!strcmp(OrbitalInfoargv[i],"--standalone")) ) {
98            standalone = true;
99          };
100          if ( (!strcmp(OrbitalInfoargv[i],"--calculate-pitch")) ) {
101            standalone = false;
102          };
103        i++;        i++;
104      };      };
105    };    };
# Line 98  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f Line 108  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f
108    //    //
109    TTree *OrbitalInfotr = 0;    TTree *OrbitalInfotr = 0;
110    UInt_t nevents = 0;    UInt_t nevents = 0;
111      UInt_t neventsm = 0;
112    //    //
113    // variables needed to reprocess data    // variables needed to reprocess data
114    //    //
# Line 116  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f Line 127  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f
127    stringstream ftmpname;    stringstream ftmpname;
128    TString fname;    TString fname;
129    UInt_t totfileentries = 0;    UInt_t totfileentries = 0;
130    UInt_t idRun = 0;    UInt_t idRun = 0;
131      //
132      // My variables. Vitaly.
133      //
134    //  UInt_t oi = 0;
135      Int_t tmpSize = 0;
136    //    //
137    // variables needed to handle error signals    // variables needed to handle error signals
138    //    //
# Line 127  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f Line 143  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f
143    //    //
144    OrbitalInfo *orbitalinfo = new OrbitalInfo();    OrbitalInfo *orbitalinfo = new OrbitalInfo();
145    OrbitalInfo *orbitalinfoclone = new OrbitalInfo();    OrbitalInfo *orbitalinfoclone = new OrbitalInfo();
146    
147    //    //
148    // define variables for opening and reading level0 file    // define variables for opening and reading level0 file
149    //    //
150    TFile *l0File = 0;    TFile *l0File = 0;
151    TTree *l0tr = 0;    TTree *l0tr = 0;
152      //  TTree *l0trm = 0;
153      TChain *ch = 0;
154    // EM: open also header branch    // EM: open also header branch
155    TBranch *l0head = 0;    TBranch *l0head = 0;
156    pamela::EventHeader *eh = 0;    pamela::EventHeader *eh = 0;
157    pamela::PscuHeader *ph = 0;    pamela::PscuHeader *ph = 0;
158      pamela::McmdEvent *mcmdev = 0;
159      pamela::McmdRecord *mcmdrc = 0;
160    // end EM    // end EM
161      
162      //  pamela::RunHeaderEvent *reh = new pamela::RunHeaderEvent;
163      //  pamela::EventHeader    *eH  = new pamela::EventHeader;
164      
165    //    //
166    // Define other basic variables    // Define other basic variables
167    //    //
# Line 147  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f Line 172  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f
172    Int_t totevent = 0;    Int_t totevent = 0;
173    UInt_t atime = 0;    UInt_t atime = 0;
174    UInt_t re = 0;    UInt_t re = 0;
175      UInt_t ik = 0;
176    
177    // Position    // Position
178    Float_t lon, lat, alt;    Float_t lon, lat, alt;
# Line 154  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f Line 180  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f
180    //    //
181    // IGRF stuff    // IGRF stuff
182    //    //
183    float dimo = 0.0; // dipole moment (computed from dat files)    Float_t dimo = 0.0; // dipole moment (computed from dat files)
184    float bnorth, beast, bdown, babs;    Float_t bnorth, beast, bdown, babs;
185    float xl; // L value    Float_t xl; // L value
186    float icode; // code value for L accuracy (see fortran code)    Float_t icode; // code value for L accuracy (see fortran code)
187    float bab1; // What's  the difference with babs?    Float_t bab1; // What's  the difference with babs?
188    float stps = 0.005; // step size for field line tracing    Float_t stps = 0.005; // step size for field line tracing
189    float bdel = 0.01; // required accuracy    Float_t bdel = 0.01; // required accuracy
190    float bequ;  // equatorial b value (also called b_0)    Float_t bequ;  // equatorial b value (also called b_0)
191    bool value = 0; // false if bequ is not the minimum b value    Bool_t value = 0; // false if bequ is not the minimum b value
192    float rr0; // equatorial radius normalized to earth radius    Float_t rr0; // equatorial radius normalized to earth radius
193    
194    //    //
195    // Working filename    // Working filename
# Line 179  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f Line 205  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f
205    TTree *tempOrbitalInfo = 0;    TTree *tempOrbitalInfo = 0;
206    stringstream tempname;    stringstream tempname;
207    stringstream OrbitalInfofolder;    stringstream OrbitalInfofolder;
208      Bool_t myfold = false;
209    tempname.str("");    tempname.str("");
210    tempname << outDir;    tempname << outDir;
211    tempname << "/" << processFolder.Data();    tempname << "/" << processFolder.Data();
212    OrbitalInfofolder.str("");    OrbitalInfofolder.str("");
213    OrbitalInfofolder << tempname.str().c_str();    OrbitalInfofolder << tempname.str().c_str();
   gSystem->MakeDirectory(OrbitalInfofolder.str().c_str());  
214    tempname << "/OrbitalInfotree_run";    tempname << "/OrbitalInfotree_run";
215    tempname << run << ".root";      tempname << run << ".root";  
216      UInt_t totnorun = 0;
217    //    //
218    // DB classes    // DB classes
219    //    //
220    GL_ROOT *glroot = new GL_ROOT();    GL_ROOT *glroot = new GL_ROOT();
221    GL_TIMESYNC *dbtime = 0;    GL_TIMESYNC *dbtime = 0;
222    GL_TLE *gltle = new GL_TLE();    GL_TLE *gltle = new GL_TLE();
223      //
224      //Quaternions classes
225      //
226      Quaternions *L_QQ_Q_l_lower = new Quaternions();
227      InclinationInfo *RYPang_lower = new InclinationInfo();
228      Quaternions *L_QQ_Q_l_upper = new Quaternions();
229      InclinationInfo *RYPang_upper = new InclinationInfo();
230      
231      cEci eCi;
232      
233    // Initialize fortran routines!!!    // Initialize fortran routines!!!
234    Int_t ltp2 = 0;    Int_t ltp2 = 0;
235    Int_t ltp3 = 0;    Int_t ltp3 = 0;
236    Int_t uno = 1;    Int_t uno = 1;
237    char *niente = " ";    const char *niente = " ";
238    GL_PARAM *glparam = new GL_PARAM();    GL_PARAM *glparam = new GL_PARAM();
239    GL_PARAM *glparam2 = new GL_PARAM();    GL_PARAM *glparam2 = new GL_PARAM();
240    Int_t parerror=glparam->Query_GL_PARAM(1,301,dbc); // parameters stored in DB in GL_PRAM table  
241      //
242      // Orientation variables. Vitaly
243      //
244      UInt_t evfrom = 0;
245      UInt_t jumped = 0;
246      Int_t itr = -1;    
247      Double_t A1;
248      Double_t A2;
249      Double_t A3;
250      Double_t Px = 0;
251      Double_t Py = 0;      
252      Double_t Pz = 0;  
253      TTree *ttof = 0;
254      ToFLevel2 *tof = new ToFLevel2();
255      OrientationInfo *PO = new OrientationInfo();
256      Int_t nz = 6;
257      Float_t zin[6];
258      Int_t nevtofl2 = 0;
259      if ( verbose ) cout<<"Reading quaternions external file"<<endl;
260      cout.setf(ios::fixed,ios::floatfield);  
261      /******Reading recovered quaternions...*********/
262      //cout<<"START reading recovered quaternions..."<<endl;
263      vector<Double_t> recqtime;
264      vector<Float_t> recq0;
265      vector<Float_t> recq1;
266      vector<Float_t> recq2;
267      vector<Float_t> recq3;
268      Float_t Norm = 1;
269      Int_t parerror=glparam->Query_GL_PARAM(1,303,dbc); // parameters stored in DB in GL_PRAM table  
270      if ( parerror<0 ) {
271        code = parerror;
272        goto closeandexit;
273      };
274      ifstream in((glparam->PATH+glparam->NAME).Data(),ios::in);
275      //cout<<"ifstream loaded..."<<endl;
276      while(!in.eof()){
277        recqtime.resize(recqtime.size()+1);
278        Int_t sizee = recqtime.size();
279        recq0.resize(sizee);
280        recq1.resize(sizee);
281        recq2.resize(sizee);
282        recq3.resize(sizee);
283        in>>recqtime[sizee-1];
284        in>>recq0[sizee-1];
285        in>>recq1[sizee-1];
286        in>>recq2[sizee-1];
287        in>>recq3[sizee-1];
288        in>>Norm;
289        //cout<<recqtime[sizee]<<endl;
290      }
291      if ( verbose ) cout<<"We have read recovered data"<<endl;
292    
293    
294      parerror=glparam->Query_GL_PARAM(1,301,dbc); // parameters stored in DB in GL_PRAM table  
295    if ( parerror<0 ) {    if ( parerror<0 ) {
296      code = parerror;      code = parerror;
297      goto closeandexit;      goto closeandexit;
# Line 217  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f Line 308  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f
308    if ( verbose ) printf(" Reading Earth's Magnetic Field parameter file: %s \n",(glparam2->PATH+glparam2->NAME).Data());    if ( verbose ) printf(" Reading Earth's Magnetic Field parameter file: %s \n",(glparam2->PATH+glparam2->NAME).Data());
309    //    //
310    initize_((char *)niente,&uno,(char *)(glparam->PATH+glparam->NAME).Data(),&ltp2,(char *)(glparam2->PATH+glparam2->NAME).Data(),&ltp3);    initize_((char *)niente,&uno,(char *)(glparam->PATH+glparam->NAME).Data(),&ltp2,(char *)(glparam2->PATH+glparam2->NAME).Data(),&ltp3);
   
311    //    //
312    // End IGRF stuff//    // End IGRF stuff//
313    //    //
314      for (Int_t ip=0;ip<nz;ip++){
315        zin[ip] = tof->GetZTOF(tof->GetToFPlaneID(ip));
316      };
317      //
318      if ( !standalone ){
319        //
320        // Does it contain the Tracker tree?
321        //
322        ttof = (TTree*)file->Get("ToF");
323        if ( !ttof ) {
324          if ( verbose ) printf(" OrbitalInfo - ERROR: no tof tree\n");
325          code = -900;
326          goto closeandexit;
327        };
328        ttof->SetBranchAddress("ToFLevel2",&tof);  
329        nevtofl2 = ttof->GetEntries();
330      };
331    //    //
332    // Let's start!    // Let's start!
333    //    //
# Line 276  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f Line 382  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f
382    // number of run to be processed    // number of run to be processed
383    //    //
384    numbofrun = runinfo->GetNoRun();    numbofrun = runinfo->GetNoRun();
385      totnorun = runinfo->GetRunEntries();
386    //    //
387    // Try to access the OrbitalInfo tree in the file, if it exists we are reprocessing data if not we are processing a new run    // Try to access the OrbitalInfo tree in the file, if it exists we are reprocessing data if not we are processing a new run
388    //    //
# Line 302  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f Line 409  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f
409      //      //
410      if (verbose) printf("\n Preparing the pre-processing...\n");      if (verbose) printf("\n Preparing the pre-processing...\n");
411      //      //
412      if ( run == 0 ){      if ( run == 0 || totnorun == 1 ){
413        //        //
414        // we are reprocessing all the file        // we are reprocessing all the file
415        // if we are reprocessing everything we don't need to copy any old event and we can just work with the new tree and delete the old one immediately        // if we are reprocessing everything we don't need to copy any old event and we can just work with the new tree and delete the old one immediately
# Line 321  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f Line 428  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f
428        //        //
429        // copying old tree to a new file        // copying old tree to a new file
430        //        //
431          gSystem->MakeDirectory(OrbitalInfofolder.str().c_str());
432          myfold = true;
433        tempfile = new TFile(tempname.str().c_str(),"RECREATE");        tempfile = new TFile(tempname.str().c_str(),"RECREATE");
434        tempOrbitalInfo = OrbitalInfotrclone->CloneTree(-1,"fast");        tempOrbitalInfo = OrbitalInfotrclone->CloneTree(-1,"fast");
435        tempOrbitalInfo->SetName("OrbitalInfo-old");        tempOrbitalInfo->SetName("OrbitalInfo-old");
# Line 341  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f Line 450  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f
450    file->cd();    file->cd();
451    OrbitalInfotr = new TTree("OrbitalInfo-new","PAMELA OrbitalInfo data");    OrbitalInfotr = new TTree("OrbitalInfo-new","PAMELA OrbitalInfo data");
452    OrbitalInfotr->SetAutoSave(900000000000000LL);    OrbitalInfotr->SetAutoSave(900000000000000LL);
453      orbitalinfo->Set();//ELENA **TEMPORANEO?**
454    OrbitalInfotr->Branch("OrbitalInfo","OrbitalInfo",&orbitalinfo);    OrbitalInfotr->Branch("OrbitalInfo","OrbitalInfo",&orbitalinfo);
455    //    //
456    if ( reproc && !reprocall ){    if ( reproc && !reprocall ){
# Line 360  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f Line 470  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f
470        }        }
471        for (UInt_t j = 0; j < nobefrun; j++){        for (UInt_t j = 0; j < nobefrun; j++){
472          //          //
473          OrbitalInfotrclone->GetEntry(j);                    if ( OrbitalInfotrclone->GetEntry(j) <= 0 ) throw -36;    
474          //          //
475          // copy orbitalinfoclone to mydec          // copy orbitalinfoclone to mydec
476          //          //
# Line 377  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f Line 487  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f
487      };                };          
488    };    };
489    //    //
490      //
491    // Get the list of run to be processed, if only one run has to be processed the list will contain one entry only.    // Get the list of run to be processed, if only one run has to be processed the list will contain one entry only.
492    //    //
493    runlist = runinfo->GetRunList();    runlist = runinfo->GetRunList();
# Line 387  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f Line 498  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f
498      //      //
499      // retrieve the first run ID to be processed using the RunInfo list      // retrieve the first run ID to be processed using the RunInfo list
500      //      //
501        
502      idRun = runlist->At(irun);      idRun = runlist->At(irun);
503      if (verbose){      if (verbose){
504        printf("\n\n\n ####################################################################### \n");        printf("\n\n\n ####################################################################### \n");
# Line 419  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f Line 531  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f
531      // prepare the timesync for the db      // prepare the timesync for the db
532      //      //
533      dbtime = new GL_TIMESYNC(runinfo->ID_ROOT_L0,"ID",dbc);      dbtime = new GL_TIMESYNC(runinfo->ID_ROOT_L0,"ID",dbc);
534      
535      //      //
536      // Search in the DB the path and name of the LEVEL0 file to be processed.      // Search in the DB the path and name of the LEVEL0 file to be processed.
537      //      //
# Line 428  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f Line 541  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f
541      ftmpname << glroot->PATH.Data() << "/";      ftmpname << glroot->PATH.Data() << "/";
542      ftmpname << glroot->NAME.Data();      ftmpname << glroot->NAME.Data();
543      fname = ftmpname.str().c_str();      fname = ftmpname.str().c_str();
544        ftmpname.str("");
545      //      //
546      // print out informations      // print nout informations
547      //      //
548      totevent = runinfo->NEVENTS;      totevent = runinfo->NEVENTS;
549        evfrom = runinfo->EV_FROM;
550        //cout<<"totevents = "<<totevent<<"\n";
551      if (verbose){      if (verbose){
552        printf("\n LEVEL0 data file: %s \n",fname.Data());        printf("\n LEVEL0 data file: %s \n",fname.Data());
553        printf(" RUN HEADER absolute time is:  %u \n",runinfo->RUNHEADER_TIME);        printf(" RUN HEADER absolute time is:  %u \n",runinfo->RUNHEADER_TIME);
554        printf(" RUN TRAILER absolute time is: %u \n",runinfo->RUNTRAILER_TIME);        printf(" RUN TRAILER absolute time is: %u \n",runinfo->RUNTRAILER_TIME);
555        printf(" %i events to be processed for run %u: from %i to %i \n\n",totevent,idRun,runinfo->EV_FROM,runinfo->EV_FROM+totevent);        printf(" %i events to be processed for run %u: from %i to %i \n\n",totevent,idRun,runinfo->EV_FROM+1,runinfo->EV_FROM+totevent);
556      }//      }//
557        //
558        //    if ( !totevent ) goto closeandexit;
559      // Open Level0 file      // Open Level0 file
560      l0File = new TFile(fname.Data());      l0File = new TFile(fname.Data());
561      if ( !l0File ) {      if ( !l0File ) {
# Line 464  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f Line 582  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f
582      // end EM      // end EM
583      nevents = l0head->GetEntries();      nevents = l0head->GetEntries();
584      //      //
585      if ( nevents < 1 ) {      if ( nevents < 1 && totevent ) {
586        if ( debug ) printf(" OrbitalInfo - ERROR: Level0 file is empty\n\n");        if ( debug ) printf(" OrbitalInfo - ERROR: Level0 file is empty\n\n");
587        l0File->Close();        l0File->Close();
588        code = -11;        code = -11;
589        goto closeandexit;        goto closeandexit;
590      };      };
591      //      //
592      if ( runinfo->EV_TO > nevents-1 ) {      if ( runinfo->EV_TO > nevents-1 && totevent ) {
593        if ( debug ) printf(" OrbitalInfo - ERROR: too few entries in the registry tree\n");        if ( debug ) printf(" OrbitalInfo - ERROR: too few entries in the registry tree\n");
594        l0File->Close();        l0File->Close();
595        code = -12;        code = -12;
596        goto closeandexit;        goto closeandexit;
597      };      };
598      //      //
599        //     TTree *tp = (TTree*)l0File->Get("RunHeader");
600        //     tp->SetBranchAddress("Header", &eH);
601        //     tp->SetBranchAddress("RunHeader", &reh);
602        //     tp->GetEntry(0);
603        //     ph = eH->GetPscuHeader();
604        //     ULong_t TimeSync = reh->LAST_TIME_SYNC_INFO;
605        //     ULong_t ObtSync = reh->OBT_TIME_SYNC;    
606        //     if ( debug ) printf(" 1 TimeSync %lu ObtSync %lu DeltaOBT %lu\n",TimeSync,ObtSync,TimeSync-ObtSync);
607        //
608        ULong_t TimeSync = (ULong_t)dbtime->GetTimesync();
609        ULong_t ObtSync = (ULong_t)(dbtime->GetObt0()/1000);
610        ULong_t DeltaOBT = TimeSync - ObtSync;
611    
612        if ( debug ) printf(" 2 TimeSync %lu ObtSync %lu DeltaOBT %lu\n",(ULong_t)(dbtime->GetTimesync()/1000),(ULong_t)dbtime->GetObt0(),TimeSync-ObtSync);
613        //
614        // Read MCMDs from up to 11 files, 5 before and 5 after the present one in order to have some kind of inclination information
615        //
616        ch = new TChain("Mcmd","Mcmd");
617        //
618        // look in the DB to find the closest files to this run
619        //
620        TSQLResult *pResult = 0;
621        TSQLRow *Row = 0;
622        stringstream myquery;
623        UInt_t l0fid[10];
624        Int_t i = 0;
625        memset(l0fid,0,10*sizeof(Int_t));
626        //
627        myquery.str("");
628        myquery << "select ID_ROOT_L0 from GL_RUN where RUNHEADER_TIME<=" << runinfo->RUNHEADER_TIME << " group by ID_ROOT_L0 order by RUNHEADER_TIME desc limit 5;";
629        //
630        pResult = dbc->Query(myquery.str().c_str());
631        //
632        i = 9;
633        if( pResult ){
634          //
635          Row = pResult->Next();
636          //
637          while ( Row ){
638            //
639            // store infos and exit
640            //
641            l0fid[i] = (UInt_t)atoll(Row->GetField(0));
642            i--;
643            Row = pResult->Next();  
644            //
645          };
646          pResult->Delete();
647        };
648        //
649        myquery.str("");
650        myquery << "select ID_ROOT_L0 from GL_RUN where RUNHEADER_TIME>" << runinfo->RUNHEADER_TIME << " group by ID_ROOT_L0 order by RUNHEADER_TIME asc limit 5;";
651        //
652        pResult = dbc->Query(myquery.str().c_str());
653        //
654        i = 0;
655        if( pResult ){
656          //
657          Row = pResult->Next();
658          //
659          while ( Row ){
660            //
661            // store infos and exit
662            //
663            l0fid[i] = (UInt_t)atoll(Row->GetField(0));
664            i++;
665            Row = pResult->Next();  
666            //
667          };
668          pResult->Delete();
669        };
670        //
671        i = 0;
672        UInt_t previd = 0;
673        while ( i < 10 ){
674          if ( l0fid[i] && previd != l0fid[i] ){
675            previd = l0fid[i];
676            myquery.str("");
677            myquery << "select PATH,NAME from GL_ROOT where ID=" << l0fid[i] << " ;";
678            //
679            pResult = dbc->Query(myquery.str().c_str());
680            //
681            if( pResult ){
682              //
683              Row = pResult->Next();
684              //
685              if ( debug ) printf(" Using inclination informations from file: %s \n",(((TString)gSystem->ExpandPathName(Row->GetField(0)))+"/"+(TString)Row->GetField(1)).Data());
686              ch->Add(((TString)gSystem->ExpandPathName(Row->GetField(0)))+"/"+(TString)Row->GetField(1));
687              //
688              pResult->Delete();
689            };
690          };
691          i++;
692        };
693        //
694        //    l0trm = (TTree*)l0File->Get("Mcmd");
695        //    ch->ls();
696        ch->SetBranchAddress("Mcmd",&mcmdev);
697        //    printf(" entries %llu \n", ch->GetEntries());
698        //    l0trm = ch->GetTree();
699        //    neventsm = l0trm->GetEntries();
700        neventsm = ch->GetEntries();
701        if ( debug ) printf(" entries %u \n", neventsm);
702        //    neventsm = 0;
703        //
704        if (neventsm == 0){
705          if ( debug ) printf("InclinationInfo - WARNING: No quaternions in this File");
706          //      l0File->Close();
707          code = 900;
708          //      goto closeandexit;
709        }
710        //
711        
712        //    l0trm->SetBranchAddress("Mcmd", &mcmdev);
713        //    l0trm->SetBranchAddress("Header", &eh);
714        //
715        //
716        //
717    
718    //    UInt_t mctren = 0;    
719    //    UInt_t mcreen = 0;        
720        UInt_t numrec = 0;
721        //
722        Double_t upperqtime = 0;
723        Double_t lowerqtime = 0;
724        
725    //    Double_t incli = 0;
726    //    oi = 0;
727    //    UInt_t ooi = 0;
728        //
729        // init quaternions information from mcmd-packets
730        //
731        Bool_t isf = true;
732    //    Int_t fgh = 0;
733    
734        vector<Float_t> q0;
735        vector<Float_t> q1;
736        vector<Float_t> q2;
737        vector<Float_t> q3;
738        vector<Double_t> qtime;
739        vector<Float_t> qPitch;
740        vector<Float_t> qRoll;
741        vector<Float_t> qYaw;
742        vector<Int_t> qmode;
743    
744        Int_t nt = 0;
745        
746        //init sine-function interpolation
747        
748        //cout<<"Sine coeficient initialisation..."<<endl;
749        vector<Sine> q0sine;
750        vector<Sine> q1sine;
751        vector<Sine> q2sine;
752        vector<Sine> q3sine;
753        vector<Sine> Yawsine;
754    
755        /*TH2F* q0testing = new TH2F();
756          TH2F* q1testing = new TH2F();
757          TH2F* q2testing = new TH2F();
758          TH2F* q3testing = new TH2F();
759          TH2F* Pitchtesting = new TH2F();
760        */
761        UInt_t must = 0;
762    
763        //
764      // run over all the events of the run      // run over all the events of the run
765      //      //
766      if (verbose) printf("\n Ready to start! \n\n Processed events: \n\n");      if (verbose) printf("\n Ready to start! \n\n Processed events: \n\n");
767      //      //
768        //
769      for ( re = runinfo->EV_FROM; re < (runinfo->EV_FROM+runinfo->NEVENTS); re++){      for ( re = runinfo->EV_FROM; re < (runinfo->EV_FROM+runinfo->NEVENTS); re++){
770        //        //
771        if ( procev%1000 == 0 && procev > 0 && verbose ) printf(" %iK \n",procev/1000);          if ( procev%1000 == 0 && procev > 0 && verbose ) printf(" %iK \n",procev/1000);  
772          if ( debug ) printf(" %i \n",procev);      
773        //        //
774        l0head->GetEntry(re);        if ( l0head->GetEntry(re) <= 0 ) throw -36;
775        //        //
776        // absolute time of this event        // absolute time of this event
777        //        //
778        ph = eh->GetPscuHeader();        ph = eh->GetPscuHeader();
779        atime = dbtime->DBabsTime(ph->GetOrbitalTime());          atime = dbtime->DBabsTime(ph->GetOrbitalTime());
780          if ( debug ) printf(" %i absolute time \n",procev);      
781        //        //
782        // paranoid check        // paranoid check
783        //        //
784        if ( (atime > runinfo->RUNTRAILER_TIME) || (atime < runinfo->RUNHEADER_TIME)  ) {        if ( (atime > (runinfo->RUNTRAILER_TIME+1)) || (atime < (runinfo->RUNHEADER_TIME-1))  ) {
785          if (verbose) printf(" OrbitalInfo - WARNING: event at time outside the run time window, skipping it\n");          if (verbose) printf(" OrbitalInfo - WARNING: event at time outside the run time window, skipping it\n");
786          debug = true;          jumped++;
787            //      debug = true;
788          continue;          continue;
789        }        }
790    
791          //
792          // retrieve tof informations
793          //
794          if ( !reprocall ){
795            itr = nobefrun + (re - evfrom - jumped);
796            //itr = re-(46438+200241);
797          } else {
798            itr = runinfo->GetFirstEntry() + (re - evfrom - jumped);
799          };
800          //
801          if ( !standalone ){
802            if ( itr > nevtofl2 ){  
803              if ( verbose ) printf(" OrbitalInfo - ERROR: no tof events with entry = %i in Level2 file\n",itr);
804              if ( debug ) printf(" nobefrun %u re %u evfrom %u jumped %u reprocall %i \n",nobefrun,re,evfrom,jumped,reprocall);
805              l0File->Close();
806              code = -901;
807              goto closeandexit;
808            };
809            //
810            tof->Clear();
811            //
812            if ( ttof->GetEntry(itr) <= 0 ) throw -36;
813            //
814          };
815        //        //
816        procev++;        procev++;
817        //        //
818        // start processing        // start processing
819        //        //
820          if ( debug ) printf(" %i start processing \n",procev);      
821        orbitalinfo->Clear();        orbitalinfo->Clear();
822        //        //
823        // CHANGE HERE!!!!        OrbitalInfoTrkVar *t_orb = new OrbitalInfoTrkVar();
824          if( !(orbitalinfo->OrbitalInfoTrk) ) orbitalinfo->OrbitalInfoTrk = new TClonesArray("OrbitalInfoTrkVar",2);
825          TClonesArray &tor = *orbitalinfo->OrbitalInfoTrk;
826        //        //
827        orbitalinfo->absTime = atime;        // Fill OBT, pkt_num and absTime
828        // EM: add OBT and plt_num infos from the header        //      
       ph = eh->GetPscuHeader();  
829        orbitalinfo->pkt_num = ph->GetCounter();        orbitalinfo->pkt_num = ph->GetCounter();
830        orbitalinfo->OBT = ph->GetOrbitalTime();        orbitalinfo->OBT = ph->GetOrbitalTime();
831          orbitalinfo->absTime = atime;
832        // If the absolute time of the event overpass the time of the        if ( debug ) printf(" %i pktnum obt abstime \n",procev);      
833        // tle, get a new tle.  GL_TLE::GetToTime() default to zero.        //
834          // Propagate the orbit from the tle time to atime, using SGP(D)4.
835          //
836          if ( debug ) printf(" %i sgp4 \n",procev);      
837          cCoordGeo coo;
838          Float_t jyear=0.;    
839        //        //
       // I also use this condition to compute the dipole moment dimo.  
       // It's really redundant to compute it so often because  
       // probably it will not change at all.  But the overhead is  
       // minimum.  
       float jyear=0;  
   
840        if(atime >= gltle->GetToTime()) {        if(atime >= gltle->GetToTime()) {
841          if ( !gltle->Query(atime, dbc) ){          if ( !gltle->Query(atime, dbc) ){
842                        //      
843            // Compute the magnetic dipole moment.            // Compute the magnetic dipole moment.
844              //
845              if ( debug ) printf(" %i compute magnetic dipole moment \n",procev);      
846            UInt_t year, month, day, hour, min, sec;            UInt_t year, month, day, hour, min, sec;
847                        //
848            TTimeStamp t = TTimeStamp(atime, kTRUE);            TTimeStamp t = TTimeStamp(atime, kTRUE);
849            t.GetDate(kTRUE, 0, &year, &month, &day);            t.GetDate(kTRUE, 0, &year, &month, &day);
850            t.GetTime(kTRUE, 0, &hour, &min, &sec);            t.GetTime(kTRUE, 0, &hour, &min, &sec);
851            jyear = (float) year            jyear = (float) year
852              + (month*31.+ (float) day)/365.              + (month*31.+ (float) day)/365.
853              + (hour*3600.+min*60.+(float)sec)/(24*3600*365.);              + (hour*3600.+min*60.+(float)sec)/(24.*3600.*365.);
854                        //
855              if ( debug ) printf(" %i compute magnetic dipole moment get dipole moment for year\n",procev);      
856            feldcof_(&jyear, &dimo); // get dipole moment for year            feldcof_(&jyear, &dimo); // get dipole moment for year
857              if ( debug ) printf(" %i compute magnetic dipole moment end\n",procev);      
858          } else {          } else {
859            code = -56;            code = -56;
860            goto closeandexit;            goto closeandexit;
861          };          };
862        }        }
863          coo = getCoo(atime, gltle->GetFromTime(), gltle->GetTle());
864          //
865          cOrbit orbits(*gltle->GetTle());
866          //
867          if ( debug ) printf(" I am Here \n");
868          //
869          // synchronize with quaternions data
870          //
871          if ( isf && neventsm>0 ){
872            //
873            // First event
874            //
875            isf = false;
876            upperqtime = atime;
877            lowerqtime = runinfo->RUNHEADER_TIME;
878            for ( ik = 0; ik < neventsm; ik++){  //number of macrocommad packets
879              if ( ch->GetEntry(ik) <= 0 ) throw -36;
880              tmpSize = mcmdev->Records->GetEntries();
881              numrec = tmpSize;
882              for (Int_t j3 = 0;j3<tmpSize;j3++){  //number of subpackets
883                if ( debug ) printf(" ik %i j3 %i eh eh eh \n",ik,j3);
884                mcmdrc = (pamela::McmdRecord*)mcmdev->Records->At(j3);
885                if ( mcmdrc ){ // missing inclination bug [8RED 090116]
886                  if ((int)mcmdrc->ID1 == 226 && mcmdrc->Mcmd_Block_crc_ok == 1){ //Check that it is Inclination Packet
887                    L_QQ_Q_l_upper->fill(mcmdrc->McmdData);
888                    for (UInt_t ui = 0; ui < 6; ui++){
889                      if (ui>0){
890                        if (L_QQ_Q_l_upper->time[ui]>L_QQ_Q_l_upper->time[0]){
891                          Double_t u_time = dbtime->DBabsTime((UInt_t)(L_QQ_Q_l_upper->time[ui]*1000-DeltaOBT*1000));
892                          Int_t recSize = recqtime.size();
893                          for(Int_t mu = nt;mu<recSize;mu++){
894                            if(recqtime[mu]>lowerqtime && recqtime[mu]<u_time){
895                              nt=mu;
896                              Int_t sizeqmcmd = qtime.size();
897                              inclresize(qtime,q0,q1,q2,q3,qmode,qRoll,qPitch,qYaw);
898                              qtime[sizeqmcmd]=recqtime[mu];
899                              q0[sizeqmcmd]=recq0[mu];
900                              q1[sizeqmcmd]=recq1[mu];
901                              q2[sizeqmcmd]=recq2[mu];
902                              q3[sizeqmcmd]=recq3[mu];
903                              qmode[sizeqmcmd]=-10;
904                              orbits.getPosition((double) (qtime[sizeqmcmd] - gltle->GetFromTime())/60., &eCi);
905                              RYPang_upper->TransAngle(eCi.getPos().m_x,eCi.getPos().m_y,eCi.getPos().m_z,eCi.getVel().m_x,eCi.getVel().m_y,eCi.getVel().m_z,recq0[mu],recq1[mu],recq2[mu],recq3[mu]);
906                              qRoll[sizeqmcmd]=RYPang_upper->Kren;
907                              qYaw[sizeqmcmd]=RYPang_upper->Ryskanie;
908                              qPitch[sizeqmcmd]=RYPang_upper->Tangazh;
909                            }
910                            if(recqtime[mu]>=u_time){
911                              Int_t sizeqmcmd = qtime.size();
912                              inclresize(qtime,q0,q1,q2,q3,qmode,qRoll,qPitch,qYaw);
913                              qtime[sizeqmcmd]=u_time;
914                              q0[sizeqmcmd]=L_QQ_Q_l_upper->quat[ui][0];
915                              q1[sizeqmcmd]=L_QQ_Q_l_upper->quat[ui][1];
916                              q2[sizeqmcmd]=L_QQ_Q_l_upper->quat[ui][2];
917                              q3[sizeqmcmd]=L_QQ_Q_l_upper->quat[ui][3];
918                              qmode[sizeqmcmd]=holeq(lowerqtime,qtime[sizeqmcmd],L_QQ_Q_l_lower,L_QQ_Q_l_upper,ui);
919                              lowerqtime = u_time;
920                              orbits.getPosition((double) (u_time - gltle->GetFromTime())/60., &eCi);
921                              RYPang_upper->TransAngle(eCi.getPos().m_x,eCi.getPos().m_y,eCi.getPos().m_z,eCi.getVel().m_x,eCi.getVel().m_y,eCi.getVel().m_z,L_QQ_Q_l_upper->quat[ui][0],L_QQ_Q_l_upper->quat[ui][1],L_QQ_Q_l_upper->quat[ui][2],L_QQ_Q_l_upper->quat[ui][3]);
922                              qRoll[sizeqmcmd]=RYPang_upper->Kren;
923                              qYaw[sizeqmcmd]=RYPang_upper->Ryskanie;
924                              qPitch[sizeqmcmd]=RYPang_upper->Tangazh;
925                              break;
926                            }
927                          }
928                        }
929                      }else{
930                        Double_t u_time = dbtime->DBabsTime((UInt_t)(L_QQ_Q_l_upper->time[0]*1000-DeltaOBT*1000));
931                        if(lowerqtime>u_time)nt=0;
932                        Int_t recSize = recqtime.size();
933                        for(Int_t mu = nt;mu<recSize;mu++){
934                          if(recqtime[mu]>lowerqtime && recqtime[mu]<u_time){
935                            nt=mu;
936                            Int_t sizeqmcmd = qtime.size();
937                            inclresize(qtime,q0,q1,q2,q3,qmode,qRoll,qPitch,qYaw);
938                            qtime[sizeqmcmd]=recqtime[mu];
939                            q0[sizeqmcmd]=recq0[mu];
940                            q1[sizeqmcmd]=recq1[mu];
941                            q2[sizeqmcmd]=recq2[mu];
942                            q3[sizeqmcmd]=recq3[mu];
943                            qmode[sizeqmcmd]=-10;
944                            orbits.getPosition((double) (qtime[sizeqmcmd] - gltle->GetFromTime())/60., &eCi);
945                            RYPang_upper->TransAngle(eCi.getPos().m_x,eCi.getPos().m_y,eCi.getPos().m_z,eCi.getVel().m_x,eCi.getVel().m_y,eCi.getVel().m_z,recq0[mu],recq1[mu],recq2[mu],recq3[mu]);
946                            qRoll[sizeqmcmd]=RYPang_upper->Kren;
947                            qYaw[sizeqmcmd]=RYPang_upper->Ryskanie;
948                            qPitch[sizeqmcmd]=RYPang_upper->Tangazh;
949                          }
950                          if(recqtime[mu]>=u_time){
951                            Int_t sizeqmcmd = qtime.size();
952                            inclresize(qtime,q0,q1,q2,q3,qmode,qRoll,qPitch,qYaw);
953                            qtime[sizeqmcmd]=u_time;
954                            q0[sizeqmcmd]=L_QQ_Q_l_upper->quat[0][0];
955                            q1[sizeqmcmd]=L_QQ_Q_l_upper->quat[0][1];
956                            q2[sizeqmcmd]=L_QQ_Q_l_upper->quat[0][2];
957                            q3[sizeqmcmd]=L_QQ_Q_l_upper->quat[0][3];
958                            qmode[sizeqmcmd]=holeq(lowerqtime,qtime[sizeqmcmd],L_QQ_Q_l_lower,L_QQ_Q_l_upper,ui);
959                            lowerqtime = u_time;
960                            orbits.getPosition((double) (u_time - gltle->GetFromTime())/60., &eCi);
961                            RYPang_upper->TransAngle(eCi.getPos().m_x,eCi.getPos().m_y,eCi.getPos().m_z,eCi.getVel().m_x,eCi.getVel().m_y,eCi.getVel().m_z,L_QQ_Q_l_upper->quat[0][0],L_QQ_Q_l_upper->quat[0][1],L_QQ_Q_l_upper->quat[0][2],L_QQ_Q_l_upper->quat[0][3]);
962                            qRoll[sizeqmcmd]=RYPang_upper->Kren;
963                            qYaw[sizeqmcmd]=RYPang_upper->Ryskanie;
964                            qPitch[sizeqmcmd]=RYPang_upper->Tangazh;
965                            CopyQ(L_QQ_Q_l_lower,L_QQ_Q_l_upper);
966                            break;
967                          }
968                        }
969                      }
970                    }
971                  }
972                }
973              }
974            }
975    
976        // Propagate the orbit from the tle time to atime, using SGP(D)4.          sineparam(q0sine,qtime,q0,qRoll,qPitch,0.58);
977        cCoordGeo coo = getCoo(atime, gltle->GetFromTime(), gltle->GetTle());          sineparam(q1sine,qtime,q1,qRoll,qPitch,0.79);
978            sineparam(q2sine,qtime,q2,qRoll,qPitch,0.79);
979            sineparam(q3sine,qtime,q3,qRoll,qPitch,0.58);
980            sineparam(Yawsine,qtime,qYaw,qRoll,qPitch,4);
981            Double_t tmin = 9999999999.;
982            Double_t tmax = 0.;
983            for(UInt_t tre = 0;tre<qtime.size();tre++){
984              if(qtime[tre]>tmax)tmax = qtime[tre];
985              if(qtime[tre]<tmin)tmin = qtime[tre];
986            }
987            
988            //q0testing->SetName("q0testing");
989            //q1testing->SetName("q1testing");
990            //q2testing->SetName("q2testing");
991            //q3testing->SetName("q3testing");
992            
993    //      Int_t ss=10.*(tmax-tmin);
994            //q0testing->SetBins(ss,tmin,tmax,1000,-1.,1.);
995            //Pitchtesting->SetBins(ss,tmin,tmax,1000,-40.,40.);
996    
997    //      for(Int_t tre = 0;tre<qtime.size();tre++){
998              //cout<<"q0["<<tre<<" = "<<q0[tre]<<endl;
999              //q0testing->Fill(qtime[tre],q0[tre]);
1000              //q1testing->Fill(qtime[tre],q1[tre]);
1001              //Pitchtesting->Fill(qtime[tre],qPitch[tre],100);
1002              //if(qmode[tre] == -10)Pitchtesting->Fill(qtime[tre],10,100);
1003              //q2testing->Fill(qtime[tre],q2[tre],100);
1004              //q3testing->Fill(qtime[tre],q3[tre],100);
1005    //      }
1006            
1007            //for(Int_t tre=0;tre<q0sine.size();tre++)cout<<q1sine[tre].A<<"*sin("<<q1sine[tre].b<<"x+"<<q1sine[tre].c<<")\t time start: "<<q1sine[tre].startPoint<<"\ttime end: "<<q1sine[tre].finishPoint<<endl;
1008            //for(Int_t tre=0;tre<q0sine.size();tre++)cout<<q1sine[tre].A<<"*sin("<<q1sine[tre].b<<"x+"<<q1sine[tre].c<<")\t time start: "<<q0sine[tre].startPoint<<"\ttime end: "<<q0sine[tre].finishPoint<<endl;
1009          } // if we processed first event
1010          
1011          //Filling Inclination information
1012          Double_t incli = 0;
1013          for(UInt_t mu = must;mu<qtime.size()-1;mu++){
1014            if(qtime[mu+1]>qtime[mu]){
1015              if(atime<=qtime[mu+1] && atime>=qtime[mu]){
1016                must = mu;
1017                incli = (qPitch[mu+1]-qPitch[mu])/(qtime[mu+1]-qtime[mu]);
1018                orbitalinfo->theta =  incli*atime+qPitch[mu+1]-incli*qtime[mu+1];
1019                incli = (qRoll[mu+1]-qRoll[mu])/(qtime[mu+1]-qtime[mu]);
1020                orbitalinfo->etha =  incli*atime+qRoll[mu+1]-incli*qtime[mu+1];
1021                incli = (qYaw[mu+1]-qYaw[mu])/(qtime[mu+1]-qtime[mu]);
1022                orbitalinfo->phi =  incli*atime+qYaw[mu+1]-incli*qtime[mu+1];
1023                
1024                incli = (q0[mu+1]-q0[mu])/(qtime[mu+1]-qtime[mu]);
1025                orbitalinfo->q0t =  incli*atime+q0[mu+1]-incli*qtime[mu+1];
1026                incli = (q1[mu+1]-q1[mu])/(qtime[mu+1]-qtime[mu]);
1027                orbitalinfo->q1t =  incli*atime+q1[mu+1]-incli*qtime[mu+1];
1028                incli = (q2[mu+1]-q2[mu])/(qtime[mu+1]-qtime[mu]);
1029                orbitalinfo->q2t =  incli*atime+q2[mu+1]-incli*qtime[mu+1];
1030                incli = (q3[mu+1]-q3[mu])/(qtime[mu+1]-qtime[mu]);
1031                orbitalinfo->q3t =  incli*atime+q3[mu+1]-incli*qtime[mu+1];
1032                
1033                orbitalinfo->TimeGap = qtime[mu+1]-qtime[mu];
1034                orbitalinfo->mode = qmode[mu+1];
1035                if(qmode[mu+1]==-10) orbitalinfo->R10r = true;else orbitalinfo->R10r = false;
1036                if(qmode[mu+1]==-10 || qmode[mu+1]==0 || qmode[mu+1]==1 || qmode[mu+1]==3 || qmode[mu+1]==4 || qmode[mu+1]==6){
1037                  //linear interpolation
1038                  incli = (q0[mu+1]-q0[mu])/(qtime[mu+1]-qtime[mu]);
1039                  orbitalinfo->q0 =  incli*atime+q0[mu+1]-incli*qtime[mu+1];
1040                  incli = (q1[mu+1]-q1[mu])/(qtime[mu+1]-qtime[mu]);
1041                  orbitalinfo->q1 =  incli*atime+q1[mu+1]-incli*qtime[mu+1];
1042                  incli = (q2[mu+1]-q2[mu])/(qtime[mu+1]-qtime[mu]);
1043                  orbitalinfo->q2 =  incli*atime+q2[mu+1]-incli*qtime[mu+1];
1044                  incli = (q3[mu+1]-q3[mu])/(qtime[mu+1]-qtime[mu]);
1045                  orbitalinfo->q3 =  incli*atime+q3[mu+1]-incli*qtime[mu+1];
1046                }else{
1047                  //sine interpolation
1048                  for(UInt_t mt=0;mt<q0sine.size();mt++){
1049                    if(atime<=q0sine[mt].finishPoint && atime>=q0sine[mt].startPoint){
1050                      if(!q0sine[mt].NeedFit)orbitalinfo->q0=q0sine[mt].A*sin(q0sine[mt].b*atime+q0sine[mt].c);else{
1051                        incli = (q0[mu+1]-q0[mu])/(qtime[mu+1]-qtime[mu]);
1052                        orbitalinfo->q0 =  incli*atime+q0[mu+1]-incli*qtime[mu+1];
1053                      }
1054                    }
1055                    if(atime<=q1sine[mt].finishPoint && atime>=q1sine[mt].startPoint){
1056                      if(!q1sine[mt].NeedFit)orbitalinfo->q1=q1sine[mt].A*sin(q1sine[mt].b*atime+q1sine[mt].c);else{
1057                        incli = (q1[mu+1]-q1[mu])/(qtime[mu+1]-qtime[mu]);
1058                        orbitalinfo->q1 =  incli*atime+q1[mu+1]-incli*qtime[mu+1];
1059                      }
1060                    }
1061                    if(atime<=q2sine[mt].finishPoint && atime>=q2sine[mt].startPoint){
1062                      if(!q2sine[mt].NeedFit)orbitalinfo->q2=q0sine[mt].A*sin(q2sine[mt].b*atime+q2sine[mt].c);else{
1063                        incli = (q2[mu+1]-q2[mu])/(qtime[mu+1]-qtime[mu]);
1064                        orbitalinfo->q2 =  incli*atime+q2[mu+1]-incli*qtime[mu+1];
1065                      }
1066                    }
1067                    if(atime<=q3sine[mt].finishPoint && atime>=q3sine[mt].startPoint){
1068                      if(!q3sine[mt].NeedFit)orbitalinfo->q3=q0sine[mt].A*sin(q3sine[mt].b*atime+q3sine[mt].c);else{
1069                        incli = (q3[mu+1]-q3[mu])/(qtime[mu+1]-qtime[mu]);
1070                        orbitalinfo->q3 =  incli*atime+q3[mu+1]-incli*qtime[mu+1];
1071                      }
1072                    }
1073                    if(atime<=Yawsine[mt].finishPoint && atime>=Yawsine[mt].startPoint){
1074                      if(!Yawsine[mt].NeedFit)orbitalinfo->phi=Yawsine[mt].A*sin(Yawsine[mt].b*atime+Yawsine[mt].c);else{
1075                        incli = (qYaw[mu+1]-qYaw[mu])/(qtime[mu+1]-qtime[mu]);
1076                        orbitalinfo->phi =  incli*atime+qYaw[mu+1]-incli*qtime[mu+1];
1077                      }
1078                    }
1079                  }
1080                }
1081                //q0testing->Fill(atime,orbitalinfo->q0,100);
1082                //q1testing->Fill(atime,orbitalinfo->q1,100);
1083                //Pitchtesting->Fill(atime,orbitalinfo->etha);
1084                //q2testing->Fill(atime,orbitalinfo->q2);
1085                //q3testing->Fill(atime,orbitalinfo->q3);
1086                break;
1087              }
1088            }
1089          }
1090    
1091          //
1092          // ops no inclination information
1093          //
1094    
1095          if ( orbitalinfo->q0< -999 || orbitalinfo->q1 < -999 || orbitalinfo->q2 < -999 || orbitalinfo->q3 < -999 || orbitalinfo->q0 != orbitalinfo->q0 || orbitalinfo->q1 != orbitalinfo->q1 || orbitalinfo->q2 != orbitalinfo->q2 || orbitalinfo->q3 != orbitalinfo->q3 ){
1096            orbitalinfo->mode = 10;
1097            orbitalinfo->q0 = -1000.;
1098            orbitalinfo->q1 = -1000.;
1099            orbitalinfo->q2 = -1000.;
1100            orbitalinfo->q3 = -1000.;
1101            orbitalinfo->etha = -1000.;
1102            orbitalinfo->phi = -1000.;
1103            orbitalinfo->theta = -1000.;
1104          };
1105          //
1106          // #########################################################################################################################  
1107          //
1108          // fill orbital positions
1109          //        
1110        // Build coordinates in the right range.  We want to convert,        // Build coordinates in the right range.  We want to convert,
1111        // longitude from (0, 2*pi) to (-180deg, 180deg).  Altitude is        // longitude from (0, 2*pi) to (-180deg, 180deg).  Altitude is
1112        // in meters.        // in meters.
1113        lon = (coo.m_Lon > M_PI) ? rad2deg(coo.m_Lon - 2*M_PI) : rad2deg(coo.m_Lon);        lon = (coo.m_Lon > M_PI) ? rad2deg(coo.m_Lon - 2*M_PI) : rad2deg(coo.m_Lon);
1114        lat = rad2deg(coo.m_Lat);        lat = rad2deg(coo.m_Lat);
1115        alt = coo.m_Alt;        alt = coo.m_Alt;
1116          //
   
       //      if((lon>180) || (lon<-180) || (lat>90) || (lat<-90) || (alt<0))  
       //        continue;  
1117        if( lon<180 && lon>-180 && lat<90 && lat>-90 && alt>0 ){          if( lon<180 && lon>-180 && lat<90 && lat>-90 && alt>0 ){  
1118            //      
1119          orbitalinfo->lon = lon;          orbitalinfo->lon = lon;
1120          orbitalinfo->lat = lat;          orbitalinfo->lat = lat;
1121          orbitalinfo->alt = alt ;          orbitalinfo->alt = alt ;
1122                    //
1123          // compute mag field components and L shell.          // compute mag field components and L shell.
1124            //
1125          feldg_(&lat, &lon, &alt, &bnorth, &beast, &bdown, &babs);          feldg_(&lat, &lon, &alt, &bnorth, &beast, &bdown, &babs);
1126          shellg_(&lat, &lon, &alt, &dimo, &xl, &icode, &bab1);          shellg_(&lat, &lon, &alt, &dimo, &xl, &icode, &bab1);
1127          findb0_(&stps, &bdel, &value, &bequ, &rr0);          findb0_(&stps, &bdel, &value, &bequ, &rr0);
1128                    //
1129          orbitalinfo->Bnorth = bnorth;          orbitalinfo->Bnorth = bnorth;
1130          orbitalinfo->Beast = beast;          orbitalinfo->Beast = beast;
1131          orbitalinfo->Bdown = bdown;          orbitalinfo->Bdown = bdown;
1132          orbitalinfo->Babs = babs;          orbitalinfo->Babs = babs;
1133          orbitalinfo->BB0 = babs/bequ;          orbitalinfo->BB0 = babs/bequ;
1134          orbitalinfo->L = xl;          orbitalinfo->L = xl;      
           
1135          // Set Stormer vertical cutoff using L shell.          // Set Stormer vertical cutoff using L shell.
1136          orbitalinfo->cutoff[0] = 14.9/(xl*xl);          orbitalinfo->cutoffsvl = 14.9/(xl*xl);
1137            //
1138          };      
1139          //
1140          if ( debug ) printf(" pitch angle \n");
1141          //
1142          // pitch angles
1143          //
1144          if ( orbitalinfo->mode != 10 && orbitalinfo->mode != 5 && orbitalinfo->mode !=7 && orbitalinfo->mode != 9 ){
1145            //
1146            Float_t Bx = -orbitalinfo->Bdown;                       //don't need for PamExp ExpOnly for all geography areas
1147            Float_t By = orbitalinfo->Beast;                        //don't need for PamExp ExpOnly for all geography areas
1148            Float_t Bz = orbitalinfo->Bnorth;                       //don't need for PamExp ExpOnly for all geography areas
1149            //
1150            TMatrixD Fij = PO->ECItoGreenwich(PO->QuatoECI(orbitalinfo->q0,orbitalinfo->q1,orbitalinfo->q2,orbitalinfo->q3),orbitalinfo->absTime);
1151            TMatrixD Dij = PO->GreenwichtoGEO(orbitalinfo->lat,orbitalinfo->lon,Fij);
1152            TMatrixD Iij = PO->ColPermutation(Dij);
1153            //
1154            orbitalinfo->Iij.ResizeTo(Iij);
1155            orbitalinfo->Iij = Iij;
1156            //
1157            A1 = Iij(0,2);
1158            A2 = Iij(1,2);
1159            A3 = Iij(2,2);
1160            //      
1161            //      orbitalinfo->pamzenitangle = (Float_t)PO->GetPitchAngle(1,0,0,A1,A2,A3);                        // Angle between zenit and Pamela's main axiz
1162            //      orbitalinfo->pamBangle = (Float_t)PO->GetPitchAngle(A1,A2,A3,Bx,By,Bz);                 // Angle between Pamela's main axiz and B
1163            //
1164            if ( !standalone && tof->ntrk() > 0 ){
1165              //
1166              Int_t nn = 0;
1167              for(Int_t nt=0; nt < tof->ntrk(); nt++){  
1168                //
1169                ToFTrkVar *ptt = tof->GetToFTrkVar(nt);
1170                Double_t E11x = ptt->xtr_tof[0]; // tr->x[0];
1171                Double_t E11y = ptt->ytr_tof[0]; //tr->y[0];
1172                Double_t E11z = zin[0];
1173                Double_t E22x = ptt->xtr_tof[3];//tr->x[3];
1174                Double_t E22y = ptt->ytr_tof[3];//tr->y[3];
1175                Double_t E22z = zin[3];
1176                if ( (E11x < 100. && E11y < 100. && E22x < 100. && E22y < 100.) || ptt->trkseqno != -1  ){
1177                  Double_t norm = sqrt(pow(E22x-E11x,2)+pow(E22y-E11y,2)+pow(E22z-E11z,2));
1178                  //              Double_t MyAzim = TMath::RadToDeg()*atan(TMath::Abs(E22y-E11y)/TMath::Abs(E22x-E11x));
1179                  //              if(E22x-E11x>=0 && E22y-E11y <0) MyAzim =  360. - MyAzim;
1180                  //              if(E22x-E11x>=0 && E22y-E11y >=0) MyAzim = MyAzim;
1181                  //              if(E22x-E11x<0 && E22y-E11y >0) MyAzim = 180. - MyAzim;
1182                  //              if(E22x-E11x<0 && E22y-E11y <0) MyAzim = 180. + MyAzim;
1183                  Px = (E22x-E11x)/norm;
1184                  Py = (E22y-E11y)/norm;
1185                  Pz = (E22z-E11z)/norm;
1186                  //
1187                  t_orb->trkseqno = ptt->trkseqno;
1188                  //
1189                  TMatrixD Eij = PO->PamelatoGEO(Iij,Px,Py,Pz);
1190                  t_orb->Eij.ResizeTo(Eij);
1191                  t_orb->Eij = Eij;
1192                  //
1193                  TMatrixD Sij = PO->PamelatoGEO(Fij,Px,Py,Pz);
1194                  t_orb->Sij.ResizeTo(Sij);
1195                  t_orb->Sij = Sij;
1196                  //            
1197                  t_orb->pitch = (Float_t)PO->GetPitchAngle(Eij(0,0),Eij(1,0),Eij(2,0),Bx,By,Bz);
1198                  //
1199                  //
1200                  Double_t omega = PO->GetPitchAngle(Eij(0,0),Eij(1,0),Eij(2,0),cos(orbitalinfo->lon+TMath::Pi()/2)-sin(orbitalinfo->lon+TMath::Pi()/2),cos(orbitalinfo->lon+TMath::Pi()/2)+sin(orbitalinfo->lon+TMath::Pi()/2),1);
1201                  //
1202                  t_orb->cutoff = 59.3/(pow(orbitalinfo->L,2)*pow((1+sqrt(1-pow(orbitalinfo->L,-3/2)*cos(omega))),2));
1203                  //
1204                  if ( t_orb->pitch != t_orb->pitch ) t_orb->pitch = -1000.;
1205                  if ( t_orb->cutoff != t_orb->cutoff ) t_orb->cutoff = -1000.;
1206                  //
1207                  if ( debug ) printf(" orbitalinfo->cutoffsvl %f vitaly %f \n",orbitalinfo->cutoffsvl,t_orb->cutoff);
1208                  //
1209                  new(tor[nn]) OrbitalInfoTrkVar(*t_orb);
1210                  nn++;
1211                  //
1212                  t_orb->Clear();
1213                  //
1214                };
1215                //
1216              };
1217            } else {
1218              if ( debug ) printf(" mmm... mode %u standalone %i ntrk %i \n",orbitalinfo->mode,standalone,tof->ntrk());
1219            };
1220            //
1221          } else {
1222            if ( !standalone && tof->ntrk() > 0 ){
1223              //
1224              Int_t nn = 0;
1225              for(Int_t nt=0; nt < tof->ntrk(); nt++){  
1226                //
1227                ToFTrkVar *ptt = tof->GetToFTrkVar(nt);
1228                if ( ptt->trkseqno != -1  ){
1229                  //
1230                  t_orb->trkseqno = ptt->trkseqno;
1231                  //
1232                  t_orb->Eij = 0;  
1233                  //
1234                  t_orb->Sij = 0;
1235                  //            
1236                  t_orb->pitch = -1000.;
1237                  //
1238                  t_orb->cutoff = -1000.;
1239                  //
1240                  new(tor[nn]) OrbitalInfoTrkVar(*t_orb);
1241                  nn++;
1242                  //
1243                  t_orb->Clear();
1244                  //
1245                };
1246                //
1247              };    
1248            };
1249        };        };
1250                //
1251        // end EM        // Fill the class
1252          //
1253        OrbitalInfotr->Fill();        OrbitalInfotr->Fill();
1254      }        //
1255              delete t_orb;
1256          //
1257        }; // loop over the events in the run
1258      //      //
1259      // Here you may want to clear some variables before processing another run        // Here you may want to clear some variables before processing another run  
1260      //      //
1261    
1262        //gStyle->SetOptStat(000000);
1263        //gStyle->SetPalette(1);
1264        
1265        /*TCanvas* c1 = new TCanvas("c1","",1200,800);
1266        //c1->Divide(1,4);
1267        c1->cd(1);
1268        //q0testing->Draw("colz");
1269        //c1->cd(2);
1270        //q1testing->Draw("colz");
1271        //c1->cd(3);
1272        Pitchtesting->Draw("colz");
1273        //c1->cd(4);
1274        //q3testing->Draw("colz");
1275        c1->SaveAs("9.Rollhyst.png");
1276        delete c1;*/
1277    
1278      delete dbtime;      delete dbtime;
1279        if ( L_QQ_Q_l_upper ) delete L_QQ_Q_l_upper;
1280        if ( L_QQ_Q_l_lower ) delete L_QQ_Q_l_lower;
1281        if ( RYPang_upper ) delete RYPang_upper;
1282        if ( RYPang_lower ) delete RYPang_lower;
1283    }; // process all the runs    }; // process all the runs
1284    //    
1285    if (verbose) printf("\n Finished processing data \n");    if (verbose) printf("\n Finished processing data \n");
1286    //    //
1287   closeandexit:   closeandexit:
# Line 606  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f Line 1299  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f
1299          //          //
1300          // Get entry from old tree          // Get entry from old tree
1301          //          //
1302          OrbitalInfotrclone->GetEntry(j);                    if ( OrbitalInfotrclone->GetEntry(j) <= 0 ) throw -36;    
1303          //          //
1304          // copy orbitalinfoclone to OrbitalInfo          // copy orbitalinfoclone to OrbitalInfo
1305          //          //
# Line 626  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f Line 1319  int OrbitalInfoCore(UInt_t run, TFile *f
1319    //    //
1320    if ( l0File ) l0File->Close();    if ( l0File ) l0File->Close();
1321    if ( tempfile ) tempfile->Close();                if ( tempfile ) tempfile->Close();            
1322    gSystem->Unlink(tempname.str().c_str());    if ( myfold ) gSystem->Unlink(tempname.str().c_str());
1323    //    //
1324    if ( runinfo ) runinfo->Close();        if ( runinfo ) runinfo->Close();    
1325    if ( OrbitalInfotr ) OrbitalInfotr->SetName("OrbitalInfo");        if ( OrbitalInfotr ) OrbitalInfotr->SetName("OrbitalInfo");    
1326      if ( tof ) tof->Delete();
1327      if ( ttof ) ttof->Delete();
1328      //
1329    if ( file ){    if ( file ){
1330      file->cd();      file->cd();
1331      file->Write();      file->Write();
1332    };    };
1333    //    //
1334    gSystem->Unlink(OrbitalInfofolder.str().c_str());    if ( myfold ) gSystem->Unlink(OrbitalInfofolder.str().c_str());
1335    //    //
1336    // the end    // the end
1337    //    //
1338      if ( dbc ){
1339        dbc->Close();
1340        delete dbc;
1341      };
1342    if (verbose) printf("\n Exiting...\n");    if (verbose) printf("\n Exiting...\n");
1343    if(OrbitalInfotr)OrbitalInfotr->Delete();    if(OrbitalInfotr)OrbitalInfotr->Delete();
1344    //    //
1345      if ( PO ) delete PO;
1346    if ( orbitalinfo ) delete orbitalinfo;    if ( orbitalinfo ) delete orbitalinfo;
1347    if ( orbitalinfoclone ) delete orbitalinfoclone;    if ( orbitalinfoclone ) delete orbitalinfoclone;
1348    if ( glroot ) delete glroot;    if ( glroot ) delete glroot;
# Line 663  cCoordGeo getCoo(UInt_t atime, UInt_t tl Line 1364  cCoordGeo getCoo(UInt_t atime, UInt_t tl
1364  {  {
1365    cEci eci;    cEci eci;
1366    cOrbit orbit(*tle);    cOrbit orbit(*tle);
     
1367    orbit.getPosition((double) (atime - tletime)/60., &eci);    orbit.getPosition((double) (atime - tletime)/60., &eci);
1368        
1369    return eci.toGeo();    return eci.toGeo();
1370  }  }
1371    
1372    // function of copyng of quatrnions classes
1373    
1374    void CopyQ(Quaternions *Q1, Quaternions *Q2){
1375      for(UInt_t i = 0; i < 6; i++){
1376        Q1->time[i]=Q2->time[i];
1377        for (UInt_t j = 0; j < 4; j++)Q1->quat[i][j]=Q2->quat[i][j];
1378      }
1379      return;
1380    }
1381    
1382    // functions of copyng InclinationInfo classes
1383    
1384    void CopyAng(InclinationInfo *A1, InclinationInfo *A2){
1385      A1->Tangazh = A2->Tangazh;
1386      A1->Ryskanie = A2->Ryskanie;
1387      A1->Kren = A2->Kren;
1388      return;
1389    }
1390    
1391    UInt_t holeq(Double_t lower,Double_t upper,Quaternions *Qlower, Quaternions *Qupper, UInt_t f){
1392      
1393      UInt_t hole = 10;
1394      Bool_t R10l = false;     // Sign of R10 mode in lower quaternions array
1395      Bool_t R10u = false;     // Sign of R10 mode in upper quaternions array
1396      Bool_t insm = false;     // Sign that we inside quaternions array
1397      Bool_t mxtml = false;    // Sign of mixt mode in lower quaternions array
1398      Bool_t mxtmu = false;    // Sign of mixt mode in upper quaternions array
1399      Bool_t npasm = false;     // Sign of normall pass between R10 and non R10 or between non R10 and R10
1400      UInt_t NCQl = 6;       // Number of correct quaternions in lower array
1401      UInt_t NCQu = 6;       // Number of correct quaternions in upper array
1402      if (f>0){
1403        insm = true;
1404        if(Qupper->time[f]-Qupper->time[f-1]==30) R10u = false;
1405        if(Qupper->time[f]-Qupper->time[f-1]<1) R10u = true;
1406      }else{
1407        insm = false;
1408        if((Qlower->time[5]-Qlower->time[0]<2)&&(Qlower->time[1]-Qlower->time[0]<2)) R10l = true;
1409        if((Qupper->time[5]-Qupper->time[0]<2)&&(Qupper->time[1]-Qupper->time[0]<2)) R10u = true;
1410        if((Qlower->time[5]-Qlower->time[0]==150)&&(Qlower->time[1]-Qlower->time[0]==30)) R10l = false;
1411        if((Qupper->time[5]-Qupper->time[0]==150)&&(Qupper->time[1]-Qupper->time[0]==30)) R10u = false;
1412        if((Qlower->time[5]-Qlower->time[0]<2)&&(Qlower->time[1]-Qlower->time[0]==30)){
1413          mxtml = true;
1414          for(UInt_t i = 1; i < 6; i++){
1415            if(Qlower->time[i]-Qlower->time[0]==30*i) NCQl=i;
1416          }
1417        }
1418        if((Qupper->time[5]-Qupper->time[0]<2)&&(Qupper->time[1]-Qupper->time[0]==30)){
1419          mxtmu = true;
1420          for(UInt_t i = 1; i < 6; i++){
1421            if(Qupper->time[i]-Qupper->time[0]==30*i) NCQu=i;
1422          }
1423        }
1424      }
1425      
1426      if(((upper-lower==1.5)||(upper-lower==3.)||(upper-lower==30.)||(upper-lower==31.5)||(upper-lower==33.)||(upper-lower==181.5)||(upper-lower==210.)||(upper-lower==211.5))&&!insm) npasm = true;
1427      
1428      
1429      if (R10u&&insm) hole=0; // best event R10
1430      if ((upper-lower<=5)&&(!insm)&&R10l&&R10u) hole = 1; // when first of 6 quaternions in array is correct
1431      if (((!R10u)&&insm)||((!insm)&&(!R10u)&&(!R10l)&&((upper-lower==210+(6-NCQl)*30)||(upper-lower==30)))) hole = 2; //non R10
1432      if (npasm&&(!insm)&&((R10l&&!R10u)||(R10u&&!R10l))) hole = 3; //normall pass from R10 to non R10 or from non R10 to R10
1433      if ((!npasm)&&(upper-lower<=300)&&(!insm)&&((R10l&&!R10u)||(R10u&&!R10l))) hole = 4; // eliminable hole between R10 and non R10 or between non R10 and R10
1434      if ((upper-lower>=300)&&(!insm)&&((R10l&&!R10u)||(R10u&&!R10l))) hole = 5; //uneliminable hole between R10 and non R10 or between non R10 and R10
1435      if ((upper-lower>5)&&(upper-lower<=300)&&R10u&&R10l) hole = 6; // eliminable hole inside R10
1436      if ((upper-lower>300)&&R10u&&R10l) hole = 7; //uneliminable hole inside R10
1437      if ((upper-lower>210)&&(upper-lower<=1200)&&(!R10u)&&(!R10l)) hole = 8; //eliminable hole inside non R10
1438      if ((upper-lower>1200)&&!R10u&&!R10l) hole = 9; // uneliminable hole inside non R10
1439      return hole;
1440    }
1441    
1442    void inclresize(vector<Double_t>& t,vector<Float_t>& q0,vector<Float_t>& q1,vector<Float_t>& q2,vector<Float_t>& q3,vector<Int_t>& mode,vector<Float_t>& Roll,vector<Float_t>& Pitch,vector<Float_t>& Yaw){
1443      Int_t sizee = t.size()+1;
1444      t.resize(sizee);
1445      q0.resize(sizee);
1446      q1.resize(sizee);
1447      q2.resize(sizee);
1448      q3.resize(sizee);
1449      mode.resize(sizee);
1450      Roll.resize(sizee);
1451      Pitch.resize(sizee);
1452      Yaw.resize(sizee);
1453    }
1454    
1455    //Find fitting sine functions for q0,q1,q2,q3 and Yaw-angle;
1456    void sineparam(vector<Sine>& qsine, vector<Double_t>& qtime, vector<Float_t>& q, vector<Float_t>& Roll, vector<Float_t>& Pitch, Float_t limsin){
1457      UInt_t mulast = 0;
1458      UInt_t munow = 0;
1459      UInt_t munext = 0;
1460      Bool_t increase = false;
1461      Bool_t decrease = false;
1462      Bool_t Max_is_defined = false;
1463      Bool_t Start_point_is_defined = false;
1464      Bool_t Period_is_defined = false;
1465      Bool_t Large_gap = false;
1466      Bool_t normal_way = true;
1467      Bool_t small_gap_on_ridge = false;
1468      Double_t t1 = 0;
1469      Double_t t1A = 0;
1470      Int_t sinesize = 0;
1471      Int_t nfi = 0;
1472      for(UInt_t mu = 0;mu<qtime.size();mu++){
1473        if(Roll[mu]<1. && Pitch[mu]<1.){
1474        if(munext==0 && munow!=0)munext=mu;
1475        if(munow==0 && mulast!=0)munow=mu;
1476        if(mulast==0)mulast=mu;
1477        if(mulast!=0 && munow!=0 && munext!=0){mulast=munow;munow=munext;munext=mu;}
1478        if(TMath::Abs(q[munow])>TMath::Abs(q[mulast]) && TMath::Abs(q[munow])>TMath::Abs(q[munext]) && TMath::Abs(q[munow])>limsin && qtime[munext]-qtime[mulast]>400)small_gap_on_ridge = true;
1479        if(munext>mulast && (qtime[munext]-qtime[mulast]>=2000 || qtime[munext]-qtime[mulast]<0)){if(Large_gap){normal_way = false;Large_gap = false;}else{Large_gap = true;normal_way = false;}}else normal_way = true;
1480        if(Large_gap || small_gap_on_ridge){
1481          //cout<<"Large gap..."<<endl;
1482          //if(small_gap_on_ridge)cout<<"small gap..."<<endl;
1483          increase = false;
1484          decrease = false;
1485          if(nfi>0){
1486            qsine.resize(qsine.size()-1);
1487            sinesize = qsine.size();
1488          }else{
1489            if(!Period_is_defined){
1490              if(qsine.size()>1){
1491                qsine[sinesize-1].b = qsine[sinesize-2].b;
1492                qsine[sinesize-1].c = qsine[sinesize-2].c;
1493              }else{
1494                qsine[sinesize-1].b = TMath::Pi()/1591.54;
1495                qsine[sinesize-1].c = qsine[sinesize-1].startPoint;
1496              }
1497            }
1498            if(!Max_is_defined){
1499              if(qsine.size()>1)qsine[sinesize-1].A = qsine[sinesize-2].A;else qsine[sinesize-1].A = limsin;
1500            }
1501            qsine[sinesize-1].NeedFit = true;
1502          }
1503          qsine[sinesize-1].finishPoint = qtime[munow];
1504          nfi = 0;
1505          Max_is_defined = false;
1506          Start_point_is_defined = false;
1507          Period_is_defined = false;
1508          small_gap_on_ridge = false;
1509        }
1510        if(munext > munow && munow > mulast && normal_way){
1511          if(!increase && !decrease){
1512            qsine.resize(qsine.size()+1);
1513            sinesize = qsine.size();
1514            qsine[sinesize-1].startPoint=qtime[mulast];
1515            if(q[munext]>q[munow] && q[munow]>q[mulast]) increase = true;
1516            if(q[munext]<q[munow] && q[munow]<q[mulast]) decrease = true;
1517          }
1518          //if(TMath::Abs(q[munow])>TMath::Abs(q[mulast]) && TMath::Abs(q[munow])>TMath::Abs(q[munext]) && TMath::Abs(q[munow])>limsin && qtime[munow]-qtime[mulast]>=400 || qtime[munext]-qtime[munow]>=400){small_gap_on_ridge = true;mu--;continue;}
1519          if(TMath::Abs(q[munow])>TMath::Abs(q[mulast]) && TMath::Abs(q[munow])>TMath::Abs(q[munext]) && TMath::Abs(q[munow])>limsin && qtime[munow]-qtime[mulast]<400 && qtime[munext]-qtime[munow]<400){
1520            //cout<<"Max point is qtime = "<<qtime[munow]<<"\tq = "<<q[munow]<<endl;
1521            if(q[munow]>q[mulast]){
1522              increase = false;
1523              decrease = true;
1524            }
1525            if(q[munow]<q[mulast]){
1526              increase = true;
1527              decrease = false;
1528            }
1529            if(Max_is_defined && !Start_point_is_defined){
1530              Double_t qPer = qtime[munow]-t1A;
1531              if(qPer>1000){
1532                //cout<<"qsine["<<sinesize-1<<"] = "<<qPer<<" = "<<qtime[munow]<<" - "<<t1A<<"\tlim = "<<limsin<<endl;
1533                qsine[sinesize-1].b=TMath::Pi()/qPer;
1534                if(decrease)qsine[sinesize-1].c=-qsine[sinesize-1].b*t1A;
1535                if(increase)qsine[sinesize-1].c=-qsine[sinesize-1].b*(t1A-qPer);
1536                Period_is_defined = true;
1537              }
1538            }
1539            Max_is_defined = true;
1540            qsine[sinesize-1].A = TMath::Abs(q[munow]);
1541            if(Start_point_is_defined && Period_is_defined){
1542              qsine[sinesize-1].finishPoint = qtime[munow];
1543              nfi++;
1544              qsine[sinesize-1].NeedFit = false;
1545              Max_is_defined = false;
1546              Start_point_is_defined = false;
1547              Period_is_defined = false;
1548              qsine.resize(qsine.size()+1);
1549              sinesize = qsine.size();
1550              qsine[sinesize-1].startPoint = qtime[munow];
1551            }
1552            if(!Start_point_is_defined) t1A=qtime[munow];
1553          }
1554          //if((q[munow]>=0 && q[mulast]<=0) || (q[munow]<=0 && q[mulast]>=0))cout<<"cross zero point diference = "<<qtime[munext] - qtime[mulast]<<"\tqlast = "<<qtime[mulast]<<"\tqnow = "<<qtime[munow]<<"\tqnext = "<<qtime[munext]<<endl;
1555          if(((q[munow]>=0 && q[mulast]<=0) || (q[munow]<=0 && q[mulast]>=0)) && qtime[munow]-qtime[mulast]<2000 && qtime[munext]-qtime[munow]<2000){
1556            Double_t tcrosszero = 0;
1557            //cout<<"cross zero point...qtime = "<<qtime[munow]<<endl;
1558            if(q[munow]==0.) tcrosszero = qtime[munow];else
1559              if(q[mulast]==0.)tcrosszero = qtime[mulast];else{
1560                Double_t k_ = (q[munow]-q[mulast])/(qtime[munow]-qtime[mulast]);
1561                Double_t b_ = q[munow]-k_*qtime[munow];
1562                tcrosszero = -b_/k_;
1563              }
1564            if(Start_point_is_defined){
1565              //cout<<"Start Point allready defined"<<endl;
1566              Double_t qPer = tcrosszero - t1;
1567              qsine[sinesize-1].b = TMath::Pi()/qPer;
1568              //cout<<"qsine["<<sinesize-1<<"].b = "<<TMath::Pi()/qPer<<endl;
1569              Period_is_defined = true;
1570              Float_t x0 = 0;
1571              if(decrease)x0 = t1;
1572              if(increase)x0 = tcrosszero;
1573              qsine[sinesize-1].c = -qsine[sinesize-1].b*x0;
1574              if(Max_is_defined){
1575                //cout<<"Max was previous defined"<<endl;
1576                qsine[sinesize-1].finishPoint = qtime[munow];
1577                nfi++;
1578                qsine[sinesize-1].NeedFit = false;
1579                Max_is_defined = false;
1580                t1 = tcrosszero;
1581                Start_point_is_defined = true;
1582                Period_is_defined = false;
1583                qsine.resize(qsine.size()+1);
1584                sinesize = qsine.size();
1585                qsine[sinesize-1].startPoint = qtime[munow];
1586              }
1587            }else{
1588              t1 = tcrosszero;
1589              Start_point_is_defined = true;
1590            }
1591          }
1592        }
1593        }
1594      }
1595    
1596      //cout<<"FINISH SINE INTERPOLATION FUNCTION..."<<endl<<endl;
1597    }
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